BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-303K19
Chromosome1 (Build37)
Map Location 70,028,248 - 70,193,066
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpag16
Upstream geneErbb4, LOC667842, EG241084, Ikzf2
Downstream geneA830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-303K19.bB6Ng01-303K19.g
ACCGA097419GA097420
length9941,020
definitionB6Ng01-303K19.b B6Ng01-303K19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(70,028,248 - 70,029,216)(70,192,039 - 70,193,066)
sequence
gaattccatcctttaaaaataaacaaaccaactatgtttaatcataggta
gaccatgaagcttggacctatattatcattgttttgggtcaaatagagat
ggtcagtagttagcttgcatgggactgagactccaaataatgacaacatt
ctaaaatctaggctgctttcaagggaatattgaacctctaatttgattaa
tatagaatattttataatagaacatgagagcatcaaaaagaatttatttg
tcagttggaattattatggaccactaactatagatataaacagcaacaac
agtaaccaagctagtgaatgttcatttatgatgatgtacttagtgccaag
catatgatgccaagcatgtgatgccagctttgtcactcatcactcatgga
agcctctaaaatagggaaaatattggtcataatttatagttgataaaaca
tactttaaaaatatggcaaacagatctttcctgctcgctgaatcttctgg
agcaagataagcagccctgagcagcctgttatcccagggggaacctccat
tctcccaccacttctcctcccatttcatcagatttgcatatacagaacca
tacagaccttcagatatagaactatacaacccaaggttacccatcagagg
cctggcataccaggactattcaggttaacccccttcacaatacctattac
aacaggaacatccagggatcaaagccatccatattgctaacagcccttga
aagaacacaatgaacaaaagccaggtcaatatgacacgttgaaaatagag
ctaccctattacaacaagccctggataccctaacacaactgaagcacaag
aaaataacctttaatccaatcttatatagatgatagatgcccttaaagag
gaaatgaataaaccctttaaagaaatacaagcatatacaatcaacaggta
gaggtatcaaagaggaaacaataatccctaaaagatatagagga
gaattctttgtttagctctgagccccatcttttaagggggttattttgat
tttctggagtccaccctcttgagttctttatatatattggatattagtcc
cctatctgatttaagataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggcc
ttttttttttttaaatagaggagaaaactgtatatttaaacagtgaatgt
cattactggaatttcatttgagaaaaactctcttgatatcactgtatagc
aagattctagaaagccaagatataaggacactatttcagtcaggaattga
aatctttgtaagtatttagtaatctgttaccctttattatgaattctttt
cagaaaacatttagaccagtgaaaaccaaaatgaccattgatcatttcct
tcctttaattcaacatgaggacaagagtcagagtcctagaactgcaagcc
agttgggagttctgtccattctgccatgatttcttgaggttatgctaagt
aagaacagagtcaggcacttttctgcttcctgaaactgatgccagctatt
ccatagactctaaagagctaacagccagtgaccctgtcacccccacgcca
gaatctctgctgtgtcctgtgcaaaatccatactcagcagcaattttcaa
aatgatgcactttcctcagctaggtctgaagcagattcaatatgatttgt
gaatgtctgcgtgggaaaagtggatctcgcttccctactttttctacaat
tacctatattgtttgagccggcagactcaactttaggcactttatgaaaa
tatctattttctctgactatcaaaatgtatgggaatttgcataatcccat
atgggatttgcataaatactagttcttggctggtgctttttttttttgta
gaaaagctggtttctaggtagcatgtacaatgcttttagaatttatcaac
actatgactgacctcctattcagtgacagctcagacattgtaattctctc
ctcaacgatcagagtatgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_70028248_70029216
seq2: B6Ng01-303K19.b_47_1013

seq1  GAATTCCATCCTTTAAAAATAAACAAACCAACTATGTTTAATCATAGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCCTTTAAAAATAAACAAACCAACTATGTTTAATCATAGGTA  50

seq1  GACCATGAAGCTTGGACCTATATTATCATTGTTTTGGGTCAAATAGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATGAAGCTTGGACCTATATTATCATTGTTTTGGGTCAAATAGAGAT  100

seq1  GGTCAGTAGTTAGCTTGCATGGGACTGAGACTCCAAATAATGACAACATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGTAGTTAGCTTGCATGGGACTGAGACTCCAAATAATGACAACATT  150

seq1  CTAAAATCTAGGCTGCTTTCAAGGGAATATTGAACCTCTAATTTGATTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAATCTAGGCTGCTTTCAAGGGAATATTGAACCTCTAATTTGATTAA  200

seq1  TATAGAATATTTTATAATAGAACATGAGAGCATCAAAAAGAATTTATTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAATATTTTATAATAGAACATGAGAGCATCAAAAAGAATTTATTTG  250

seq1  TCAGTTGGAATTATTATGGACCACTAACTATAGATATAAACAGCAACAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTGGAATTATTATGGACCACTAACTATAGATATAAACAGCAACAAC  300

seq1  AGTAACCAAGCTAGTGAATGTTCATTTATGATGATGTACTTAGTGCCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAACCAAGCTAGTGAATGTTCATTTATGATGATGTACTTAGTGCCAAG  350

seq1  CATATGATGCCAAGCATGTGATGCCAGCTTTGTCACTCATCACTCATGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGATGCCAAGCATGTGATGCCAGCTTTGTCACTCATCACTCATGGA  400

seq1  AGCCTCTAAAATAGGGAAAATATTGGTCATAATTTATAGTTGATAAAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTAAAATAGGGAAAATATTGGTCATAATTTATAGTTGATAAAACA  450

seq1  TACTTTAAAAATATGGCAAACAGATCTTTCCTGCTCGCTGAATCTTCTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTAAAAATATGGCAAACAGATCTTTCCTGCTCGCTGAATCTTCTGG  500

seq1  AGCAAGATAAGCAGCCCTGAGCAGCCTGTTATCCCAGGGGGAACCTCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGATAAGCAGCCCTGAGCAGCCTGTTATCCCAGGGGGAACCTCCAT  550

seq1  TCTCCCACCACTTCTCCTCCCATTTCATCAGATTTGCATATACAGAACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCACCACTTCTCCTCCCATTTCATCAGATTTGCATATACAGAACCA  600

seq1  TACAGACCTTCAGATATAGAACTATACAACCCAAGGTTACCCATCAGAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGACCTTCAGATATAGAACTATACAACCCAAGGTTACCCATCAGAGG  650

seq1  CCTGGCATACCAGGACTATTCAGGTTAACCCCCTTCACAATACCTATTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCATACCAGGACTATTCAGGTTAACCCCCTTCACAATACCTATTAC  700

seq1  AACAGGAACATCCAGGGATCAAAGCCATCCATATTGCTAACAGCCCTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGAACATCCAGGGATCAAAGCCATCCATATTGCTAACAGCCCTTGA  750

seq1  AAGAACACAATGAACAAAAGCCAGGTCAATATGACACGTTGAAAATAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACACAATGAACAAAAGCCAGGTCAATATGACACGTTGAAAATAGAG  800

seq1  CTACCCTATTACAACAAGCCCTGGATACCCTAACACAACTGAAGCACAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCTATTACAACAAGCCCTGGATACCCTAACACAACTGAAGCACAAG  850

seq1  AAAATAACCTTAAATCCAATCTTATATAGATGATAGATGCCCTTAAAGAG  900
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAACCTTTAATCCAATCTTATATAGATGATAGATGCCCTTAAAGAG  900

seq1  GAAATGAATAAACCCTTTAAAGAAATACAAGCATATACAATCAAACAGGT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GAAATGAATAAACCCTTTAAAGAAATACAAGCATATACAATC-AACAGGT  949

seq1  AGAGGTATTCAAAGAGGAA  969
      ||||||| |||||||||||
seq2  AGAGGTA-TCAAAGAGGAA  967

seq1: chr1_70192039_70193066
seq2: B6Ng01-303K19.g_64_1083 (reverse)

seq1  ATCATACTCTTATCTTTTGAGAGAGAATTACAAATGTCTTGAGCTGTCAC  50
      |||||||||| ||| ||   ||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  ATCATACTCTGATCGTTGAGGAGAGAATTAC-AATGTC-TGAGCTGTCAC  48

seq1  TTGAATAGGAGGTCAGTCATAGTGTTTGATAAATTTCTAAAAGCATTGTA  100
       ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  -TGAATAGGAGGTCAGTCATAGTG-TTGATAAA-TTCTAAAAGCATTGTA  95

seq1  CATGCTAACCTAGAAAACAGCTTTTCTTAAAAAAAAAAAAAGGCAACAGC  150
      |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||| ||||
seq2  CATGCT-ACCTAGAAACCAGCTTTTCT--ACAAAAAAAAAAAGCACCAGC  142

seq1  CAAGAAACTAGTATTTATGCAAATCCCATATGGGATTTATGCAAATT-CC  199
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  CAAG-AACTAGTATTTATGCAAATCCCATATGGGA-TTATGCAAATTCCC  190

seq1  ATACATTTTGATAGTCAGAGAAAATAGATATTTTTCATAAAGTGCCT-AA  248
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  ATACATTTTGATAGTCAGAGAAAATAGATA-TTTTCATAAAGTGCCTAAA  239

seq1  GTTGAGTCTGCC-GCTCAAACAATATAGGTAATTGTAGAAAAAGTAGGGA  297
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGTCTGCCGGCTCAAACAATATAGGTAATTGTAGAAAAAGTAGGGA  289

seq1  AGCGAGATCCACTTTTCCCACGCAGACATTCACAAATCATATTGAATCTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAGATCCACTTTTCCCACGCAGACATTCACAAATCATATTGAATCTG  339

seq1  CTTCAGACCTAGCTGAGGAAAGTGCATCATTTTGAAAATTGCTGCTGAGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGACCTAGCTGAGGAAAGTGCATCATTTTGAAAATTGCTGCTGAGT  389

seq1  ATGGATTTTGCACAGGACACAGCAGAGATTCTGGCGTGGGGGTGACAGGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATTTTGCACAGGACACAGCAGAGATTCTGGCGTGGGGGTGACAGGG  439

seq1  TCACTGGCTGTTAGCTCTTTAGAGTCTATGGAATAGCTGGCATCAGTTTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGGCTGTTAGCTCTTTAGAGTCTATGGAATAGCTGGCATCAGTTTC  489

seq1  AGGAAGCAGAAAAGTGCCTGACTCTGTTCTTACTTAGCATAACCTCAAGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCAGAAAAGTGCCTGACTCTGTTCTTACTTAGCATAACCTCAAGA  539

seq1  AATCATGGCAGAATGGACAGAACTCCCAACTGGCTTGCAGTTCTAGGACT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATGGCAGAATGGACAGAACTCCCAACTGGCTTGCAGTTCTAGGACT  589

seq1  CTGACTCTTGTCCTCATGTTGAATTAAAGGAAGGAAATGATCAATGGTCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCTTGTCCTCATGTTGAATTAAAGGAAGGAAATGATCAATGGTCA  639

seq1  TTTTGGTTTTCACTGGTCTAAATGTTTTCTGAAAAGAATTCATAATAAAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGTTTTCACTGGTCTAAATGTTTTCTGAAAAGAATTCATAATAAAG  689

seq1  GGTAACAGATTACTAAATACTTACAAAGATTTCAATTCCTGACTGAAATA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACAGATTACTAAATACTTACAAAGATTTCAATTCCTGACTGAAATA  739

seq1  GTGTCCTTATATCTTGGCTTTCTAGAATCTTGCTATACAGTGATATCAAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCTTATATCTTGGCTTTCTAGAATCTTGCTATACAGTGATATCAAG  789

seq1  AGAGTTTTTCTCAAATGAAATTCTAGTAATGACATTCACTGTTTAAATAT  847
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTTTCTCAAATGAAATTCCAGTAATGACATTCACTGTTTAAATAT  839

seq1  ACAGTTTTCTCCTCTATTTAAAAAAAAAAAAGGCCACCAACAGATTGGGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTTTCTCCTCTATTTAAAAAAAAAAAAGGCCACCAACAGATTGGGA  889

seq1  AAGGATCTTTACCTATCTTAAATCAGATAGGGGACTAATATCCAATATAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATCTTTACCTATCTTAAATCAGATAGGGGACTAATATCCAATATAT  939

seq1  ATAAAGAACTCAAGAGGGTGGACTCCAGAAAATCAAAATAACCCCCTTAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAACTCAAGAGGGTGGACTCCAGAAAATCAAAATAACCCCCTTAA  989

seq1  AAGATGGGGCTCAGAGCTAAACAAAGAATTC  1028
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGGGGCTCAGAGCTAAACAAAGAATTC  1020