BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163O22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 68,619,468 - 68,762,589
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErbb4
Upstream geneKif22-ps
Downstream geneLOC667842, EG241084, Ikzf2
LinkOpen Mouse BAC browser

no map image available.



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163O22.bB6Ng01-163O22.g
ACCDH956394DH956395
length7941,218
definitionDH956394|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163O22, 5' end.DH956395|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163O22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,619,468 - 68,620,261)(68,761,389 - 68,762,589)
sequence
gaattcatgttctatccccaaatatatatcataacttacaaccatctgca
atgttaatctcaagagatacaacaatatcttctggctttcctggacactg
catgaatattaggtatagacacacaagtaggcagatcatttatgtacatg
aaataaataaataaataaataaataaataaatactatcttctaaaaatat
tttaaaagaaaaaatggctcatagagactcccctgcattaattttattct
gaattcacaagcataaatttccttcactgaacagcctctgtagtttattg
tattagttatttcatcactgtgacataaaacctaacagttgcaactatag
gaaagagagactatttctgctcaataatcaaagaagaacaatgatcatgg
tagggaatacatggtggtcaaggctcacctgtggggtagaagctttcagg
gcaacctgctaaatgcccaagaccaagaatcaaaaatgcgcatcagactt
agacagactctcgccatcaaaagagacacactttgcatacaccaacaaga
ttttcctgacaggaccctgatatagctgtctcctgtgaggctatgccagt
gcctggaaaatacagaagtggatgctcacagtcatctattggatggaaca
cagggcccccaatggaggagctagagaaagtacccaaggagctgaagggg
tctccagccctataggagaaacaacaatatgaactaagtaataaccccag
agctcatgtctctagctgcatatgtagcagaagatggcctagtc
gaattccttataaatgtatcccaggagagagcttggcatataacaaataa
gccaggaagaacttcaataacattaatgttgtaagtgtgggaattacaca
ccagagttgttttgaatgttacatgcctctggtgcatagagaagcacaaa
gccaaatgtcatttgctttcagtgtcttaaaaaaaacacctagaattaga
actctcgagatcctactgaatttcattgtcagcctgattccttcaaggta
acaatcatggtgagtgggaatataatctataggcaaaaggtggttcctgt
taaaaaataacattacgtctgttgtgtgtgtagaacagaggaaagaaatt
gcagaagctttccatgggtttgagaattccatatagctttcagctttact
ttgtaatgtgcttaaatgaaagaaaaataatcaaaaatgctttctttcat
aagaatgtaaagctaatgactgacctttgtgagtggccatattttttctt
gaagagctctttatttaaggactaacaaatcttatttttcaattgtcaat
atctgactggattatgatatataactgtgagataacttccttagtttatt
ttttaggaaataagtggtttttcaattatctatctgataattaatgccct
acaatatactgacaacatgatttatcatgtaaaagcaatcaaattttata
ataataagaaaaaactcttccatgattatatgtaacaatatggtaaaggg
atatctatcatcttttcccacctaatatataagaggaccaaagaacagcc
acattgtataccttgggtgacatctcaactcataggtgatcaagccaaga
ttcaatgtatgtgtcttagttggggtactgctggaaacaggcactatgac
caaggcaagtcttataaaggacaacatttaattggggctgacttacatgt
tccgaggttcagtctaatcatcaaaggcaggaacatgtaaacatcaaggc
agatattggttgcaggcataggctgagaagttctacatcttcaatttgaa
gttgactaggtggaaggactggcttctagggtagcgagggatggagtgtc
tttaaacccacacctacaatggacacaccttactcaacaaggacacatct
ttcctattcttgcccactccctggcctagcatataccaatattcttagta
aggtcagtcatgggcttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_68619468_68620261
seq2: B6Ng01-163O22.b_49_842

seq1  GAATTCATGTTCTATCCCCAAATATATATCATAACTTACAACCATCTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTTCTATCCCCAAATATATATCATAACTTACAACCATCTGCA  50

seq1  ATGTTAATCTCAAGAGATACAACAATATCTTCTGGCTTTCCTGGACACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAATCTCAAGAGATACAACAATATCTTCTGGCTTTCCTGGACACTG  100

seq1  CATGAATATTAGGTATAGACACACAAGTAGGCAGATCATTTATGTACATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATATTAGGTATAGACACACAAGTAGGCAGATCATTTATGTACATG  150

seq1  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATACTATCTTCTAAAAATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATACTATCTTCTAAAAATAT  200

seq1  TTTAAAAGAAAAAATGGCTCATAGAGACTCCCCTGCATTAATTTTATTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAGAAAAAATGGCTCATAGAGACTCCCCTGCATTAATTTTATTCT  250

seq1  GAATTCACAAGCATAAATTTCCTTCACTGAACAGCCTCTGTAGTTTATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAAGCATAAATTTCCTTCACTGAACAGCCTCTGTAGTTTATTG  300

seq1  TATTAGTTATTTCATCACTGTGACATAAAACCTAACAGTTGCAACTATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGTTATTTCATCACTGTGACATAAAACCTAACAGTTGCAACTATAG  350

seq1  GAAAGAGAGACTATTTCTGCTCAATAATCAAAGAAGAACAATGATCATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAGAGACTATTTCTGCTCAATAATCAAAGAAGAACAATGATCATGG  400

seq1  TAGGGAATACATGGTGGTCAAGGCTCACCTGTGGGGTAGAAGCTTTCAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGAATACATGGTGGTCAAGGCTCACCTGTGGGGTAGAAGCTTTCAGG  450

seq1  GCAACCTGCTAAATGCCCAAGACCAAGAATCAAAAATGCGCATCAGACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACCTGCTAAATGCCCAAGACCAAGAATCAAAAATGCGCATCAGACTT  500

seq1  AGACAGACTCTCGCCATCAAAAGAGACACACTTTGCATACACCAACAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGACTCTCGCCATCAAAAGAGACACACTTTGCATACACCAACAAGA  550

seq1  TTTTCCTGACAGGACCCTGATATAGCTGTCTCCTGTGAGGCTATGCCAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTGACAGGACCCTGATATAGCTGTCTCCTGTGAGGCTATGCCAGT  600

seq1  GCCTGGAAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGATGGAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGAAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGATGGAACA  650

seq1  CAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGAAGGGG  700

seq1  TCTCCAGCCCTATAGGAGAAACAACAATATGAACTAAGTAATAACCCCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAGCCCTATAGGAGAAACAACAATATGAACTAAGTAATAACCCCAG  750

seq1  AGCTCATGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCATGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGGCCTAGTC  794

seq1: chr1_68761389_68762589
seq2: B6Ng01-163O22.g_67_1284 (reverse)

seq1  GAAGACCATGACTGACC-TACTATGATAATTTGTATATGCTAGGCCCAGG  49
      |||| |||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||| |||||
seq2  GAAGCCCATGACTGACCTTACTAAGAATATTGGTATATGCTAGG-CCAGG  49

seq1  GAGT-GGCAAGATTAG--AAGATGTGGTCTTGTTGGAGT-AGGTGTGT-C  94
      |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||| |||| |||||||| |
seq2  GAGTGGGCAAGAATAGGAAAGATGTGTCCTTGTT-GAGTAAGGTGTGTCC  98

seq1  ATTGTAGGTGTGGGTTT-AAGACACT-CAT-CCTCGCTA-CCTAGAAGCC  140
      ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||
seq2  ATTGTAGGTGTGGGTTTAAAGACACTCCATCCCTCGCTACCCTAGAAGCC  148

seq1  AGT-CTTCCA-CTAGTCAACTTCAAA-TGAAGATGTAGAAC-TCTCAG-C  185
      ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
seq2  AGTCCTTCCACCTAGTCAACTTCAAATTGAAGATGTAGAACTTCTCAGCC  198

seq1  TATGCCTGCA--CCATATCTGCCTTGATGTTTACATGTTCCTGCC-TTGA  232
      ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TATGCCTGCAACCAATATCTGCCTTGATGTTTACATGTTCCTGCCTTTGA  248

seq1  TGATTAGACTGAACCTCGGAACATGTAAGTCAGCCCCAATTAAATGTTGT  282
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTAGACTGAACCTCGGAACATGTAAGTCAGCCCCAATTAAATGTTGT  298

seq1  CCTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATAGTGCCTGTTTCCAGCAGTACCCCA  332
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTATAAGACTTGCCTTGGTCATAGTGCCTGTTTCCAGCAGTACCCCA  348

seq1  ACTAAGACACCTACATTGAATCTTGGCTTGATCACCTATGAGTTGAGATG  382
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGACACATACATTGAATCTTGGCTTGATCACCTATGAGTTGAGATG  398

seq1  TCACCCAAGGTATACAATGTGGCTGTTCTTTGGTCCTCTTATATATTAGG  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCAAGGTATACAATGTGGCTGTTCTTTGGTCCTCTTATATATTAGG  448

seq1  TGGG-AAAGATGATAGATATCCCTTTACCATATTGTTACATATAATCATG  481
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAAAGATGATAGATATCCCTTTACCATATTGTTACATATAATCATG  498

seq1  GAAGAGTTTTTTCTTATTATTATAAAATTTGATTGCTTTTACATGATAAA  531
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGTTTTTTCTTATTATTATAAAATTTGATTGCTTTTACATGATAAA  548

seq1  TCATGTTGTCAGTATATTGTAGGGCATTAATTATCAGATAGATAATTGAA  581
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTTGTCAGTATATTGTAGGGCATTAATTATCAGATAGATAATTGAA  598

seq1  AAACCACTTATTTCCTAAAAAATAAACTAAGGAAGTTATCTCACAGTTAT  631
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCACTTATTTCCTAAAAAATAAACTAAGGAAGTTATCTCACAGTTAT  648

seq1  ATATCATAATCCAGTCAGATATTGACAATTGAAAAATAAGATTTGTTAGT  681
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCATAATCCAGTCAGATATTGACAATTGAAAAATAAGATTTGTTAGT  698

seq1  CCTTAAATAAAGAGCTCTTCAAGAAAAAATATGGCCACTCACAAAGGTCA  731
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAATAAAGAGCTCTTCAAGAAAAAATATGGCCACTCACAAAGGTCA  748

seq1  GTCATTAGCTTTACATTCTTATGAAAGAAAGCATTTTTGATTATTTTTCT  781
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTAGCTTTACATTCTTATGAAAGAAAGCATTTTTGATTATTTTTCT  798

seq1  TTCATTTAAGCACATTACAAAGTAAAGCTGAAAGCTATATGGAATTCTCA  831
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTAAGCACATTACAAAGTAAAGCTGAAAGCTATATGGAATTCTCA  848

seq1  AACCCATGGAAAGCTTCTGCAATTTCTTTCCTCTGTTCTACACACACAAC  881
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCATGGAAAGCTTCTGCAATTTCTTTCCTCTGTTCTACACACACAAC  898

seq1  AGACGTAATGTTATTTTTTAACAGGAACCACCTTTTGCCTATAGATTATA  931
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGTAATGTTATTTTTTAACAGGAACCACCTTTTGCCTATAGATTATA  948

seq1  TTCCCACTCACCATGATTGTTACCTTGAAGGAATCAGGCTGACAATGAAA  981
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCACTCACCATGATTGTTACCTTGAAGGAATCAGGCTGACAATGAAA  998

seq1  TTCAGTAGGATCTCGAGAGTTCTAATTCTAGGTGTTTTTTTTAAGACACT  1031
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTAGGATCTCGAGAGTTCTAATTCTAGGTGTTTTTTTTAAGACACT  1048

seq1  GAAAGCAAATGACATTTGGCTTTGTGCTTCTCTATGCACCAGAGGCATGT  1081
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGCAAATGACATTTGGCTTTGTGCTTCTCTATGCACCAGAGGCATGT  1098

seq1  AACATTCAAAACAACTCTGGTGTGTAATTCCCACACTTACAACATTAATG  1131
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTCAAAACAACTCTGGTGTGTAATTCCCACACTTACAACATTAATG  1148

seq1  TTATTGAAGTTCTTCCTGGCTTATTTGTTATATGCCAAGCTCTCTCCTGG  1181
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGAAGTTCTTCCTGGCTTATTTGTTATATGCCAAGCTCTCTCCTGG  1198

seq1  GATACATTTATAAGGAATTC  1201
      ||||||||||||||||||||
seq2  GATACATTTATAAGGAATTC  1218