BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123P14.T7 (MSMg01no123_p14.b1) | MSMg01-123P14.TJ (MSMg01no123_p14.g1) |
ACC | AG333446 | AG333447 |
length | 1,285 | 1,265 |
length of high quality (start - end) | 335 (130 - 464) | 367 (133 - 499) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_p14.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_p14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_p14.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_p14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:25 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GTATCTTTNNNGGATCATTGGGCGCTATAGACTACTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCTTAGAGCCAAAGTTACTTATATTTTTCAATCTTCTATGC
TCATAGCCTGGAGAATTACTTTAATGTTGTCAAATTGATACATTTGAATA
ATTGGCATTTTTAAAATGTTTGAAGTGCTATTATTGTCTAGAAAATTTCT
TAATTATGTTTTATAAGTAACTTATGATTAAATGATAATCAAGGTAATAT
ATATTTAAACTGTACACCCACACCCATGTAAACACTCACACACACATATA
CACACAGATTTATGCTATTTAAAATAAAAATCATGTATTCACAGATATGT
TTTGAAGCAAAGAAGGTCTCACTCAGTAACTGTCATCTTTCTCAGAAAAA
GGTAAGATGCCTATATCCAGCTTACCCTTTCAGAGTAGGAGAAATAACCT
CTGGAGACTGATTTTTTATAGAGGGCAGTGAGTGCAGTCACTCAGCTTGA
AAGACAGTCCATGTGAATTCACAATTCTCTTACTTCCATAAAATCTACAA
TTAATTCCTTCCTATCTCCCTGTTGTCATTGCTTCAGAAGACCTTATGTG
AAGAGGTTAATAAAGAAAATTGTGTTTTCTGAAATGATTAAGTTAGAGGC
ATCCGAGGAATAGAAATAAGTGCTCTGACTGTTCCAAATATAACCAACTG
CACATCATTTCTGAAATGTTAAGACAATAATTTTAGTACAGTAGTCTAAA
AATTAAATAAGAAAAAGTCTATCTCCATCTATCTATCTATCTATCCATCT
ATCTATCTNATCTATCTAACGCCTAGAGTGAAAGAAGATTGATTTAGGAC
TTTTCTAACCCTCTTTTTTGGCTGTGAAAATTTTCCGTTGTAAAACTTAA
AAATACTTAGGGTTAACTGTGCTAAACTTTGAATCAATAAAAAAACTGCT
TTTCCCATGTACACATATACTTTATTCCTTGGTCCATTGGCAATGGGCCC
ATTCTCTGAAAAAAAACTCCCATATTTTTTTTACTTAATATATGGCACAT
TGAACCCTTTCTATTTTTTTTAGAATAACTATAATCTTTTCCCCCCTTTG
TGTTTTTACTCCCTATATGCACTCAGTCTGAAAATACAAGGCTGTTCTTT
TCTACATTTATAGGCTAAACATCCGCTAAATACTCTTCCTTCCGTTCTTT
CTAATCTCACGTCTTCACACTATATCGCTCATAATGGCTCTTCTTTTATA
CTTTCTCTCCTCCTATTTTCTCTACTGTCCTCTTT
| NAAATTTTTTNNNATATGACGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTAAACGACCAGGATATGGCC
CTGGCCTTTATTAGGTTGGCTATTAAAAAACTAATGACTTTAATTTCTTT
TTGGGTTATATGGCTGCTTTTAAAATTATACCTAATTTGGATTTAACTTT
GATAAGTGGTATCTGTATAAACAAATTTTTATTTTATTAAAAATTCCAAT
GTTTATGTACTACAGGCTTTGAAGTAAGACCTAATGATTTGTTCAATTTC
CTCATTGTCTATTGCTATGTCTTTCTTTTCGTTAGTGATTCTTTTGACTT
GTGTACTCTTTCTGTATATTTTTATTAGTTTGCCTAAGCAATTGTCCATT
TGCTGATTAATTCATAGAACCAGTCCTTTGCTTTATTAATTATTTATATG
GTTTTCTTTTTTTTTTATGTTAACTTTAGCCCTAATTTTGATTATCTCCA
AATATCCAGTCCCTGTCTTCAACTACTCTTTTTTGTGCTTCCTTCTAATT
TTTTTTCTAGAGCTTTCAGGTATACTTTTAAATTGCTGATATGAAAACTT
TCTAATTTCTCTACAGAGACACTTATATCTGTTATTTCCAACATTTTCCT
GTGTAGTATGTCTGGAACTCTTGTCCACTGGTAGAGTTGGGTGTAGGAGT
ATCTCACTATTAATCTGTGATTCCATGTGAGATTTAAGATTTAGCAATTA
TTCTTTTTTAAATGTATGTGTCCTTGTGCTTAGGTCACAGTTACCTTGTG
AGTAGATGCCCTGTATCACTTTTATTCCTAGTGATTGAAAATTAATTATT
TTCCTTAACACCTACATCCTCCTTCCTAATAGATTGCTCCTACCAATTTA
CCTCCATGGAACCTTGAAGTTTCCAAACCTTATTCTAAACCCTAAATGAT
TCCCGTTTCCTTACCAACCCAATAACTTTTTAATTTGAAGTTTTGGATTT
TTGGCCCCTCTATTTTTACCCCCCCAATTGCCAATCTTTGTTGGGCCCCA
CACATTCCTTGACCCTAAGAGCTTTTTTTAACAAACTTACCCTCAACTTG
CCAAAAAAAAAACGGCGCTTCTCCTCCCACAAACAAACTTTTCTCCACCC
CCCCCCTCTAGAGGGGGAGGCTTTTCCCACTATCCCTTTCTTTAAAAATC
ACCGCGTCATTTGTCAATACCTCCTCAACCACTACCCCGCGGCTCTTATA
TCTTCTATGATGCGC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 6 6 6 7 3 0 0 0 3 9 9 8 7 6 8 8 8 10 10 13 13 13 8 8 8 8 8 17 10 10 8 8 8 13 13 15 18 30 28 19 24 20 20 18 24 34 23
18 24 24 30 30 29 28 30 37 37 36 26 25 25 25 33 29 29 33 33 29 31 33 33 30 28 16 12 10 12 10 10 10 11 11 16 23 21 28 28 33 37 47 36 36 36 34 34 30 39
44 43 43 47 47 38 38 39 37 36 44 44 39 37 37 26 21 9 9 7 8 8 10 10 10 11 12 18 19 28 22 22 23 34 41 57 53 53 43 43 28 28 28 43 43 59 57 57 53 53
68 68 68 48 48 48 48 48 48 47 50 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 42 37 37 42 48 57 68 68 68 59 27 19 8 8 8 8 19 27 59 68 57 57 48 44
46 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 54 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 52 52 52 52 52 54 52 57 57 57 54 57
59 59 59 59 59 57 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 46 46 50 57 54 54 50 50 42 44 50 57 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 59 54 54 42 44 35 37 47 59 57 57 57
57 54 57 57 48 39 32 27 18 12 12 15 23 15 21 15 28 24 32 34 47 59 59 59 48 48 48 48 59 59 57 54 54 50 48 43 32 28 23 28 28 39 43 57 57 57 57 43 43 43
39 39 34 34 40 39 32 30 22 18 12 9 9 9 10 10 10 10 10 12 12 15 21 14 17 24 26 28 39 39 50 50 43 43 39 28 16 12 13 13 14 18 14 9 9 9 10 13 12 8
8 8 8 8 8 11 21 21 31 33 35 39 43 43 50 50 48 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 43 43 43 59 43 43 43 43 43 54 57 57 54 40 43 41 31 28 44 44 54 54
57 59 57 54 48 48 47 47 47 48 59 48 48 48 59 59 43 43 41 40 40 41 48 48 48 48 54 54 48 57 57 47 42 25 22 12 21 28 32 24 26 24 24 39 59 59 59 59 59 28
26 17 30 29 28 24 25 31 39 39 39 39 39 32 35 35 39 39 46 59 59 59 43 39 26 26 35 37 47 47 47 37 37 37 37 39 39 43 34 34 25 25 20 32 20 20 20 23 23 13
11 18 18 11 11 11 23 23 28 28 28 12 12 10 17 17 19 19 10 13 12 22 19 25 33 28 37 28 30 30 33 28 28 33 28 33 33 31 28 28 28 34 28 20 17 25 22 28 28 32
24 24 14 14 15 18 18 18 32 21 20 15 21 10 9 8 8 8 13 19 26 19 15 15 21 21 28 30 34 39 25 25 15 12 9 12 9 16 13 11 11 11 11 12 9 12 12 21 15 10
9 9 9 9 9 10 13 21 23 15 19 13 19 26 28 23 12 12 11 10 10 17 12 12 9 9 9 15 21 30 28 21 15 15 16 19 14 20 19 19 20 19 23 13 9 9 8 8 10 15
10 10 11 12 8 8 10 3 0 3 10 10 8 8 8 15 13 8 8 8 8 8 8 10 9 10 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 11 11 10 12
15 19 22 20 18 12 9 8 8 8 8 9 10 15 9 9 9 15 8 8 7 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 8 16 10 9 9 11 15 12 8 8 8 8 9 12 12 8 8 8 15
15 19 12 10 10 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 12 12 12 16 12 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 9 9 11 11 8 8 8 9 9 9 10 8 11 8 10 10 10 11 13
13 12 15 12 12 13 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 7 8 9 12 12 9 8 8 8 10 11 12 10 8 10 11 11 9 9 9 9 10 10 10 10 13 10 9 9 12 9 12
9 9 9 10 9 9 9 10 9 13 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 15 15 12 12 11 12 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 10
10 10 8 8 12 12 15 11 10 10 8 8 6 6 8 8 13 21 16 12 15 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 8 10 8 10 12 12 10 9 9 11 11 17 19 14 14 10 10 10 10
10 10 9 11 11 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 9 9 10 9 11 11 10 8 6 6 8 8 8 6 7 8 10 8 10 8 6 6 8 10 9 9 8 13 8 8 8 10 13 11 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8
8 8 8 8 10 7 7 8 9 9 8 8 7 6 8 8 14 10 10 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 8 7 6 7 10 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13
13 14 8 8 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 11 13 13 12 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 19 14 9 9 | Open.Hide. 0 3 9 11 10 10 11 11 21 3 0 0 0 3 9 9 9 7 6 6 6 6 6 7 7 7 13 9 9 9 10 10 10 17 15 8 9 8 10 9 19 19 15 8 9 9 21 15 19 12
14 19 28 29 35 32 33 33 37 29 28 33 34 36 50 36 53 50 44 37 34 28 28 23 20 9 9 9 9 9 9 9 9 11 9 10 9 10 10 10 10 13 26 34 37 50 50 48 33 30
30 30 24 30 30 23 25 24 36 36 36 33 31 31 31 27 21 11 9 8 6 8 8 7 7 13 11 11 8 8 8 8 10 12 24 41 43 43 37 39 39 39 39 39 47 53 47 47 47 57
57 57 57 57 53 47 44 41 37 37 42 33 37 15 14 9 9 10 21 22 33 33 33 33 37 37 47 47 47 35 34 30 30 30 42 43 59 59 57 57 57 53 43 48 42 42 42 48 48 48
48 54 54 48 48 47 54 48 47 48 48 48 48 54 54 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 47 47 35 35 35 43
43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 36 37 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 47 43 43 39 50 50 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59
52 52 52 52 43 44 47 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57
47 59 47 44 44 41 41 41 43 37 47 32 59 43 47 43 48 48 57 59 68 68 59 59 59 59 48 42 42 32 32 32 42 43 57 57 48 48 57 57 59 59 59 57 59 48 59 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 36 25 24 16 11 11 12 12 21 30 37 39 41 40 48 48 48 59 27 24 9 9 9 9 21 23 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 47 47
59 59 59 32 32 39 39 40 59 59 22 21 10 8 8 8 9 12 18 16 23 23 30 28 32 21 25 25 41 59 47 47 57 48 48 43 37 37 35 28 28 23 23 23 28 24 24 12 12 12
12 11 11 11 12 12 18 18 20 31 34 59 59 59 59 46 46 43 57 48 48 48 57 57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 28 25 15 15 20 41 37 48 48 47 47 48 59 59 59
54 54 57 59 59 57 40 40 18 18 14 21 21 44 41 42 42 35 42 42 32 24 15 15 17 27 27 32 32 25 13 10 10 10 30 32 43 44 44 44 50 50 50 43 43 36 42 33 35 28
44 36 43 43 44 57 47 59 35 37 35 27 27 21 21 19 28 12 11 11 11 12 21 21 37 44 48 54 48 48 48 39 42 39 39 43 59 59 43 43 23 22 9 9 9 14 14 30 32 32
20 19 12 12 12 14 12 18 21 16 25 28 34 43 48 34 34 28 32 35 34 25 23 18 12 12 12 24 19 21 10 10 10 10 8 10 8 14 10 11 13 13 18 18 18 18 20 23 23 19
19 24 24 30 30 33 33 39 39 37 37 37 28 28 23 30 24 21 16 19 11 12 17 13 16 19 19 17 17 14 17 15 22 12 12 12 11 13 14 23 23 18 13 9 9 10 10 12 18 19
12 12 13 20 19 28 28 37 32 28 22 17 19 11 11 12 24 23 16 9 9 9 9 13 18 28 18 18 15 10 10 10 10 11 12 19 18 13 11 11 12 11 9 9 11 14 14 11 9 9
9 10 9 9 10 10 10 9 10 11 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 12 21 19 16 16 14 13 13 10 10 11 11 11 10 14 13 14 14 24 22 18 13 9 9 12 13 14 21 11
11 11 11 10 9 9 6 8 8 10 11 14 13 11 8 8 9 9 9 12 10 10 10 12 9 9 8 9 8 12 12 10 10 8 8 10 9 10 9 10 10 11 8 8 8 8 10 10 14 15
15 14 14 13 13 10 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 7 6 8 8 8 10 19 19 13 13 12 11 11 15 14 14 10 10 9 9 8 8 10 10 10 10 11 11 11 11 11 11 9 8
8 8 8 8 10 8 11 8 10 8 8 8 8 10 8 9 10 10 10 18 13 11 10 10 9 9 9 14 15 13 10 9 12 13 18 11 16 9 9 10 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8
11 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 10 13 11 11 10 12 9 9 9 9 10 10 10 9 10 12 10 10 6 6 8 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8
9 9 9 9 9 11 11 11 12 12 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 23 24 10 9 9 9 9 10 11 13 10 10 10 9 9 9 6 6 6 9 10 8 8 8 10 9
11 12 12 12 12 12 15 12 13 12 10 10 10 10 10 10 11 11 12 11 11 8 8 7 7 6 6 10 10 11 8 17 8 9 9 12 12 12 10 18 18 21 13 8 6 8 6 6 8 8
24 23 30 13 12 9 9 10 8 8 8 10 12 18 16 16 11 10 10 9 9 9 8 8 10 8 10 8 6 8 6 6 8 8 10 10 13 9 11 10 9 9 11 8 11 8 8 8 8 8
8 8 9 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 6 6 6 8 10 8 8 10 8 8 6 8
6 6 8 8 13 13 12 8 8 8 8 8 6 6 6 |