BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-087E01.T7 (MSMg01no087_e01.b1) | MSMg01-087E01.TJ (MSMg01no087_e01.g1) |
ACC | AG306338 | AG306339 |
length | 644 | 682 |
length of high quality (start - end) | 422 (33 - 454) | 558 (54 - 611) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no087_e01.b1 PHD_FILE: MSMg01no087_e01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:39:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no087_e01.g1 PHD_FILE: MSMg01no087_e01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:39:18 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (75,952,168 - 75,952,589) | (76,062,973 - 76,063,413) |
---|
sequence | ACGATCCGCGGAATTCTTTTAAATATATAAAACAATGCAAGTCTTCTCAT
GATCTTTTTTGTTGTTGTTGCTTGGTTTTTGAGAAAATAGTATTTTCTTA
AAAAATGTTAATGCTGTTGACCTAAAGTCTATTTGTATTTTAACATTTTC
TCAGGTTTAAGTCTTAATATGGTAAGGACTGATAGTTTGAGATGGGAGAT
GGAGACAAGAGACTCTTGGCTGCTCACAGGCCACTGGCCCGGTCTACTTA
GCAGTGACAAGAGACCCTCCCTGATTCAAATAATCCAGAAGGTGAGACTT
GATCCAGGTTGTTCTTTATCTCCCACATGTGTGCCATTGTATACATACAC
ACAGATACATGCATATGTACACACATGCAAAGATAAAAAAGATATATGTG
TATATAAATATATTTGCTTGAGTGTATGTATGTGTTTCATATACATACAG
ATACCCACAGAGGCCAGGAGAGGGCATCGGATCTCCTGGAAATGCAGTTC
CAGACAGGTATGGGTGCTAAGTACTGAGTACTGAGGTGCTGAGTACTGAT
TACTACACCTGAGTTTCCTGTCAGAGCAGCTCTTTATCTGCTAACCCATT
TCTCCAGCCCCCCTAAGAATTGTTCTTTTTTATAAAAGCTCCCG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXAGTCTTGCTCATGGTTTGGGGGACCACAGTTGATAATAGCAAGGACA
ACACACAGCAAGGACCACTGTAGGTTATGGCTGCAGGAAAACAGGGGCAG
GGCAGCTGATTCCATCAGGTCCCCAGCTAGGAAGCAGAGAGCTGGACTGA
TAAGAGGCAAGCCTACAACCTTCAAGGCACAACCCTACAATCTTTCATCT
ACCCATGATGCCCCAAATCCAAAAGGTTCAGAGCCTCCACAAACAGTGCC
AACAGCTAGGGACCAAGTGCTCAAATACGTGAGCCTAGAGGGGACTTGGC
ACACTAGAGCCAAAGCAACAGTGATGAGGGAAAGTGACCACGTTAATCTA
GGTTCCCCGCAAAGTGTCTGTCCAAAGTGTATGTGAAAAGAGGACATTGC
TGATGAATCCAATAGGAACAGACACACCACATACATAGAGCAAGCACAAC
ACATACAACACACAGTATGCATAACACTTCTGTATCCACACAACACAGAG
TGTGCTCAATGCATACAACAGCCTACACACAGCACATATCCCACAGAGGT
GTGTTGTTTGTTTGTTGATGCCATATGCATTCCACGTGGGCATCAGTCAA
AGTGGGAATCTGCTCCTCAGAATTCCTGATGG
|
quality values | Open.Hide.12 12 9 16 15 27 27 31 28 28 28 28 35 36 57 57 57 50 36 21 18 11 11 11 11 11 13 11 12 18 22 22 22 22 25 29 29 41 37 37 37 40 40 43 57 43 43 37 37 37
40 54 68 68 57 59 59 57 40 40 38 33 33 29 29 29 40 38 46 40 50 47 41 41 41 41 47 42 47 47 47 37 37 37 37 43 35 42 42 42 42 46 50 57 68 68 68 57 57 57
54 54 54 50 50 50 50 50 50 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 52 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 43 43 35 43 43 52 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 68 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 44 44 39
44 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 62 43 52 52 43 43 43 43 45 52 52 52 57 57 52 52 45 52 52 57
57 57 57 57 52 43 43 43 43 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 39 28 28 39 43 44 43 23 23 23 44 38 33 28 32 17 17 17 32 36 44 43 52 38 38 18 16
19 32 32 43 50 44 43 35 35 43 59 43 52 52 57 59 59 57 57 48 57 50 43 35 43 32 43 23 28 28 37 32 32 32 32 28 32 33 42 42 43 37 42 42 37 42 39 37 37 42
42 43 43 42 42 41 41 35 32 41 36 37 43 46 48 48 48 42 40 32 36 30 30 31 28 28 24 22 22 34 31 36 36 43 43 48 48 36 36 36 37 34 34 30 30 30 39 33 29 26
19 16 17 16 16 10 11 13 24 24 28 22 22 24 24 24 21 23 19 19 23 31 23 25 25 25 25 28 23 23 14 19 24 37 28 23 15 11 11 13 15 16 14 9 9 9 14 14 19 19
18 22 17 21 14 14 17 26 19 23 28 26 14 10 10 12 15 23 19 12 12 11 15 16 15 15 11 11 11 11 17 15 18 8 8 8 10 9 9 12 12 11 10 12 13 19 17 18 12 12
10 10 10 10 9 9 11 8 8 10 11 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 10 11 9 8 8 8 8 12 19 37 20 20 11 12 11 11 11 18 22 28 14 12 10 10 13 15
10 10 10 8 8 8 9 14 18 11 9 8 10 10 9 11 10 10 10 12 10 10 8 8 8 8 17 17 9 9 9 7 8 8 10 8 8 8 11 12 7 6 8 6 | Open.Hide.13 13 25 25 33 33 33 41 47 27 21 10 9 6 6 7 7 8 8 9 11 10 21 21 28 28 28 19 19 14 16 20 29 21 42 36 31 19 17 11 11 12 17 25 27 42 47 42 42 48
54 41 41 41 41 41 41 41 48 48 43 43 50 50 50 50 48 57 47 57 54 57 57 54 57 57 48 48 41 41 41 48 48 50 50 50 48 57 47 50 46 46 46 46 47 47 57 57 57 57
57 57 50 48 47 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 52 52 57 57 57 57 50 50 57 57 52 52 47 50 47 47 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 45 45 45 62 52 52 52 62 62 52 52 62 62 52 43 47 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 45 62 52 52 62 62 43 52 62 52 45 52 52 52 62 52 52 52 62 52 52 52 43
52 45 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52
52 57 57 57 57 39 39 39 44 43 45 45 57 57 57 57 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 43 43 43 43 52 50
50 57 57 52 52 52 52 57 52 52 43 44 35 31 31 33 33 43 44 57 50 47 43 43 43 42 33 33 42 42 44 57 57 57 57 57 43 46 43 43 43 44 44 44 43 44 44 44 43 43
46 57 57 57 57 57 54 44 44 25 25 25 44 44 54 54 54 54 54 54 57 43 43 36 36 36 43 43 48 48 48 43 42 30 30 30 30 30 39 39 46 43 43 43 43 43 48 48 59 41
37 36 37 30 34 30 31 31 39 39 41 41 41 41 59 43 43 39 43 39 37 37 39 39 42 42 42 42 57 43 37 37 37 33 37 37 36 36 37 30 32 29 29 32 37 39 39 34 28 23
18 22 13 12 19 24 28 32 39 39 59 35 35 32 37 33 37 35 37 37 43 43 48 32 29 15 15 15 21 21 33 36 39 39 39 43 43 43 47 30 30 30 29 31 31 25 22 25 19 30
32 39 39 34 32 20 20 19 12 22 20 19 19 15 17 12 20 8 8 8 8 8 12 13 30 28 30 25 21 16 15 17 11 15 15 21 22 25 22 19 20 20 24 32 32 30 24 18 19 19
21 19 15 14 14 12 10 12 9 9 12 12 14 24 22 19 23 12 11 11 13 16 20 28 25 25 25 29 15 15 14 14 |