BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-347J05
Chromosome1 (Build37)
Map Location 177,115,393 - 177,265,067
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRgs7
Upstream geneSpna1, Olfr419, 1810030J14Rik, Olfr417, GA_x5J8B7W3B3M-312879-313274, GA_x5J8B7W3B3M-318013-318414, Olfr415, Olfr414, Olfr220, Fmn2, Grem2
Downstream geneFh1, Kmo, Opn3, Chml, Wdr64, Exo1, Gm104, Pld5, B020018G12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-347J05.bB6Ng01-347J05.g
ACCGA129139GA129140
length1,1381,009
definitionB6Ng01-347J05.b B6Ng01-347J05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(177,263,932 - 177,265,067)(177,115,393 - 177,116,401)
sequence
gaattccaagggtcaccacagttgaattacgaggagaccaacatcagtga
ttggaagctgagcacaaacttccaggattacccctgagatgacctttggc
tcttcttgtgtcgaggcctttcatgctgttaatctgccaagccatggcac
tgccattccaattgttaccaatgtggctgctgctaccgctactctctctt
gcttctattttcatggtaccagctcatccagtacttcagaagcagggttt
tattggacctaatgttgtgaccctcaggaaggcagcacaggggagtgtct
cccaggcaacctgctaaatgagtgtgggcagtctgcttatctagaaaagg
ggtgttttgacagaccaaaatatcttgaacagttgtggtcatttctttgg
accaattccagtcatttgctagaataaatcacaactacttattggagcag
ttacagccttgcatcttgtggcaggagtcaggagatccttgacagggcaa
gtggtcctcctctggcaaaggcagaaatggttgcatgggtcatctagagt
ttaggtatccaaaagtctggtacaaatagtttcaaatcatccttgctgag
gctactcctacaaagccagagttgttggctgaaatctttgtatagttgtc
tcaatatgtccatggaatgtttttgataactcttgccaccagaaagacaa
agtggttggctgttcatatgatgggccttttacttaagttagtaaggaaa
aatttaaaggctgttgattaagaagtcaaattgcccatccctagtgtgtg
tctacttattcacagacaaaagaacatcagtttgagctatgtccttcaga
aagcattcatattcatctagcattgaggaggatgggaattgtgtgtgctg
aacactttgtgtgcattacttcattctcttctctcagctacctagtaagg
tacgccttgttctccatgtgaacaaggtgatcactccagctgtgacagat
ggagtatgatgtgttgttatttggatttttgtggaagccacataatttat
aatggaaatgaagcagtccagtgttgttttgggctgagtatgagtagaag
gaacctcgtccattagatctctctggccaggttgctga
gaattctgtgggctgccctagaaggaaagcttcagataactctggacttt
gaaatggtaaggaagtaggagtaccttcttttacttgaggataaatataa
aaggaaatggggtaggttatagggagtgcagcctacatttcttgtgtcgg
gccttctgttgctatgctcccacacagatcctggctacagtacagttgtc
agtacataggacaggcctctgttaacatggagaagtaacagtaacaaagc
caacgatttgtccaccaactggacacagcagtcatagacatagaaaacct
cagaggatgctatgataggcagttcttattaatgttgctatttttttctt
ttgtttctatttttgcaggccagtcactgaatagatctcatgcattcaac
agcaaaaacttaactctaagactaaatgggaacacaagaggcaggtgcaa
gaataagtctaggctctgtgctgagttgtgttgaggtctaccccctcccc
acgcctagccaaaaagactcaaatgggcattgactaaaagtacaaggcat
cagtcatggagagaccagcaagaatgccacacacactacatttatgggaa
ttcttgggcttatgttacttagcaacagtgtgtgtggatggataggaggc
aggacccaacaccacaatctggcggcttcattatatcttggttatagagt
taaaaggtatcatgagagactgaaacaaaaccagtgaaaacgaagaagga
tgtaggatgcttgaatcaatctcccattcaagggaggagaagttttccat
agcctacagtgagaattcaaaaatatttgttaaatgaacccaaagggtga
ataattcaacaagacactgatcttataatattcacatgcagtccctatta
tgatattatcattagaccaaagtgtagaagaaatccaacacgttagacaa
atctggtaatgttgtgtgattgttttgaaaagaaaaccccctcctcccat
ggactcata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_177263932_177265067
seq2: B6Ng01-347J05.b_48_1185 (reverse)

seq1  TCAGCAAACCTGG-CAGAGAGAACTTATGGACGAGGTTCCCTCTACACCA  49
      ||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |  
seq2  TCAGC-AACCTGGCCAGAGAGATCTAATGGACGAGGTTCCTTCTACTCAT  49

seq1  TCTCAGCACAAAACAACACTGAACTGCTTCA-TTCCATTAT-AATTATGT  97
       |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  ACTCAGCCCAAAACAACACTGGACTGCTTCATTTCCATTATAAATTATGT  99

seq1  GGCTTCCAACAAAATCCAAATAACAACACATCATACTCCATCTGTCACAG  147
      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCCACAAAAATCCAAATAACAACACATCATACTCCATCTGTCACAG  149

seq1  CTGGAGTGATCAACCTTGTTCACATGGAG-ACAAGGCGTACCTTACTAGG  196
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGTGATC-ACCTTGTTCACATGGAGAACAAGGCGTACCTTACTAGG  198

seq1  TAGCTGAGAGAAGAGAATGAAGTAATGCACACAAAGTGTTCAGCACACAC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTGAGAGAAGAGAATGAAGTAATGCACACAAAGTGTTCAGCACACAC  248

seq1  AATTCCCATCCTCCTCAATGCTAGATGAATATGAATGCTTTCTGAAGGAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCCATCCTCCTCAATGCTAGATGAATATGAATGCTTTCTGAAGGAC  298

seq1  ATAGCTCAAACTGATGTTCTTTTGTCTGTGAATAAGTAGACACACACTAG  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTCAAACTGATGTTCTTTTGTCTGTGAATAAGTAGACACACACTAG  348

seq1  GGATGGGCAATTTGACTTCTTAATCAACAGCCTTTAAATTTTTCCTTACT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGCAATTTGACTTCTTAATCAACAGCCTTTAAATTTTTCCTTACT  398

seq1  AACTTAAGTAAAAGGCCCATCATATGAACAGCCAACCACTTTGTCTTTCT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAGTAAAAGGCCCATCATATGAACAGCCAACCACTTTGTCTTTCT  448

seq1  GGTGGCAAGAGTTATCAAAAACATTCCATGGACATATTGAGACAACTATA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCAAGAGTTATCAAAAACATTCCATGGACATATTGAGACAACTATA  498

seq1  CAAAGATTTCAGCCAACAACTCTGGCTTTGTAGGAGTAGCCTCAGCAAGG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGATTTCAGCCAACAACTCTGGCTTTGTAGGAGTAGCCTCAGCAAGG  548

seq1  ATGATTTGAAACTATTTGTACCAGACTTTTGGATACCTAAACTCTAGATG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTGAAACTATTTGTACCAGACTTTTGGATACCTAAACTCTAGATG  598

seq1  ACCCATGCAACCATTTCTGCCTTTGCCAGAGGAGGACCACTTGCCCTGTC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGCAACCATTTCTGCCTTTGCCAGAGGAGGACCACTTGCCCTGTC  648

seq1  AAGGATCTCCTGACTCCTGCCACAAGATGCAAGGCTGTAACTGCTCCAAT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATCTCCTGACTCCTGCCACAAGATGCAAGGCTGTAACTGCTCCAAT  698

seq1  AAGTAGTTGTGATTTATTCTAGCAAATGACTGGAATTGGTCCAAAGAAAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGTTGTGATTTATTCTAGCAAATGACTGGAATTGGTCCAAAGAAAT  748

seq1  GACCACAACTGTTCAAGATATTTTGGTCTGTCAAAACACCCCTTTTCTAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACAACTGTTCAAGATATTTTGGTCTGTCAAAACACCCCTTTTCTAG  798

seq1  ATAAGCAGACTGCCCACACTCATTTAGCAGGTTGCCTGGGAGACACTCCC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCAGACTGCCCACACTCATTTAGCAGGTTGCCTGGGAGACACTCCC  848

seq1  CTGTGCTGCCTTCCTGAGGGTCACAACATTAGGTCCAATAAAACCCTGCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCTGCCTTCCTGAGGGTCACAACATTAGGTCCAATAAAACCCTGCT  898

seq1  TCTGAAGTACTGGATGAGCTGGTACCATGAAAATAGAAGCAAGAGAGAGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAGTACTGGATGAGCTGGTACCATGAAAATAGAAGCAAGAGAGAGT  948

seq1  AGCGGTAGCAGCAGCCACATTGGTAACAATTGGAATGGCAGTGCCATGGC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGTAGCAGCAGCCACATTGGTAACAATTGGAATGGCAGTGCCATGGC  998

seq1  TTGGCAGATTAACAGCATGAAAGGCCTCGACACAAGAAGAGCCAAAGGTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGATTAACAGCATGAAAGGCCTCGACACAAGAAGAGCCAAAGGTC  1048

seq1  ATCTCAGGGGTAATCCTGGAAGTTTGTGCTCAGCTTCCAATCACTGATGT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGGGGTAATCCTGGAAGTTTGTGCTCAGCTTCCAATCACTGATGT  1098

seq1  TGGTCTCCTCGTAATTCAACTGTGGTGACCCTTGGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTCCTCGTAATTCAACTGTGGTGACCCTTGGAATTC  1138

seq1: chr1_177115393_177116401
seq2: B6Ng01-347J05.g_68_1076

seq1  GAATTCTGTGGGCTGCCCTAGAAGGAAAGCTTCAGATAACTCTGGACTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGGGCTGCCCTAGAAGGAAAGCTTCAGATAACTCTGGACTTT  50

seq1  GAAATGGTAAGGAAGTAGGAGTACCTTCTTTTACTTGAGGATAAATATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGTAAGGAAGTAGGAGTACCTTCTTTTACTTGAGGATAAATATAA  100

seq1  AAGGAAATGGGGTAGGTTATAGGGAGTGCAGCCTACATTTCTTGTGTCGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAATGGGGTAGGTTATAGGGAGTGCAGCCTACATTTCTTGTGTCGG  150

seq1  GCCTTCTGTTGCTATGCTCCCACACAGATCCTGGCTACAGTACAGTTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTGTTGCTATGCTCCCACACAGATCCTGGCTACAGTACAGTTGTC  200

seq1  AGTACATAGGACAGGCCTCTGTTAACATGGAGAAGTAACAGTAACAAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACATAGGACAGGCCTCTGTTAACATGGAGAAGTAACAGTAACAAAGC  250

seq1  CAACGATTTGTCCACCAACTGGACACAGCAGTCATAGACATAGAAAACCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGATTTGTCCACCAACTGGACACAGCAGTCATAGACATAGAAAACCT  300

seq1  CAGAGGATGCTATGATAGGCAGTTCTTATTAATGTTGCTATTTTTTTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGATGCTATGATAGGCAGTTCTTATTAATGTTGCTATTTTTTTCTT  350

seq1  TTGTTTCTATTTTTGCAGGCCAGTCACTGAATAGATCTCATGCATTCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTCTATTTTTGCAGGCCAGTCACTGAATAGATCTCATGCATTCAAC  400

seq1  AGCAAAAACTTAACTCTAAGACTAAATGGGAACACAAGAGGCAGGTGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAAACTTAACTCTAAGACTAAATGGGAACACAAGAGGCAGGTGCAA  450

seq1  GAATAAGTCTAGGCTCTGTGCTGAGTTGTGTTGAGGTCTACCCCCTCCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAGTCTAGGCTCTGTGCTGAGTTGTGTTGAGGTCTACCCCCTCCCC  500

seq1  ACGCCTAGCCAAAAAGACTCAAATGGGCATTGACTAAAAGTACAAGGCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTAGCCAAAAAGACTCAAATGGGCATTGACTAAAAGTACAAGGCAT  550

seq1  CAGTCATGGAGAGACCAGCAAGAATGCCACACACACTACATTTATGGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCATGGAGAGACCAGCAAGAATGCCACACACACTACATTTATGGGAA  600

seq1  TTCTTGGGCTTATGTTACTTAGCAACAGTGTGTGTGGATGGATAGGAGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGGCTTATGTTACTTAGCAACAGTGTGTGTGGATGGATAGGAGGC  650

seq1  AGGACCCAACACCACAATCTGGCGGCTTCATTATATCTTGGTTATAGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCCAACACCACAATCTGGCGGCTTCATTATATCTTGGTTATAGAGT  700

seq1  TAAAAGGTATCATGAGAGACTGAAACAAAACCAGTGAAAACGAAGAAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGTATCATGAGAGACTGAAACAAAACCAGTGAAAACGAAGAAGGA  750

seq1  TGTAGGATGCTTGAATCAATCTCCCATTCAAGGGAGGAGAAGTTTTCCCA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGTAGGATGCTTGAATCAATCTCCCATTCAAGGGAGGAGAAGTTTT-CCA  799

seq1  TAGCCTACAGTGAGAATTCAAAAATATTTGTTAAATGAA-CCAAAGGGTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TAGCCTACAGTGAGAATTCAAAAATATTTGTTAAATGAACCCAAAGGGTG  849

seq1  AATAATTCAACAAAGACACTGATCTTATAATATTCACATGCAGTTCCTAT  899
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AATAATTCAAC-AAGACACTGATCTTATAATATTCACATGCAGTCCCTAT  898

seq1  AATGATATTATTCAATTAGACCAAAGTGTAGAAGAAATCCAACACGTTAG  949
       ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATATTAT--CATTAGACCAAAGTGTAGAAGAAATCCAACACGTTAG  946

seq1  ACAAATCTGGT-ATGTTGTGTGATTGTTTTGAAGAGAACACCCC--TCTC  996
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||
seq2  ACAAATCTGGTAATGTTGTGTGATTGTTTTGAAAAGAAAACCCCCTCCTC  996

seq1  CCATGGACTCATA  1009
      |||||||||||||
seq2  CCATGGACTCATA  1009