BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-296M14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 75,768,370 - 75,912,754
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCyp27a1, Prkag3, Wnt6, Wnt10a, LOC100042901, Cdk5r2, Fev, Cryba2, Ccdc108, Ihh, Nhej1, Slc23a3, 1810031K17Rik, BC038286, Zfand2b, Abcb6, Atg9a, D1Ertd161e, Stk16, Tuba4a, A630095N17Rik, Dnajb10, Ptprn, Resp18, Dnpep, Des, Speg, Gmppa, Accn4, D1Bwg1363e, A230078I05Rik, AW822216, Inha, Stk11ip, Slc4a3, LOC100039069, LOC383531
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-296M14.bB6Ng01-296M14.g
ACCGA092307GA092308
length1,120917
definitionB6Ng01-296M14.b B6Ng01-296M14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,768,370 - 75,769,495)(75,911,839 - 75,912,754)
sequence
gaattctgcctcgtctcatgtactgagtggagagaggctgttctgcttgg
ggatgctgttgaacttgaaatgtggtactctctgatggagacgggatgtg
ttctgagagggagcacaggcttgagcatcaagacctatgaagttgtaaga
ttgtgagaggctctatctggactctaacatggtgcctgaagatgaggcct
tttggtctaatgccatcagagggcaacaaaagaagtttggctccatctca
aaacttatccagtccctggagccctcgctgagtctagggggacttctgtg
ggctctgtgctcctcctctgtaagccaggactctaatctgtgtcttacat
ccttcctgggaccattgtggggattccctcattcggaaagaattcacaga
gccccgaccacacatttagcattgggtggggcactttggagaatagggaa
cacagttaattctcagcgttatccttaaagaactaacagatgtggatgga
gtttaaagagccgttaggggtgtttgtagatgagttatgcagacagaggt
gggttaaccagctcaatgcagtctggggctcagctctattctgcccgttc
ctgattaaggctatgtactcctctcatagggctcccctacaaaacaactg
gtaaagaatactttctctagggaagtcttgtctagatctggctaacacaa
atctcctagccattcaaactttcctcttgtcaggcccagagtagcaacaa
ataaagatagcgctaaggcattagcttctcatgtaagggaaagtagaggg
ggtcatgtctccatagcccagaatttcaggtcatcagtacaaatgacttg
gcaagtttaaactgtgtgaaagtgagctctgaccaggacttcagcagtgg
atgccctgggtctgtgctgggggtggaggggcaggagccaggcctgctgg
cttagcttgcagaatgacaagggactagttagcatcctcacgctgtcctg
gggaggaagtctcagtctgatcccgctttattaagtttccttgaagatct
gatgtggcagctaggagctcaccgaccttctgaactcagatgttttcagg
tgttttttcaatatttcttc
gaattcccagcctccctgtcatgtctatcaatttctgttagtttcaaagt
ctggctctaataatgccttcactggtcatttaaaacatgacatagttcca
aaggttaaagttcacaatcaaggcagagctaggctctaagaaagaatgct
ttcttgcctcttcctggtccctagtcatggccagctggtgccgccatccc
ctgtgtggtagcagggattaacactaacctctgccttcttcttcacctgc
cctgtgtgtgtctctgtacccaaatctctctccctatgaagacacactgg
atttgggcttaccataatccattttggctcctcttagtatgatggtatct
atggagatcctgctctcagtagggtcacattgaacaggtacagacaggta
aggctttggcatatctttggggtataaggcacaattcagtccacaacaca
agataatccaaaatgttttaagtcctatttttcaactctgtgggctaact
ttatttctgctccctccatgagaggataaagataacataagctgacataa
gaactctgtaacaccctactcatcactttaatgtgattaaacacaccaat
cctgaaggcagtgaagtgctcaagaaataaactcattacacacaaagggc
ccgcggtctaggataatctttgtcatgagctatatatgaaatctgagtaa
tatcacttcacctctctgagccttcaggtgtgaagcccaaaagcagagct
ggcaatggatcagagtttcctgcagtgtgagatatgggtcattggtgagg
tggctgcactcaacactttacagtgtatatactgttgactgaaagagtct
gcatgatgaatgacacagcagagaactaagtttaaagggtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_75768370_75769495
seq2: B6Ng01-296M14.b_49_1168

seq1  GAATTCTGCCTCGTCTCATGTACTGAGTGGAGAGAGGCTGTTCTGCTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCCTCGTCTCATGTACTGAGTGGAGAGAGGCTGTTCTGCTTGG  50

seq1  GGATGCTGTTGAACTTGAAATGTGGTACTCTCTGATGGAGACGGGATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGTTGAACTTGAAATGTGGTACTCTCTGATGGAGACGGGATGTG  100

seq1  TTCTGAGAGGGAGCACAGGCTTGAGCATCAAGACCTATGAAGTTGTAAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGAGGGAGCACAGGCTTGAGCATCAAGACCTATGAAGTTGTAAGA  150

seq1  TTGTGAGAGGCTCTATCTGGACTCTAACATGGTGCCTGAAGATGAGGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAGAGGCTCTATCTGGACTCTAACATGGTGCCTGAAGATGAGGCCT  200

seq1  TTTGGTCTAATGCCATCAGAGGGCAACAAAAGAAGTTTGGCTCCATCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCTAATGCCATCAGAGGGCAACAAAAGAAGTTTGGCTCCATCTCA  250

seq1  AAACTTATCCAGTCCCTGGAGCCCTCGCTGAGTCTAGGGGGACTTCTGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTATCCAGTCCCTGGAGCCCTCGCTGAGTCTAGGGGGACTTCTGTG  300

seq1  GGCTCTGTGCTCCTCCTCTGTAAGCCAGGACTCTAATCTGTGTCTTACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTGTGCTCCTCCTCTGTAAGCCAGGACTCTAATCTGTGTCTTACAT  350

seq1  CCTTCCTGGGACCATTGTGGGGATTCCCTCATTCGGAAAGAATTCACAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTGGGACCATTGTGGGGATTCCCTCATTCGGAAAGAATTCACAGA  400

seq1  GCCCCGACCACACATTTAGCATTGGGTGGGGCACTTTGGAGAATAGGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCGACCACACATTTAGCATTGGGTGGGGCACTTTGGAGAATAGGGAA  450

seq1  CACAGTTAATTCTCAGCGTTATCCTTAAAGAACTAACAGATGTGGATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTAATTCTCAGCGTTATCCTTAAAGAACTAACAGATGTGGATGGA  500

seq1  GTTTAAAGAGCCGTTAGGGGTGTTTGTAGATGAGTTATGCAGACAGAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAAGAGCCGTTAGGGGTGTTTGTAGATGAGTTATGCAGACAGAGGT  550

seq1  GGGTTAACCAGCTCAATGCAGTCTGGGGCTCAGCTCTATTCTGCCCGTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAACCAGCTCAATGCAGTCTGGGGCTCAGCTCTATTCTGCCCGTTC  600

seq1  CTGATTAAGGCTATGTACTCCTCTCATAGGGCTCCCCTACAAAACAACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTAAGGCTATGTACTCCTCTCATAGGGCTCCCCTACAAAACAACTG  650

seq1  GTAAAGAATACTTTCTCTAGGGAAGTCTTGTCTAGATCTGGCTAACACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGAATACTTTCTCTAGGGAAGTCTTGTCTAGATCTGGCTAACACAA  700

seq1  ATCTCCTAGCCATTCAAACTTTCCTCTTGTCAGGCCCAGAGTAGCAACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCTAGCCATTCAAACTTTCCTCTTGTCAGGCCCAGAGTAGCAACAA  750

seq1  ATAAAGATAGCGCTAAGGCATTAGCTTCTCATGTAAGGGAAAGTAGAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGATAGCGCTAAGGCATTAGCTTCTCATGTAAGGGAAAGTAGAGGG  800

seq1  GGTCATGTCTCCATAGCCCAGAATTTCAGGTCATCAGTACAAATGACTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATGTCTCCATAGCCCAGAATTTCAGGTCATCAGTACAAATGACTTG  850

seq1  GCAAGTTTAAACTGTGTGAAAGTGAGCTCTGACCAGGACTTCAGCAGTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTTTAAACTGTGTGAAAGTGAGCTCTGACCAGGACTTCAGCAGTGG  900

seq1  ATGCCCTGGGTCTGTGCTGGGGGTGGAGGGGCAGGAGCCAGGCCTGCTGG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCTGGGTCTGTGCTGGGGGTGGAGGGGCAGGAGCCAGGCCTGCTGG  950

seq1  CTTAGCTTGCAGAATGACAAGGGACTAGTTAGCATCCTCACCGCTGTCCT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTTAGCTTGCAGAATGACAAGGGACTAGTTAGCATCCTCA-CGCTGTCCT  999

seq1  GGGGAGGAAGTCTTCAGTCTGATCCCGCTTTTATAAAGTTTCCTTGAAGG  1050
      |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
seq2  GGGGAGGAAGTC-TCAGTCTGATCCCGC-TTTATTAAGTTTCCTTGAA-G  1046

seq1  ATCTGATTGTGGCAGCTAGAGGCTCACCGAACCTTTCTGAAATCAGATGT  1100
      |||||| ||||||||||||  |||||||||  | ||||||| ||||||||
seq2  ATCTGA-TGTGGCAGCTAGGAGCTCACCGA--CCTTCTGAACTCAGATGT  1093

seq1  TTTCAGTTGTTTTTTC-ATATTTCTTC  1126
      |||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTTCAGGTGTTTTTTCAATATTTCTTC  1120

seq1: chr1_75911839_75912754
seq2: B6Ng01-296M14.g_69_985 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACCCCTTAAACTTAGTTCTCTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACCCTTTAAACTTAGTTCTCTGC  50

seq1  TGTGTCATTCATCATGCAGACTCTTTCAGTCAACAGTATATACACTGT-A  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TGTGTCATTCATCATGCAGACTCTTTCAGTCAACAGTATATACACTGTAA  100

seq1  AGTGTTGAGTGCAGCCACCTCACCAATGACCCATATCTCACACTGCAGGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGAGTGCAGCCACCTCACCAATGACCCATATCTCACACTGCAGGA  150

seq1  AACTCTGATCCATTGCCAGCTCTGCTTTTGGGCTTCACACCTGAAGGCTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGATCCATTGCCAGCTCTGCTTTTGGGCTTCACACCTGAAGGCTC  200

seq1  AGAGAGGTGAAGTGATATTACTCAGATTTCATATATAGCTCATGACAAAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGTGAAGTGATATTACTCAGATTTCATATATAGCTCATGACAAAG  250

seq1  ATTATCCTAGACCGCGGGCCCTTTGTGTGTAATGAGTTTATTTCTTGAGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCCTAGACCGCGGGCCCTTTGTGTGTAATGAGTTTATTTCTTGAGC  300

seq1  ACTTCACTGCCTTCAGGATTGGTGTGTTTAATCACATTAAAGTGATGAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCACTGCCTTCAGGATTGGTGTGTTTAATCACATTAAAGTGATGAGT  350

seq1  AGGGTGTTACAGAGTTCTTATGTCAGCTTATGTTATCTTTATCCTCTCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTTACAGAGTTCTTATGTCAGCTTATGTTATCTTTATCCTCTCAT  400

seq1  GGAGGGAGCAGAAATAAAGTTAGCCCACAGAGTTGAAAAATAGGACTTAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGAGCAGAAATAAAGTTAGCCCACAGAGTTGAAAAATAGGACTTAA  450

seq1  AACATTTTGGATTATCTTGTGTTGTGGACTGAATTGTGCCTTATACCCCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTGGATTATCTTGTGTTGTGGACTGAATTGTGCCTTATACCCCA  500

seq1  AAGATATGCCAAAGCCTTACCTGTCTGTACCTGTTCAATGTGACCCTACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATATGCCAAAGCCTTACCTGTCTGTACCTGTTCAATGTGACCCTACT  550

seq1  GAGAGCAGGATCTCCATAGATACCATCATACTAAGAGGAGCCAAAATGGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCAGGATCTCCATAGATACCATCATACTAAGAGGAGCCAAAATGGA  600

seq1  TTATGGTAAGCCCAAATCCAGTGTGTCTTCATAGGGAGAGAGATTTGGGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGTAAGCCCAAATCCAGTGTGTCTTCATAGGGAGAGAGATTTGGGT  650

seq1  ACAGAGACACACACAGGGCAGGTGAAGAAGAAGGCAGAGGTTAGTGTTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGACACACACAGGGCAGGTGAAGAAGAAGGCAGAGGTTAGTGTTAA  700

seq1  TCCCTGCTACCACACAGGGGATGGCGGCACCAGCTGGCCATGACTAGGGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGCTACCACACAGGGGATGGCGGCACCAGCTGGCCATGACTAGGGA  750

seq1  CCAGGAAGAGGCAAGAAAGCATTCTTTCTTAGAGCCTAGCTCTGCCTTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGAAGAGGCAAGAAAGCATTCTTTCTTAGAGCCTAGCTCTGCCTTGA  800

seq1  TTGTGAACTTTAACCTTTGGAACTATGTCATGTTTTAAATGACCAGTGAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAACTTTAACCTTTGGAACTATGTCATGTTTTAAATGACCAGTGAA  850

seq1  GGCATTATTAGAGCCAGACTTTGAAACTAACAGAAATTGATAGACATGAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTATTAGAGCCAGACTTTGAAACTAACAGAAATTGATAGACATGAC  900

seq1  AGGGAGGCTGGGAATTC  916
      |||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGCTGGGAATTC  917