BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244P22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 67,714,790 - 67,856,259
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRpe, 1110028C15Rik, Acadl, Myl1, LOC100043192, Lancl1, Cps1, Kif22-ps
Downstream geneErbb4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244P22.bB6Ng01-244P22.g
ACCGA053995GA053996
length8711,022
definitionB6Ng01-244P22.b B6Ng01-244P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,855,396 - 67,856,259)(67,714,790 - 67,715,805)
sequence
gaattcttttatgtttattcttggcatctgttgggtggctcatgaaaata
ggattccctcatttattcatttatccctctttaagaaaacatattaatag
actgaaggatattcttacacaggtcttctaatgatcctggaacccaaatt
agtttctccaatttcatgtataaaataaattacagtttaatgcatctgct
actttcttttatagtaagccgagtgccaattcttacaacgtggattaact
gagagtcttcattagacaagaagtcctttggagagatagcaagggaagga
gggcagaaatgaagacttcactttggtgggagaggggaagagggaaagtt
gaacctcttccacttttaacaaagatgcatccctggtgtctttatgaaag
atctattgaaagttataaggaaagggaaaatccatatagcacagcaagtg
gtatatcatcctgcatgttattttcacatacatcaaaccagaagtatccc
ctacaaatgtgctcaaaacactaattcttgggtcttacataattcttggg
tcttaccagagacatactgagaatgggcctggaaaggtttaacaaactat
ccaggtcatatttgctaatatctgtgaacaactgcttcacttttatccac
agaagaaaatttttaggctttagtaatttgtctggatatgcagagtctta
aagttccttacaagttacactgaaattaatcccttttgcctggggcctca
gagttgcacacctatgagaggcaaaagtactctgggttttgagattttag
gagatcctgagttctgaatggccttctcctgacctgaagtctcttgcact
tccttgacacccatcctttca

gaattctgggtgaatgttgactgtttataaattggaattagaagagtaga
ttagaacagagatatggtgcataataaaggcactgaaatttaccctgaaa
tgaaaaagaaaacagtaggtttttaagcagaggacttatctaactttgat
tcaatggtgtgtgtgtgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttata
gacaggtcaaaaagcctaatgttttattttaggctatcaaatttgtaata
cctaataaattgcaaatgtttgtggagtcaaggtctggctaaaaaagtct
gtgttatttgaaagtcatcagtgtttggtattaaaggtcatgtgatacca
tgagaacactgagtaagtatggataataaagcattcaaacgccatgtcac
tagacacaaacttgtggtaataggaaaagtgaagagaacaggaataaagg
gaagaaagcatgggaattcagtacaaggagaggagatgcttcaatgaaag
gagagaaataacctctgggaactgcagtagatttctaacagtaagaagga
caagctgtggctattagattgaacaatatgggagatattcatgagaagaa
tattttatgtgggctaacttggttcaaaacccaactatagtaatttcaaa
aaaatgggtgaaagacattagaggtgtcaagtttatacaaaccaatcaag
aacaatgtaaatgtgaactctcagttgataataccaaaggttgctaaaat
cagaactaattttataaaatttaatatcatattgaactcatacacaaagt
tcaccaaaattattatctgtaagagtaacacatcagtaattgagggatta
tggcttatctaattaagaagcatttgcctcctctttcagagtacttaagt
tgggtttatagcacccatgtggacagcctcacactctctgtaactcaaga
tccaagaaatctgataccttcattggcctctatgggtgtctgcatacata
catacatatatcatacttacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_67855396_67856259
seq2: B6Ng01-244P22.b_46_915 (reverse)

seq1  GAAA-GATGAGTGTCAAGGAAGTGCAAAGAAGACTCCA-GTCAGGGAGAA  48
      |||| |||| |||||||||||||||||   ||||| || |||| ||||||
seq2  GAAAGGATGGGTGTCAAGGAAGTGCAA--GAGACTTCAGGTCA-GGAGAA  47

seq1  GGCATTTCAGAACTCAGGATCTCCTAAAATCTCAAAA-CCAGAGTACTTT  97
      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGCCATTCAGAACTCAGGATCTCCTAAAATCTCAAAACCCAGAGTACTTT  97

seq1  TGCCTCTCATAGGTGTGCAACTCTGAGGCCCCAGGC-AAAGGGATT-ATT  145
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  TGCCTCTCATAGGTGTGCAACTCTGAGGCCCCAGGCAAAAGGGATTAATT  147

seq1  TCAGTGT-ACTTGTAAGGAACTTT-AGACTCTGCATATCCAGAC-AATTA  192
      ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCAGTGTAACTTGTAAGGAACTTTAAGACTCTGCATATCCAGACAAATTA  197

seq1  CTAAAGCCTAAAAA-TTTCTTCTGTGGATAAAAGTGAAGCAGTTGTTCAC  241
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGCCTAAAAATTTTCTTCTGTGGATAAAAGTGAAGCAGTTGTTCAC  247

seq1  AGATATTAGCAAATATGACCTGGATAGTTTGTTAAACCTTTCCAGGCCCA  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATTAGCAAATATGACCTGGATAGTTTGTTAAACCTTTCCAGGCCCA  297

seq1  TTCTCAGTATGTCTCTGGTAAGACCCAAGAATTATGTAAGACCCAAGAAT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGTATGTCTCTGGTAAGACCCAAGAATTATGTAAGACCCAAGAAT  347

seq1  TAGTGTTTTGAGCACATTTGTAGGGGATACTTCTGGTTTGATGTATGTGA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTTTTGAGCACATTTGTAGGGGATACTTCTGGTTTGATGTATGTGA  397

seq1  AAATAACATGCAGGATGATATACCACTTGCTGTGCTATATGGATTTTCCC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACATGCAGGATGATATACCACTTGCTGTGCTATATGGATTTTCCC  447

seq1  TTTCCTTATAACTTTCAATAGATCTTTCATAAAGACACCAGGGATGCATC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTATAACTTTCAATAGATCTTTCATAAAGACACCAGGGATGCATC  497

seq1  TTTGTTAAAAGTGGAAGAGGTTCAACTTTCCCTCTTCCCCTCTCCCACCA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTAAAAGTGGAAGAGGTTCAACTTTCCCTCTTCCCCTCTCCCACCA  547

seq1  AAGTGAAGTCTTCATTTCTGCCCTCCTTCCCTTGCTATCTCTCCAAAGGA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGAAGTCTTCATTTCTGCCCTCCTTCCCTTGCTATCTCTCCAAAGGA  597

seq1  CTTCTTGTCTAATGAAGACTCTCAGTTAATCCACGTTGTAAGAATTGGCA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGTCTAATGAAGACTCTCAGTTAATCCACGTTGTAAGAATTGGCA  647

seq1  CTCGGCTTACTATAAAAGAAAGTAGCAGATGCATTAAACTGTAATTTATT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGGCTTACTATAAAAGAAAGTAGCAGATGCATTAAACTGTAATTTATT  697

seq1  TTATACATGAAATTGGAGAAACTAATTTGGGTTCCAGGATCATTAGAAGA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACATGAAATTGGAGAAACTAATTTGGGTTCCAGGATCATTAGAAGA  747

seq1  CCTGTGTAAGAATATCCTTCAGTCTATTAATATGTTTTCTTAAAGAGGGA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTAAGAATATCCTTCAGTCTATTAATATGTTTTCTTAAAGAGGGA  797

seq1  TAAATGAATAAATGAGGGAATCCTATTTTCATGAGCCACCCAACAGATGC  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAATAAATGAGGGAATCCTATTTTCATGAGCCACCCAACAGATGC  847

seq1  CAAGAATAAACATAAAAGAATTC  864
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATAAACATAAAAGAATTC  870


seq1: chr1_67714790_67715805
seq2: B6Ng01-244P22.g_63_1084

seq1  GAATTCTGGGTGAATGTTGACTGTTTATAAATTGGAATTAGAAGAGTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGTGAATGTTGACTGTTTATAAATTGGAATTAGAAGAGTAGA  50

seq1  TTAGAACAGAGATATGGTGCATAATAAAGGCACTGAAATTTACCCTGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAACAGAGATATGGTGCATAATAAAGGCACTGAAATTTACCCTGAAA  100

seq1  TGAAAAAGAAAACAGTAGGTTTTTAAGCAGAGGACTTATCTAACTTTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAAGAAAACAGTAGGTTTTTAAGCAGAGGACTTATCTAACTTTGAT  150

seq1  TCAATGGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGTGTGTGTGTGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATA  200

seq1  GACAGGTCAAAAAGCCTAATGTTTTATTTTAGGCTATCAAATTTGTAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGTCAAAAAGCCTAATGTTTTATTTTAGGCTATCAAATTTGTAATA  250

seq1  CCTAATAAATTGCAAATGTTTGTGGAGTCAAGGTCTGGCTAAAAAAGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATAAATTGCAAATGTTTGTGGAGTCAAGGTCTGGCTAAAAAAGTCT  300

seq1  GTGTTATTTGAAAGTCATCAGTGTTTGGTATTAAAGGTCATGTGATACCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTATTTGAAAGTCATCAGTGTTTGGTATTAAAGGTCATGTGATACCA  350

seq1  TGAGAACACTGAGTAAGTATGGATAATAAAGCATTCAAACGCCATGTCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAACACTGAGTAAGTATGGATAATAAAGCATTCAAACGCCATGTCAC  400

seq1  TAGACACAAACTTGTGGTAATAGGAAAAGTGAAGAGAACAGGAATAAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACAAACTTGTGGTAATAGGAAAAGTGAAGAGAACAGGAATAAAGG  450

seq1  GAAGAAAGCATGGGAATTCAGTACAAGGAGAGGAGATGCTTCAATGAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAGCATGGGAATTCAGTACAAGGAGAGGAGATGCTTCAATGAAAG  500

seq1  GAGAGAAATAACCTCTGGGAACTGCAGTAGATTTCTAACAGTAAGAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAAATAACCTCTGGGAACTGCAGTAGATTTCTAACAGTAAGAAGGA  550

seq1  CAAGCTGTGGCTATTAGATTGAACAATATGGGAGATATTCATGAGAAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGTGGCTATTAGATTGAACAATATGGGAGATATTCATGAGAAGAA  600

seq1  TATTTTATGTGGGCTAACTTGGTTCAAAACCCAACTATAGTAATTTCAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTATGTGGGCTAACTTGGTTCAAAACCCAACTATAGTAATTTCAAA  650

seq1  AAAATGGGTGAAAGACATTAGAGGTGTCAAGTTTATACAAACCAATCAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGGTGAAAGACATTAGAGGTGTCAAGTTTATACAAACCAATCAAG  700

seq1  AACAATGTAAATGTGAACTCTCAGTTGATAATACC-AAGGTTGCTAAAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AACAATGTAAATGTGAACTCTCAGTTGATAATACCAAAGGTTGCTAAAAT  750

seq1  CAGAACTAA-TTTATAAAATTTAATATCATATTGAACTCATACACAAAGT  798
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACTAATTTTATAAAATTTAATATCATATTGAACTCATACACAAAGT  800

seq1  TCACCAAAA-TATTATCTGTAAGAGTAACACATCAGTAATTGAGG--ATA  845
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
seq2  TCACCAAAATTATTATCTGTAAGAGTAACACATCAGTAATTGAGGGATTA  850

seq1  TGGCTTATCT-ATTAAG-AGCATTTG-CTCCTCTTTCAGAGTACTTAAGT  892
      |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTATCTAATTAAGAAGCATTTGCCTCCTCTTTCAGAGTACTTAAGT  900

seq1  TTGGTTTATAGCACCCATGTTGGACAG-CTCACACTCTTCTGTAACTCAA  941
      | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  TGGGTTTATAGCACCCATG-TGGACAGCCTCACACTC-TCTGTAACTCAA  948

seq1  GATCCAAGAAATCTGATACCCTCATTGGCCTCTATGGGTGTCTGCATACA  991
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCAAGAAATCTGATACCTTCATTGGCCTCTATGGGTGTCTGCATACA  998

seq1  TACATACATATATACATACATACAT  1016
      ||||||||||||| ||||| |||||
seq2  TACATACATATAT-CATACTTACAT  1022


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |