BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-053A08.T7 (MSMg01no053_a08.b1) | MSMg01-053A08.TJ (MSMg01no053_a08.g1) |
ACC | AG281356 | AG281357 |
length | 710 | 701 |
length of high quality (start - end) | 378 (67 - 444) | 392 (71 - 462) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_a08.b1 PHD_FILE: MSMg01no053_a08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:53:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no053_a08.g1 PHD_FILE: MSMg01no053_a08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:53:48 2005 |
singlet/doublet | singlet | singlet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (56,465,336 - 56,465,677) | (66,852,425 - 66,852,810) |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCATGACCATTGCGGCAACAGGTAGGCAGGCATAGCCTGGAGCAGCAGCT
GAAGGCTTGCATCCGATTCACAGGTAGCAGGTGGAGAGAGACTGGTCCTG
GTATGGACTTTTGAAACCTCCAAGGCTATAGTCAGTGACACCCTTCCTCC
AACAAGACCATACCGCCAATCCTCCCTAAAATAGTTCTACCAGCTAAAAA
CTAAGCATTCAAACACATAAGTCTATGGGAGCCATGTTTATTCAAACCAC
CAAAGCCAGCCAGAAATACTTAATCACAGTCAGATCTCTTTTTTAAATAA
TATGGCAGATCTCTGCTCAGCATTTTCTGAGGCCTTTGGGGGTCAACTGC
ACATTTTATGTGACACATTGAACTTGTTTGCTTTCTACCACATAACCTTA
CTTTCACTTGGTTTTCAACACTAGGCAAGTATTATATTCTCAGCCTGTGG
CTTGCCTCTTAATTTACTGCCTGACATATAGGATGCCGCTGATATTATAA
TAACCAAGGCTTATACATTATATAACTATTTCTGTTTATCCCCTTTATCT
TTTCATAATCCAAGTTTTAAAATCCGGATGAAACACTTTTTTTATACAAA
GAACAGTCTAGTGTTTTATTTGAATCACTCCCCGATTTCTCCTCTCCCTT
TTTTAATTTA
| ATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTATGCACTATCAAGATATAAACTATAGG
GGCTGGTGAAATGGCTCAGCAGCTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCGAAGG
TCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACAACCACCCGTAA
TGAGATCTGATGCCCTCTTCTGGTGCATCTTGGGGCTACAGTGTACTTAT
ATATAATAATTAAAAATTAAAAAAAATAATAAATTCAGGGCAGCATTAAA
AAAAAAGATATAAACTATAGACTTTCATGATTTTTGCTGGGTTAAGGAAT
TTCTTTCCTTTGTCCTAAATTTCAGGAGTTCTTTATTTCCTTATAAGTGG
ATTTTTACAATCTGGCAAATGCTTTTACTATATGAGACCCTGGTTTGCTT
TTTTTGTTTGCTTGTTTGCTTTTGTTTTTTTAAACTTTGCTATGGGGAAT
TTCAGTGATTGCTTAAAAAATGTTGAACTCGCCTTGAGTTCATGAAATAT
CCCATACTTGATTTGTTCCCATTACCCCGTTTGTATCGCGCTGCAATTGC
ACATTCCTTGTTTAAAAATGAATTAAATAGGTATTTCCTACCAATTTAAA
ATTACATGGCACGCTTGAGGGCATCATAACCCCCCCTTCTTGATTCCCTC
A
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 9 15 19 23 18 13 12 11 9 10 22 21 15 8 8 8 21 19 19 9 9 9 15 21 25 12 16 19 11 11 11 11 11 10 10 19 19 20 26 34 37 44 36 36 36 36
31 28 28 28 22 15 9 10 10 10 10 12 11 9 9 17 17 25 28 29 29 29 33 39 47 38 38 42 42 42 43 43 34 34 39 39 43 48 42 39 37 42 43 47 42 37 42 42 42 42
46 43 43 43 47 46 57 50 48 48 50 48 48 57 57 57 41 41 36 33 29 30 36 30 42 44 47 47 54 54 54 57 57 47 47 48 48 57 57 57 57 57 57 50 68 43 43 43 44 43
42 50 50 50 50 50 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 50 50 46 46 46 50 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 59 57 57 59 57 68 57 57 68 68 68 68 59 59 57 52 52 57 43 43 35 35 43 43 62 68 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62
62 43 43 31 31 31 43 44 62 52 52 52 52 62 62 62 62 44 43 35 35 43 44 62 62 62 47 43 35 35 43 43 57 57 68 68 57 57 57 57 43 43 35 43 42 43 43 52 43 57
57 39 39 42 39 43 43 57 57 52 43 43 39 39 43 43 34 34 20 18 18 20 15 15 13 24 24 38 23 23 27 44 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 38 38 18 23 23 32 32 32 44 44 54 50 44 36 19 18 14 15 19 24 28 28 31 27 27 18 26 26 32 35 32 34 36 27 23 23 23 23 36 44 57 57 57 57 54 54
54 57 57 57 48 48 54 48 46 42 39 20 22 14 19 15 15 25 40 37 48 48 43 43 47 35 35 35 47 43 43 33 37 28 32 28 37 30 24 12 12 11 12 12 19 19 24 24 23 19
20 24 28 28 18 18 15 15 17 11 8 8 10 10 10 13 11 11 11 15 15 21 12 12 12 12 12 12 10 18 17 22 17 23 21 30 28 43 39 34 32 19 19 19 20 32 23 20 20 20
20 15 23 10 10 10 10 10 10 19 17 19 22 22 30 30 28 28 25 23 28 23 19 19 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 12 15 15 19 11 10 10 10 8
9 12 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 9 10 10 9 9 14 17 10 8 9 8 8 15 15 9 9 10 15 17 22 13 9 9 9 9 9 12 10 10 12 16 19 10 10 10 10 10
13 13 13 10 10 11 18 12 12 12 14 8 9 10 10 11 15 12 15 14 17 10 8 8 8 8 8 17 16 19 13 17 8 8 8 8 8 10 14 14 14 14 12 9 9 9 11 9 10 8
8 8 8 11 12 12 12 11 9 9 9 9 9 9 6 6 6 7 8 10 12 10 8 8 10 8 8 8 10 8 10 8 9 10 9 9 8 8 8 8 10 6 9 9 10 9 10 14 14 13
12 11 10 9 9 9 9 12 12 12 | Open.Hide. 7 10 6 6 8 8 13 13 11 11 11 19 21 39 32 33 33 33 27 27 25 23 24 39 39 37 28 20 8 6 6 6 6 8 11 11 16 19 19 28 24 24 19 21 11 11 12 27 27 44
53 44 44 39 34 28 30 29 19 21 10 12 12 23 21 30 33 33 33 33 50 53 36 36 30 32 30 35 37 42 42 47 40 40 40 42 53 53 53 53 68 68 68 68 68 54 54 57 57 54
54 54 54 54 54 54 54 54 50 50 48 48 47 50 50 48 48 35 38 38 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 48 57 57
57 50 50 57 57 47 47 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 47 47 50 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 57 59 59 57 52 52 62 62 62 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62
68 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 39 39 43 62 62 52 52 52 43 62 43 52 52 52 52 43 43 52 52 52 47 44 35 35 35 35 35 43 43 52 52 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 59 59 68 68 57 57 44 43 26 26 43 44 57 57 57 52 52 57 57 52 45 52 52 52 52 57 43 43 35 41 57 57 57 52 52 52 57 57 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 59 43 52 38 38 27 20 20 36 38 52 43 50 50 43 43 32 32 35 43 43 52 57 59 59 59 57 44 43 43 44 50 43 43 43 42 43 43 42 32
32 32 32 37 43 40 40 28 28 28 33 33 30 21 14 14 14 30 30 28 30 25 30 28 36 32 25 25 21 28 13 17 15 16 11 11 19 24 32 33 36 25 25 25 19 21 13 13 13 26
28 43 57 36 36 24 23 19 23 11 11 11 18 24 22 30 21 19 15 23 21 23 23 16 14 14 19 19 35 37 19 16 14 17 18 13 16 11 12 12 15 17 21 18 17 18 14 15 17 17
28 26 24 16 19 14 14 19 12 14 9 9 9 9 19 15 20 15 15 13 13 13 16 13 10 10 9 9 9 9 9 9 10 16 17 17 8 8 8 10 10 11 14 10 11 8 8 8 10 8
8 8 15 15 21 14 14 18 20 14 14 22 11 10 12 8 14 12 12 14 24 27 23 11 11 10 11 9 10 9 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 18 8 9
9 9 9 9 10 10 10 12 10 15 10 13 7 9 10 9 6 6 6 6 8 13 15 16 16 19 21 21 24 17 18 21 19 21 13 21 20 16 15 15 11 12 12 12 9 15 10 8 8 8
8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 9 15 12 10 8 6 6 6 6 8 13 9 8 8 8
8 |