BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-064K01.T7 (MSMg01no064_k01.b1) | MSMg01-064K01.TJ (MSMg01no064_k01.g1) |
ACC | AG290048 | AG290049 |
length | 1,212 | 1,225 |
length of high quality (start - end) | 332 (133 - 464) | 100 (493 - 592) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_k01.b1 PHD_FILE: MSMg01no064_k01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no064_k01.g1 PHD_FILE: MSMg01no064_k01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:09:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCACCTCTTTTNNNTACATTTGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCAGCCAGGAGNCAGAGCTCTCTTAAAAACCCACCATTACA
AATGAGTGTGGATTACACCCTTTAACTCTTAGCATTAATTTTTCAAGATA
TTTAAATTTAATTCTTCTGAAAATTACTTTACAATTAAAGCCTTTTACTT
GCTTACTAGGTCTATCTCATAAAGCTCTGTTATTGAATATGTTTTAAAAG
AAAATATTTCTATGATGAATTATACCTAAGTGCGGAAATTTGCACAGATT
TGGAGGTTAGGGTTGATTTCAGTGCGGTTAGTTATCGGTTATTGTGTTGC
TGAAACACTCAAATGAATTAAATTTACAATCTTCCCCACATTTGCCCATC
AGGTCACCATTTGGTCTCCAGATGTCCCTGGTTTCTCTTTATATGAAAGA
TATTTCTGCTGCGGCATGCGCATATTGATCAATCTATTTTAAACTGCTGG
ATTTTGGTTCATCTGTGTTCACTAAACAATCTCTGTTTTTTTTCAAAACC
TGACATGGTCACTTCGATGGTCTAACTATTGAAGTTGGTGTCACTATTTT
TATGATAGTTATAATCTATAATAAAATCACTTTCTATTCAAAATGAACTG
TTCATAGGGCATGATGTTCTAAACACTACCCAATTGACCCTCATCCTCTC
TACATGTACACACAGAAGGAACTTTTCAAATTCTTGCTTCACAAGGCTGA
AACTGGGCATTAAGAAAATTAAATGCTCCCAGAAAAAACTTCATAGCTGG
GAATTGAACAAAGGTGACTGTACTATTAATGCTATATGACAATAGCTTTT
TCTTTAATGACAGTGATAATTGTGACCCAGCCCCGAGTCTTAGTCCGGAA
AGGAATGGGAAGTTTGTTTTGGAAAAGGTTAAAATTTTATAAATTGTAAG
CCCCAAATGGCCCCTTTTTTAAAAGTGCTTTTTAAAAATGGCTGTGTGGG
GGTTGTGTGCAATTCCCGCGCAAGTTGTTTCAAAAATTCCCGGGGAAAGA
CCCTCTTTTCCTCGGAGACAAATTATTACCCTCCCAAGGGTCATTTTTTT
AAAAAAAACGTCGGGAATTTATTTTCTATATCTTCGCGCCCAACGGGCAT
TTTACCAAAAACACCTCCTTATGGAAACTCCCTCTTTTTTATCTGTTCTT
CACAAAGTGTTN
| NNTGGAGACGGTAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGAGAAGGGCATTGGGAGGAAAACTCAAAGC
TGGAAAAGAGGAGAGGGAATAAAGACTAGAGAGAGAGGGAAGGGATATGT
TTCTCATGGGTAGGGAAAGTTACAATGACTCCCATTCATCGGTTCAACTA
TATGTTAATGACGTTTTAAAATCCAGAAATTGGGGGCACATGCCTTTAAT
CCCAGCAGTTCAGGGTCAAAGGCAGGCAAATATCTATAAATTTCAGGCCA
GTTGGATCTACAAAGGGAGTTCCAATAAAGCCAGGGCTACCCTGAAAAAC
CCTGTCTTGAAAAAACAATAACAACAACAACAACAACAACAGCATCAATG
ATTTTATTAAAAAGATAACATGCAAAGTATCTTCTCCAATCATATGATGA
TTTTTTTTTTCCCCCCCCCCTCCCTTGTATACGGCCACCTAAAAAAAAGA
AGGTTTTGTTGAAATCAAATAATTTATTAATTTAATTATAACTGTATAAC
TTTAAACAATGTGTTAAAGCAAAAAATATGAAGGATTAAAAATGATTAGA
GAAAAGTAAAACCTTACCATGCTATCTGGATGTGATATTAGTGCATTTTT
TGAGGATCGGTCTGTTGCTAAGTATTGAAATGCTAAATTCTATACCTGGA
GGTCTAGGCTTCAGTTTACAAGCTTTTGTTGTGCAAACCTTGTCCCTTGA
TTTAAAACTTTTGGTTAATTAAAATTGTCTACTGCAACTTACTGGGGGGG
ATTAGAGGTAGGTGGGTTTTTGATTTCCCTCTCCTCATTTGTTTATCTCA
TTTCTCCTCAATTTTCATGTCTAATACTATATCTCCCCTTTAACTTCATT
CCCTTTATCACCTCTCATCTCCTTAATTTCCTACCCTATTTCTTTTTCTT
TTTTTTACAACTTTACCCATTTTTACCTTATCTAAATCTTACTTATGTTT
CTATCAATTAACTCCTTCCTCACCATATTTTTTCATCTCCTATTTTTATA
ATCCTCTTCCCTTATTCCTCCTTTTTTTTTCTCATCCTATCTTTTTCTTT
CTCTTCACTTCCCAATTTTCTCTTCTTCTCATCTTTCTATTTTTTACTAC
CATCTCCTATATGATACTTTCTCTCTCTCCTCTCCATCTTTTTCTTTTAT
CTCCTTCTCCTATCTTCTACTAATC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 8 19 17 3 0 0 0 3 6 6 6 7 7 6 9 11 9 8 8 8 8 8 8 10 12 13 8 10 12 13 12 10 12 17 26 28 19 24 14 17 22 25 24
24 22 20 20 24 24 36 33 33 32 34 30 22 22 16 16 14 14 13 3 0 3 17 19 21 19 9 9 6 6 6 6 8 6 9 13 12 10 10 10 10 11 11 27 27 36 31 31 23 23
23 28 22 24 24 14 13 12 11 9 9 10 10 9 9 10 15 12 17 9 10 10 18 16 17 17 18 21 16 16 11 15 24 26 28 28 25 25 25 33 34 43 39 35 35 37 37 32 32 23
28 28 28 22 23 24 37 40 48 46 46 36 43 43 43 43 43 43 43 48 48 48 42 42 39 41 41 47 46 46 37 37 35 32 35 28 28 23 28 32 32 18 28 24 44 44 37 37 35 42
42 37 32 37 32 24 27 16 19 20 24 24 24 19 32 32 32 43 27 27 20 32 32 35 38 38 21 21 14 24 36 32 24 24 19 19 19 32 27 38 29 29 29 32 43 23 19 19 28 28
28 23 23 29 33 33 39 39 57 57 57 35 34 39 31 31 31 39 39 39 43 43 52 52 57 57 38 38 16 15 13 11 11 11 19 24 43 38 50 43 43 43 44 33 33 33 35 43 47 42
43 29 33 29 33 33 38 38 27 38 20 20 15 27 24 28 41 41 32 32 23 21 21 14 14 14 15 15 27 34 30 17 17 24 28 27 28 24 32 37 36 32 31 20 20 20 20 20 40 44
32 28 20 20 28 28 44 29 30 14 14 14 30 30 37 39 59 30 32 28 41 36 33 39 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 43 47 43 43 43 43 43 43 43 43 40 39 39 39 30 25
17 17 24 28 32 34 22 19 10 10 9 9 9 11 12 21 24 34 28 25 25 28 34 37 39 37 37 37 39 30 39 39 39 39 39 46 47 47 48 46 43 43 57 43 54 44 44 40 43 43
37 37 32 32 41 41 41 32 30 27 19 21 13 17 17 11 10 8 8 8 8 8 10 21 32 42 35 28 28 20 20 20 34 34 57 57 59 59 59 59 59 57 48 47 44 43 41 41 20 20
20 32 32 32 32 17 20 20 44 43 52 52 43 38 27 20 20 27 27 35 35 44 44 32 33 33 43 33 33 35 43 43 41 32 27 23 23 32 32 43 43 28 24 18 15 15 20 38 38 35
35 35 33 32 32 32 24 19 11 11 18 27 27 32 15 15 14 24 24 12 12 12 32 32 35 35 33 35 35 42 32 36 23 23 20 32 20 23 23 27 30 19 23 23 36 36 39 43 37 29
28 28 23 36 26 44 40 40 30 30 32 32 30 30 34 34 41 33 28 28 23 28 28 32 47 40 43 43 32 32 32 32 32 20 18 18 21 21 12 22 21 15 19 19 21 17 23 27 29 20
20 11 11 11 23 25 34 28 28 19 28 15 20 15 21 18 14 14 18 28 28 33 32 30 30 28 29 20 20 20 24 24 32 31 32 32 34 18 18 24 21 28 30 33 33 40 43 47 43 39
32 31 15 15 14 15 15 30 29 40 40 39 37 37 21 17 13 13 13 21 25 27 23 24 27 24 14 12 10 15 9 12 11 19 19 24 32 20 22 18 18 25 22 17 10 8 8 8 15 19
37 37 37 34 22 15 14 14 16 17 15 15 9 9 9 12 9 8 9 13 11 14 15 10 13 12 15 13 19 21 22 13 11 10 9 9 7 8 8 8 8 10 18 13 10 10 10 12 13 12
14 21 19 19 16 15 10 10 10 15 15 19 28 19 18 11 11 11 21 18 15 15 12 15 9 9 9 9 11 11 10 10 10 10 10 10 15 12 12 12 15 13 13 11 11 11 13 17 19 12
12 12 13 9 8 9 8 8 8 13 6 6 8 8 11 10 10 10 14 10 10 10 11 12 16 18 19 10 10 10 8 8 8 8 10 8 7 8 8 11 10 9 9 9 9 9 10 11 11 17
11 9 9 9 10 9 10 9 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 11 19 10 8 8 8 9 9 10 14 10 10 11 14 23 12 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 15 10 18 18 17 19 18 13 12 9 19 22 25 13 13 12 12 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 10 15 10 9 9 9 12 9 9 9 7 7 7 8 8 11 11 6
6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 13 11 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 11 13 10 8 13 9 8 9 8 9 9 9 9 9 12 12 9 12 8 8 6
6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 9 6 8 6 6 8 8 11 10 15 11 11 8 8 6 8 10 8 12 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 6 6 10 10 26 19 12 6
6 6 10 12 9 8 11 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 10 11 15 10 10 6 6 8 8 10 11 11 12 10 10 10 9 10 12 10 9 10 11 12 12 11 9 9
8 8 8 8 9 10 11 12 12 10 8 10 8 8 10 8 8 8 10 8 8 13 10 10 10 9 10 9 11 10 10 10 12 12 12 14 15 16 16 12 15 12 12 11 12 15 15 16 16 11
9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 3 0 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 14 6 6 6 6 9 9 7 10 6 6 6 6 8 8 12 18 14 14 10 10 14 14 15 22 12 21 13 22 15 12 12 14 24 19 36
25 35 30 37 32 43 43 43 43 43 28 28 20 20 17 29 25 34 34 26 26 13 13 13 28 28 44 28 21 21 17 26 17 14 12 12 18 18 20 23 19 22 24 24 16 24 24 24 21 19
16 16 15 15 15 24 12 13 13 12 12 11 11 11 24 12 13 14 24 24 15 15 14 14 14 16 16 11 11 12 19 12 20 20 21 21 14 14 13 24 12 12 11 18 18 21 15 21 27 43
43 32 32 24 19 12 12 11 12 12 16 12 12 12 18 18 27 27 28 33 33 35 28 24 14 14 14 18 18 23 33 34 28 28 22 32 15 15 15 12 12 12 21 21 31 34 19 16 16 22
26 19 18 19 22 22 22 14 14 14 20 27 35 43 43 43 43 43 43 39 35 35 35 34 34 17 17 16 29 14 20 13 18 18 18 34 26 24 13 15 15 23 35 35 39 43 43 35 31 31
35 32 29 27 26 26 27 35 26 35 24 18 14 14 14 24 24 20 20 35 43 43 39 39 39 24 28 14 18 22 28 35 35 35 35 39 34 38 20 20 20 36 36 35 39 39 43 43 39 32
32 14 18 14 16 16 32 32 32 24 24 14 14 16 18 18 20 27 38 38 43 43 43 28 19 19 17 23 23 32 32 23 23 23 32 20 20 20 32 38 38 25 18 18 11 19 19 36 32 32
24 15 15 13 21 21 20 20 20 38 38 57 57 54 43 43 31 29 29 33 41 42 43 42 43 43 42 42 33 33 33 35 35 35 35 35 35 41 41 20 18 18 18 18 18 24 19 12 12 12
18 18 28 27 21 14 14 14 28 32 32 30 14 14 14 21 26 28 18 12 12 12 16 15 15 23 19 22 20 24 24 30 32 26 28 26 33 33 39 30 28 18 18 22 21 21 14 12 12 12
12 13 21 15 18 18 17 16 16 12 12 15 16 18 18 18 12 9 9 8 8 8 9 29 12 16 11 12 12 17 16 11 9 8 8 8 8 8 10 11 11 12 21 31 34 22 17 12 12 11
12 12 12 24 28 35 35 35 39 35 32 28 23 23 25 30 37 32 35 35 35 37 39 35 30 35 31 31 23 32 32 43 43 32 41 27 32 27 36 32 28 15 18 14 24 21 32 32 41 41
47 44 41 37 37 37 27 32 18 20 20 22 21 28 31 24 24 25 36 36 46 43 43 42 32 30 30 30 25 29 18 28 14 19 19 31 32 29 39 26 19 14 14 16 23 18 23 12 12 12
24 24 43 39 39 40 39 37 25 23 11 11 11 18 25 12 15 12 12 12 13 18 29 22 22 15 15 14 18 15 21 13 15 15 22 21 22 21 19 11 11 11 12 16 22 30 37 37 37 35
35 28 24 20 20 19 26 22 18 10 10 10 13 13 18 23 28 30 20 18 12 12 11 12 20 24 12 9 9 9 9 9 14 24 32 20 23 22 28 28 28 28 31 31 31 24 24 14 15 18
24 18 20 20 31 26 26 16 14 10 12 9 9 9 14 16 24 20 16 14 19 16 14 13 26 24 24 24 17 21 15 15 15 19 21 12 9 9 10 10 15 10 11 11 17 22 32 35 35 30
26 15 8 8 8 8 8 8 10 19 17 17 12 11 10 10 18 10 9 9 9 9 12 18 18 24 13 8 8 10 10 8 8 9 14 12 20 13 15 13 10 13 13 11 19 19 11 11 11 11
11 10 10 8 8 8 8 10 11 11 15 14 12 9 8 8 9 10 9 11 8 8 10 13 13 16 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 10 8 8 11 8 8 8 7 7 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 11 10 15 13 13 11
11 13 13 15 15 10 8 8 8 8 8 8 15 16 11 11 11 11 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 8 10 8 10 8 10 8 9 9 8 10 8 8 6 7 8
8 11 12 12 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 12 12 12 15 13 14 14 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 9 10 13 9 9 8 13 10 10 10 9 10 9
9 8 8 10 10 10 15 15 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 7 7 8 8 9 9 10 8 8 6 6 8 8 12 8 8 8 8 10 19 15 10 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 10 21 18 16 16 15 18 10 12 10 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 12 10 8 8 10 12 16 18
14 14 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 13 8 10 8 16 10 10 10 15 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 12 10 11 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 13 12 14 9 9 13 8 10 6 7 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 21 10 11 10 11 12 10 14 10 8 8
8 10 10 12 10 8 10 6 7 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 |