BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107N18.T7 (MSMg01no107_n18.b1) | MSMg01-107N18.TJ (MSMg01no107_n18.g1) |
ACC | AG321470 | AG321471 |
length | 1,286 | 1,263 |
length of high quality (start - end) | 276 (134 - 409) | 337 (120 - 456) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_n18.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_n18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:10:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_n18.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_n18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:10:20 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (67,986,428 - 67,986,703) | (67,841,747 - 67,842,083) |
---|
sequence | NCCGATATTNTNNNNGAACACTGCGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXTATCAAATAGGAACCCTTTACAATTACTACTTTTT
TCCTATAAAATCTTCTGTTTCCCTAAAAGGCCTTGATGCACGAATGGGAG
CATGCTAAACATCACCGTGTATGAGTCAGGCAATCATATCTGCTTCAGGA
CCGTGTTCTCTTAGCTCAGAAAGGGTTGTGCACTTTAGGGACAATTAAAA
AGTATAAAGTACGGTAGTCGAAAGATCTAGGCAATGTCCAGGGCCTCATG
TATTTACTCTGCCCAAAAGTAAACCAGTCATAATTTATACATTTGCTGAG
AAGTAGAAAATACACAGACAGAGTTTGGAAGACCAGGAATCAACAGATGC
AATAAAACATTATTTTAAGATGCTCTAGTTTTGAGATGGATTTTTGTCCT
CTCGGGTCTTCTTTGCCTTTTGCCCCACCAAAATCGACTTCTCTAGTCCT
GCTACCTGAAACCTACTTTTTTTGTGGTTCTTACCCACTTCCAATTAAGG
AAAGCATGAAAGAAGCACTAGGTGCGGTTGAGTGGGACCATCATTTTGTA
ATTAGTTTGTAACCTAATTAGTTTTCTGACCAAAGGCAAGTGATCTGACT
TTCTTACCACACACTGCTCTGTCTTAAAGACTTAATTTGAGACTCTTACA
TAAGTCTTTATTTGACATTATTAATGCCTATTAGCCAATACAGTGTGACA
CCTAATAAATATGCCACTTTCTATAAGCTCTGACTTTTAAACCGTGATAG
TACCATCCATGATGGCCTGTCTATCTCCCATCCCTGCCTAGTTATGTGTA
TTATCCCACATATTTGTTTTTCCTTTTCCTATCCCCTCTTTACCACTTAC
AATGCCCGTTTTGTCCTGTGCTTCTGTCTATCTCAAACTCTGTTCTTGCA
GTGCATCTCTCCTGATTTTTTTTTCTCTTATTCCTAACGCTAAACTTTAT
CTTTCTACCCATTCCTTAACCGTTTCTTATTTTAATATTTTTAACTTTAG
TTTCTTTATCTCTTTCGTTCTTTTCTGCTAATTCTTTTCTCCTCTAATAT
TGTCCTATTATACCTTTTTATTAATTCTTTATCCACCGCTATTTCTCCCT
ATATTAATCTTTTCCTTTAACAAATTCTATCCTCTTTCTTTTGATATACC
TTTTCCTTTATAAATCGCACCTCTTAATCTTGTTCTCTATCTTTTATCTT
TATTCTTCTNTCATTTTCCCTCTTCAACAATATCAA
| TTTTTCTACTGATTGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAGCTATCAATTATTTGGGTTGGAATT
TTCCTTTGCCCTTTAATGGCAGACATACCCCAGGGGTCATGTTCAATCAC
CCCAAGAACACTCCAGCTGGAGTTCATTGGCAAGATGACTAATAGACAAT
TAGGGCACAATGGAGGCCATTTATTTTCTAAACATGTCTCTAATTTGCCA
GTCATTCGAAGCTTTGGAGCAATAAACTCACTGTTTAGAGGGTGGTTTCT
GGTATCTGGGCTGAAGCATCTGAGTGTGCACACACACCCACGATAATGTT
TCAGACATCAAAAGCAGAGTATGGAGAGAACTAGGTATTTTTAAAAGACT
TATTTTTAAATGTACTAGAATAAAAATAGCTTCTCAATTCTTTTGAATGC
TGTTAAGACAGCCCCCTAACTGCATGTCATTATTTGTAAGGTTTTGGTTG
CCATTTCATTTCCTAAAAGCATATTCTATTTTTTTCTTTGTCGAGAATGT
TTTTAAATGTATTGAATAAGATGAAACTCCAATTTAAATGTGTATATATA
GTAAATCAAAGTTCCTACAAAAAAACGGGGGACCCCTTATCACATTCATG
AGAACAGAAAATTTCCACTGGAATTTGAAGAAACTAGTATTTTCATGGGG
TGTTATTATCTGAATTACAGCCCGAGTCCACAGATTTATTCATAATCTCT
CCCTGTAATTTTATTTATTGCCTTCTAAAGCTCAGTCATGAACCTTAACC
ATATCTTGATTCCTACTGAATTTGCATCTTAATTCATACCTATTCTTGGC
CTGAACTTTTTATGGGTTTCTGTCCCCTCCTTAAGAAATTATTGGCTTCG
AAATCATTGCCCTTTTCTTTTATTTTTTTCCCAATTGATTTGCCACCCCT
GGTCAAATTTTTTTCTATTTACTGAACCTTATTTCTTTGTTTATTGAATA
ATTCCTCTGGGTTTTTTGCCCGTTAATCAAACTATATTTTTGTATCTTTC
TATGTTTCTTAACCAAATTATATTTTGGTCCTTTTAATTGTATTGTCTTC
ACATAATATGTCCTTAAGTCTCTTTTTTATATTAATACCCGGGTCTCTAT
ATTCTTTCCCCCTCCAGTTAGGTATTCCTCTACTTCTACTACTTCTTTCT
CTATTTGTACATCTCGCTTAACACATTTCTTCCCTTCTATACACTTTTAT
ATATTTTTTCCTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 0 0 0 3 9 10 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 22 8 8 8 11 15 19 8 8 8 10 11 10 19 19 37 37 37 37 37 40 48
50 50 50 48 48 47 47 47 50 37 33 43 28 28 28 37 37 47 47 37 37 37 37 28 21 21 14 10 9 9 9 23 13 10 11 11 11 14 14 15 11 11 10 23 27 31 50 50 50 50
50 42 42 42 42 42 38 38 47 36 33 33 33 33 33 27 21 8 8 6 6 6 6 10 12 10 26 24 28 25 18 17 17 19 25 28 28 32 39 43 43 46 46 57 40 40 35 35 35 42
42 57 48 40 40 36 41 41 47 54 57 48 48 48 47 48 47 41 42 48 48 48 50 57 57 57 57 44 44 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 47 47 42 39 37 44 44 57
57 57 47 47 47 57 57 57 57 68 57 57 44 43 43 43 43 35 35 35 47 44 59 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 57 50 43 37 37 39
57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 43 43 35 42 42 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 43 43 52 52 43 50 43 52 52 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 43 43 43 43 43 43 57 50 57 48 48 50 50 57 57 57 57 57 57 48 48 48 34 27 15 11 11 18 24 44 57 57 57 54 40 38 36 17
17 21 24 24 18 18 24 34 24 35 41 44 41 41 28 28 23 31 36 37 37 39 39 43 40 40 30 30 30 30 30 30 32 32 20 28 30 35 40 40 47 43 34 28 25 25 25 32 31 20
23 23 34 34 28 22 28 22 18 17 11 11 11 12 10 9 9 9 10 25 32 40 41 46 47 43 48 39 39 32 32 31 28 15 12 12 15 27 30 42 48 57 48 57 57 47 43 43 57 57
59 47 47 39 30 28 28 23 34 34 40 34 27 18 11 11 11 27 25 19 13 10 9 8 10 6 6 8 8 10 20 26 37 43 39 40 43 43 57 48 48 48 37 32 24 20 20 18 28 24
32 28 28 24 24 20 23 24 24 28 32 32 39 43 48 57 48 48 48 48 44 44 36 18 18 23 23 32 36 37 43 46 57 57 57 43 43 43 43 44 43 43 39 43 36 32 20 20 20 18
30 21 23 19 19 17 15 21 14 14 21 18 12 11 11 11 12 12 22 18 11 11 12 15 12 12 12 12 12 21 12 11 18 18 14 14 14 28 28 28 28 22 31 24 28 22 22 13 13 12
10 8 8 6 8 8 10 10 10 19 21 31 33 28 30 24 28 24 32 18 15 15 24 28 37 43 36 37 37 33 28 22 31 20 18 15 14 17 15 16 15 13 9 9 9 12 15 22 28 22
30 22 19 17 23 18 21 19 16 16 13 12 16 16 16 10 10 11 18 19 31 31 37 28 28 16 19 15 12 12 14 10 15 10 9 10 12 13 13 13 10 10 19 19 15 8 9 10 10 8
10 12 11 9 8 8 8 8 8 10 11 14 15 12 12 12 9 10 10 15 20 19 19 10 13 10 10 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 11 10 10
10 12 12 15 19 10 10 10 10 10 11 12 16 16 11 11 13 16 18 21 14 12 12 13 11 10 10 10 10 10 12 12 10 10 10 13 15 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8
8 8 12 12 15 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 11 11 21 23 12 10 8 8 8 17 15 12 12 10 8 8 8 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 12 13 13 13 8 8 8 6 6 8 8 15 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 9 8 10 10 12 9 9 13 15 15 19 19 10 10 9 6 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 13 10 10 10
10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 10 8 8 6 6 8 8 16 12 13 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 13 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 12 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 9 11 10 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 10 10 12 8 8 8 11 7 6 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 7 8 10 10 9 9 9 9 12 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 11 11 10 9 9 9 9 9 11 11 11 11 9
8 8 8 8 10 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 7
7 9 8 8 6 6 6 6 8 8 13 13 22 15 18 8 8 8 9 8 8 11 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 7 8
8 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 12 11 12 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 10 13 10 8 6 6 6 6 6 6 9 10 10 10 10 10 8
8 8 8 8 8 9 9 8 3 0 3 8 8 12 12 13 9 6 6 6 7 8 8 12 11 9 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 10 8 8 8 8 7 7 9 9 6 6 6 6 6 6 10 7 6 6 6 6 6 8 8 17 8 7 9 9 12 8 15 9 9 8 8 10 15 19 28 24 24 24 32 32 32 38 42
42 36 35 34 35 35 36 47 47 50 50 50 50 47 33 29 11 9 9 9 9 11 9 9 9 10 10 13 18 20 11 24 22 36 36 38 50 42 50 50 50 43 42 42 42 53 53 53 53 50
50 33 33 33 30 29 27 22 9 6 6 6 6 6 11 15 17 23 26 23 23 23 28 34 39 48 50 53 53 57 57 57 57 47 43 50 43 48 42 42 42 48 48 48 42 42 48 48 48 48
48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 54 50 48 48 41 41 41 44 57 48 54 47 47 57 57 57 57 57 42 42 36 37 43 43 47 57 54 57 57 57 57 57 44 43 43 43 44 44 54 57
57 43 43 43 50 50 57 43 43 52 57 52 43 43 52 52 52 52 59 57 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 45 52 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 62 43 62 62 62 62 62 52 52 52 52
62 52 62 62 62 62 44 43 27 27 20 35 43 44 39 39 39 62 43 52 43 62 43 52 62 62 62 44 43 35 35 43 44 43 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 52 62
62 62 52 52 52 62 62 52 62 45 45 45 62 43 43 35 43 35 43 24 31 43 43 43 52 52 52 44 44 39 39 39 43 39 39 43 57 59 59 59 59 59 57 57 44 36 27 22 24 18
13 12 13 24 28 24 40 43 43 37 43 35 43 43 43 44 23 23 23 43 43 52 43 52 37 43 43 43 36 38 50 50 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 43
43 43 32 27 12 11 11 27 15 12 12 13 12 14 14 12 12 12 10 10 10 22 13 20 20 31 29 28 12 12 16 25 32 42 42 37 37 37 32 32 30 25 25 36 40 39 43 43 43 43
43 43 43 43 39 43 42 54 54 43 43 43 39 39 39 42 47 29 29 12 12 12 28 30 46 48 48 48 57 46 48 48 48 47 47 59 59 34 22 17 11 11 11 23 23 23 34 32 39 35
32 30 28 28 31 28 36 43 39 39 33 34 28 28 29 37 32 33 30 30 25 40 36 39 36 39 39 24 24 15 15 19 27 24 21 13 13 10 10 10 19 12 12 12 14 17 22 32 28 25
21 16 14 10 15 18 11 12 23 18 30 41 24 21 12 10 10 10 10 16 18 17 16 12 12 15 12 12 11 10 10 8 11 8 8 10 15 15 12 12 10 14 16 22 16 21 15 19 22 19
12 10 10 10 10 10 10 9 10 11 10 13 14 17 21 15 19 19 26 15 13 13 13 20 23 25 23 19 10 9 9 9 10 10 13 10 10 8 10 10 16 13 13 9 9 13 16 10 11 11
10 10 10 16 19 15 19 18 16 10 9 9 9 8 11 10 11 8 8 10 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 10 11 11 15 15 12 12 10 12 8 11 11 12 16 10 10 15 8 8
8 8 10 13 9 9 9 9 16 15 10 10 9 9 9 10 16 16 15 9 8 8 8 10 8 10 11 10 11 11 12 15 16 12 12 12 13 10 11 17 12 12 10 10 10 10 9 8 10 8
10 9 11 8 8 8 8 8 8 10 15 12 11 10 10 9 9 10 10 10 8 8 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 9 9 9 8 8 9 9 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 16 12 10 10 10 11 9 11 10 10 13 16 13 13 14 12 11 10 10 9 9 9 9 9 9 7 8 8 13 8 8 8 13 8 8 8 8 8 9 9
8 10 10 8 10 8 8 8 8 8 11 8 11 12 10 12 14 17 18 16 11 10 8 10 8 10 10 10 12 10 10 10 10 7 7 8 8 8 10 13 8 7 9 13 10 10 10 10 11 9
8 8 8 8 8 8 10 9 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 10 6 7 8 8 8 8 9 9 10 9 9 10 13 8 12 10 10 8 13 10 13 9 10 10 13 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 15 12 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 10 14 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 11 9 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 10 10 13 10 10 10 10 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 15 9 10 10
10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 11 13 20 8 11 8 6 6 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10
8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
7 6 8 8 10 8 7 6 6 6 6 8 8 10 6 6 9 11 10 10 10 8 10 13 10 9 9 10 10 10 6 6 8 6 6 6 6 8 11 6 6 6 6 6 6 7 7 8 9 8
8 7 7 7 15 7 9 9 9 9 11 8 8 |