agttggctgctcagcactcatgtttgtcagctcacatccactatagctgt
agttcagagaggcccaactccttcttctggcctgcttatactatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgatata
tatatatatatatatatatataaaaaaaaaatatttaattataataatac
atatatatatatacgtatatacatatataaatatataaatataaatatgg
acggacaaaagaaaataattgataatgtgtgtacagcacgtgtgagggta
aggacgagatagagatagatacatacatgcatatgagaaaatacaaatgc
tagatacacatttttcttttttttttttttttttaatcaaggtgacatca
aatgtttttgtcaatgtggcaaactgtatacttgtttatatattattcac
ctctttgctcttcttctaaaagatcatacataatttatcaatcatcagga
aaatca

gaattcccagccagccagtgctgcgcagggtaagtttcctggggtgtgga
tgtcatggcctactctgtggatacccacttaatgataggaaatgaatcaa
tactgtatcctttatgtcatatatttagattgccttaaaatatggtccgc
tgcatttgcatgttcctaaaattgtcatgcagaccaaattaatgagaatc
acaactgtattgtgctaaagcgtcttaggaaatgaatattcatttggggg
tgtatacaagaaatcaggaaatcaagagttatttgcctctcatctccttg
aaatataggctcagtgatagctgcaaaatagagatggcttcccagataaa
gacttcccagcttctctattcaaactgcccagacaggttgagacatggct
ttattaataggtaccatttgtggggctatacatttggagctttttgggtt
ttggtttgttgtttacatagcatatagtctgcagggtattgatatgtcat
tcacatgactctttgttaaaaacaatgctaaataaaagaagccagacaca
aaggattacaatgtatatgtcatccagtagggcctggacatagatatgtt
aaaatatttatgtaaaatacctctccaatctctgacaaacctagatatga
tacactgctcagtctagtgtacactcccagatctcagctacatgaggcat
ctctggaaaatgtctcataatagatgtcaaatttccatctctacaatcct
atataatcccctcttcatttgcctttttccttttccaaatttgaatatag
tccactgatgttatgcttagagtgtaacactattcctcctacagctatta
gtcatttttttgacacgtgttgctaaattttttcttgtgaataaggtcca
ggtcatgtaccaaatccatgtcccaagttttcctcctgcatcaacttggc
aatgttgaattctgacatgaaatcctatgagaaccaccctggtcatcttc
accaatactttgggtcctttgggtgtgagaccatccttaactttctgtcc
aggttcagtcctctcacagccacgagaaaattggcttgatattgtattaa
ccctctcctggatgaatttgcttactgcaagggg

seq1: chr1_114273511_114274619
seq2: B6Ng01-183A01.g_64_1197

seq1  GAATTCCCAGCCAGCCAGTGCTGCGCAGGGTAAGTTTCCTGGGGTGTGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGCCAGCCAGTGCTGCGCAGGGTAAGTTTCCTGGGGTGTGGA  50

seq1  TGTCATGGCCTACTCTGTGGATACCCACTTAATGATAGGAAATGAATCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATGGCCTACTCTGTGGATACCCACTTAATGATAGGAAATGAATCAA  100

seq1  TACTGTATCCTTTATGTCATATATTTAGATTGCCTTAAAATATGGTCCGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTATCCTTTATGTCATATATTTAGATTGCCTTAAAATATGGTCCGC  150

seq1  TGCATTTGCATGTTCCTAAAATTGTCATGCAGACCAAATTAATGAGAATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTGCATGTTCCTAAAATTGTCATGCAGACCAAATTAATGAGAATC  200

seq1  ACAACTGTATTGTGCTAAAGCGTCTTAGGAAATGAATATTCATTTGGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTGTATTGTGCTAAAGCGTCTTAGGAAATGAATATTCATTTGGGGG  250

seq1  TGTATACAAGAAATCAGGAAATCAAGAGTTATTTGCCTCTCATCTCCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATACAAGAAATCAGGAAATCAAGAGTTATTTGCCTCTCATCTCCTTG  300

seq1  AAATATAGGCTCAGTGATAGCTGCAAAATAGAGATGGCTTCCCAGATAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATAGGCTCAGTGATAGCTGCAAAATAGAGATGGCTTCCCAGATAAA  350

seq1  GACTTCCCAGCTTCTCTATTCAAACTGCCCAGACAGGTTGAGACATGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCCCAGCTTCTCTATTCAAACTGCCCAGACAGGTTGAGACATGGCT  400

seq1  TTATTAATAGGTACCATTTGTGGGGCTATACATTTGGAGCTTTTTGGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAATAGGTACCATTTGTGGGGCTATACATTTGGAGCTTTTTGGGTT  450

seq1  TTGGTTTGTTGTTTACATAGCATATAGTCTGCAGGGTATTGATATGTCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTTGTTGTTTACATAGCATATAGTCTGCAGGGTATTGATATGTCAT  500

seq1  TCACATGACTCTTTGTTAAAAACAATGCTAAATAAAAGAAGCCAGACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATGACTCTTTGTTAAAAACAATGCTAAATAAAAGAAGCCAGACACA  550

seq1  AAGGATTACAATGTATATGTCATCCAGTAGGGCCTGGACATAGATATGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATTACAATGTATATGTCATCCAGTAGGGCCTGGACATAGATATGTT  600

seq1  AAAATATTTATGTAAAATACCTCTCCAATCTCTGACAAACCTAGATATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATTTATGTAAAATACCTCTCCAATCTCTGACAAACCTAGATATGA  650

seq1  TACACTGCTCAGTCTAGTGTACACTCCCAGATCTCAGCTACATGAGGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTGCTCAGTCTAGTGTACACTCCCAGATCTCAGCTACATGAGGCAT  700

seq1  CTCTGGAAAATGTCTCATAATAGATGTCAAATTTCCATCTCTACAATCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGAAAATGTCTCATAATAGATGTCAAATTTCCATCTCTACAATCCT  750

seq1  ATATAATCCCCTCTTCA-TTGCC-TTTTCCTTTTCCAAATTTGAATATAG  798
      ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATCCCCTCTTCATTTGCCTTTTTCCTTTTCCAAATTTGAATATAG  800

seq1  TCCACTGATGTTATGCTTAGAGTGTAACACTATT-CTCCTACAGCTATTA  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TCCACTGATGTTATGCTTAGAGTGTAACACTATTCCTCCTACAGCTATTA  850

seq1  GTCA-TTTTTTGACACGTGTTGCTAAATTTTTTCTGTAGAATAAGGTTCA  896
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||
seq2  GTCATTTTTTTGACACGTGTTGCTAAATTTTTTCTTGTGAATAAGGTCCA  900

seq1  GGTCATGTACCAAATCCATGTCCC-AGTTTTTCTCCTGCATCAAC-TGGC  944
      |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||
seq2  GGTCATGTACCAAATCCATGTCCCAAGTTTTCCTCCTGCATCAACTTGGC  950

seq1  AATGTTGAAATTCTGACATGAAAT-CTATGAGAAC--ACCTGGTCATCTT  991
      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||
seq2  AATGTTG-AATTCTGACATGAAATCCTATGAGAACCACCCTGGTCATCTT  999

seq1  CACC-ATACTTT-GGTC--TTTGGTG-GAGAC--ACCTT-ACTTTCTGTC  1033
      |||| ||||||| ||||  || |||| |||||   |||| ||||||||||
seq2  CACCAATACTTTGGGTCCTTTGGGTGTGAGACCATCCTTAACTTTCTGTC  1049

seq1  CAGG-TCAGTC--CTCACAGC--AGAG-AAATTGGCTTGAGA-TGTATTA  1076
      |||| ||||||  ||||||||   ||| |||||||||||| | |||||||
seq2  CAGGTTCAGTCCTCTCACAGCCACGAGAAAATTGGCTTGATATTGTATTA  1099

seq1  A-CCTCTTCTGGATGATTTTG-GTACTGCAAGGGG  1109
      | ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||
seq2  ACCCTCTCCTGGATGAATTTGCTTACTGCAAGGGG  1134