| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-111P13.T7 (MSMg01no111_p13.b1) | MSMg01-111P13.TJ (MSMg01no111_p13.g1) |
|---|
| ACC | AG324507 | AG324508 |
|---|
| length | 1,137 | 1,223 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 717 (79 - 795) | 557 (80 - 636) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_p13.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_p13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_p13.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_p13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:57 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | plural |
|---|
| sequence | NNNAACACTGCGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTCAAAAGAGGAAACACCAATGACCGAGAAGCACTTAACTATTCAAAATC
CTTAGCCCTCTGGGAAATGCAATTCAAAACTATTGCCATATTTTATCTTT
TCTCTTGATTCTATTTTTAAATTTAATCCATTGTTTTACACTCCGTATTT
TATTCTCACCCCCATCAACCCTTGACTATTCCACATACCATACCTCCTCC
CCATTCCCCTGTCTCCATATGGATGTCCCCCCACCCCCCACCATACCTGA
CCTCTAAACTCCCTGGGGCTTCAAGTCTCTTGAGGGTTAGGTGCATCATC
TCTGAATGAACACAGACCTGGAATTCCTCTATTGAATGTGTGTTGGTTGC
CTCATATCAGCTGGTGTATGCTGCCTGTTTGGTGGTCCAGTGTTTGAGAA
ATCTTGGGGGTCCAGATTAATTGAGACTGCTGGTTCTCCTACAGGACTGC
CCTTCTCCCCAGCTTCTTTCAGCCTTCCATAATACAACAATGGGGACCAG
CTGCTTCTGTCCATTAGTTGGGTGCAAATATCTGAATCTGACTCATTCAG
GTGCTTGTTGGGACTTCTGGAATGCTATTCTGCTAGGTCCATTTTTGTGA
GTGCTCTATAACCTCATTAATAGTGTCAGGTTTCAGGCCTCCCCTTGAGC
TGGATCCCACTTTGGACCTGTTGATGGACCTTCTTGTCATCAGGCTCCTC
TCCATTTCCATCCCTGCAGTTCTTTCAAACAGGAACAATTATGGGTCAGA
GTTGTGACTGTGGGATGGCAATCCCATTCCTCACTTGATGTACTGTCTCC
CTGCTGGAGGTACACTCTATATGTTCCCTCCTCCTACTGTCTGGCATTTC
ATCTAANGTCCCTCCCTTTTGCTCCTGAAAGTGTCTCACCTCCCAGAACT
CTGGTGCATTCTGGAGGGTACCCCCACCTCCTATTTCCCTGAAGTTGCCT
GTTTCCATTCTTTTCTGCTGACCCCCCCAACTTTATATCCCTTCCCCCCT
CCTCCCAAAACCAAAATAAATTTTTCCCCCAAAATTCCCCCAAAAAAAAA
CACCTCCTTTCCCTGTGCCCCCTTTTCCCTCCCCAGA
| NTTTTCGAGTGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTCAGTGCATACAGAGTTACACAGTGAGATC
CTGTCTCACGAAAACAAAACCAAAACAAAGAAAACAAAACAAAGAAAACC
AAACAAAATCCAAGAAAAAGGGAAAACCAAATAACACAAGGAAAAGGAAA
AGGAGTAATCAACAAACTTTCTAGAGAAAGGATACAGTTTTATGGTCTTT
GAGTCTGGAAAAGATTTCTCAGATATAACAGCAAAAATAAATAAATAAAC
AAACAATTAAATAAGCGAATTGCTTTGAAAATGTTTAAAGGAGCCTGTAA
CAAGCTATACAAGTTTGCATTCCCAGAGCAACGAATAACTGTTTCGCTCT
CCACACCCTCCTAGAATGAGCTATCTCTTGTCTTAATGAAATTACTCATT
TGGACAGGTACAGGTGAAATAAAGAAATGGAGTTGATTCTCATTTCCTGA
TGGCTAAGGACTTTGAATATTTAAGTGCTTCTCTGCCTTTTGAAATTCCT
CTTTTTAGCATTCTTTGTCAGATCTTCAGCCCACTTTTTTTTTCCCATGA
TAGTTGGCAAAAATATTTTCCTCCTTTTCTCCTCATTAATTTGTTTATTT
ATTCACGACATCCTGATCGCTGCCCCCCTCCGTAATTTCCTCCTTTTTTT
TTTTTTATTGCATATATTCTTTCGGCCTCCCCTCCCGAAAACCCCATTTC
CATTCCCTCCCTCCTGCCTCTATGAGGGTGCGTCCCCCTTCCACACACTT
CACTCCTTACCTGGGCTTTCCCTTACACTGAGGCCCTCAAACCCCCCACG
GGATTCTAGTCCCTGCTTCCTCCCATTTCTAGGTCCAAACATGGTCCATT
CCTTTGGCCCTTTTACTTCTGTCTAGAATTCCTTGGAGTCCCTTTCCTAT
GTCGATCCTTCTTTTGTCTGGGGGTGGTTCCATTTCCCCTCTTCAACTCC
TTTCTCCTTTCTGTGCAATGTTTTGAACCCTGGTTTGGCCTCCTCTCCCC
CCCTCTGGGGATCTTGTGGGGGCCCCCCCCTTACGCTTTCCTTTTTTTTT
CCTCCTTTCTCCCACAATTTATTTCCCCCTTTAGAATACCCTCGGTTGTC
TTCTACTTCCAAAGGTTTCTTGTGTGTTAATAAACCATTCCTTGGGTCCC
TCCTTGTTGTCTTCTGTTTTGTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 8 8 10 12 18 18 16 12 10 8 8 10 13 19 28 24 24 20 15 15 19 21 42 43 34 42 37 37 37 37 31 31 32 28 28 28 24 34 42 42 47
34 34 33 28 32 32 44 59 50 50 50 50 37 37 25 23 12 11 10 10 11 20 15 24 15 19 11 12 12 21 30 33 39 33 34 42 42 42 36 36 37 42 42 39 43 43 48 48 48 48
48 32 32 35 25 25 11 9 8 8 8 8 11 18 30 44 44 47 41 37 37 37 48 48 47 48 48 57 48 47 47 50 48 48 57 57 37 46 46 57 57 68 68 68 50 50 47 54 57 57
57 47 50 50 57 57 57 59 57 57 50 50 50 57 57 51 51 51 50 50 50 51 51 51 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 50 51 57 57 50 50 52 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 59 43 43 23 23 29 43 44 68
68 68 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 62 62 62 43 41 43 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 33 26 10 10 10 23 34 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52
57 57 52 57 57 57 59 59 59 59 44 44 31 44 44 57 57 57 57 57 57 57 44 44 42 35 42 42 47 44 48 57 44 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 57
59 59 57 46 48 54 57 54 59 59 68 57 57 57 48 48 48 48 48 50 54 54 54 57 59 59 54 48 48 57 57 48 44 43 40 31 34 31 31 43 43 48 48 57 48 39 39 26 20 12
19 12 23 26 43 32 37 41 43 47 47 43 43 46 43 39 39 47 41 41 34 36 39 39 39 39 39 39 34 34 37 32 30 20 20 28 31 33 33 41 41 41 31 31 43 37 59 59 59 43
41 37 37 39 37 37 39 39 39 41 46 59 59 47 47 39 59 43 30 28 17 17 14 9 9 9 12 18 34 34 37 37 37 30 34 41 43 47 59 39 37 26 17 10 9 9 10 9 9 10
11 11 12 16 20 28 21 33 33 27 25 37 15 13 7 8 7 8 13 13 12 16 11 9 9 8 8 8 12 13 22 25 25 20 26 26 26 28 22 18 18 14 19 24 30 28 22 21 18 20
18 23 28 25 18 13 13 16 14 15 15 12 14 13 14 14 16 24 22 22 9 9 9 15 23 20 27 19 22 20 20 28 34 19 17 9 8 8 10 22 17 32 26 26 32 36 37 43 46 34
26 13 13 12 12 3 0 3 15 12 11 19 28 28 23 17 15 16 14 10 8 8 12 9 9 15 14 11 11 9 9 10 10 8 8 10 8 10 10 17 16 15 15 12 9 9 9 12 15 24
15 19 12 10 10 10 8 8 8 10 11 12 12 8 8 8 8 9 9 13 16 20 20 12 12 18 11 11 11 10 10 8 8 10 10 12 12 8 8 8 8 8 6 7 9 9 9 9 9 11
11 11 10 19 15 16 19 21 18 18 20 27 16 18 12 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 10 6 7 6 8 10 10 14 15 14 14 13 16 10 9 8 8
8 9 12 12 10 8 8 8 8 10 10 14 13 11 9 9 9 9 9 9 13 16 8 8 8 8 15 8 19 18 16 11 11 8 8 10 10 12 15 14 9 10 10 16 15 25 27 25 18 12
10 6 6 6 6 10 10 12 17 16 10 8 12 7 6 6 6 8 11 10 13 13 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 9 7 6 8 8 8 8 9 9 9 6 6 8 6 9 11 19 19 19 10 8 8 8 10 21 19 21 10 10 10 19 21 31 15 15 26 29 40 37 37 33 24 28 33
33 30 30 32 44 43 48 46 46 46 47 27 25 11 11 10 12 12 18 20 14 10 10 10 10 10 10 17 15 21 21 31 33 36 32 32 35 37 42 42 39 36 34 36 36 36 36 33 39 37
33 33 37 33 22 21 12 11 12 12 13 18 28 30 35 37 35 35 30 30 25 25 25 41 43 39 39 43 43 43 48 43 42 37 37 37 33 40 25 25 25 30 32 37 37 35 37 35 37 37
43 37 37 30 30 30 42 44 43 39 37 39 41 43 43 44 57 48 46 46 43 44 47 47 47 42 42 37 35 35 42 42 44 57 43 43 43 43 44 44 50 50 48 50 50 57 50 48 48 50
57 57 57 57 57 52 52 52 52 43 37 37 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 57 57 57
57 52 43 43 39 43 43 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 44 43 35 35 35 43 43 52 43 57 39 39 39 43 43 43 43 43 52 52 52 52 52 52 62 62 47 43 43 35 35 43
43 47 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 62 52 45 45 52 62 62 62 62 45 45 45 62 44 62 52 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52
52 62 43 43 35 35 43 44 43 52 52 52 62 62 62 62 52 45 45 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 59 57 42 39 39 31 43 43
43 27 27 43 43 57 43 44 43 35 24 27 32 38 57 57 68 57 57 57 45 52 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 57 57 57 52 52 52 57 52 52 43
43 32 32 37 36 24 24 12 12 12 15 19 13 18 18 43 36 43 43 50 43 42 37 37 35 42 42 42 35 35 35 42 42 43 44 46 48 54 48 48 54 57 57 57 44 37 37 42 42 42
46 39 39 41 42 42 37 35 35 42 47 54 54 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 37 28 19 18 21 28 40 37 43 43 43 43 48 48 57 48 48 48 48 43 43 43 39 39 47 47 39
39 23 17 12 9 10 12 12 24 34 34 40 43 43 31 21 14 12 16 16 15 24 33 31 30 30 14 14 14 14 19 23 29 43 43 48 59 42 41 41 41 41 36 40 36 25 24 24 30 26
23 17 22 28 33 28 30 30 37 32 34 25 25 28 40 40 40 39 36 36 30 25 20 20 20 28 37 37 37 28 28 14 14 12 11 11 17 14 13 13 9 9 10 18 13 25 30 37 37 33
33 22 22 11 11 11 25 23 22 15 13 16 16 16 20 17 16 14 10 19 12 14 9 9 12 9 15 16 21 19 19 16 19 16 10 10 10 15 10 8 8 8 15 18 14 12 12 15 15 19
12 12 15 19 19 17 10 11 10 10 10 10 15 13 19 14 10 10 19 21 12 12 11 14 12 9 10 10 12 17 21 28 22 15 13 8 8 8 15 14 18 18 23 12 14 14 14 24 22 18
13 16 16 13 10 12 15 10 8 8 8 8 8 8 12 13 14 14 11 10 8 10 10 11 10 10 15 13 14 19 8 8 10 8 8 8 8 10 11 11 19 11 10 11 11 13 11 11 11 10
10 9 10 9 8 8 8 8 10 10 19 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 13 12 12 9 9 9 15 12 10 12 11 8 8 10 10 8 8 10 10 9 11 15 15 14 11 11 12 13
12 19 8 10 10 10 10 8 11 11 9 9 8 8 8 8 8 10 9 12 14 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 10 13 9 9 9 9 9 9 12 15 13 15 10 10 10 10
13 10 9 9 9 9 9 15 13 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 9 10 10 6 6 6 7 8 8 8 10 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10
8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 10 10 8 8 8 8 8 8 12 15 15 8 8 6
6 8 6 10 13 15 10 8 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 10 10 13 16 12 12 11 11 16 15 15 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 22 11
8 8 8 8 8 8 12 8 8 10 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 10 8 13 13 14 14 11 11 10 10 10 9 9 9 10 10 9 11 17 13 9 12 12 13 13 15 19 16
12 8 8 8 13 15 15 9 9 8 8 10 8 6 6 7 8 8 8 8 9 10 10 9 11 11 8 8 6 6 8 6 9 11 7 8 8 8 8 8 12 12 11 10 10 8 6 6 6 8
8 10 8 8 8 6 6 10 8 8 8 9 8 6 6 6 10 8 11 11 10 10 8 8 8 6 6 8 8 7 7 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 7 10 8 8 8 8 15 8 8
8 10 6 6 8 8 8 7 7 8 8 9 10 8 8 8 8 10 8 7 7 7 7 |
|---|
