BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205K02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 129,153,786 - 129,154,926
singlet/doubletsinglet
Overlap geneMgat5
Upstream geneE030049G20Rik, LOC383559
Downstream geneLOC667090, Tmem163, Acmsd, Ccnt2, Ysk4, Rab3gap1, Zranb3, LOC666778, LOC100042670, EG666784, R3hdm1, LOC667109, LOC100042111, Ubxd2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205K02.g
ACCGA025262
length1,155
definitionB6Ng01-205K02.g
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcaccctctagaacagacgaggaagaatcatcgtttattgagtggg
caacaggagggcagtgggctaaacagtgatcagagtaagcctgcagtgcg
gggcaatggacatggcggggctctatctgggagaaggacttttacaagag
tttctctgcttgcagtctcctggcgtgtaattcatgctatgggaaggagg
gccttccagattaaccaagcacagttcagggaggttagcagaagccactg
tgcagcttcatttccagttgtaccatttctgccatgcaaatcagggcagg
ccaagcaaaatacaagacagggtcatgcaaatgagagtactcctggcaga
tctaaattccatgggtatgtctgcttatcccaaagccacacccagtgtcc
tcccatgtttccatgaccttcctaggaagaggaccttctagcagccagag
agatggacttcccacagtttcctgtatgcacaagagtatccaagaaagtc
actaaaccacatctgtgaaataagcaagctcaggggctctctgtaaccca
tatgctacgaggtcactataaaattcctgtgactgacttacttactatac
aactaaaccaagttattctaaagcagtggttctcaacctgtgggttccga
ccactttggcggttgaacgactctttcacagggatcccctatgaccatct
gcatatcacatattcacattttattcttaatagtggcaaaattacagtta
tgaagtagcaacaaaaaatcatttgatggtcggtgtcaccacaaacttta
ggaattataataagggggtcacagccctttaggaagattgagaatcaata
ttctaaagaaaagctagagccacttaggccaatcaagtaatagtggaccc
tgagttagaacaacagcaccagaccagagagaagtaggaagcatcgtgcc
agccacctttcttaccctgcatattgcctcctattacaattaaggcatat
tcctgggactttgtcttctgcttcccggggtggggcagacctccagccct
tagaaacttcctgacttaaggagtcttgttgactcatgaagctcctgaat
cacagaatatagcggttattaatggtcacatacctcaaggtaggggtctt
ggccg
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_129153786_129154926
seq2: B6Ng01-205K02.g_69_1223 (reverse)

seq1  CGGCCA--GCCCCTA-CTTGAGTCATGTGACCCTTTAATACACTTATA-T  46
      ||||||   |||||| ||||||  |||||||| || |  ||   |||| |
seq2  CGGCCAAGACCCCTACCTTGAGGTATGTGACCATTAATAACCGCTATATT  50

seq1  CTGTGATCCAAGGAGC-TCATGAGTCACAAAGACTCCTTTTAGTCAGGAA  95
      ||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||
seq2  CTGTGATTC-AGGAGCTTCATGAGTCAACAAGACTCC-TTAAGTCAGGAA  98

seq1  G-TTCTAAGGGCTGGA-GTCTGCCCCACCCCGGGAAGCAG-AGACAAAGT  142
      | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GTTTCTAAGGGCTGGAGGTCTGCCCCACCCCGGGAAGCAGAAGACAAAGT  148

seq1  -CCAGGAATATG-CTTAA-TGT-ATAGGAGGC-ATATGCAGGGTAAG-AA  186
       ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  CCCAGGAATATGCCTTAATTGTAATAGGAGGCAATATGCAGGGTAAGAAA  198

seq1  GGTGGCTGGCACGATGCTTCCTACTTCTCTCTGGTCTTGGTGCTGTTGTT  236
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGTGGCTGGCACGATGCTTCCTACTTCTCTCTGGTC-TGGTGCTGTTGTT  247

seq1  CTAACTCAGGGTCCACTATTTACTTGATTGGCCTAAGTGGCTCTAGCTTT  286
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACTCAGGGTCCACTA-TTACTTGATTGGCCTAAGTGGCTCTAGCTTT  296

seq1  TCTTTAGAATATTGATTCTCAATCTTCCTAA--GGCTGTGACCCCCTTAT  334
      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
seq2  TCTTTAGAATATTGATTCTCAATCTTCCTAAAGGGCTGTGACCCCCTTAT  346

seq1  TATAATTCCTTAAG-TTGTGGTGACACCGACCATCAAATGA-TTTTTGTT  382
      |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TATAATTCCTAAAGTTTGTGGTGACACCGACCATCAAATGATTTTTTGTT  396

seq1  GCTACTTCATAACTGTAATTTTGCCACTATTAAGAATAAAATGTGAATAT  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTCATAACTGTAATTTTGCCACTATTAAGAATAAAATGTGAATAT  446

seq1  GTGATATGCAGATGGTCATAGGGGATCCCTGTGAAAGAGTCGTTCAACCG  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATATGCAGATGGTCATAGGGGATCCCTGTGAAAGAGTCGTTCAACCG  496

seq1  CCAAAGTGGTCGGAACCCACAGGTTGAGAACCACTGCTTTAGAATAACTT  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTGGTCGGAACCCACAGGTTGAGAACCACTGCTTTAGAATAACTT  546

seq1  GGTTTAGTTGTATAGTAAGTAAGTCAGTCACAGGAATTTTATAGTGACCT  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAGTTGTATAGTAAGTAAGTCAGTCACAGGAATTTTATAGTGACCT  596

seq1  CGTAGCATATGGGTTACAGAGAGCCCCTGAGCTTGCTTATTTCACAGATG  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGCATATGGGTTACAGAGAGCCCCTGAGCTTGCTTATTTCACAGATG  646

seq1  TGGTTTAGTGACTTTCTTGGATACTCTTGTGCATACAGGAAACTGTGGGA  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTAGTGACTTTCTTGGATACTCTTGTGCATACAGGAAACTGTGGGA  696

seq1  AGTCCATCTCTCTGGCTGCTAGAAGGTCCTCTTCCTAGGAAGGTCATGGA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCATCTCTCTGGCTGCTAGAAGGTCCTCTTCCTAGGAAGGTCATGGA  746

seq1  AACATGGGAGGACACTGGGTGTGGCTTTGGGATAAGCAGACATACCCATG  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGGAGGACACTGGGTGTGGCTTTGGGATAAGCAGACATACCCATG  796

seq1  GAATTTAGATCTGCCAGGAGTACTCTCATTTGCATGACCCTGTCTTGTAT  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTAGATCTGCCAGGAGTACTCTCATTTGCATGACCCTGTCTTGTAT  846

seq1  TTTGCTTGGCCTGCCCTGATTTGCATGGCAGAAATGGTACAACTGGAAAT  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTGGCCTGCCCTGATTTGCATGGCAGAAATGGTACAACTGGAAAT  896

seq1  GAAGCTGCACAGTGGCTTCTGCTAACCTCCCTGAACTGTGCTTGGTTAAT  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGCACAGTGGCTTCTGCTAACCTCCCTGAACTGTGCTTGGTTAAT  946

seq1  CTGGAAGGCCCTCCTTCCCATAGCATGAATTACACGCCAGGAGACTGCAA  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGGCCCTCCTTCCCATAGCATGAATTACACGCCAGGAGACTGCAA  996

seq1  GCAGAGAAACTCTTGTAAAAGTCCTTCTCCCAGATAGAGCCCCGCCATGT  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGAAACTCTTGTAAAAGTCCTTCTCCCAGATAGAGCCCCGCCATGT  1046

seq1  CCATTGCCCCGCACTGCAGGCTTACTCTGATCACTGTTTAGCCCACTGCC  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGCCCCGCACTGCAGGCTTACTCTGATCACTGTTTAGCCCACTGCC  1096

seq1  CTCCTGTTGCCCACTCAATAAACGATGATTCTTCCTCGTCTGTTCTAGAG  1132
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGTTGCCCACTCAATAAACGATGATTCTTCCTCGTCTGTTCTAGAG  1146

seq1  GGTGAATTC  1141
      |||||||||
seq2  GGTGAATTC  1155