BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-329G22
Chromosome1 (Build37)
Map Location 176,676,571 - 176,816,229
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFmn2, Grem2
Upstream geneIfi204, EG666028, LOC100040462, Mnda, Ifi203, Ifi202b, Ifi205, Olfr433, Olfr432, GA_x5J8B7W3B3M-30314-31216, Olfr430, Olfr429, Olfr426, Olfr1528-ps1, Olfr244, Olfr424, Olfr423-ps1, Olfr421, Olfr422-ps1, Olfr420, Spna1, Olfr419, 1810030J14Rik, Olfr417, GA_x5J8B7W3B3M-312879-313274, GA_x5J8B7W3B3M-318013-318414, Olfr415, Olfr414, Olfr220
Downstream geneRgs7, Fh1, Kmo, Opn3, Chml, Wdr64, Exo1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-329G22.bB6Ng01-329G22.g
ACCGA116399GA116400
length1,1291,184
definitionB6Ng01-329G22.b B6Ng01-329G22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(176,676,571 - 176,677,695)(176,815,049 - 176,816,229)
sequence
gaattccttcctgattggtggggacagaattccttcctgctcctcagtat
acaggcttcagctgatgggattgggcccaaccctgtataaagagaaatat
gctttccttaaagtctagtgaaggaagtggtaaccacatctcacacctgc
cgtcacaacgaggctggtgtctcaatcccagctagagatcataacccacc
caaggaaatagtccaactagcggtcacgctcgggagagactccgtgtatt
ctcaggaaaggattttattgaataaattccttgtcgttcctttaccaggc
aagttcttaacagcctctgtgcagggagcacaccctcggaagctgcggag
gtgctgtgctaggcaggctgattaaagaattgtcaagttcgaaggaaaaa
gctgaagtgaagacataatttgtatcaaccacaaattcaatgtaaatact
tatgataaaatgcttagtagtacagcaattttgatgtttagaaatgaaaa
taagtaatggattatctaaaacatttaataccctccacaccaccccagaa
tgtttctttatgccatttcaccagcattactacataggctggacagtgac
caacagtagctctgtgaagaacaacaacatagcccttctaggggcctttg
attttgagccaggcctgttactttccatcgctctataccttaaactagga
ttaaaactgtcagtatttactgttgttaaagaagactgagtggcatggtc
cctgacaggtgctttagtacttggtaagtgattgatagatgcttctgtgt
tactgttatattattatcatcattagagactaaaaaccatatagtagtag
agcctgggaggtaggtcactcattgaggtgctttgctttcacaatcatgc
tgagtttggctccctagctaccatgcagaagctgatcatggcactgcata
tctatagttccagagctgggaatgcaggtaggagggtctcctcgagctta
cagccagctcattttgataataactgactttcagttcagaaagagatcct
gtttaaaacttaaagtggaaaatttagaaggagaaaaaataacctcaatg
ttacctccagtctttcatataaaccatac
gaattcaggccagtatgaagaatatagtggtatccattctctgatatcag
aaaaggaggagggtcacaggaggccatgaagatgaagcaattttgtggat
tcaaagagaggtgagatatagttttttactccagctgcaagataggccac
tgagggaccacatccaggcatactcgtatacacacagaccacttgggtgg
tagacacatagcacatagacctagaaacacatgtaggcagactgacaaag
gcaaaggctacaacctctggcctcaatgccatatttatacagaatccaca
caaaaactggcagcctttcaggaatagttaaaaaatggagtacatcactg
cttgcttactttaggggttcccaggatgtctggtctggtgtcagacattt
tgtgctgactcaggcccctgaatgtcctgtgtcagtcatgttttagctga
ctcttacagcatatctacatcagcaccatgctgtttaaacataaactcgt
cctatggccttctggtgccagtagtaggtcaatgggctttaatgtagccg
cgggcaagaagttcacagacaagagttcacagttgctcatgtcaattcaa
acacaacaaactgtttcatctcaagttttggttctctaccaaataatacc
cagagccattataagaagggatagattctgattagtatgtctgaggaagc
ctagagtgaatgataatttactttgtagctcaagctggcctcaaaatcat
tacatagcccaggctggcttcaaatttgatttctctgcagcagcctccca
gaattttagactcatagtcaggagccattttgcctggctgatcagctaaa
aatagctaattaaagtaattaattaacagctgatgaaaacaattaaaggt
atctataaagatagacttaccaaagtgtgaatgtatatcattctaatttt
tgaagttgctatttttgaaatagagttttatttaccacaacatgccatag
attattttaaacaaagtcataaataattcaggttgtttgactttaaatac
aataaaatattgaatagcttgtaatagaacaaagctccttggaggttctt
agagttttaaagagcaattggaggttctgatcattgcaacttggctagga
ttggtctagttccaggaaaaggatatatccaggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_176676571_176677695
seq2: B6Ng01-329G22.b_46_1174

seq1  GAATTCCTTCCTGATTGGTGGGGACAGAATTCCTTCCTGCTCCTCAGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCTGATTGGTGGGGACAGAATTCCTTCCTGCTCCTCAGTAT  50

seq1  ACAGGCTTCAGCTGATGGGATTGGGCCCAACCCTGTATAAAGAGAAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGCTTCAGCTGATGGGATTGGGCCCAACCCTGTATAAAGAGAAATAT  100

seq1  GCTTTCCTTAAAGTCTAGTGAAGGAAGTGGTAACCACATCTCACACCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCTTAAAGTCTAGTGAAGGAAGTGGTAACCACATCTCACACCTGC  150

seq1  CGTCACAACGAGGCTGGTGTCTCAATCCCAGCTAGAGATCATAACCCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCACAACGAGGCTGGTGTCTCAATCCCAGCTAGAGATCATAACCCACC  200

seq1  CAAGGAAATAGTCCAACTAGCGGTCACGCTCGGGAGAGACTCCGTGTATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAAATAGTCCAACTAGCGGTCACGCTCGGGAGAGACTCCGTGTATT  250

seq1  CTCAGGAAAGGATTTTATTGAATAAATTCCTTGTCGTTCCTTTACCAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGAAAGGATTTTATTGAATAAATTCCTTGTCGTTCCTTTACCAGGC  300

seq1  AAGTTCTTAACAGCCTCTGTGCAGGGAGCACACCCTCGGAAGCTGCGGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTTAACAGCCTCTGTGCAGGGAGCACACCCTCGGAAGCTGCGGAG  350

seq1  GTGCTGTGCTAGGCAGGCTGATTAAAGAATTGTCAAGTTCGAAGGAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGTGCTAGGCAGGCTGATTAAAGAATTGTCAAGTTCGAAGGAAAAA  400

seq1  GCTGAAGTGAAGACATAATTTGTATCAACCACAAATTCAATGTAAATACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAGTGAAGACATAATTTGTATCAACCACAAATTCAATGTAAATACT  450

seq1  TATGATAAAATGCTTAGTAGTACAGCAATTTTGATGTTTAGAAATGAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAAAATGCTTAGTAGTACAGCAATTTTGATGTTTAGAAATGAAAA  500

seq1  TAAGTAATGGATTATCTAAAACATTTAATACCCTCCACACCACCCCAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAATGGATTATCTAAAACATTTAATACCCTCCACACCACCCCAGAA  550

seq1  TGTTTCTTTATGCCATTTCACCAGCATTACTACATAGGCTGGACAGTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTTTATGCCATTTCACCAGCATTACTACATAGGCTGGACAGTGAC  600

seq1  CAACAGTAGCTCTGTGAAGAACAACAACATAGCCCTTCTAGGGGCCTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTAGCTCTGTGAAGAACAACAACATAGCCCTTCTAGGGGCCTTTG  650

seq1  ATTTTGAGCCAGGCCTGTTACTTTCCATCGCTCTATACCTTAAACTAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGAGCCAGGCCTGTTACTTTCCATCGCTCTATACCTTAAACTAGGA  700

seq1  TTAAAACTGTCAGTATTTACTGTTGTTAAAGAAGACTGAGTGGCATGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACTGTCAGTATTTACTGTTGTTAAAGAAGACTGAGTGGCATGGTC  750

seq1  CCTGACAGGTGCTTTAGTACTTGGTAAGTGATTGATAGATGCTTCTGTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACAGGTGCTTTAGTACTTGGTAAGTGATTGATAGATGCTTCTGTGT  800

seq1  TACTGTTATATTATTATCATCATTAGAGACTAAAAACCATATAGTAGTAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTATATTATTATCATCATTAGAGACTAAAAACCATATAGTAGTAG  850

seq1  AGCCTGGGAGGTAGGTCACTCATTGAGGTGC-TTGC-TTCACAATCATGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
seq2  AGCCTGGGAGGTAGGTCACTCATTGAGGTGCTTTGCTTTCACAATCATGC  900

seq1  TGAGTTTGGCTCCCTAGCTACCATGCAGAAGCTGATCATGGCACTGCATA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTTGGCTCCCTAGCTACCATGCAGAAGCTGATCATGGCACTGCATA  950

seq1  CCTATAGTTCCAGAGCTGGGAATGCAGGTAGGAGGGTCTCCTCGAGCTTA  998
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATAGTTCCAGAGCTGGGAATGCAGGTAGGAGGGTCTCCTCGAGCTTA  1000

seq1  CAGGCCAGCTCATTTTGATAAATAACTGACTTTCAGGTTCAGAAAGAGAC  1048
      || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  CA-GCCAGCTCATTTTGAT-AATAACTGACTTTCA-GTTCAGAAAGAGAT  1047

seq1  CCTGTTTTAAAAACTAAAGTGGAAAA-TTAGA--GAG-AAAAATA--CTC  1092
      |||| |||||||  |||||||||||| |||||  ||| |||||||  |||
seq2  CCTG-TTTAAAACTTAAAGTGGAAAATTTAGAAGGAGAAAAAATAACCTC  1096

seq1  AAATGTTACCCTCCAG-CTTTCATATAAA-CATAC  1125
       ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||
seq2  -AATGTTA-CCTCCAGTCTTTCATATAAACCATAC  1129

seq1: chr1_176815049_176816229
seq2: B6Ng01-329G22.g_63_1246 (reverse)

seq1  CCCTG---ATATCCTTTCCTTG--ACTAGACCCAACCCTTACCAAAGTTG  45
      |||||   ||||||||| | ||  |||||||| | ||  || | ||||||
seq2  CCCTGGATATATCCTTTTCCTGGAACTAGACCAATCC--TAGCCAAGTTG  48

seq1  CAATGATCAGAACCTCATTTTGCTCTTTAAAAACTCTTAAGGACCT-CAA  94
      ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| |||| |||
seq2  CAATGATCAGAACCTCCAATTGCTCTTT-AAAACTC-TAAGAACCTCCAA  96

seq1  GGAGCTTTTGTTTCTATTAC-AGCTAT--CATA-TTTATTGTATTTTAAA  140
      ||||||||   ||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||||||
seq2  GGAGCTTT--GTTCTATTACAAGCTATTCAATATTTTATTGTA-TTTAAA  143

seq1  GTCAAACAACCTGAATTATTTATGACTTTGTTTAAAATAATCTATGGCAT  190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAACAACCTGAATTATTTATGACTTTGTTTAAAATAATCTATGGCAT  193

seq1  GTTGTGTTAAATAAAACTCTATTTTCAAAAATAGCAACTTCAAAAATTAG  240
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGGTAAATAAAACTCTA-TTTCAAAAATAGCAACTTCAAAAATTAG  242

seq1  AATGATATACATTCACACTTTGGTAAGTCTATCTTTATAGATACC-TTAA  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AATGATATACATTCACACTTTGGTAAGTCTATCTTTATAGATACCTTTAA  292

seq1  TTGTTTTCATCAGCTGTTAATTAATTACTTTAATTAGCTATTTTTAGCTG  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTCATCAGCTGTTAATTAATTACTTTAATTAGCTATTTTTAGCTG  342

seq1  ATCAGCCAGGCAAAATGGCTCCTGACTATGAGTCTAAAATTCTGGGAGGC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCCAGGCAAAATGGCTCCTGACTATGAGTCTAAAATTCTGGGAGGC  392

seq1  TGCTGCAGAGAAATCAAATTTGAAGCCAGCCTGGGCTATGTAATGATTTT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCAGAGAAATCAAATTTGAAGCCAGCCTGGGCTATGTAATGATTTT  442

seq1  GAGGCCAGCTTGAGCTACAAAGTAAATTATCATTCACTCTAGGCTTCCTC  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGCTTGAGCTACAAAGTAAATTATCATTCACTCTAGGCTTCCTC  492

seq1  AGACATACTAATCAGAATCTATCCCTTCTTATAATGGCTCTGGGTATTAT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATACTAATCAGAATCTATCCCTTCTTATAATGGCTCTGGGTATTAT  542

seq1  TTGGTAGAGAACCAAAACTTGAGATGAAACAGTTTGTTGTGTTTGAATTG  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAGAGAACCAAAACTTGAGATGAAACAGTTTGTTGTGTTTGAATTG  592

seq1  ACATGAGCAACTGTGAACTCTTGTCTGTGAACTTCTTGCCCGCGGCTACA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAGCAACTGTGAACTCTTGTCTGTGAACTTCTTGCCCGCGGCTACA  642

seq1  TTAAAGCCCATTGACCTACTACTGGCACCAGAAGGCCATAGGACGAGTTT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCCCATTGACCTACTACTGGCACCAGAAGGCCATAGGACGAGTTT  692

seq1  ATGTTTAAACAGCATGGTGCTGATGTAGATATGCTGTAAGAGTCAGCTAA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAAACAGCATGGTGCTGATGTAGATATGCTGTAAGAGTCAGCTAA  742

seq1  AACATGACTGACACAGGACATTCAGGGGCCTGAGTCAGCACAAAATGTCT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGACTGACACAGGACATTCAGGGGCCTGAGTCAGCACAAAATGTCT  792

seq1  GACACCAGACCAGACATCCTGGGAACCCCTAAAGTAAGCAAGCAGTGATG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACCAGACCAGACATCCTGGGAACCCCTAAAGTAAGCAAGCAGTGATG  842

seq1  TACTCCATTTTTTAACTATTCCTGAAAGGCTGCCAGTTTTTGTGTGGATT  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCATTTTTTAACTATTCCTGAAAGGCTGCCAGTTTTTGTGTGGATT  892

seq1  CTGTATAAATATGGCATTGAGGCCAGAGGTTGTAGCCTTTGCCTTTGTCA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATAAATATGGCATTGAGGCCAGAGGTTGTAGCCTTTGCCTTTGTCA  942

seq1  GTCTGCCTACATGTGTTTCTAGGTCTATGTGCTATGTGTCTACCACCCAA  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCCTACATGTGTTTCTAGGTCTATGTGCTATGTGTCTACCACCCAA  992

seq1  GTGGTCTGTGTGTATACGAGTATGCCTGGATGTGGTCCCTCAGTGGCCTA  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCTGTGTGTATACGAGTATGCCTGGATGTGGTCCCTCAGTGGCCTA  1042

seq1  TCTTGCAGCTGGAGTAAAAAACTATATCTCACCTCTCTTTGAATCCACAA  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCAGCTGGAGTAAAAAACTATATCTCACCTCTCTTTGAATCCACAA  1092

seq1  AATTGCTTCATCTTCATGGCCTCCTGTGACCCTCCTCCTTTTCTGATATC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTTCATCTTCATGGCCTCCTGTGACCCTCCTCCTTTTCTGATATC  1142

seq1  AGAGAATGGATACCACTATATTCTTCATACTGGCCTGAATTC  1181
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATGGATACCACTATATTCTTCATACTGGCCTGAATTC  1184