BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049F07.T7 (MSMg01no049_f07.b1) | MSMg01-049F07.TJ (MSMg01no049_f07.g1) |
ACC | AG278826 | AG278827 |
length | 1,314 | 1,297 |
length of high quality (start - end) | 548 (78 - 625) | 499 (78 - 576) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f07.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_f07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_f07.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_f07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:14 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NTTACTATGGGGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTT
TGTTCAGTTCTGAGCCCTTTTTTTTAATGGGGTTATTTGCTTTTCTGAAG
TCCACCCTCTTGAGTTCTTTCCACATGTTGGATATTAGTCCCCTATCTGA
TTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTGTCT
TACTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTTTGGAGTTTCATTAGGTCC
CATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGTTCAG
GAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCT
CTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCTTTGATCCATTTA
TATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATCGATTCGCATTCTTCT
ACATGATAACAACCAGTTGCGCCAGCACCAATTGCTGAAAATGCTGTCTT
TCTTTCACTGGATGCATTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCCAGTGACCATAG
GTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTATTCCATTGGTCTACTTG
TCTGTCTCTATACCCGTACCATGCAGATTTTACCACACTTGCTCTGTAAT
AAAGCTTCAGGTCAGGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTTTATCCTTG
AGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGTGTTTTTGTTATTCCAAATGATCTTGCA
ACTTGCTCCTTCTAATTTCTTTTGAAGAATTGATTTGCAATTTTGATGAG
AATTTCTTTGTAACCGTTAATTTGATTTTTGCTTCTATATCACTTTTTTT
CTTGTTGATTTCTCCTCTTCTCCGTTTCCTTTCTATTCTCTTTCTTTTCT
TCGTATATCTTCCTTTACTTTTCCCTCTTTCCCTTCCTTTATCTTTACTT
CTCTTATCCATCTTTTTTCTCTCTACTTTTATATCTCTTTTATTTCCATT
CTATATTTTTTTTTCTTTTATTCTACTTTATGTATTCATTTCTCTATTTT
TTTCTTTTTTATTCTTCTTTTCTTTTGTTCTTTTTCTTTCATTTATCATT
CTTTTTATCTGTATCATTATCTGATCTTTCTTTTCCCTTTTTTATCTTCT
TTCTTTGTCTTTCTTTCTCTATTTTCTATATTTCTGTTCTTACTTTTATT
TCTTTATTACTATTTATTTTCCATTATTATCTTCCTCTACTGTACTTACC
ATCTATCTACTTACTTATACTTATCTTTATATCTCTCTAAACTTATACAT
CTGTATCTGTCTAT
| TTTTTCACACGTGAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTACAAACATGTTCTAAAACACATACAGA
AAGGATTTATACGAAAAGATTCATGCCCGTTTTAATCAACATCATGCAAC
GCTCAAAAAAAAATAGTTTTCTAACACAATGGGAAAAAAGCTTGATAGAT
AAAGAAATGATTCCTGTTACTGGAATAGAAAGAAAAGAATGTGCTACGTG
TGTAACCCAACATGTACATTCATTTGATGAAAATACCCAGAATTACACAT
GAATGTTTTGCTTTCTTTTTTTTAATTTATTTATTTATTTTAAACTCCAG
ATTTTATACCCATCCCTGGTCCACCCTCCAACTGTTCCACATCACATACC
TCCTCACTGCCCCCTAGTCTCCACAAGGATGTCCTCACCCCACACCCCCA
CACCACCCACCAGAACTCTAAACTCCCTAAGGCTTCCCGCCCCGTGAGCA
TTAAGTGCACCTTCTCTGACAAAACCCAGACCCTAGCCTTCTTCTACTGT
ATATGCCTTGGGGACCTCATAGCACTTGAGGTACGCCGCCTGGTAGGTGC
TTCACTATCTGAGACATCTCCTGGGTCCAGCTTACTTGACACAGCTTGTT
CTCCTACCGACTCACCCTTCTCAACTTCTTCCAGCCTTCCCCTAATTCAA
CCACAGGGTTCAGCACGCTTCTGTCCATCGCTTGAGTGCAAATTCATCTG
CATCTAAATTTTTCAGCTGTTTGTTGGATCTTCCCGACGGCAGTCATCAT
AGGTCCACTCTTGTGAGCACTTCCACCACCTTCCTAATAAAGTCCTGTCT
TGGAAACTCCTCCTTGAAATCGTTCCAAGTTTGGTCCTGTTGCCTGCACC
TTCCTTTCCTTAGGCTCCCTTTCTACTTCCATCCCTGTAAGTTCTTTTCT
AACATAACAAATAATTTGTCCAACCTTTCAACTTGTTCATTAAACCCCCA
CTTCCTTCATATAAGTCCCGTTCTTCTTGCTGAATTGGTTCTTGTACAAT
TCCCTTCTTCCCCATCAATATAATTTCTCCTTCAGATCCCTCTTTTTTTA
ATCTCGTTATATTTCTTATCTCCCAAGTATCCTGTGAATATTTTTGAGAA
ATTATTTCTTTCTTCTTCTAAACTTATTATATTTTTCTGAGTATATATTT
TATATTCGAATCTCATAATATAACTTGCCATACACTACCACCCGCAAAAT
ATAACATTACATGCTCCTACGCTCATTTCATATATACTACTATTATT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 0 0 0 8 10 9 9 8 8 10 12 8 8 8 12 15 22 28 19 15 8 8 8 19 21 37 40 40 50 50 50 50 50 50 50 42 48 48 42 47 47 47 50 50 50 42
42 38 35 35 30 28 28 30 41 42 37 37 37 24 12 9 8 9 9 11 14 24 19 19 19 16 16 13 23 28 34 39 47 53 53 53 53 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 57 47 43
43 43 43 21 21 10 10 10 17 23 27 33 41 33 33 33 33 22 22 8 6 6 6 6 8 13 25 36 59 59 42 48 50 53 53 38 38 42 42 57 53 42 42 47 47 47 47 57 57 59
53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 44 44 31 31 31 44 43 57 57 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 52 52 54 59 59 68 68 68 68 59 59 44 44 27 43 42 59 59 59 59 68
59 59 43 35 35 44 44 59 57 59 57 59 54 54 54 57 57 68 57 57 59 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 44 34 30 21 13
13 13 21 16 19 24 32 32 14 16 15 27 27 46 46 43 46 43 43 42 42 39 43 32 32 21 24 11 12 15 27 27 57 27 27 12 12 12 27 23 48 59 59 47 59 47 47 47 47 27
27 11 11 11 27 27 47 43 59 41 41 41 59 59 59 57 41 41 24 28 15 34 34 43 43 43 43 43 47 47 59 29 24 12 15 12 23 26 48 48 48 48 48 54 54 57 57 57 59 59
68 68 57 50 50 41 41 40 42 37 37 24 32 19 30 33 44 34 43 41 41 43 44 57 57 34 21 10 10 10 21 21 36 32 32 43 43 43 32 35 43 43 43 44 44 48 46 44 43 43
43 44 43 43 42 37 32 27 23 19 27 27 35 37 40 59 57 44 36 23 23 23 38 43 57 48 48 43 43 48 57 57 57 57 48 48 48 48 37 28 23 23 29 32 43 48 48 43 48 43
48 48 47 47 47 48 57 43 43 39 35 24 28 15 10 10 19 19 26 36 33 24 23 13 10 9 9 10 19 21 25 24 18 15 15 13 13 10 10 10 10 10 15 21 22 16 10 8 8 8
8 12 12 14 16 16 11 11 9 11 18 15 18 18 18 18 17 15 20 20 20 24 24 24 22 20 20 13 13 10 12 10 10 10 13 14 15 15 15 16 19 14 19 18 15 14 13 13 18 17
11 16 17 14 14 14 26 26 31 31 31 29 28 28 26 30 19 18 16 22 13 11 9 9 10 17 19 20 19 15 12 12 12 10 17 17 10 8 6 8 8 8 7 7 9 12 14 11 8 8
8 8 8 8 12 12 11 11 10 13 11 10 10 10 15 10 12 13 22 22 18 14 9 8 8 8 9 9 12 12 16 12 12 12 14 12 10 8 8 10 10 10 10 16 15 16 12 11 9 11
12 11 12 12 9 8 8 8 8 8 8 10 15 12 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 9 17 15 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 19 20 8 8 7
7 8 8 13 10 9 9 9 10 10 8 8 10 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 10 10 12 13 19 18 24 16 16 10 10 12 22 15 12 12 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 10 8 8 9 14 8 9 10 14 12 9 12 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 12 8 10 8 8 10 8 6 6 8 8 8
8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 15 9 9 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 14 10 11 10 13 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 11
12 8 10 6 6 8 8 13 12 13 18 10 10 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 14 8 8 8 12 8 8 11 12 12 15
8 8 6 6 8 8 10 12 17 11 10 9 9 9 9 9 12 11 11 10 10 10 8 8 10 11 6 6 7 6 8 10 12 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 6 6 8
8 8 10 12 8 8 8 8 8 6 7 7 8 8 9 9 9 9 8 8 8 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 9 8 25 15 15 11 11 11 9 9 9 10 10
10 10 9 9 17 11 11 11 19 13 15 14 15 10 10 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 6 8 8 9 8 8 11 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 7 12
7 9 8 8 9 11 12 8 9 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 6 7 10 8 8 8 10 12 10 10 9 7 7 8 8 8 10 13 10 8 15
8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 10 7 8 12 8 8 9 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 10 10 10 10 11 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8
9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 8 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 6 8 10 15 8 8 8 6 8 8 9 19 19 22 8 9 10 22 21 33 24 24 30 35 35 35 36 37 42 37 43
42 42 42 50 57 53 53 50 50 50 59 42 47 27 27 9 10 10 13 12 8 8 8 8 8 8 22 22 30 24 25 25 30 31 35 38 38 42 57 59 59 57 50 50 50 53 53 48 57 57
57 57 57 57 57 53 42 27 18 13 11 11 12 24 24 39 47 47 47 59 46 37 30 24 16 11 11 10 10 12 17 25 33 33 33 33 48 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 47 47 43 43 50 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68
68 68 68 57 68 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 31 31 39 44 57 44 44 31 31 31 44 44 68 68 68 68 59 59 52
62 52 62 62 62 52 52 38 41 18 18 18 41 41 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 39 39 39 62 62 68 62 62 62 68
68 43 43 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 39 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 44 43 35 39 39 41 62
62 62 52 43 43 31 31 31 35 35 43 43 62 44 62 52 62 62 68 68 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
52 43 59 43 39 41 44 44 44 38 23 12 12 10 11 11 33 33 62 62 33 33 11 12 13 33 33 15 12 12 18 18 44 44 38 23 10 10 10 12 13 15 15 33 28 57 57 57 44 44
35 35 23 38 41 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 38 38 18 18 18 32 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 21 21 10 10 10 23 36 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 50 50 50 50 50 57 59 59 44 44 35 43 43 57 59 38 32 13 13 12 18 11 11 12 15 11 26 26 26 11 16 12 12 12 11 26 26 44 44 39 46 44 40 21 17 10 10
10 23 21 14 10 10 19 25 46 44 44 20 19 9 17 13 9 11 12 28 27 57 48 39 39 35 37 26 23 11 10 10 24 32 25 27 11 11 11 20 18 28 28 30 30 39 39 48 48 47
47 39 41 39 37 23 23 11 11 11 10 10 9 9 9 11 24 37 41 41 39 19 17 10 10 10 19 24 33 33 33 33 21 21 10 10 11 21 28 37 36 31 30 23 23 21 19 9 9 9
15 21 41 41 39 27 21 11 11 9 12 13 13 18 23 12 14 21 26 28 39 39 40 33 34 21 21 10 10 13 10 10 21 21 14 17 18 29 21 22 22 28 15 15 23 23 27 28 25 25
10 10 10 19 22 32 35 28 28 28 29 29 28 26 28 33 30 32 30 28 28 19 19 10 10 10 11 19 15 14 9 9 8 8 6 8 8 8 8 10 8 13 10 8 8 11 8 8 8 14
12 19 13 10 8 7 8 8 9 10 11 21 19 13 10 8 8 8 8 8 12 12 12 19 18 12 11 8 10 13 19 9 9 11 11 11 11 16 9 9 8 8 10 8 8 8 8 10 16 15
20 13 12 12 12 14 10 10 8 9 11 13 15 15 18 17 14 16 17 8 8 8 11 13 10 13 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 19 21 12 10 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 14 12 11 9 10 8 8 8 10 13 10 15 11 11 11 14 10 8 8 8 8 9 14 13 8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 10 10 10 10 13 15 9 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 15 13 10 8 6 6 6 8 8 15 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 7 10 10 8 8 10 10 9 9 9 9 15 11 13 11 10 8 10 8 17 13 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 9 12
9 9 10 11 12 12 11 12 12 15 10 10 7 6 8 8 8 6 6 8 6 9 10 12 8 8 10 8 8 6 7 6 6 8 8 10 10 11 11 8 8 6 6 8 8 9 11 15 15 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 10 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 13 13 11 10 10 10 10 11
8 10 8 8 8 10 11 6 6 6 8 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 10 9 8 8 8 6 6 8 10 10 12 7 7 6 6 8
8 19 8 7 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 9 8 7 8 8 8 8 14 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8
10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 9 9 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 10 8 12 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 |