BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124B05.T7 (MSMg01no124_b05.b1) | MSMg01-124B05.TJ (MSMg01no124_b05.g1) |
ACC | AG333521 | AG333522 |
length | 1,229 | 1,274 |
length of high quality (start - end) | 568 (117 - 684) | 269 (126 - 394) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_b05.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_b05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_b05.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_b05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTTGGAC
ATTAACATACCCTTATAGAGGTTACTAAGTTCTGAGGNTGTTCTTAAATA
GCCCCTTAAGAACTTTAATAATGTTTAAGGGATTGGTCATTCAAATAAAG
GTATAAATCAACATACTTTTTCAGTACCCGGGTAGGCACACTAGATAGAT
GGGTTACAGCAAAAGAGAAATCTCTGATATAGGTTTCAGACACTGTCTTG
TAGAATTCTGAGCTTTTGCATTGGTTCACACTAAAGGGTTTTTATCTGAT
CTAAAAAAATTACATAATAATCACGACAGGTCACAGAAAAAGGTATAGAA
CAAATAGATGTTGGGCTAAAGATAATCCAATATAACTTGGAATATGTATC
TGGGCCTTAAGCATTCCAACCTCTAAGCTTTTGTCGGTATAACCTCTGTC
TTTGCTAGGATTTTACTGCTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCT
TGTAAAGAACAACATTTTCGGCCTCTACAACCAACACAACACACAAAGGC
CCTAATTTGACTTAGGACAGAGAGGCCAGTCTTATAAGTCCCACTCAACC
TCATCCTTAGGGAGCCTAAAAAGCACTTAATACCTACATGGTCATTACTT
ATCTCTGAGATGCCCCTCCCCAAGCTTCCACAGAGACTAGTTAAAGTAAG
TGCCCCAAAGTGAGACACAGGAGTCTTGTTCAATTCTATTGCGCCCAGGA
GTTCCTCAGAAGATGTTTGTCATAAGAATGTGTCTTAGGGAAACCCTTAG
GAAATATTTTCTTTATTTCAAATTTGCTAAGGGAAAGGGCTATCCTTGGA
CAGGAAAACTGAAGGTTTTGTTTTGGACTGCAAATATTGAAGCTTGTAAG
GAATATTGGTTGAACCCAGTTTTATCACAGCAGGCTTAGGGCTTCCTTTT
CTTTTCAGTGTAATTGGAACAGTTAATCCTGCTACATTCTAAAAGTGATC
TTTGTTTGAAAAATAAACTTCCATGGACATCTTATCCCTGGGGCTTTAAG
GGCTTGAAGTTCCTGGGTAACTAATTCCCAGGGAAGACTCCAAATAAGTT
TTCAATTCACTTTTTAAACCCCAAACTGGTCCTAGAAAACAAATTTTACC
GTCTACACATCACCTCGGGGATTGGGTAACCTTATTTGAATTTTTATTGT
GTAACTCTCACTGGGACTACTGGTAAGTG
| NTTCCAAACATGTGAGCCTGGGGCGCCTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCACCTTTAAAAGAGGAGGAACCAGGAGACAAGAAC
TGATGAAGCACCTTTAAGAAATAATGCTATTTGATGGCTTGCTCAGTCTA
CTTTCTTTTCTTTTCTCTTTTCTTTTTTAAATTTTCCTTTTAAAAAAATG
TTTTATTGGCTACTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTATACCCCTTTCC
TGGTAACACCTCAAAATCCCCTATCCCATCCTCTCTGACCTACTTCTATG
AGGGTGTTCTCTCACCCACCAACCCACCTCTGCCTCCCCGCCCTTGAATT
ACCCTACACTGGGGAACAAAATACACATAGGAGCAAATGCTGAGACAATG
TTTTTAGCAGAGACTGAAAGAAAGGCCATCCAATGGACCTGGAGGGTCCT
TTTTTTTTTTCCCCCCCCACAAAGGAACTCATACAAAAAAAAAAACAGGA
TAATTGTATATTAGCCCAGATACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAA
TTTGCTAAATGCATGAAACTCAATAAGAATGAAGACCAAAGTGTGGACAC
TTTGCCCCTTCTTATAATTGGGGATAAAACACCCATGTAAGGAGTTACCG
ATACAAAGTTTGTAGCTGTGATGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCA
TATCCGGGGATCCATTCCATATTCAGTTTCCAAACGCTGACACCATTGTA
CACTCTTCCAAAAATTTTTTGTTGAATGGACCTATAAAATAGCCTTTTTC
TTGTGAAACTATCGCTGGGCATCTATTAAAACACAATTAATGAATGCTCC
CATTTTTTTTCTTGTAATTTATTATAATGTCCCCTAATGTTTTTATCTAA
AAAAAATATCTCATGCTCTTAATTGCTTCCTCACCCCTTATTTCTGTAAC
ATACTTTTTGTAAATTACCTAGTATCCCTTCAATTTCTTTACTTTCTCCT
GGCTTTTGGATTCTAAAAATTGGTTCTAATCTTACTCCTCTATTTTTAAA
CAAAATACCTATTTGAAATTTGCAACACTTTTTTATTCCTCCATCTATAT
GTTCTATTCGCCTCGATTCTAATAATTTTTCTTATCTTATTTTCTTATTG
CATTCTTCTTTTCATACTTCTCCTCTTTTATTTATTATTAATATACATTT
ATATACATTTCATACTACTTATCTTTCATTACTATACATTCCTATAGTAA
TCTATATATTTATCTTTCCTATAC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 10 12 13 15 25 22 13 13 10 8 8 15 17 9 9 10 8 8 9 15 22 25 31 31 31 31 33 47 47 47 47 47 47 47 47 34 34 34 34 42 42 44 39 39 24 31 29
31 31 31 33 31 21 19 9 9 10 12 17 10 9 7 7 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 16 21 30 47 50 47 41 37 23 23 3 0 3 23 23 37 33 37 37 37 37 34 34 13
13 9 10 10 8 11 8 8 10 10 11 12 15 13 13 13 19 22 32 33 36 36 57 38 42 42 53 50 50 59 59 57 57 57 57 50 50 50 53 53 53 48 48 48 50 50 50 48 48 48
48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 42 42 38 36 36 36 48 44 42 42 37 25 18 11 11 11 14 15 25 22 37 37 37 37 36 37 37 43 43 34 36 36 36 48 48 48 57 57 48
48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 47 47 54 54 54 59 44 48 47 47 48 46 48 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 47 47 46 57 44
48 48 48 57 57 57 59 57 57 57 50 48 48 48 57 59 50 43 43 50 50 57 54 54 54 54 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54
50 50 50 50 44 43 43 43 57 57 57 48 48 48 48 57 59 59 59 59 44 44 43 43 42 59 59 48 48 48 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 47 59 43 43 43 43
43 59 48 54 57 54 46 48 48 43 43 46 47 43 43 43 59 59 57 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 59 48 48 48 48 47 59 59 59 33 13 10 6 6 6 8 8 9 9 9 22
23 41 34 46 48 48 59 48 57 57 57 57 43 59 43 48 48 57 57 57 59 48 48 48 59 48 54 48 57 48 48 48 48 48 59 59 59 43 39 43 42 48 37 37 28 41 20 24 17 17
17 28 22 17 12 12 12 12 12 27 30 43 59 59 59 59 47 43 43 47 47 48 48 48 46 57 37 37 43 50 50 43 43 27 28 28 23 32 33 37 32 32 38 38 52 43 43 35 43 43
43 42 38 43 27 27 29 43 32 37 35 43 43 52 52 59 59 57 43 43 32 20 20 38 41 38 44 43 43 39 43 43 43 43 44 47 47 47 43 50 43 43 43 43 44 44 47 47 46 43
43 42 44 43 43 43 59 57 57 43 43 32 32 20 23 28 37 42 46 57 42 42 37 42 37 43 46 44 42 30 30 37 43 42 42 43 43 37 39 39 39 43 47 47 43 35 35 39 35 35
39 39 43 39 39 39 40 43 36 36 28 32 20 23 23 23 26 32 28 30 37 30 24 17 17 22 28 30 28 28 32 39 39 59 59 59 41 43 37 37 33 22 15 17 10 19 15 34 37 39
39 35 40 39 46 36 40 28 24 24 32 32 43 47 43 43 39 39 28 28 28 31 31 36 39 39 39 31 22 22 22 21 23 28 26 24 21 18 11 13 13 20 24 17 15 12 10 10 13 12
13 14 9 15 19 14 14 13 15 19 30 33 28 24 17 16 16 18 21 31 39 28 28 20 28 31 33 33 28 21 21 15 10 8 15 8 8 8 8 20 15 17 17 23 23 19 18 11 11 11
11 8 10 8 9 10 13 10 10 10 12 12 12 16 21 26 26 16 13 13 21 21 22 14 11 8 8 8 8 8 8 15 15 18 19 21 16 17 17 19 24 15 16 9 9 9 9 9 12 11
18 23 21 15 15 9 10 8 8 10 13 17 37 33 24 24 11 10 8 11 8 9 13 10 12 10 14 14 13 9 9 9 10 10 16 12 12 11 11 11 15 10 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 8 15 15 21 17 18 21 13 16 16 17 11 11 10 9 9 9 8 8 10 15 12 9 10 12 10 10 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 11 8 8 8 8 8 8
10 10 12 15 13 15 17 12 14 16 15 15 10 10 9 9 9 8 8 8 9 11 11 12 10 9 9 13 13 11 9 9 13 9 9 8 10 10 13 12 10 10 10 11 10 14 9 9 8 8
10 8 11 9 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 10 10 10 11 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 9 10 10 10 10 13 16 13 10 10 14 15 12 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 6 6 8 10 8 10 11 21 21 11 10 10 16 11 11 11 18 15 10 10 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 9 9 9 9 12
12 12 15 12 12 15 12 12 11 12 11 11 11 11 9 8 8 7 6 8 8 12 11 13 12 11 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 9 9 10
10 10 15 10 11 10 15 8 8 8 10 14 16 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 7 10 10 10 12 10 11 16 11 11 10 9 9
8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 11 12 10 10 10 10 10 11 12 12 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 9 9 14 16 15 10 8 8 8 6 6 6
6 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 10 9 16 13 15 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 9 9 6 6 7 6 6 6 8 8 13 6 6 6 6 9 11 13 7 6 8 8 6 6 10 7 6 8 8 13 19 21 28 17 19 19 21 21 22 28 28 28 28
23 20 19 24 35 43 39 48 42 42 41 41 25 21 8 7 7 8 8 8 8 8 9 9 9 13 15 23 18 18 18 29 30 43 43 36 33 26 28 28 36 26 26 33 37 39 43 43 41 37
37 37 37 37 27 19 8 7 7 8 8 10 12 15 10 11 10 11 11 11 11 11 11 11 12 16 17 30 34 37 41 48 48 48 43 43 48 42 42 47 43 43 34 37 34 34 39 42 48 48
53 54 43 43 48 48 42 43 48 48 50 50 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 50 59 44 44 50 37 30 25 17 12 11 10 10 10 10 10 19 26 37 33 30 30 30 30 32 32 32
32 39 39 43 48 43 43 33 37 30 30 37 43 48 59 59 57 54 54 54 48 48 39 39 35 39 39 47 46 47 47 43 46 46 54 54 57 57 57 57 57 57 41 43 43 46 57 57 54 46
42 39 39 44 44 57 42 46 44 44 44 44 57 43 43 44 57 57 43 43 35 35 43 59 47 39 39 39 50 50 50 43 52 52 52 43 43 39 43 43 52 52 52 52 57 52 52 52 43 43
33 43 42 42 37 43 43 44 47 43 44 43 43 37 35 35 41 42 42 42 42 33 33 33 42 42 42 42 32 32 35 30 30 42 42 59 59 59 59 44 43 43 43 47 57 57 54 59 57 47
47 43 43 43 44 44 43 39 37 36 37 32 41 30 30 37 39 43 43 43 43 43 43 37 37 28 24 24 24 21 28 23 23 23 32 27 31 28 23 23 25 28 22 19 15 17 13 11 10 10
10 18 18 12 12 11 11 12 12 12 12 18 18 30 25 34 23 24 22 17 17 25 29 32 23 20 20 23 23 23 23 23 24 32 32 23 23 28 28 31 28 23 23 23 21 21 14 15 17 11
12 11 12 21 11 10 8 8 8 10 8 12 19 13 12 10 10 10 17 18 32 32 28 23 18 21 15 18 19 15 11 11 11 11 12 11 17 13 13 15 13 27 13 11 8 8 8 8 9 9
10 15 10 10 10 12 16 20 31 31 25 25 12 11 11 21 20 13 13 12 20 16 23 16 23 15 20 15 22 21 24 30 32 26 28 18 18 16 27 24 23 17 11 11 11 17 18 23 25 22
22 37 37 37 37 37 36 20 16 16 15 15 18 27 30 27 17 17 17 30 22 27 19 15 15 12 12 11 21 19 18 15 12 10 10 17 17 18 10 12 13 13 18 19 12 11 11 11 11 13
19 30 28 26 14 13 10 12 13 21 24 23 21 13 13 18 22 28 26 15 14 10 8 8 8 8 10 15 15 21 13 17 17 19 19 18 13 14 14 18 17 19 12 12 12 10 8 8 8 8
8 13 12 9 9 9 10 11 19 18 19 13 11 11 11 15 21 24 28 28 24 24 16 15 17 17 9 9 12 13 9 9 11 15 13 14 14 17 15 10 10 10 10 10 13 12 10 9 10 10
15 24 26 15 13 11 11 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 10 13 10 9 9 9 12 11 10 10 10 15 12 17 15 15 10 10 10 10 14 15 13 10 10 10 11 11 21 15 12 10 10
10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 11 9 10 14 14 37 29 22 12 10 10 10 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 16 11 10 8 8 8 8 8 13 13 14
13 13 12 10 8 8 8 10 10 13 10 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 12 11 9 9 10 10 13 19 12 11 11 11 12 11 11 11 11 16 12 11 9 9 11 10 10 9 9 9
9 12 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 10 7 6 8 6 8 8 8 8 10 8 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10
11 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 12 12 10 7 6 8 8 11 10 13 10 10 11 11 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8
6 6 8 10 10 11 10 15 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 8 6 6 8 8 8 6 7 6 9 9 7 8 8 10 9 9 9 11 12 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9
6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 8 10 8 8 8 8 8 11 11 11 12 9 10 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 10 10 11 11 11 16 11 11 11 11 8 8
6 6 8 8 6 6 8 8 8 9 11 11 9 9 9 8 8 6 6 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 10 10 10 11 10 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 8 8
8 8 10 7 6 8 8 11 11 11 11 16 12 10 10 8 8 8 8 7 9 7 8 8 10 10 10 11 8 9 9 8 8 8 11 10 8 8 8 8 11 14 13 13 10 12 6 6 8 8
9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 11 9 9 10 9 6 8 8 6 6 8 12 12 9 7 7 6 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 8 6 10 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 6 7 6 6 8 8 9 10 10 10 10 10 10 10 10 11 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 7 8 8
8 9 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 13 17 9 9 8 8 8 8 8 8 |