BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184N22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,826,769 - 128,935,210
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneE030049G20Rik
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163, Acmsd, Ccnt2, Ysk4, Rab3gap1, Zranb3, LOC666778, LOC100042670
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184N22.bB6Ng01-184N22.g
ACCGA010137GA010138
length1,0451,076
definitionB6Ng01-184N22.b B6Ng01-184N22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,934,161 - 128,935,210)(128,826,769 - 128,827,842)
sequence
gaattcagcatagcgacacactattggcttattcaaacatcagcagaaaa
agtacatgtacatgcaggatgtcagagttctgtgagttgttgactcagtt
cagatagccctgttatgtcttcacattgctctttatcttaaggttaagct
gttcccaggaatgttttaactatggggcatacccaggtttgtttttctct
tttctcagccccaggcagcctctaggctcacaaacaaccagcaattcctg
agtactttatatgacttataggtcttgaaatttcatctttctttcattgg
caaacttggcacctcaataaacatgaattttcaacactgctatttttaat
tccctagaataccagtttatgtttctgacaaactgcccattgtcatctta
attatgacataatacttggttttgtaaggatactacccttttgacaactt
acacgataacacaaagatcaattcatgtattctggattcctcatttgcat
atagttaatcactgtctctgtgaagacttgggtactggtttttatgaatc
aggtcatctctaagggcagctaaagccagatctctggggcaggtgactcc
atagtgacaattgtgaatgactaacacgtctcatatcttgatggatcagg
aggccacagtgcataggaagtagatctgggctttaaaatataaagggtca
gccccacaatgacttactttatttagccatctactaaaggttccagaacc
ttctgaaacagtgccaccatctggggacaaatgttcaaacaaatgagcct
atgtgtgttggggggagtccattgcatatttatatataagataggaactt
aactttataagaatgttcctagtttttaaaggaataatttttatatccac
caggcatgtggagtatctctcttgcttctacatcaatgctaggatctggt
agtgttaatgatttgaatttcaccccatttggaccattgtataatatcta
actaatatttaaacttgtatttcatgatagctaatggtgacaaac

gaattcagaagagggcatcagattgcctccagctgggcttacagatattt
gtgagccacctgacatggatgctgggaacagaaccctagtcctttgcaac
agtggtactcactcttagccagccctagaaaaatctcttttcacagtgag
tccatggataactagcaactccttttaagttagtgatcctacattctagg
tactcagctgctaccatgagaggctaggctgtcaggtgagacaagaaaac
tgtccgcaagatgaacagtgctcccactccagatgaacagtgctcctact
ccaaagccatatcgacaccccaaagaaaagatggttctcttccacaggtc
agattcacggcagaatctacctacctacaacattgaggaggaaatactat
tgtctctgctcttcccttcatcgccgctgtgtggagggaccacatctctc
cccacaccaaagttccgccaaatgttatctgcataggcatcaccaaaacc
tgccttggctctttttatggaacttgaaatctttttaattgagacaacac
ccagccgaccagccacgggcttgctgcactgggctttaagttagtttgac
gttagcctcctacgtgttaccaaacgcctgtgtgggtgctgccttctgtc
tcgtttaacactgcaagatctcaagtgcaggacattccaaacccatcggc
cttctcgtttctctgctccaaagcgtcattcattcggaggctctcttgcg
tttcatattcattcttttctactcccctccctcctcaattttctcattat
agtctgaccctttaagcacagtgttatctggttatcattgaaaattgcaa
aatctatagcataaatataaaaacaacgtgtatatcttaactgtgtatct
tatttttaaaacgtgtgctagcagacattagttgtatatctcaatgtatt
cagtgtgttcttctcctaaaagaacgttcgtttcattagttattgggagg
ggggcaacacacatgcttgcctctcagatggggtcaaaacataagcttgg
gaaaatcagtttctctttccagcacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128934161_128935210
seq2: B6Ng01-184N22.b_46_1090 (reverse)

seq1  GTTTGTCACCATTAGCTATCAATGAAATACAAGTTAAAATATTAGTTAGA  50
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTTTGTCACCATTAGCTATC-ATGAAATACAAGTTTAAATATTAGTTAGA  49

seq1  TATTATTACAAATGGTCCAAAATGGGTGAAATTCAAATCATTAACACTAC  100
      ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTA-TAC-AATGGTCCAAATGGGGTGAAATTCAAATCATTAACACTAC  97

seq1  CAGATCCTAGCATTGATGTAGAAGCAAGAGAGATACTCCCACATGCCTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAGATCCTAGCATTGATGTAGAAGCAAGAGAGATACT-CCACATGCCTGG  146

seq1  TGGATATAAAAATTATTCCTTTTAAAAACTAGGAACATTCTTATAAAGTT  200
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATATAAAAATTATTCC-TTTAAAAACTAGGAACATTCTTATAAAGTT  195

seq1  AAGTTCCTATCTTATATATAAATATGCAATGGACTCCCCCCAACACACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCCTATCTTATATATAAATATGCAATGGACTCCCCCCAACACACAT  245

seq1  AGGCTCATTTGTTTGAACATTTGTCCCCAGATGGTGGCACTGTTTCAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCATTTGTTTGAACATTTGTCCCCAGATGGTGGCACTGTTTCAGAA  295

seq1  GGTTCTGGAACCTTTAGTAGATGGCTAAATAAAGTAAGTCATTGTGGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTGGAACCTTTAGTAGATGGCTAAATAAAGTAAGTCATTGTGGGGC  345

seq1  TGACCCTTTATATTTTAAAGCCCAGATCTACTTCCTATGCACTGTGGCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCTTTATATTTTAAAGCCCAGATCTACTTCCTATGCACTGTGGCCT  395

seq1  CCTGATCCATCAAGATATGAGACGTGTTAGTCATTCACAATTGTCACTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATCCATCAAGATATGAGACGTGTTAGTCATTCACAATTGTCACTAT  445

seq1  GGAGTCACCTGCCCCAGAGATCTGGCTTTAGCTGCCCTTAGAGATGACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCACCTGCCCCAGAGATCTGGCTTTAGCTGCCCTTAGAGATGACCT  495

seq1  GATTCATAAAAACCAGTACCCAAGTCTTCACAGAGACAGTGATTAACTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCATAAAAACCAGTACCCAAGTCTTCACAGAGACAGTGATTAACTAT  545

seq1  ATGCAAATGAGGAATCCAGAATACATGAATTGATCTTTGTGTTATCGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATGAGGAATCCAGAATACATGAATTGATCTTTGTGTTATCGTGT  595

seq1  AAGTTGTCAAAAGGGTAGTATCCTTACAAAACCAAGTATTATGTCATAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGTCAAAAGGGTAGTATCCTTACAAAACCAAGTATTATGTCATAAT  645

seq1  TAAGATGACAATGGGCAGTTTGTCAGAAACATAAACTGGTATTCTAGGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATGACAATGGGCAGTTTGTCAGAAACATAAACTGGTATTCTAGGGA  695

seq1  ATTAAAAATAGCAGTGTTGAAAATTCATGTTTATTGAGGTGCCAAGTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAATAGCAGTGTTGAAAATTCATGTTTATTGAGGTGCCAAGTTTG  745

seq1  CCAATGAAAGAAAGATGAAATTTCAAGACCTATAAGTCATATAAAGTACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGAAAGAAAGATGAAATTTCAAGACCTATAAGTCATATAAAGTACT  795

seq1  CAGGAATTGCTGGTTGTTTGTGAGCCTAGAGGCTGCCTGGGGCTGAGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATTGCTGGTTGTTTGTGAGCCTAGAGGCTGCCTGGGGCTGAGAAA  845

seq1  AGAGAAAAACAAACCTGGGTATGCCCCATAGTTAAAACATTCCTGGGAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAAACAAACCTGGGTATGCCCCATAGTTAAAACATTCCTGGGAAC  895

seq1  AGCTTAACCTTAAGATAAAGAGCAATGTGAAGACATAACAGGGCTATCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTAACCTTAAGATAAAGAGCAATGTGAAGACATAACAGGGCTATCTG  945

seq1  AACTGAGTCAACAACTCACAGAACTCTGACATCCTGCATGTACATGTACT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAGTCAACAACTCACAGAACTCTGACATCCTGCATGTACATGTACT  995

seq1  TTTTCTGCTGATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGCTGATGTTTGAATAAGCCAATAGTGTGTCGCTATGCTGAATTC  1045


seq1: chr1_128826769_128827842
seq2: B6Ng01-184N22.g_66_1141

seq1  GAATTCAGAAGAGGGCATCAGATTGCCTCCAGCTGGGCTTACAGATATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAGAGGGCATCAGATTGCCTCCAGCTGGGCTTACAGATATTT  50

seq1  GTGAGCCACCTGACATGGATGCTGGGAACAGAACCCTAGTCCTTTGCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCCACCTGACATGGATGCTGGGAACAGAACCCTAGTCCTTTGCAAC  100

seq1  AGTGGTACTCACTCTTAGCCAGCCCTAGAAAAATCTCTTTTCACAGTGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTACTCACTCTTAGCCAGCCCTAGAAAAATCTCTTTTCACAGTGAG  150

seq1  TCCATGGATAACTAGCAACTCCTTTTAAGTTAGTGATCCTACATTCTAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGATAACTAGCAACTCCTTTTAAGTTAGTGATCCTACATTCTAGG  200

seq1  TACTCAGCTGCTACCATGAGAGGCTAGGCTGTCAGGTGAGACAAGAAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAGCTGCTACCATGAGAGGCTAGGCTGTCAGGTGAGACAAGAAAAC  250

seq1  TGTCCGCAAGATGAACAGTGCTCCCACTCCAGATGAACAGTGCTCCTACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCGCAAGATGAACAGTGCTCCCACTCCAGATGAACAGTGCTCCTACT  300

seq1  CCAAAGCCATATCGACACCCCAAAGAAAAGATGGTTCTCTTCCACAGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCCATATCGACACCCCAAAGAAAAGATGGTTCTCTTCCACAGGTC  350

seq1  AGATTCACGGCAGAATCTACCTACCTACAACATTGAGGAGGAAATACTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCACGGCAGAATCTACCTACCTACAACATTGAGGAGGAAATACTAT  400

seq1  TGTCTCTGCTCTTCCCTTCATCGCCGCTGTGTGGAGGGACCACATCTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTGCTCTTCCCTTCATCGCCGCTGTGTGGAGGGACCACATCTCTC  450

seq1  CCCACACCAAAGTTCCGCCAAATGTTATCTGCATAGGCATCACCAAAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACCAAAGTTCCGCCAAATGTTATCTGCATAGGCATCACCAAAACC  500

seq1  TGCCTTGGCTCTTTTTATGGAACTTGAAATCTTTTTAATTGAGACAACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTGGCTCTTTTTATGGAACTTGAAATCTTTTTAATTGAGACAACAC  550

seq1  CCAGCCGACCAGCCACGGGCTTGCTGCACTGGGCTTTAAGTTAGTTTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCGACCAGCCACGGGCTTGCTGCACTGGGCTTTAAGTTAGTTTGAC  600

seq1  GTTAGCCTCCTACGTGTTACCAAACGCCTGTGTGGGTGCTGCCTTCTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCCTCCTACGTGTTACCAAACGCCTGTGTGGGTGCTGCCTTCTGTC  650

seq1  TCGTTTAACACTGCAAGATCTCAAGTGCAGGACATTCCAAACCCATCGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTTAACACTGCAAGATCTCAAGTGCAGGACATTCCAAACCCATCGGC  700

seq1  CTTCTCGTTTCTCTGCTCCAAAGCGTCATTCATTCGGAGGCTCTCTTGCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCGTTTCTCTGCTCCAAAGCGTCATTCATTCGGAGGCTCTCTTGCG  750

seq1  TTTCATATTCATTCTTTTCTACTCCCCTCCCTCCTCAAATTTTCTCATTA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TTTCATATTCATTCTTTTCTACTCCCCTCCCTCCTC-AATTTTCTCATTA  799

seq1  TAGTCTGACCCTTTAAGCACAGTGTTATCTGGTTATCATTGAAAATTGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTGACCCTTTAAGCACAGTGTTATCTGGTTATCATTGAAAATTGCA  849

seq1  AAATCTATAGCATAAATATAAAAACAACGTGTATATCTTAACTGTGTATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTATAGCATAAATATAAAAACAACGTGTATATCTTAACTGTGTATC  899

seq1  TTATTTTTAAAACGTGTGCTAGCAGACATTAGTTGTATATCTCAATGTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTAAAACGTGTGCTAGCAGACATTAGTTGTATATCTCAATGTAT  949

seq1  TCAGTGTGTTCTTCTCCTAAAAGAACGTTCGTTCATTTAGTTATT-GGAG  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||
seq2  TCAGTGTGTTCTTCTCCTAAAAGAACGTTCGTTTCATTAGTTATTGGGAG  999

seq1  GGGGGGCACACACATGCTTGGCTCTCAGATGGGGGTCAAACAT-AGCTTG  1048
      |||||  ||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||
seq2  GGGGGCAACACACATGCTTGCCTCTCAGATGGGGTCAAAACATAAGCTTG  1049

seq1  GGAAAATCAG-TTCTCTTTCCAGCACC  1074
      |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGAAAATCAGTTTCTCTTTCCAGCACC  1076


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |