| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-142L05.T7 (MSMg01no142_l05.b1) | MSMg01-142L05.TJ (MSMg01no142_l05.g1) |
| ACC | AG347245 | AG347246 |
| length | 1,314 | 1,247 |
length of high quality (start - end) | 424 (133 - 556) | 684 (85 - 768) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no142_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no142_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no142_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:02:43 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CGTTCTTTNNNNNGCATGTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCACTTTGTAGACCAGGCCCTTTACAAACTCAGAAATCTGC
TTGCCTCTGCCTCCCAACCCTTGAAATTACCGGCGTGCGCCACCACCCGG
CCTGCCAGTTTTGTTACTATAGCTTTGTAGTATAATTTGAATTCAGGGAT
GGTGATGCCTCCAACAGTCTTTTTATTATCCTTGAGTGTTTTAGGAATCC
TGCTTTGTCTTGTTTTGTTTAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGTG
TTTATTTTCATATGATGCTGAATATTTGTCCTTTCAAGTCTGTGGAGAAT
TGTCAGACTTATTATGGGGATTTTGTTGAGTTCTCTAGATTGATTTTGGT
AGGATGTTTATGTTCACTATACTAATTCCACTGACTCATAAGGATGAGAA
ATCTTTCCATCTGGTACCTTCTTCAGTCTCTCTCTCTTCAGTGTCTTAAG
GATTTTATCCTACAAGTCTTTCCTTTCCTTGGTTAGAATTACCTGAAGGA
TTGTGAAGGTGTTGTTTCTCCGAATTCTTCCATAGTCTTTTTGTCATTTG
TAAATAGGAAGGATACTGATTCTTGTGAGTTAATTTTGTTTCTTGCTACC
ATTGTTTAAACTATCCCTTGTAACAGTTTTTCTTCTCTGCAGTCTTTTTT
CTTTTAATTATTTTCCATTTTATTTTCTTGTCTTTAATCATTTTTTTGTT
CTCTTCCTTTTCCTTTTTTTATCTCCCTTTGATCTTCTTTTCCTTTTTTT
TATTCTCCTTCTTAAAATTTTCTGTCCTTTACTCTCCATCAGTTTATGGT
CTCTCCCTAAACATCTTTTTCTTCCCCTCCTTGTCCTTCCTTTCCTACTC
TCTCCTAATTTCCTTCCTCTCATTGTTTCTCTTTCTTTCTTATCTACTTT
TTTTTCTTCTTCCTCTCTTTTTTTTTTATTTATTTCCCTCTTCTTTCTCT
TTCACTCTCATTTCCTCTTTTTTTCCCTTTACTCTCTTCTTTTTTTTTCT
TTTTCCTTCTTTTTTCTTCTATCTTATTCCTTCTTATATTTTTTTTTTTC
TTTCCTATTTCTCTTCTATTTTCTCTCTTTCTACTTACTTTATTTGCTTT
TTTCTTCTTCTTCTCTTCCCTTTCTCTATTCTTTTCTCTTCTTTCTTTCT
CACTCTCTATCTTCCATTCTCTCTTCTCTATTCTATTATCTGCTTATTTT
TTCTTTTTCCTTCTTTCCTATTCTCTTCTATCTTCTTCTATCAATGTCTC
CNCTCTATTCTCTC
| CATTCTTCTTNNTAAACATGGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAATCCCCACTCTTCTCTATGC
TTCCACTCCCTCTTCTGATAAAACCTTTCCATGCCTGGCATTCCTCCCCC
TCTATGTTCATGTACCCTGTCTACTCTGCCCATTCCCTCAAAGCATTTTC
TTCCTGCTCTCCTTCCTACTAAGGGTCCCTTTCTTTTAGTATCTGATATT
AAACAAATCAGTGTAAAACTTTAATTAAGGCATACCTATTAATGACATGG
ACACTAATCTATGGAGGCATGGGTTGTTTCACTCAGTGTAATATTTTTCA
GGTCTATTCATTGTTCTACAAACGTCATAATTTAATTCTTTTTAACCAGT
GAATATTATTACATCTTGCACACATACCATACTTTCAGTATCCATTCTTC
CTCTGACGGGTGTCAAAGCTCATTCAATTTTCTCATATTATGAATATAGG
CAAAATGAACATGGAAACATCTCTGTAACAGGGTATGAATGGAGTCTTTT
GGGCAAATAATCAAGAATGATATATATGAGTCATGCCAAAGCTCTATTTT
TAGCTTTTGGGCAAACTCCATGCTTATTTTTATTGTACCAGTTTACACCC
ATATCAATAGTGAATAACAGTTCCTCTTTCTCCACAGCTTCTCCTGCATT
TTCAGCCTCTTGTTTTCTTGATGCCAGTTATTAAGAATAAAATAAGATGA
AATCTCTAGGTTGCTTTAATTTGTTGTCCCCCAGTGACTAAAATTATCGA
ACATTTTTAGAATGTGTATTAATATATCAGACAGGGTTCTCTAGAAAAAC
AGAACCGATTCTAACACATGTATATGAGATTATTAGAATGGCCTACAGCC
AGTGATCCAATTTGTTCCAAAACAGCTGACTCCCAATTGGAAAGTCCAAA
AAATTCAATAATTGTTTGGAAAAAGGAATCTGGTTGCCTCAAACAGCCTT
TGGTTGTTTCCAAAAATCCTGAAAAAATTAAAACTCTATTAACTAGGTAA
GGAAATAACCTTTCCCATGAAAACTAAAGCCAAATTATACCAAAATATAA
AAATTTCTCTTCTCCACAGGTCCTTTTAAATAAACGGCCCCCAATAAAGA
TGTGGGCCCCAAATTTAAACTTCTCAATGTACTTAAAACTTTATTGGGTA
TTCTTCCCTAACCCTCTCTTAATATAGGTTTATTTTCTATCTTCACA
|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 10 9 9 3 0 0 0 0 0 3 6 7 6 6 6 8 8 11 13 11 8 6 6 6 6 8 19 19 17 19 16 19 22 20 23 24 28 36 36 33 33 33 36 33 33 33
33 33 39 37 37 32 32 32 29 37 29 30 31 31 30 31 28 28 30 30 33 37 23 23 10 10 9 12 13 21 16 11 11 11 11 10 10 11 12 9 9 9 18 27 35 41 42 37 39 31
31 36 36 53 38 53 53 53 33 31 31 31 31 30 21 21 8 8 8 8 10 9 12 12 12 11 16 15 9 9 9 9 17 21 37 26 26 17 18 20 41 32 57 57 48 48 48 59 59 57
48 48 48 48 50 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 47 42 42 42 43 43 43 50 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 57 68 57
57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 43 43 43 43 44 47 47 44 44 46 46 57 57 57 57 57
57 57 47 43 43 57 47 57 57 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 68 59 59 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 57 48 48 43 44 43 57 48 57 57 48 59 59 48 47
47 39 23 25 18 18 13 14 11 11 11 16 16 27 27 40 40 40 43 47 47 59 43 40 40 47 47 59 59 43 43 43 43 43 42 39 35 32 32 32 32 35 35 42 42 42 37 43 39 44
32 42 35 39 41 40 40 39 39 30 39 37 40 37 48 57 59 46 57 57 57 48 57 44 44 36 23 23 36 38 57 59 59 59 57 54 54 57 32 32 13 13 13 34 34 50 59 37 37 37
50 59 59 68 68 59 59 52 52 52 38 38 32 23 17 24 19 33 43 44 52 52 52 57 57 43 43 39 38 38 38 38 38 38 18 20 20 32 32 43 43 28 29 21 25 18 24 24 15 19
24 43 32 32 18 23 17 19 18 15 14 14 14 24 24 20 23 23 27 27 18 12 12 12 10 19 18 27 19 33 28 28 31 27 20 20 20 32 36 27 24 20 24 24 13 10 16 10 11 12
10 12 10 8 8 9 11 11 11 12 12 15 13 11 11 16 18 21 22 22 22 23 19 10 10 8 10 8 9 11 13 19 24 30 30 30 30 18 16 9 9 9 12 13 9 10 11 14 9 10
9 12 9 9 15 13 14 9 9 9 12 10 13 8 8 8 8 9 9 10 8 8 6 7 10 10 10 15 14 26 12 8 10 10 9 12 12 12 9 9 8 8 8 10 10 10 11 8 12 10
9 10 10 12 9 8 8 8 8 8 8 12 11 13 10 9 9 9 10 13 10 21 14 19 14 12 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 14 17 17 16 18 12 12 8 8 8 7
7 9 9 11 11 17 18 16 11 11 12 10 10 10 15 12 15 15 14 14 13 16 13 10 10 10 15 15 13 10 8 8 10 10 9 8 13 8 8 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 10
15 16 6 6 6 7 10 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 13 11 12 10 8 8 10 13 10 14 6 6 8 8 10 8 9 11 11 12 10 9 9 8 10 10 8 8 8 8 9
8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 9 9 10 10 10 10 12 12 12 8 10 8 8 8 8 8 10 16 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 11 6 6 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 13 10 11 9 9 9 9 7 8 10 9 10 10 13 10 9 9 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11
9 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 12 12 10 9 12 10 13 11 11 11 11 10 8 7 6 8 8 10 13 8 8 8 10 8 8 8 11 10 16 14 10 10 13 8 8 8
8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 21 16 10 10 10 10 13 22 8 8 6 6 8 8 8 13 10 10 8 10 15 21 20 23 15 16 11 11 10
10 10 8 10 8 8 8 7 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 13 12 14 21 18 15 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 13 13 15 10 8 10 10 8 10 13
15 11 13 11 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 10 10 10 8 8 10 8 7 6 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 6 6 6 6 11 6
9 9 10 8 8 7 6 8 8 9 8 8 10 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 6 9 9 9 9 6 8 8 6 8 8 10 11 10 8 8 8 6 9 11 13 13
10 10 10 10 13 15 9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 15 11 8 8 6 6 6 6 9 10 9 9 10 8 11 7 7 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 13 12 8 8 8 6 8 8 7 6 10 7 6 8 8 8 8 9 10 10 12 15 10 10 8 12 8 8 10 8 6 6 8 6 9 9 11 11 10
3 0 3 6 6 6 8 8 10 12 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 6 8 8 8 3 0 0 3 9 9 7 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 10 11 8 7 9 3 0 3 17 19 13 8 9 12 21 21 29 15 15 21
24 28 32 35 37 37 37 29 28 29 36 38 53 53 50 50 50 50 47 41 27 27 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 12 19 21 28 28 33 32 33 36 36 36 36 36 36 36 37 43
43 43 42 38 38 35 35 35 35 31 30 30 17 19 11 11 8 8 6 8 8 17 23 34 28 28 28 28 30 37 37 47 37 37 24 21 15 16 28 34 53 50 50 50 50 50 50 50 50 50
47 47 47 47 43 50 54 54 54 50 50 50 50 50 50 50 48 48 47 50 50 50 57 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 33 33 18 18 27 44 44 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 43 43 35 43 43 62 62 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 44
44 39 39 39 14 14 14 14 20 39 39 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
43 43 23 23 23 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52
62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 43 44 38 43 39 39 43 62 47 62 62 62 62 62 62 62 62 35 35 35 44 43 52 52 43 43 43 43 62 43 43 43 62 62 59 62
59 47 35 35 47 59 59 59 59 59 57 43 28 28 9 9 12 28 34 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 57 39 38 43 43 43 38 38 36 38 17 32 32 59 52 52 57 52 52 52 52 54 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 27 27 9 9 9 16 16 14 34 34 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 43 43 43 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 59 59
59 59 59 48 46 39 40 40 48 39 43 39 48 32 32 31 36 43 39 59 21 21 8 8 8 15 13 11 12 19 29 41 37 31 35 31 32 32 40 28 28 14 16 16 21 17 25 26 24 23
20 25 25 32 35 34 34 37 37 48 42 39 37 37 27 24 21 10 9 9 9 21 21 33 23 26 16 17 28 32 27 33 24 19 19 12 21 21 17 11 11 11 14 22 13 19 19 22 21 19
20 24 27 29 30 42 34 34 18 18 11 16 13 21 23 24 18 18 21 25 24 25 27 30 20 20 13 10 8 13 10 13 13 15 10 10 12 12 16 12 12 12 12 11 16 25 20 19 15 19
14 13 15 16 13 11 11 12 21 24 23 16 14 14 16 17 17 30 28 28 28 31 33 35 19 13 8 7 7 11 19 19 19 17 11 10 10 12 17 13 11 9 10 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 17 13 14 14 10 10 9 14 13 11 11 9 9 8 8 8 8 8 12 14 11 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 15 19 8 6 6 8 7 11 8 10 9 8 10 8 10 10
11 12 11 15 16 11 8 8 6 6 6 8 8 24 15 15 13 12 11 10 9 10 9 10 9 8 8 10 10 10 8 9 9 8 9 8 8 8 8 11 13 16 12 11 11 9 9 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 18 18 20 18 21 14 14 13 12 15 16 19 15 9 15 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8
8 9 8 8 11 8 8 8 8 8 8 13 10 9 7 10 8 6 6 8 8 7 8 9 9 12 10 8 8 8 8 8 15 15 14 8 8 6 6 8 8 8 10 14 8 7 6 8 10 10
9 8 8 8 17 15 8 8 8 8 10 10 7 9 7 7 7 8 9 9 12 10 11 9 8 11 10 8 8 8 12 10 10 13 10 11 11 11 12 12 11 11 11 10 10 11 10 8 8 9
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 13 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 11 11 8 10 9 9 10 10 10 7 6 6 6
8 8 13 12 12 8 6 7 10 8 8 10 12 9 13 12 13 13 12 8 8 8 13 12 13 10 8 10 6 8 8 8 7 7 12 10 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 6 |