BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-264C14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 64,802,047 - 64,964,363
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9430067K14Rik
Upstream gene4933402D24Rik, LOC671842, OTTMUSG00000013918, Klf7, Ppia-ps1_583.1, LOC100043124, Creb1, 2310038H17Rik, Ccnyl1, Fzd5
Downstream geneLOC667245, LOC100043141, 4921521F21Rik, LOC667276, Cryge, Crygd, Crygc, Crygb, LOC654356, Cryga, D630023F18Rik, Idh1, Pip5k3, Pthr2, LOC100042716, EG628894, LOC100043165, LOC383520, EG667775
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-264C14.bB6Ng01-264C14.g
ACCGA068137GA068138
length9271,105
definitionB6Ng01-264C14.b B6Ng01-264C14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,963,437 - 64,964,363)(64,802,047 - 64,803,147)
sequence
gaattcagcattgtatttgacaataaggaacctgtgatttaaaaatatta
atgcttaaaaggtgattgttcagtttattaaaatatctagtatatggcca
taagtgtttctaaatttggttttcataactgccatgtacattagattaaa
acatgcttgttttctttaggaatttgacatgtgtacctactcagcagata
catcgttttcttggttttggggcacacagttaagtttccagcaattaaga
aacctagcaattgagtacaatagtttcaagagcctgtgactatatggtgt
gacagggatgcagtgctcaccttcaaaactgttcctcgtgagactgttct
gtagtctgggtgtgatttggatggcccacttagggcagtgctcatgagtg
ggactgaagttgaatgtgggaagggaccaagagtgggcttagggctgcct
ccggtgcttccctctgccggttttatggtctgttccctggctgctgttta
acctctgaggactgctgttggtgactgtgcatctctggcatcaagagctg
ttgctttcctttttcttcccctgcagccctgggaggggtaaactcaaagg
ggggaaaagttttgctgtgaattcttcagccatttagtgcaaattcctgt
aattaccggcattgtgtctcttctgaatggcacataatacagcagaagcc
attcctaattgagaccttacaggaggtacaaatcccctctttgttcagcc
tgacaaattagtgccagaaagtggcagggtccgaatgggaatcaaaggca
agaagcacaaagatgggacttaaggctacagtaataaccctctcttgtcc
tgaaggaaaaaagtaatgaccaatgaaaatgaaggctttttcctccctct
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgttgtt
gaattcacctttaaataagttaacttggaattcactatgtagcccaggct
ggcctcaaatttgaatttgcaattcttctgcctcagcctctggagtacta
ggattacagggctgtgacaccatctctgtgttaaatcccccaattctaac
gtgcgtctaaaactgagagccattgttatatgctggctcaaggtaaggct
atgtaggatgaacccagccaaatgtacaaacagaagtcaaccaaaacaaa
atgactaaggagaaacccaagctatacttaaaccccaacccagggtgcta
tttctcctcttacaggcagaaatcttacttcctatcagcaagtcaacagg
atggaaaaggtggttgttttaagcacgatccttcctttataaacagcttt
tcttcttctcacctcttaaagaaaaaacaaaaaacaaaatacaaaaaaaa
acacccaaacctgccgtgtgctgccgaagtgacgtttgcagactgcagca
gagctctgagacccttttatgcaccaagccccccactaaatcctcagtgc
attatctccctcatccccacaacccccagtaataacagcctctcccattt
tccccacgtgacagatgaggaaacccctgtatgaagagattaagtaacct
gctggagggcaagtcgtgagtagctggcagtgcttaacttgcaaggatcc
ggcctgctctaactccattgtggttttatgtgccggtgccaacttgcctc
tgctgttacatagttggacaaagataatgccacgtggatttcattccttc
agagtccagggcaaatgggctgggatactgtgtccagaaaaaaaaaaaaa
aaaacacagggattacctctggatactgggaatgggacttagggtcttat
cccatttatttttactgaaaggaaatgggaccaagaagacagcaagaaga
actggggcgagagggagctctcacacccccctctttcagtgggggttagt
catcactgggcagcctagggcttctcctgttctttcccttcacactatgt
gggctgtggcttcattagttgcttgatgacagttgtcattatctacattt
gcagc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_64963437_64964363
seq2: B6Ng01-264C14.b_48_974 (reverse)

seq1  AACAACAACACACACACACACACACACAGAGGGAGGAAAAAGCCTTCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAACACACACACACACACACACAGAGGGAGGAAAAAGCCTTCATT  50

seq1  TTCATTGGTCATTACTTTTTTCCTTCAGGACAAGAGAGGGTTATTACTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTGGTCATTACTTTTTTCCTTCAGGACAAGAGAGGGTTATTACTGT  100

seq1  AGCCTTAAGTCCCATCTTTGTGCTTCTTGCCTTTGATTCCCATTCGGACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTAAGTCCCATCTTTGTGCTTCTTGCCTTTGATTCCCATTCGGACC  150

seq1  CTGCCACTTTCTGGCACTAATTTGTCAGGCTGAACAAAGAGGGGATTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACTTTCTGGCACTAATTTGTCAGGCTGAACAAAGAGGGGATTTGT  200

seq1  ACCTCCTGTAAGGTCTCAATTAGGAATGGCTTCTGCTGTATTATGTGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCTGTAAGGTCTCAATTAGGAATGGCTTCTGCTGTATTATGTGCCA  250

seq1  TTCAGAAGAGACACAATGCCGGTAATTACAGGAATTTGCACTAAATGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGAGACACAATGCCGGTAATTACAGGAATTTGCACTAAATGGCT  300

seq1  GAAGAATTCACAGCAAAACTTTTCCCCCCTTTGAGTTTACCCCTCCCAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATTCACAGCAAAACTTTTCCCCCCTTTGAGTTTACCCCTCCCAGG  350

seq1  GCTGCAGGGGAAGAAAAAGGAAAGCAACAGCTCTTGATGCCAGAGATGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGGGGAAGAAAAAGGAAAGCAACAGCTCTTGATGCCAGAGATGCA  400

seq1  CAGTCACCAACAGCAGTCCTCAGAGGTTAAACAGCAGCCAGGGAACAGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACCAACAGCAGTCCTCAGAGGTTAAACAGCAGCCAGGGAACAGAC  450

seq1  CATAAAACCGGCAGAGGGAAGCACCGGAGGCAGCCCTAAGCCCACTCTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACCGGCAGAGGGAAGCACCGGAGGCAGCCCTAAGCCCACTCTTG  500

seq1  GTCCCTTCCCACATTCAACTTCAGTCCCACTCATGAGCACTGCCCTAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTTCCCACATTCAACTTCAGTCCCACTCATGAGCACTGCCCTAAGT  550

seq1  GGGCCATCCAAATCACACCCAGACTACAGAACAGTCTCACGAGGAACAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATCCAAATCACACCCAGACTACAGAACAGTCTCACGAGGAACAGT  600

seq1  TTTGAAGGTGAGCACTGCATCCCTGTCACACCATATAGTCACAGGCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGGTGAGCACTGCATCCCTGTCACACCATATAGTCACAGGCTCTT  650

seq1  GAAACTATTGTACTCAATTGCTAGGTTTCTTAATTGCTGGAAACTTAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTATTGTACTCAATTGCTAGGTTTCTTAATTGCTGGAAACTTAACT  700

seq1  GTGTGCCCCAAAACCAAGAAAACGATGTATCTGCTGAGTAGGTACACATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCCCAAAACCAAGAAAACGATGTATCTGCTGAGTAGGTACACATG  750

seq1  TCAAATTCCTAAAGAAAACAAGCATGTTTTAATCTAATGTACATGGCAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTCCTAAAGAAAACAAGCATGTTTTAATCTAATGTACATGGCAGT  800

seq1  TATGAAAACCAAATTTAGAAACACTTATGGCCATATACTAGATATTTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAAACCAAATTTAGAAACACTTATGGCCATATACTAGATATTTTAA  850

seq1  TAAACTGAACAATCACCTTTTAAGCATTAATATTTTTAAATCACAGGTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGAACAATCACCTTTTAAGCATTAATATTTTTAAATCACAGGTTC  900

seq1  CTTATTGTCAAATACAATGCTGAATTC  927
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTGTCAAATACAATGCTGAATTC  927

seq1: chr1_64802047_64803147
seq2: B6Ng01-264C14.g_67_1171

seq1  GAATTCACCTTTAAATAAGTTAACTTGGAATTCACTATGTAGCCCAGGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCTTTAAATAAGTTAACTTGGAATTCACTATGTAGCCCAGGCT  50

seq1  GGCCTCAAATTTGAATTTGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTGGAGTACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTCAAATTTGAATTTGCAATTCTTCTGCCTCAGCCTCTGGAGTACTA  100

seq1  GGATTACAGGGCTGTGACACCATCTCTGTGTTAAATCCCCCAATTCTAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTACAGGGCTGTGACACCATCTCTGTGTTAAATCCCCCAATTCTAAC  150

seq1  GTGCGTCTAAAACTGAGAGCCATTGTTATATGCTGGCTCAAGGTAAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTCTAAAACTGAGAGCCATTGTTATATGCTGGCTCAAGGTAAGGCT  200

seq1  ATGTAGGATGAACCCAGCCAAATGTACAAACAGAAGTCAACCAAAACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGGATGAACCCAGCCAAATGTACAAACAGAAGTCAACCAAAACAAA  250

seq1  ATGACTAAGGAGAAACCCAAGCTATACTTAAACCCCAACCCAGGGTGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTAAGGAGAAACCCAAGCTATACTTAAACCCCAACCCAGGGTGCTA  300

seq1  TTTCTCCTCTTACAGGCAGAAATCTTACTTCCTATCAGCAAGTCAACAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTCTTACAGGCAGAAATCTTACTTCCTATCAGCAAGTCAACAGG  350

seq1  ATGGAAAAGGTGGTTGTTTTAAGCACGATCCTTCCTTTATAAACAGCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAAAGGTGGTTGTTTTAAGCACGATCCTTCCTTTATAAACAGCTTT  400

seq1  TCTTCTTCTCACCTCTTAAAGAAAAAACAAAAAACAAAATACAAAAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTCTCACCTCTTAAAGAAAAAACAAAAAACAAAATACAAAAAAAA  450

seq1  ACACCCAAACCTGCCGTGTGCTGCCGAAGTGACGTTTGCAGACTGCAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAAACCTGCCGTGTGCTGCCGAAGTGACGTTTGCAGACTGCAGCA  500

seq1  GAGCTCTGAGACCCTTTTATGCACCAAGCCCCCCACTAAATCCTCAGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCTGAGACCCTTTTATGCACCAAGCCCCCCACTAAATCCTCAGTGC  550

seq1  ATTATCTCCCTCATCCCCACAACCCCCAGTAATAACAGCCTCTCCCATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTCCCTCATCCCCACAACCCCCAGTAATAACAGCCTCTCCCATTT  600

seq1  TCCCCACGTGACAGATGAGGAAACCCCTGTATGAAGAGATTAAGTAACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCACGTGACAGATGAGGAAACCCCTGTATGAAGAGATTAAGTAACCT  650

seq1  GCTGGAGGGCAAGTCGTGAGTAGCTGGCAGTGCTTAACTTGCAAGGATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAGGGCAAGTCGTGAGTAGCTGGCAGTGCTTAACTTGCAAGGATCC  700

seq1  GGCCTGCTCTAACTCCATTGTGGTTTTATGTGCCGGTGCCAACTTGCCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGCTCTAACTCCATTGTGGTTTTATGTGCCGGTGCCAACTTGCCTC  750

seq1  TGCTGTTACATAGTTGGACAAAGATAATGCCACGTGGATTTCATTCCTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTACATAGTTGGACAAAGATAATGCCACGTGGATTTCATTCCTTC  800

seq1  AGAGTCCAGGGC-AATGGGCTGGGATACTGTGTCCAG-AAAAAAAAAAAA  848
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGAGTCCAGGGCAAATGGGCTGGGATACTGTGTCCAGAAAAAAAAAAAAA  850

seq1  AAAACACA-GGATTACCTCTGGATACT-GGAAT-GGACTTAGGGTCTTAT  895
      |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  AAAACACAGGGATTACCTCTGGATACTGGGAATGGGACTTAGGGTCTTAT  900

seq1  CCCATT--ATTTTACTGAAAGGAAATGGGACCAAGAAGACAGCAAGAAGA  943
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTTATTTTTACTGAAAGGAAATGGGACCAAGAAGACAGCAAGAAGA  950

seq1  ACT-GGGCGAGA-GGAGCTCCTCAACACCCCCTCTTTCCAGT-GGGGTTA  990
      ||| |||||||| |||||| ||||   |||||||||| |||| |||||||
seq2  ACTGGGGCGAGAGGGAGCT-CTCACACCCCCCTCTTT-CAGTGGGGGTTA  998

seq1  GTCATCACTGGGCAG-CTAGGGC-TCTCCTGT--CTTCCTTTCACACTAA  1036
      ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||| |
seq2  GTCATCACTGGGCAGCCTAGGGCTTCTCCTGTTCTTTCCCTTCACACT-A  1047

seq1  TGTGGGCTTGTGGCCTTCATTAGTTTGCTTTGGTGGCCAGTTGTCATTAT  1086
      ||||||| ||||| ||||||||| ||||||  |  | |||||||||||||
seq2  TGTGGGC-TGTGG-CTTCATTAG-TTGCTT--GATGACAGTTGTCATTAT  1092

seq1  CTAACAATTTGCAGC  1101
      |||   |||||||||
seq2  CTA--CATTTGCAGC  1105