BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211M10
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,074,545 - 70,240,300
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpag16
Upstream geneErbb4, LOC667842, EG241084, Ikzf2
Downstream geneA830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211M10.bB6Ng01-211M10.g
ACCGA029742GA029743
length1,1811,088
definitionB6Ng01-211M10.b B6Ng01-211M10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,074,545 - 70,075,720)(70,239,212 - 70,240,300)
sequence
gaattccttaggcatgcatatttatctactgcatccttgcacacagcata
aggtgtgtcagtcacacatatctttgaactagtaactgagctttgaaaac
atgactttcttttcccattgcattattgaacctgcagctgtttggctatg
tgcttctgaaatgtctcttcactagtgtaaatgaatggtaggaaagtaga
gaatgggaggagggaagtaatgtttgtaaccttgtttttaagaaggttaa
ggaagttaaaaaaggaaagggttgcagtgtagctaaaacaggtcatgaac
agtaatgattaagaggtgggttgattccttaccacaagaaattttgagag
atctaaaaacaaacaaacaacaacaacaacaacaacaaaaaacagaagat
ctaaaggcaaaagcaacaaccatctctttcttaagtatagctccagatat
gctaacccacaaaggttccatgcattcatcttcaggccacatagttttac
ttcttcaaggtggagttaaaaaccaaatgaatccgtgttcctaagaaatg
gagaggaaaatttgaggaagtgatccgttgaagtagcccaggcaaagggg
ctaggcatctccactgagactgtcaactgctaacaaactctcttggtgaa
cttgtccaccaagagaacactgattctgaccctgttgtttcagtgttggt
tcaaaatgggaaagtaagaaattatgctcaaaggagaaatgtaactatta
tggaaaatgaaaacgttcaattcctgcattttttaaaatttctactcaga
aaatgtactccacctatgttcacacaccctagttgctgttgcatgtaagt
aatggaatctttaaatgtgtaaagaattacagtctgccaattatagactg
tgcattcactttggacgtgcacacttttgctgctgattttagttggtgag
atttacatataaaaggaaatcccttccctttcaagttgcttcaaaacaca
agcagcttgcagaataacagcatggtcaccaatgtttgggacccttgtag
tttgggcccaggaacagtgcaatccaaaactctttatgtaagttggttca
gccacttcctgactagtatgttaggcgagaatggaacttcggcagagaga
ttcgtcatggatactactatatctaggagtg
gaattcttaagtgttatgccattgttttgatgattcaattggattttcaa
aagcatgtctactcaactgatcttggtaagaatcaaacagaaaatagaag
aagatgcccatgtatccatctctcttctagaacagatatgattctagaaa
gcgacggagaattgaataacctatgtaggataataaattgtaattctgca
cagaaattgggaagtgatatgggagtggccactttaccatgaccacataa
acatttgtcagatccccaaatgtatgagaacatgaacctaagcagagagg
ccagtgtagaacttagcctttcaatattcatgataccttgctgcagttca
ggaagcaaaagatgaagcaatcctgatgcagaaaactaactattccatgt
gtctagtgctgggctacactgtggaactgagcacttcagtaacaccctcc
aggggaaagatttttgaacctcctcaaaggacgaggatttcagaagactg
gtgattagatgtataaatcacatgaaagtaatgtttttagtgtttctaat
tagataattcccatgtaagattaggaactggaaatgaagagcactatgaa
aatcgcaacaaattccaccatcacagggttatgactcccaagagctgcag
acgggttttcatgaaatcatgcatccctcctgaggttaactctctaagga
tcaagaattgtctctattaccaaataaggatccctcacacagcagaacta
gtttgtaagtcactagttcaaaaattagaaataaatgagtagactggttg
tttgaacaatcatgttccaatataaatggaaaatagaaatatgatttatg
ttggaaaatttaaaaatctgtaaaacagaatgaggtaacatgactaccag
cagtgtcacgtgtagaatattatcaataatatgtaattaagaccattact
gtgtcttttgccttcagaaggcattatagtagttcatatattaaggatag
aattagacttgaatccatatatgttgtcccccttttacagaatattttgt
atagagaaacattatttagcttgactaaaataattagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70074545_70075720
seq2: B6Ng01-211M10.b_49_1229

seq1  GAATTCCTTAGGCATGCATATTTATCTACTGCATCCTTGCACACAGCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAGGCATGCATATTTATCTACTGCATCCTTGCACACAGCATA  50

seq1  AGGTGTGTCAGTCACACATATCTTTGAACTAGTAACTGAGCTTTGAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTGTCAGTCACACATATCTTTGAACTAGTAACTGAGCTTTGAAAAC  100

seq1  ATGACTTTCTTTTCCCATTGCATTATTGAACCTGCAGCTGTTTGGCTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTTCTTTTCCCATTGCATTATTGAACCTGCAGCTGTTTGGCTATG  150

seq1  TGCTTCTGAAATGTCTCTTCACTAGTGTAAATGAATGGTAGGAAAGTAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCTGAAATGTCTCTTCACTAGTGTAAATGAATGGTAGGAAAGTAGA  200

seq1  GAATGGGAGGAGGGAAGTAATGTTTGTAACCTTGTTTTTAAGAAGGTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGGAGGAGGGAAGTAATGTTTGTAACCTTGTTTTTAAGAAGGTTAA  250

seq1  GGAAGTTAAAAAAGGAAAGGGTTGCAGTGTAGCTAAAACAGGTCATGAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTTAAAAAAGGAAAGGGTTGCAGTGTAGCTAAAACAGGTCATGAAC  300

seq1  AGTAATGATTAAGAGGTGGGTTGATTCCTTACCACAAGAAATTTTGAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATGATTAAGAGGTGGGTTGATTCCTTACCACAAGAAATTTTGAGAG  350

seq1  ATCTAAAAACAAACAAACAACAACAACAACAACAACAAAAAACAGAAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAAACAAACAAACAACAACAACAACAACAACAAAAAACAGAAGAT  400

seq1  CTAAAGGCAAAAGCAACAACCATCTCTTTCTTAAGTATAGCTCCAGATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGCAAAAGCAACAACCATCTCTTTCTTAAGTATAGCTCCAGATAT  450

seq1  GCTAACCCACAAAGGTTCCATGCATTCATCTTCAGGCCACATAGTTTTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACCCACAAAGGTTCCATGCATTCATCTTCAGGCCACATAGTTTTAC  500

seq1  TTCTTCAAGGTGGAGTTAAAAACCAAATGAATCCGTGTTCCTAAGAAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCAAGGTGGAGTTAAAAACCAAATGAATCCGTGTTCCTAAGAAATG  550

seq1  GAGAGGAAAATTTGAGGAAGTGATCCGTTGAAGTAGCCCAGGCAAAGGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAAAATTTGAGGAAGTGATCCGTTGAAGTAGCCCAGGCAAAGGGG  600

seq1  CTAGGCATCTCCACTGAGACTGTCAACTGCTAACAAACTCTCTTGGTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCATCTCCACTGAGACTGTCAACTGCTAACAAACTCTCTTGGTGAA  650

seq1  CTTGTCCACCAAGAGAACACTGATTCTGACCCTGTTGTTTCAGTGTTGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCCACCAAGAGAACACTGATTCTGACCCTGTTGTTTCAGTGTTGGT  700

seq1  TCAAAATGGGAAAGTAAGAAATTATGCTCAAAGGAGAAATGTAACTATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATGGGAAAGTAAGAAATTATGCTCAAAGGAGAAATGTAACTATTA  750

seq1  TGGAAAATGAAAACGTTCAATTCCTGCATTTTT--AAAATTCTACTCAGA  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||
seq2  TGGAAAATGAAAACGTTCAATTCCTGCATTTTTTAAAATTTCTACTCAGA  800

seq1  AAATGTACTCCACCTATGTTCACACA-CCTAGTTGCTGTTGCATGTAAGT  847
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTACTCCACCTATGTTCACACACCCTAGTTGCTGTTGCATGTAAGT  850

seq1  AATGGAATCTTTAAATGTGTAAAGAATTACAGTCTGCCAATTATAGACTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAATCTTTAAATGTGTAAAGAATTACAGTCTGCCAATTATAGACTG  900

seq1  TGCATTCACTTT-GACGTGCACAC-TTTGCTGCTGA-TTTAGTTGGTGAG  944
      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCATTCACTTTGGACGTGCACACTTTTGCTGCTGATTTTAGTTGGTGAG  950

seq1  ATTTACATAT-AAAGGGAATCCCT--CCCTTCAAAGTGC-TCAAAACACA  990
      |||||||||| ||||| |||||||  || |||||  ||| ||||||||||
seq2  ATTTACATATAAAAGGAAATCCCTTCCCTTTCAAGTTGCTTCAAAACACA  1000

seq1  AGCAGCTTGCAGA--AACAGCATGGTCACC-ATGTTTGGG-CCCTTGTAG  1036
      |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  AGCAGCTTGCAGAATAACAGCATGGTCACCAATGTTTGGGACCCTTGTAG  1050

seq1  TTTGGGCCCAGGAACAGTGAAATCCCAAAACTCCTTATGTAAGTTGTGTT  1086
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||
seq2  TTTGGGCCCAGGAACAGTGCAAT-CCAAAACTCTTTATGTAAGTTG-GTT  1098

seq1  CAAGCACACTCCTGAATAAGTATGTTAGGTGAGAAAGGGAACTTCGGCAA  1136
      ||  |||  |||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||| 
seq2  CAGCCAC-TTCCTGACT-AGTATGTTAGGCGAG-AATGGAACTTCGGCA-  1144

seq1  GAGGAGAATTTCATCAGTGTTACCACTAAATCTAGGAGTG  1176
         ||||  ||| |||  | ||| |||| |||||||||||
seq2  ---GAGAGATTCGTCATGGATACTACTATATCTAGGAGTG  1181

seq1: chr1_70239212_70240300
seq2: B6Ng01-211M10.g_68_1155 (reverse)

seq1  GCTAATTA-TTTAGTCAA-CTAAAT-ATGTTTTTCTATTACAAAATATTC  47
      |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||
seq2  GCTAATTATTTTAGTCAAGCTAAATAATGTTTCTCTA-TACAAAATATTC  49

seq1  TTTTAAAAGGGGGACAACATATATGATTTCAAATCCTAATTCTATCCTAT  97
       | ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |
seq2  -TGTAAAAGGGGGACAACATATATGGATTCAAGT-CTAATTCTATCCT-T  96

seq1  ATTATATTGAACTACTATAATGCCTTCTGAAGGC-AAAGACACAGTAATG  146
      | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AATATA-TGAACTACTATAATGCCTTCTGAAGGCAAAAGACACAGTAATG  145

seq1  GTCTTAATTACATATTATTGATAATATTCTACACGTGACACTGCTGGTAG  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAATTACATATTATTGATAATATTCTACACGTGACACTGCTGGTAG  195

seq1  TCATGTTACCTCATTCTGTTTTACAGATTTTTAAATTTTCCAACATAAAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTTACCTCATTCTGTTTTACAGATTTTTAAATTTTCCAACATAAAT  245

seq1  CATATTTCTATTTTCCATTTATATTGGAACATGATTGTTCAAACAACCAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTTCTATTTTCCATTTATATTGGAACATGATTGTTCAAACAACCAG  295

seq1  TCTACTCATTTATTTCTAATTTTTGAACTAGTGACTTACAAACTAGTTCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTCATTTATTTCTAATTTTTGAACTAGTGACTTACAAACTAGTTCT  345

seq1  GCTGTGTGAGGGATCCTTATTTGGTAATAGAGACAATTCTTGATCCTTAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGTGAGGGATCCTTATTTGGTAATAGAGACAATTCTTGATCCTTAG  395

seq1  AGAGTTAACCTCAGGAGGGATGCATGATTTCATGAAAACCCGTCTGCAGC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTAACCTCAGGAGGGATGCATGATTTCATGAAAACCCGTCTGCAGC  445

seq1  TCTTGGGAGTCATAACCCTGTGATGGTGGAATTTGTTGCGATTTTCATAG  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGGAGTCATAACCCTGTGATGGTGGAATTTGTTGCGATTTTCATAG  495

seq1  TGCTCTTCATTTCCAGTTCCTAATCTTACATGGGAATTATCTAATTAGAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTTCATTTCCAGTTCCTAATCTTACATGGGAATTATCTAATTAGAA  545

seq1  ACACTAAAAACATTACTTTCATGTGATTTATACATCTAATCACCAGTCTT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAAAAACATTACTTTCATGTGATTTATACATCTAATCACCAGTCTT  595

seq1  CTGAAATCCTCGTCCTTTGAGGAGGTTCAAAAATCTTTCCCCTGGAGGGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAATCCTCGTCCTTTGAGGAGGTTCAAAAATCTTTCCCCTGGAGGGT  645

seq1  GTTACTGAAGTGCTCAGTTCCACAGTGTAGCCCAGCACTAGACACATGGA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTGAAGTGCTCAGTTCCACAGTGTAGCCCAGCACTAGACACATGGA  695

seq1  ATAGTTAGTTTTCTGCATCAGGATTGCTTCATCTTTTGCTTCCTGAACTG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTAGTTTTCTGCATCAGGATTGCTTCATCTTTTGCTTCCTGAACTG  745

seq1  CAGCAAGGTATCATGAATATTGAAAGGCTAAGTTCTACACTGGCCTCTCT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGGTATCATGAATATTGAAAGGCTAAGTTCTACACTGGCCTCTCT  795

seq1  GCTTAGGTTCATGTTCTCATACATTTGGGGATCTGACAAATGTTTATGTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGGTTCATGTTCTCATACATTTGGGGATCTGACAAATGTTTATGTG  845

seq1  GTCATGGTAAAGTGGCCACTCCCATATCACTTCCCAATTTCTGTGCAGAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGGTAAAGTGGCCACTCCCATATCACTTCCCAATTTCTGTGCAGAA  895

seq1  TTACAATTTATTATCCTACATAGGTTATTCAATTCTCCGTCGCTTTCTAG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAATTTATTATCCTACATAGGTTATTCAATTCTCCGTCGCTTTCTAG  945

seq1  AATCATATCTGTTCTAGAAGAGAGATGGATACATGGGCATCTTCTTCTAT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATATCTGTTCTAGAAGAGAGATGGATACATGGGCATCTTCTTCTAT  995

seq1  TTTCTGTTTGATTCTTACCAAGATCAGTTGAGTAGACATGCTTTTGAAAA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTTGATTCTTACCAAGATCAGTTGAGTAGACATGCTTTTGAAAA  1045

seq1  TCCAATTGAATCATCAAAACAATGGCATAACACTTAAGAATTC  1089
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAATTGAATCATCAAAACAATGGCATAACACTTAAGAATTC  1088