| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-142E08.T7 (MSMg01no142_e08.b1) | MSMg01-142E08.TJ (MSMg01no142_e08.g1) |
|---|
| ACC | AG346925 | AG346926 |
|---|
| length | 1,271 | 1,251 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 601 (91 - 691) | 686 (92 - 777) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_e08.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_e08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_e08.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_e08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:44 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCATTTTNNNNNNNNGACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCCAGTTGGTTTCTCCAACCCTTTTAAAAATTACTGATGG
GAACCTCTCTGAGCCAAGCACCATTAAGCAATGTTCCAACCACCTGGAAA
TGATACAAGGGAAATTAGTTGTGGTTTTACCCACGAAGCTTTATTGTGGC
TTTTAAGTCACTGCATGCCTGTTTTGCCTCGTTCTAAAAAGAAAAAAGAC
CAGACAAAATTCACAAATGGAAGTATAGTGAGGCTGAAGTACATGAATAA
GGTGAAACCACCAGCTTCAAAACCATTCAATATCAGAGGCAATAAAAAGA
AGTCAAAATTAGACTTCAAGGCTAAGTTTAAAAAGATAAGCCAAGCTAAA
GCATTTTTACCTGATTATTATAACACTCTTTGCGCAGCCATCGATAGCAG
AAGGCAGGGGCTATTCCATCATGCTCCACTAAAGCAAGGAGAACTAGCAA
GCAAACTATGTGTTGCTTGCACTGCTGAAAGTAGTGCATTCTACAATAAA
GAGAAGAAACCTGAAAGAGGGAAACAAAACCCCTCTTTACAGGTATTTCA
GCCTGGCCAACACCTGGGGGCTGATGTGGATCAAAGGAAGGAAACTCTCC
CAGACCTATCACCCTCCTCTACAAGTCAAGAACAGCCTGTTAACAGTCAA
AGGATAAAAGTCCAAGAAGATGCCCTGCAAAATGCTTTAAAGGCTAACCT
CCAAATGGATCCCCTAGACGCTCCAGAATTACAGAAAACTACCATAGCAG
ATAATGTTTTCACCTTTCCTGTGGTTCCTGAAAGTTTATTTCTTAAAGTA
TGGACCTCCTTCCCTGTTGATTATGTATACTTGATATATGATGATTTTGA
ATTTATCATAATCTCTGAACGTGTACTTAGTTTTTATCTTGTTTGTATAT
TTTCTTTATAATTCACCTTTTTTGCTCATTTATTTCTTTTTTTACGTCTT
ATTTTTTTTTTTATTTCTTTTTTTTTTTGATCTATTTATTTTTAATCTTA
TTCTTATCTTCTTTGTAGTTCTACCTTCCTTTTTCCCGTTTTTTCTTCCT
TTATATTTTTCTTTCCTATTTTTTTTTACTTCTTTTATTTTTATTTTTTC
TTCCTATCACAACATTTTACTTTTTTCTCAACTACTTATATTTTCCTTTA
TAAATTTTATTATTTATATCACTCCTTCCTTCTTTCTTTTTCTTTCTCCT
CTTATATTTATTATCTTCAAT
| NCCATACATNNNNNNAACATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTCAACTGAGGAATACCGA
ATGGCAGAGAAGCACCTGAACAATTGCTCAACATCCTTACCCATCAGGGA
AATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACAGCAGTCAGAATGG
CTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAA
AGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACT
CTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTGCTACCGG
AGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAATG
GGTAAGAAGGATACTTGCTCCACTCTGTTCATAGCAGCCTTATTTATAAT
AGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATAT
AGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTATTCAGCTATTAAAAAG
AATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCAT
CCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTACTCAC
TGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATAC
AATTTGCTAAACACATGAAACTCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTGTGAAC
ACTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTAC
AGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAAAGGATGGACCATGTAGAGACTGC
CATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCATCCCAACGCTGACACCATTG
CATACCCTATCAAGATTTTATTGAAAGGACCCCAAGTGTATTGTCCTCTG
GGAAACTATGCCGGGGTCCTACTAAATCCATAAGTGTATGCCTCCCGCCA
CCTATAGGTAGGATCTCCGGCTTTCCCTGGTCAGGACTTCAAGTAATCTA
TCTAGTAATTTCTGGATTTTGCCCTCCATTTCCGGTTACACTTATTATAT
TTCTCCTATTCCTGTAAGTTTGTTCTCCTCTCTTCTTATTTATTTAAAAA
TCCTTTTTCTCCCTCCCTTTTTTATTATGCTCATTTTTCTTCTATCTTAT
TTTTCTCCTCTTCTTCTAATCTCATTCTATTACTTGTCTCTGTATTTTAT
T
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 10 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 15 15 8 8 8 8 12 10 15 15 35 28 24 26 24 23 23 37
37 47 43 43 50 53 53 53 42 42 53 53 35 35 35 35 35 35 31 31 31 30 31 21 21 9 10 10 10 12 12 22 19 18 14 11 18 20 23 23 23 22 20 25 36 36 36 50 50 50
50 50 42 42 38 38 38 36 36 35 35 31 33 39 50 42 34 27 16 12 11 12 11 11 11 11 15 12 14 19 26 30 33 33 31 23 17 11 9 6 6 6 6 6 10 10 31 32 43 50
50 50 50 53 48 48 48 57 57 57 57 57 57 53 53 47 40 40 40 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57
57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 42 42 42 35 35 42 47 59 59 59
59 59 54 48 48 48 48 57 48 44 48 48 48 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 48 57 57 59 59 59 59 59 48 57 48 59
59 59 59 59 59 59 50 50 50 41 39 29 29 15 12 11 12 12 11 9 12 15 30 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 46 48 48 48 48 48 43 43 43 43
43 46 48 48 48 54 59 59 43 43 43 43 47 57 57 59 43 43 37 35 35 39 47 48 57 59 47 47 44 47 43 44 47 48 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54
54 50 57 47 47 50 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 35 35 38 43 47 57 52
52 52 43 43 52 52 39 43 43 52 57 43 44 33 33 33 43 43 43 43 31 29 43 43 50 52 52 52 52 52 52 52 52 54 57 57 59 59 57 43 44 32 28 28 43 43 57 57 59 50
43 43 43 59 43 43 43 43 44 43 44 42 43 42 44 42 43 42 42 33 33 28 44 40 40 22 24 20 23 36 44 42 43 43 44 47 57 48 48 47 47 39 42 41 37 30 37 37 44 44
43 40 40 40 28 28 18 18 15 34 28 39 43 43 43 43 43 48 43 33 33 25 28 33 37 43 57 48 37 37 28 30 28 28 23 22 24 26 21 23 19 14 14 15 15 15 20 26 17 17
24 26 28 32 37 32 35 39 35 35 33 34 28 37 28 17 13 11 14 14 22 32 39 35 34 32 24 20 15 15 15 16 19 14 14 11 22 18 20 18 19 24 24 25 25 22 19 18 18 25
17 12 11 9 9 10 10 10 12 11 11 13 22 17 17 11 16 20 23 23 30 19 26 11 11 11 12 14 23 19 17 10 10 10 13 15 24 33 27 26 23 18 11 11 11 11 11 11 11 9
9 9 8 8 8 8 10 8 11 24 22 22 22 8 13 8 8 8 8 17 9 12 11 9 8 8 11 22 19 19 14 9 8 8 8 8 20 15 15 10 9 9 10 9 9 9 10 10 10 10
10 10 10 12 10 10 6 6 6 8 8 12 10 10 10 9 9 9 10 10 10 10 16 13 11 9 9 6 8 6 6 10 12 13 15 13 10 10 10 10 12 13 14 12 10 9 9 9 9 9
15 12 20 17 12 12 11 12 9 9 8 8 8 8 10 12 12 10 8 8 8 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 18 12 12 18 12 8 8 8 8 8 8 10 7 7 6 6 8
10 10 10 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 11 9 8 10 11 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 7 9 12 12 8 9 12 13 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
11 9 15 9 8 8 8 8 10 10 11 10 10 9 9 9 9 12 15 14 9 10 15 21 24 14 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 11 8 8 8 6 6 8 12
8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 7 7 8 10 10 8 8 9 9 12 9 10 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 13 8 10 9 15 8 11 7 9 10 8
10 8 8 8 8 8 15 13 17 11 11 10 17 13 12 9 9 9 10 16 12 12 13 13 10 13 6 6 8 8 8 6 6 8 12 9 9 9 9 13 10 8 8 8 11 8 11 18 10 10
10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 10 13 9 9 9 10 13 10 15 21 12 12 15 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 12 9 8 8 8 8 15 8 8
9 8 8 10 8 8 12 9 7 13 10 6 6 8 8 8 8 11 9 10 8 8 6 7 11 12 10 8 8 8 10 7 7 8 6 6 8 12 15 10 11 13 9 8 6 6 6 8 8 10
10 8 12 10 8 6 6 8 6 8 8 8 11 10 10 12 16 10 10 8 8 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 7 7 3 0 0 0 0 0 0 3 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 15 6 6 6 7 10 10 9 8 6 8 6 3 0 3 17 19 23 25 30 31 31 30 20
21 15 15 24 26 32 35 42 42 42 37 35 35 36 38 38 53 53 50 50 50 50 47 47 33 33 11 11 12 17 16 17 12 11 10 10 10 13 13 9 9 10 20 26 33 37 33 33 44 33
36 36 53 53 42 53 53 53 53 53 44 44 50 33 33 33 28 25 16 11 10 10 10 10 10 13 18 24 30 33 37 36 39 37 37 23 19 10 10 10 10 19 22 37 43 41 50 50 50 50
53 53 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 53 68 68 68 68 68 68 68 48 57 57 48 48 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 53 53 50 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57
50 50 50 50 50 50 47 41 27 23 11 11 11 12 15 15 18 18 28 41 59 59 59 59 59 53 42 42 42 43 43 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 57 54 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 52
52 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 47 47 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59
59 59 57 44 43 24 24 24 43 44 59 59 59 59 48 54 54 54 48 59 59 59 54 57 57 59 59 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 48 48 48
47 47 50 53 53 57 50 50 41 41 37 37 37 37 59 59 43 28 31 40 41 30 30 33 33 33 33 43 28 28 22 22 23 28 39 42 48 48 48 48 43 43 39 39 35 42 36 37 37 28
28 28 43 43 50 57 57 59 59 43 37 39 30 30 33 37 39 43 43 40 41 43 37 37 30 28 24 24 28 25 31 39 37 39 28 28 14 24 24 32 26 17 17 17 30 30 39 33 32 30
30 32 37 39 41 37 37 19 22 9 9 9 18 21 34 22 28 25 27 32 37 37 36 25 22 22 25 19 22 19 19 14 19 15 13 19 11 11 10 11 16 19 19 28 28 22 18 19 17 14
14 16 15 18 19 12 11 10 10 10 9 13 17 11 21 16 21 21 18 17 10 12 15 16 16 20 24 22 19 18 19 19 10 10 17 18 18 20 30 16 19 9 9 9 14 18 32 33 23 23
10 9 8 10 10 13 10 10 15 14 15 15 22 19 11 13 10 14 14 14 12 10 10 10 10 10 10 11 10 10 10 9 8 8 8 11 11 10 10 10 17 20 12 12 12 11 11 10 21 13
10 10 10 10 8 8 10 15 8 8 10 13 11 12 13 24 25 29 15 17 14 24 28 34 24 24 18 10 13 13 13 15 10 10 8 6 6 6 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 11 8
8 8 8 9 9 9 11 13 10 10 9 9 9 11 13 11 10 10 12 10 9 9 10 13 10 10 10 10 10 10 13 15 10 10 10 10 11 11 13 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 11 11 11 16 15 11 7 6 6 8 8 9 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 9 8 8 8 8 8 8 11 10 9 9 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 7 9 10 15 9 9 9 11 11 11 10 12
11 11 10 8 8 8 13 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 11 8 8 6 8 6 8 8 10 10 8
8 8 6 6 10 8 8 10 18 10 10 11 8 8 8 8 8 9 10 8 13 10 10 9 9 9 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 13 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 9 9
12 17 16 9 9 9 9 9 9 11 11 10 8 8 6 6 8 8 9 12 9 10 11 8 8 12 11 7 6 8 6 9 9 14 8 10 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 9
9 |
|---|
