| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-142F21.T7 (MSMg01no142_f21.b1) | MSMg01-142F21.TJ (MSMg01no142_f21.g1) |
|---|
| ACC | AG346996 | AG346997 |
|---|
| length | 1,215 | 1,184 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 685 (142 - 826) | 743 (86 - 828) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_f21.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_f21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_f21.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_f21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:01:57 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCAATCCNNNNNNNGTGCATTGGGCGCTNXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTCACTTGAGGAATATGCATTGAAAGACCAGCACCTGA
AAAAATGTTCAACATCCTTACTCATCAAGGACATGCAAACCAAAACAATC
CTGAGATTCCACCTCACACCACTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGG
TGACAGCAGATGCTGGCAAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTTCTCCACT
GTTGTTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAG
TTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTCCTGGAGGATCCTGTAATACCTCT
CCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACTAGTAAGAAAGACGCATACT
CCACTATGTTCATTTCAGCTTTATTTATAACAGCCAGAAGCTGGAAAGAA
CCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATTAAAAAAATGTGGTACGTTTA
CACAATGCCATACTAATCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCC
TAGGCAAATGGATGAACCTGGAGGGCATCATCCTGTGAGGTAACCCAATC
ACAAAAGAACTCACATGATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCA
GAAACTTAGAATACCCAAGATATAAGATACAGTTTGAGAAACACATGAAA
CTCAAGAATGAAGACCAAATTGTGGATACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGG
GAACAAAACACCCATGGAAGGAATTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGA
CCATAGGATGGACTATCTAGAGACTGCCCCATCCGGGGATCCCTCCCATA
ATCCGCCCCCCAAAGCTGACACCATTGCTTTACACAGCAAGATTTTGCTA
AAAGGACCCTGATATAGCTATGGCCTTGTGAGACTATGCTGGTGCCCAAG
CAAACACCTTAATTGGATGCTCACAGTCCGCCTATTATAAAAAACCACAG
GGCCCCCCCATGTTAGTAACTTAAAGTAAAGTCCCCAAAGGTAACTTAAG
GGTTTTTTGAAACCCTATTATGGGGGTACACACCTTATTGATATCAAATA
ATTCCCACCCCCCCCCCAAACCCCAAAAAGTTTTGTTTTCCCTTCCCTTC
TTATATTTCTCTCAAAAAAGGCCCCCTTTTCTCCTCTCTTCGGGAATAAA
AAAGTCTCCCTTTTG
| NCGTTTCTTNNNNAATGATGGNAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTATTACCTTTGGAAAAGATGTACA
CTTAAAATGATTCCCGTATGAATTATTATTACAATATTTTAGCTACTCTT
ATTCCATGCCCTCTTTACTAAATTCTTTTGCTGAGAGCTCTGATTCATTA
GGCATCTGTAGTTCAATGACTGGGGAATGCTTGGGGCTACAAGTCAGGTG
ACCGTTCTAAGTGAATTCCACTCCCACACATGTGGTTTAGAGAAGTGAGC
CACGTGGTCTCTCCAATTGGAAGAAAACTAAACCTAAACATGTAACTTGG
AGGACTCAAATGATATTACTATATACTATGAGTGTTTGGGCCATGCACCT
ACTATAGCATGTAAAACATAGAATTTCTTAACATTAAGATATTTCTTGAC
AAGCCTCCACACTTTATTAATAATTTATGGTACCATCAAGAATGTATCAT
TTTCCTTCATAGTATTCCACTCTTGCATCTTTGTTAATCTCATGTGTGAC
TGAAGTATACTTTATAAATTATATCTCTATCTGTATTTCTCATGTTATAA
AATGATAAAACATCTTGTTCACTGCCTTGTAAAGCTAGTTCATTTCTCTC
ATTGTTATTCAAATGATATTGATGGGGTTTCTCTGTGTTTTCATTCGCAG
GTGCACTTTCTAAATTAGAAGACATATTCCCCACATCAGGCAATACAAGA
GCTTTTCCAGCTGTTAAAGTTTTTTTTTAAGTTTAATATTGTATAATTTC
TATAGGAAAATCCCTATGAACATTAGTTAAATTACATCCAAAGTGAACAT
GTACATAAAGCTAGCATTTATGTCAATAATCATAAGGAGCACCCTATTAC
TGAAGGTTTTTCCATTTATTTATTAATGCTCTACTCTCCCACATAATCTA
TTATTAAACTTACATTTGACTCATCTTGGAAGGGTTACAATTTTGTTAAA
TTTTGAGTCCAATAAGCAAAATAATTTTTCTTCCCGGTTGGCCTTCCCCC
TTTTTGAATAAAATTTCCGGAAATAATCCCCTTTATAACCCGGAAGGAAA
GGGTTTTTCTTTCTCCGGGGGCTCCCTTTTTTTGTGCCCCCTTTTTGCTG
GGCAGGGGGGGGTATCTCCTCTACAACATTTTAT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 6 6 7 6 6 7 8 8 8 3 0 3 8 15 10 13 8 8 8 10 10 10 22 22 36 34 30 34 34 34 34
37 47 47 42 39 43 43 43 57 43 43 53 50 50 36 36 35 35 35 31 31 31 33 37 37 23 17 10 10 12 11 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 8 10 13 25 30 33 33 33 33
36 53 59 59 57 57 53 53 53 53 53 33 33 33 33 33 28 24 14 12 10 10 11 12 15 26 27 37 25 14 9 9 9 14 16 32 28 25 11 11 11 18 18 36 36 42 42 42 41 41
47 47 50 47 57 53 57 57 57 57 43 50 50 50 48 48 57 57 53 50 50 50 48 54 54 54 54 57 57 57 50 50 50 53 50 48 48 48 48 54 54 57 59 59 59 59 48 48 48 57
57 57 57 57 68 59 57 59 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 68 57 57 68 68 59 59 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68
68 68 59 57 57 57 43 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68
68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 53 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 41 41 25 18 18 9 9 9 9 9 15 22 36 39 50 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 43 43 43 43 43 43 48 57 57 68 68 68 57
57 57 48 42 46 36 46 46 57 59 59 59 59 59 59 54 54 57 57 57 54 54 57 57 48 48 48 48 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 57 57 57 54 54 57 59 57 57 59 59 68
59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 44 44 42 42 37 47 47 44
44 59 47 47 54 44 44 43 43 43 44 44 48 46 46 37 37 44 43 54 46 46 39 39 35 59 59 59 59 43 43 43 43 59 59 57 48 48 48 39 39 36 36 39 39 43 44 43 43 39
39 37 33 31 37 33 28 29 35 34 34 37 37 36 37 37 37 48 59 59 59 57 57 57 57 47 43 43 48 48 48 53 53 48 57 59 48 48 48 48 34 41 40 40 39 39 37 37 30 29
32 37 39 39 47 59 59 48 47 47 37 37 32 28 28 26 25 31 31 32 37 37 33 33 33 33 40 40 36 34 28 28 28 30 24 31 27 26 26 29 26 26 32 37 39 37 27 22 8 8
8 9 13 19 34 39 39 39 27 21 13 13 21 21 33 33 28 30 37 37 20 23 10 15 15 16 11 9 9 10 15 16 17 14 15 12 12 11 11 17 14 30 23 28 23 22 32 34 32 24
18 11 8 8 8 9 9 11 15 11 8 8 8 9 9 9 10 22 13 8 8 6 6 10 10 17 16 19 18 15 16 16 8 8 10 9 8 11 10 8 8 13 25 25 29 25 22 22 19 19
27 21 23 20 25 22 20 8 12 10 13 10 10 10 13 10 10 9 9 9 9 9 10 11 11 15 15 15 15 15 8 8 8 8 8 8 8 11 17 14 11 10 10 10 9 8 10 8 7 8
9 14 22 15 12 10 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 6 6 6 6 12 8 11 11 16 26 23 13 13 9 9 9 10 10 22 11 12 13 11 11 11 15 11
13 15 10 10 10 14 17 12 11 10 10 7 7 6 8 8 6 6 7 8 8 8 8 10 9 9 7 12 7 15 11 9 9 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
12 10 11 11 12 10 10 8 8 8 8 8 9 8 12 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 10 10 12 12 12 11 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 7 6 6 6 8 8 9 9 10 8 12 8 10 8 8 8 8 10 10 16 14 14 9 14 8 8 8 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8
10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 13 13 15 12 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 6 6 6 8 7 15
19 15 13 8 8 8 19 13 10 10 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 0 3 9 9 8 8 9 9 3 0 0 0 0 3 9 6 6 6 7 6 3 0 3 6 8 6 6 7 6 9 10 13 8 8 9 8 11 10 19 19 19 8 9 9 23 21 28 22 22 28
21 21 9 9 10 24 21 35 35 35 35 36 36 41 41 50 50 42 47 23 21 9 9 10 6 7 7 6 6 8 10 10 10 11 15 18 20 28 43 50 50 59 53 53 38 38 42 42 36 36
36 36 36 36 33 33 39 37 37 37 34 25 13 10 10 10 15 15 25 37 37 37 30 37 37 33 33 33 38 30 35 19 19 19 26 32 44 53 53 53 47 47 43 43 43 43 43 48 48 48
53 54 54 53 48 48 48 50 50 50 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 51 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 59 35 35 35 59 59 68 62 62 68 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 43 44 44
43 43 29 14 14 14 14 29 39 44 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 68 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 68 38 38 13 23 23 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 59 68 59 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 38 38 20 20 23 38 44 57 68 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 38 38 12 12 12 14 14 34 34 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 68 68 68 57 57 52 52 48 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 48 48 48 59 59
59 59 59 43 43 43 23 21 10 10 10 21 23 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 54 43 59 54 48 43 47 43 43 43 46 47 43 48 48 48 57 59 59 59 59 40 40 34 34 25
28 28 37 39 43 39 32 26 32 37 37 37 30 34 34 41 41 44 37 37 37 33 33 28 25 23 23 22 17 15 24 22 25 26 37 37 41 43 47 59 37 37 30 37 37 39 37 37 39 39
47 47 39 39 39 37 32 32 34 30 25 12 11 11 14 18 26 22 18 19 22 28 26 34 22 20 18 18 15 14 15 19 25 25 24 20 10 10 8 8 12 13 18 22 17 16 14 12 19 17
32 28 34 25 22 19 20 18 22 21 28 21 28 23 23 17 10 9 10 10 12 19 24 18 13 10 10 10 13 23 18 11 9 8 10 10 11 14 17 12 11 9 11 13 20 20 30 30 28 32
18 12 10 10 9 12 23 29 25 27 15 14 14 15 10 8 8 8 10 16 11 21 12 10 10 10 10 10 10 10 10 19 21 13 13 14 10 8 9 8 12 10 10 8 10 8 8 8 10 13
12 19 17 10 10 8 9 8 8 8 9 9 9 9 9 11 14 9 10 10 12 10 10 10 21 21 16 10 8 8 9 12 9 7 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 13 16 9
10 10 19 10 12 9 9 9 10 10 9 9 8 6 8 8 8 8 9 8 8 8 11 8 12 13 15 9 10 10 10 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 16 17 12 14
13 13 9 8 8 8 9 9 10 10 11 9 9 8 8 10 10 8 8 9 9 10 10 10 10 10 11 11 12 18 13 12 7 6 6 6 8 8 10 17 8 8 8 8 8 8 11 11 21 16
18 19 20 27 28 25 26 15 17 11 17 10 9 9 9 10 7 7 7 7 7 8 10 8 8 11 11 16 25 22 14 10 9 9 9 9 9 15 9 8 9 9 8 8 11 8 8 10 10 10
10 10 9 9 9 9 9 10 11 10 11 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11 11 11 11 |
|---|
