BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168P07
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,623,333 - 70,738,937
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpag16
Upstream geneIkzf2
Downstream geneA830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12, LOC629101, Atic, Fn1, LOC100042814
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168P07.bB6Ng01-168P07.g
ACCDH960060DH960061
length1,0991,080
definitionDH960060|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168P07, 5' end.DH960061|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,737,832 - 70,738,937)(70,623,333 - 70,624,426)
sequence
gaattcaactccagttcttcctgtagccttcctagattaataagggaatt
ggtcttagaaggaagccaatagagcagaaacacaaaacagaaaggcagag
gggaattaaggctatcagtgatgacatcattgaagcactgaaacagctct
actcatcttaggtcccagtcctttcttactgctttaccatttaaccatta
agtcagcagctacttgtagccaaaatgtatattcccagcatctcaattac
ctgtcatctttatttgctatcatgccttaacatgtcactctgaacacagt
ggcttcaaacacacaatttttttctcacatttctgaagatcagaagagcc
acatttggtctgaagtctggagaaggctccatttccatgcctcatgcagt
tccctcaagctgatggccctatatcatccctgtgtctattcctctcttca
atactttccatgctctcagattctctcgcctccttcccaggaccttttgt
gattatgttgagcccaccaggataatcctattccattccaagaaccatac
tttagccacacctgtaaaattccacggtgtgtgtgtgtatgtgttgggag
tgctcttgaggatggcccttattttgtggtttgtgtctgttgagcatagt
cacatgggtttgttctcaagtgagagcttgttatcttttgccaataagca
ctgcatgttacctgggtaattattcagtcactcattcagtcaaaatggat
acaatccaagacaatagccactgcactaacaaacatgtgggttactagaa
ggagcaggttcttcactctttcaaacaggacacaggtgggagacacagag
caccaagtgaaagctttaggcacatagagaggctgcccactctgacttcc
ggttgggttgttttgttggaaagaattgtcttcatcaagataccacaaat
aatgtccctgaaacactagattatatgaagaaactaaaggtaagcagttt
ctattttcacctatgagtttaaacactctaaaatactttttttgtttgtt
ttttgaagaaaggaagtcatagctgcagaaaatgatgcttggaaattgg
gaattctatgtttccctgactgcattgctcagccagttaggaaatgggga
cattggtgaacttaagggctcaagtccaatttttctttctatctattaac
tttcttttcttcagaaatgagataggactgtaccccacactgaagacaat
tagcatgtaacttttatcacctcacctgccaaggtgttctcaatgggtag
gcaccttgtggtcctctcaaaatctctgcaagtatggtctgtgctctcga
tgttatgggaaggtagaaacaactgcaaggctgattcctaccatattgct
tgtcaatattgcaggaaggcttaggttagcctgccaaattcaggttctcc
atgtcaagaaaatagagggcaattggaactgttatcagtcaagagcctaa
taaaattgtactgaattttgcttctttatcagcctctaaattctgattta
gaccaagaactgtctccagtctaatcacctgacttccccaaacattccat
ttgaaatacaagcaaatcaaacatgaaatgcattctttacatctctctta
tctgttaatgagaaatcaaaaatatagcaaaatggtttataacataaata
tctaagtaaaattatccaaaatacatgcttttaaaagtcaccataattca
agttcatagtcttcagagattaaaaatattctcaaaatgtgtggtgattt
ctgtcagattatattgtctcctgatcagaaaataagagttacatacttgg
gtaagctaaaaaattattagcgcatcaattactttttcctgttgacaaaa
taaaaacttacttcaggaatgacttgctgatttaaaaagatgaattacct
gaaacgtagggcatggaaaaagtcaataactacaagggtgaatgtttgag
gtcataatgagaaccttctatttaaaactttagagaccaggtcacagcag
aacttatagacattttcaggtcacagagacagaaagaaacccattctgct
gtcttcagcactgtctgtttagagtgagaagtgaatttaatcaattggtt
gcataaatagttcaaagtgattttattgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70737832_70738937
seq2: B6Ng01-168P07.b_46_1144 (reverse)

seq1  CCAATTTTCCAAGCATCATTTTCTGCAGCTATGACTTCCTATCTTCAGAA  50
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  CCAA-TTTCCAAGCATCATTTTCTGCAGCTATGACTTCCTTTCTTCAAAA  49

seq1  AACAAACAAAAAAAGTATTTTAGAGTGGTTTAAAACTCATAAGGTGAAAA  100
      |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||
seq2  AACAAACAAAAAAAGTATTTTAGAGTG--TTTAAACTCAT-AGGTGAAAA  96

seq1  TAGAAACTGCTTACCTTTAGTTTCTTCATAATAATCTAGTGTTTCAGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAACTGCTTACCTTTAGTTTCTTCAT-ATAATCTAGTGTTTCAGGGA  145

seq1  CATTATTTGTGGTATCTTTGATGAAAGACAATTCTTTCCAACAAAACAAC  200
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATTTGTGGTATC-TTGATG-AAGACAATTCTTTCCAACAAAACAAC  193

seq1  CCAACCGGAAGTCAGAGTGGGCAGCCTCTCTATGTGCCTAAAGCTTTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCGGAAGTCAGAGTGGGCAGCCTCTCTATGTGCCTAAAGCTTTCAC  243

seq1  TTGGTGCTCTGTGTCTCCCACCTGTGTCCTGTTTGAAAGAGTGAAGAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGCTCTGTGTCTCCCACCTGTGTCCTGTTTGAAAGAGTGAAGAACC  293

seq1  TGCTCCTTCTAGTAACCCACATGTTTGTTAGTGCAGTGGCTATTGTCTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCTTCTAGTAACCCACATGTTTGTTAGTGCAGTGGCTATTGTCTTG  343

seq1  GATTGTATCCATTTTGACTGAATGAGTGACTGAATAATTACCCAGGTAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTATCCATTTTGACTGAATGAGTGACTGAATAATTACCCAGGTAAC  393

seq1  ATGCAGTGCTTATTGGCAAAAGATAACAAGCTCTCACTTGAGAACAAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTGCTTATTGGCAAAAGATAACAAGCTCTCACTTGAGAACAAACC  443

seq1  CATGTGACTATGCTCAACAGACACAAACCACAAAATAAGGGCCATCCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGACTATGCTCAACAGACACAAACCACAAAATAAGGGCCATCCTCA  493

seq1  AGAGCACTCCCAACACATACACACACACACCGTGGAATTTTACAGGTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTCCCAACACATACACACACACACCGTGGAATTTTACAGGTGTG  543

seq1  GCTAAAGTATGGTTCTTGGAATGGAATAGGATTATCCTGGTGGGCTCAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGTATGGTTCTTGGAATGGAATAGGATTATCCTGGTGGGCTCAAC  593

seq1  ATAATCACAAAAGGTCCTGGGAAGGAGGCGAGAGAATCTGAGAGCATGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCACAAAAGGTCCTGGGAAGGAGGCGAGAGAATCTGAGAGCATGGA  643

seq1  AAGTATTGAAGAGAGGAATAGACACAGGGATGATATAGGGCCATCAGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATTGAAGAGAGGAATAGACACAGGGATGATATAGGGCCATCAGCTT  693

seq1  GAGGGAACTGCATGAGGCATGGAAATGGAGCCTTCTCCAGACTTCAGACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAACTGCATGAGGCATGGAAATGGAGCCTTCTCCAGACTTCAGACC  743

seq1  AAATGTGGCTCTTCTGATCTTCAGAAATGTGAGAAAAAAATTGTGTGTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGGCTCTTCTGATCTTCAGAAATGTGAGAAAAAAATTGTGTGTTT  793

seq1  GAAGCCACTGTGTTCAGAGTGACATGTTAAGGCATGATAGCAAATAAAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCACTGTGTTCAGAGTGACATGTTAAGGCATGATAGCAAATAAAGA  843

seq1  TGACAGGTAATTGAGATGCTGGGAATATACATTTTGGCTACAAGTAGCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGTAATTGAGATGCTGGGAATATACATTTTGGCTACAAGTAGCTG  893

seq1  CTGACTTAATGGTTAAATGGTAAAGCAGTAAGAAAGGACTGGGACCTAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTAATGGTTAAATGGTAAAGCAGTAAGAAAGGACTGGGACCTAAG  943

seq1  ATGAGTAGAGCTGTTTCAGTGCTTCAATGATGTCATCACTGATAGCCTTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTAGAGCTGTTTCAGTGCTTCAATGATGTCATCACTGATAGCCTTA  993

seq1  ATTCCCCTCTGCCTTTCTGTTTTGTGTTTCTGCTCTATTGGCTTCCTTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCCTCTGCCTTTCTGTTTTGTGTTTCTGCTCTATTGGCTTCCTTCT  1043

seq1  AAGACCAATTCCCTTATTAATCTAGGAAGGCTACAGGAAGAACTGGAGTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCAATTCCCTTATTAATCTAGGAAGGCTACAGGAAGAACTGGAGTT  1093

seq1  GAATTC  1106
      ||||||
seq2  GAATTC  1099

seq1: chr1_70623333_70624426
seq2: B6Ng01-168P07.g_68_1147

seq1  GAATTCTATGTTTCCCTGACTGCATTGCTCAGCCAGTTAGGAAATGGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATGTTTCCCTGACTGCATTGCTCAGCCAGTTAGGAAATGGGGA  50

seq1  CATTGGTGAACTTAAGGGCTCAAGTCCAATTTTTCTTTCTATCTATTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGTGAACTTAAGGGCTCAAGTCCAATTTTTCTTTCTATCTATTAAC  100

seq1  TTTCTTTTCTTCAGAAATGAGATAGGACTGTACCCCACACTGAAGACAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTTCTTCAGAAATGAGATAGGACTGTACCCCACACTGAAGACAAT  150

seq1  TAGCATGTAACTTTTATCACCTCACCTGCCAAGGTGTTCTCAATGGGTAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATGTAACTTTTATCACCTCACCTGCCAAGGTGTTCTCAATGGGTAG  200

seq1  GCACCTTGTGGTCCTCTCAAAATCTCTGCAAGTATGGTCTGTGCTCTCGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTGTGGTCCTCTCAAAATCTCTGCAAGTATGGTCTGTGCTCTCGA  250

seq1  TGTTATGGGAAGGTAGAAACAACTGCAAGGCTGATTCCTACCATATTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGGGAAGGTAGAAACAACTGCAAGGCTGATTCCTACCATATTGCT  300

seq1  TGTCAATATTGCAGGAAGGCTTAGGTTAGCCTGCCAAATTCAGGTTCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAATATTGCAGGAAGGCTTAGGTTAGCCTGCCAAATTCAGGTTCTCC  350

seq1  ATGTCAAGAAAATAGAGGGCAATTGGAACTGTTATCAGTCAAGAGCCTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAAGAAAATAGAGGGCAATTGGAACTGTTATCAGTCAAGAGCCTAA  400

seq1  TAAAATTGTACTGAATTTTGCTTCTTTATCAGCCTCTAAATTCTGATTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTGTACTGAATTTTGCTTCTTTATCAGCCTCTAAATTCTGATTTA  450

seq1  GACCAAGAACTGTCTCCAGTCTAATCACCTGACTTCCCCAAACATTCCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAAGAACTGTCTCCAGTCTAATCACCTGACTTCCCCAAACATTCCAT  500

seq1  TTGAAATACAAGCAAATCAAACATGAAATGCATTCTTTACATCTCTCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATACAAGCAAATCAAACATGAAATGCATTCTTTACATCTCTCTTA  550

seq1  TCTGTTAATGAGAAATCAAAAATATAGCAAAATGGTTTATAACATAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTAATGAGAAATCAAAAATATAGCAAAATGGTTTATAACATAAATA  600

seq1  TCTAAGTAAAATTATCCAAAATACATGCTTTTAAAAGTCACCATAATTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGTAAAATTATCCAAAATACATGCTTTTAAAAGTCACCATAATTCA  650

seq1  AGTTCATAGTCTTCAGAGATTAAAAATATTCTCAAAATGTGTGGTGATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATAGTCTTCAGAGATTAAAAATATTCTCAAAATGTGTGGTGATTT  700

seq1  CTGTCAGATTATATTGTCTCCTGATCAGAAAATAAGAGTTACATACTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGATTATATTGTCTCCTGATCAGAAAATAAGAGTTACATACTTGG  750

seq1  GTAAGCTAAAAAATTATTAGCGCATCAATTACTTTTTCCTGTTGACAAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTAAAAAATTATTAGCGCATCAATTACTTTTTCCTGTTGACAAAA  800

seq1  TAAAAACTTACTTCAGGAATGACTTGCTGATTTAAAAAGATGAATTACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAACTTACTTCAGGAATGACTTGCTGATTTAAAAAGATGAATTACCT  850

seq1  GAAACGTAGGGCATGGAAAAAGTCAATAACTACAAGGGTGAATGTTTGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACGTAGGGCATGGAAAAAGTCAATAACTACAAGGGTGAATGTTTGAG  900

seq1  GTCATAATGAGAACCTTCTATTTAAAACTTTAAGAGACCAGGTCACCAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  GTCATAATGAGAACCTTCTATTTAAAACTTT-AGAGACCAGGTCA-CAGC  948

seq1  AGAACTTATAGACATTTTCAGGTCACAGAGACCAGAAAAGAAACCCCATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||
seq2  AGAACTTATAGACATTTTCAGGTCACAGAGA-CAG-AAAGAAA-CCCATT  995

seq1  CTGCTGTCTTCAAGCACCTGTCTGTTTAGAGTGAGAAGTGAATTTTAATC  1050
      ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTGCTGTCTTC-AGCA-CTGTCTGTTTAGAGTGAGAAGTGAA-TTTAATC  1042

seq1  AATTTGTTTGCATTAAAATAGTTCCAAAAGTGAATATTATTGTA  1094
      || ||| ||||||  |||||||||  |||||| || ||||||||
seq2  AA-TTGGTTGCAT--AAATAGTTC--AAAGTG-ATTTTATTGTA  1080