BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146M13.T7 (MSMg01no146_m13.b1) | MSMg01-146M13.TJ (MSMg01no146_m13.g1) |
ACC | AG350228 | AG350229 |
length | 1,266 | 1,233 |
length of high quality (start - end) | 735 (88 - 822) | 600 (87 - 686) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_m13.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_m13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_m13.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_m13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:58 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCATTTTTANTTNNTTACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTGTTAAGTTTAGAGACCCTTTAGAGAGAAGAATTTAAC
ATCAAATGTGTGAGAGGAACCTTAGAATATATATATATACCCCTCTCTAC
CACAGTGAAAGAATAGGAGACCATGTGTTGAGAATAAAAGAGATGTGGTC
ACTGTATTAAAGAAAGTCACAGAAATTCTTAGGATGCAGCATTGACTAGG
AAATCTGTAGGAGAACCTCACAAAAGAAATCCTAATTTCTATTAGGATTG
AATGGCAACCCTAATAGAAATCATGCAGAAACAGTAATTGCCTTTATTCT
TAGTGTTTGTGTGGGACCAACATCTGCCTTTCTGAAACTAGGTTTGTCTC
ACTGAAAATATATATGTACATGTCTGTATTGTATTATTAAAATTGGTTCT
GCTGTCCTCCTCAGTCTACTGGACAGCTTTCATGTATTTGTAGGTGATGG
AGTTTTGTGAATGCTACATGTGTGTAACACAATTAGCACAAAGTGAATAC
AGCATAGAGTGTAGTTACTACTAAACAATGAATTATGTGAAATGTTGGTG
AATTTCTGGAACTTTACAGATATTTAAATGAGATTAGAAAAAAATTTTGC
AGATAATTAAAAATATATCAAAGGTGGTAAAATAACATCTGAGCAGAGAA
GATGAAATCGAGAACCCCTTTGGTTAATTAAACCTTGCTGTGATGTTTAG
AATTCACTTGGTACTCGTACCCCTATGCACCTTTACTGTGTGCACAGACT
CACTTAATATTTATTATTTGTCAGATAAAAATGTTGATTTTTGAAACCCC
CAAACTCCTCTAATTAAAAAGAAACAGATGTGTTTGTAACTAATGTCTCA
TCCCCAAAGTCCCCAATTAAGAGACATGAATTGATTTTTATGCAAATAGT
TATTGTATATTATTGGTTTTGGAACACTGGAAATTTATCCCCCCAAGGGG
TGTTTTGTCTTCATTTTTTTTAAAAATTTATTATGGTTTTTCCTCTTTTG
TCTCTAAAAAAGGGTATGTTTGTTTATATTATCTTAGTCTCTAATTGTTT
ATAAATTTTGGTGTTAATTTTAGTATTTTTTCCCTTTTCTTATATCGTAG
GTTTTATTCTCTTTCTGTATTTTTTCTTGCTGATTAATTAACTTTCTTAT
TCTCTTAATTTATGTTATGTTTTCATATACTCAATTATCTTCTTCTTGCT
ATCTCTTACTTCTTTA
| CCCTTTTTTTTTTTAAGATGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAGTTTAGCTCTGTTCCCCAT
TTTTAAATAGGGTTACTTTGTTCTCTGGAGTCTACCCCCTTTATTTCTTT
GTATATATTGTATATTATCTCTCCACTAGATGTAGGGATGATAAAGTGTT
GCTAGCCGTCCAGCGGCTCACATGGATGGGGTACACCTGAGTGGCAGGCC
GGCACTGAAAGAAAGGGAAACTAGGCAAACGAGAGAGAAATGGAGCCAAG
ACAGTGTTCTGATCAAGGATCAAATATTTAATAGCGAATGCACTTATAAA
GGGGGGGCATTCCCGCCAATTCATCTTTGGAGCCTGGAACCAGCTGCAGG
TGATGATGTGCAGGATAGGGCATAGTCTCCAGAATAGCTCTGGGACCTGT
CAGCAGGTAGCAGTATCTTGAAGAGAAACAGCGACAGTGGCTGAACAATA
GAGTGATCTAGGGAGGAAGGCTCCACCATAGGTAATCTCCTTAGTGGTAG
CAAGGTCAAGTTCTGGCTCAGCAAGCTTCAGGCTGAGGGAAGGTTACAAT
TTCCTCCCTGTTATTAATATTAAAATAATAAGCTGGACTGAGGCACAACA
TTTACTTATGTGCCATAGTCCTGCCTGTGAATTATGGTGGCTGGTGGCCG
TGCTTGTCTTAGGAAATCTTAGATCTTTCCCTAAAATCCAATTCTGTCTT
ATAGGCTATGTGCAGCTTAGTTGTGTTATTTTTTTCACAAATGTGGTTTC
TGTGTGTGTTATTAATCGCTACGGTCCTTTGATATGTACCTCTGTATTAT
ATTTGTTTGCTCTTTTTATTTGATGTCTTTTTATTGACTGTTTGGTTCTT
TAAACCTCTTTATATTCTCATTTCAAATTCTATTTTTTTATGTTTAATAA
TTTTTTCTTTTGTTTATTTTCTTTTTCTCTTTCTTTCATTTTTATTATTT
TTTTTACTCTTCCTTACCTTTTTTTAATTTTTTTTATTCTTTTTTTTTTT
TCTATTTTTTTTTTATTCTTTTTTTTATCTCTACATTTTATTTTTTTTTT
TTATTTTTTCTTATTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTTATTCTTTTATTCTA
TTTATTTTATTTTTTCTCCTTTTTTTATGTTTTTTTTATCTCTCATTATT
TTTATTATCTATTGTATATTTTATTTTTTATTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 16 12 9 3 0 3 3 0 0 3 6 6 6 6 8 6 6 7 8 13 10 8 8 8 6 6 8 19 19 9 8 8 8 12 12 19 19 35 36 34 34 34 36 36 36
36 34 37 43 50 50 50 50 42 42 43 36 36 35 35 35 35 35 31 31 31 31 37 34 34 28 23 24 17 17 11 11 11 11 11 11 18 16 22 25 31 39 41 48 50 53 53 57 53 53
57 57 57 57 57 57 57 53 36 33 33 33 33 42 43 27 23 12 10 10 10 10 10 10 14 26 30 41 37 39 41 41 44 44 39 37 37 28 28 20 23 18 18 18 20 23 22 28 31 31
41 50 36 36 50 50 50 50 53 59 59 57 57 50 50 48 50 59 59 48 36 36 40 42 42 50 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 59 57 57 57 57 57 57
54 54 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 52 52 52 52 52 52 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 50 50 50 43 43 28 28 18 21 13 12 12 15 22 30 30 59 59 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 54 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 59 59 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 52 59 59 68 68 68 68 57 57 57 43
43 43 43 52 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 50 43 37 50 50 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57
57 57 44 44 35 39 41 44 44 43 43 43 57 57 57 57 59 57 47 43 43 43 59 59 57 54 54 54 48 48 57 57 57 47 43 43 43 43 59 59 43 39 28 28 25 40 25 30 30 33
37 39 43 47 47 48 47 47 47 47 47 47 48 48 48 48 41 59 59 47 30 23 21 18 17 18 32 47 59 34 32 23 23 23 32 41 43 39 24 24 24 33 37 36 50 57 59 43 36 36
37 43 39 25 21 11 11 11 23 16 31 37 37 39 39 41 41 41 37 33 33 33 33 33 37 37 28 28 33 31 34 42 37 37 34 33 24 18 18 15 21 32 43 43 48 43 37 37 37 37
37 37 39 39 39 39 37 39 37 37 37 42 37 37 28 25 23 22 18 9 9 12 12 16 20 19 19 8 8 8 10 8 14 24 22 23 24 28 28 28 28 31 32 28 28 25 20 14 28 18
17 15 12 9 8 8 8 8 12 9 10 10 15 15 17 17 19 14 9 9 9 14 13 21 16 19 9 9 9 11 13 17 19 22 12 8 8 10 8 8 9 11 10 15 8 7 7 7 8 11
16 22 22 18 18 15 19 21 28 20 14 14 13 12 11 11 10 10 9 9 11 9 9 9 9 11 15 16 12 10 8 8 8 10 11 15 19 11 9 8 11 9 9 19 10 12 13 10 10 9
10 10 9 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 10 9 10 10 13 13 11 16 12 17 13 11 11 11 11 11 11 12 10 19 10 10 8 8 8 10 11 13 12 11 11 12 11 8 9 9
10 10 24 12 10 8 8 8 8 11 8 9 9 9 9 9 15 22 23 23 14 10 12 10 10 10 10 13 11 9 9 14 9 8 9 9 12 15 13 13 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8
9 10 10 9 9 9 9 9 15 15 16 11 12 6 6 8 8 10 11 19 11 11 10 10 10 12 12 12 11 8 8 8 8 8 10 8 16 8 8 8 8 10 8 8 10 12 14 12 12 10
9 9 11 15 11 11 11 11 8 8 8 8 8 10 15 11 11 11 22 11 9 9 7 7 8 8 10 9 18 18 13 8 8 10 12 8 8 8 8 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 15 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 6 6 6 6 13 13 15 13 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 10 9 9 10 8 7 6 8 8 10 6 6 6 7 10
6 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 13 10 10 9 9 8 6 6 6 8 6 6 6 6 7 7 10 10 9 9 10 11 15 10 12 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 9 15 15 16 23 10 10 8 10 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 7 10 13 17 22 25 21 19 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 8 12 13 8 7 9 9 16 12 19 21 19 10 10 10 22 19 29 22 22
15 21 12 12 12 26 24 35 30 35 38 38 53 53 50 50 50 50 42 41 23 23 9 9 9 13 13 16 11 10 10 10 9 12 16 12 16 21 28 30 35 35 35 35 35 53 38 50 50 50
50 36 50 50 36 36 33 41 37 33 33 21 17 8 8 8 8 8 19 18 30 30 28 33 32 33 33 33 31 31 29 21 17 11 11 11 16 16 23 21 21 29 37 37 33 44 44 53 53 38
53 53 53 53 53 53 53 50 47 43 47 47 47 47 47 47 47 47 47 50 68 68 68 51 47 47 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57
47 47 47 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 68 59 59 59 52 52 52
59 57 57 52 57 57 57 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 52 57 52 52 52 57 57
57 57 57 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 43 43 37 39 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41 31
25 15 22 12 12 12 12 12 12 12 12 21 26 37 41 41 47 47 48 48 48 57 48 48 48 48 57 57 48 48 57 48 48 48 44 43 43 43 59 59 59 59 50 48 48 47 42 48 39 37
32 30 30 30 44 44 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 43 44 43 43 47 47 50 41 41 41 50 43 47 47 57 50 57 57
50 43 52 52 57 57 52 52 52 59 50 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 38 43 35 35 35 43 43 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 43 44 43 43 43 57 57 57 59 59
59 52 52 52 57 57 59 59 43 52 52 59 59 43 43 35 59 38 38 20 20 20 38 38 38 39 39 50 50 43 43 35 35 35 50 50 57 57 57 57 57 57 68 57 57 50 48 48 57 44
44 42 35 35 44 44 68 68 68 57 57 54 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 44 44 28 28 28 28 28 28 28 25 40 18 30 21 23 20 24 24 30 28 31
28 27 33 28 28 43 43 57 48 39 39 59 43 50 30 30 15 15 17 30 30 37 37 36 36 34 34 32 32 26 25 30 28 24 20 23 16 15 11 9 9 10 10 11 24 19 15 22 10 10
10 9 11 7 8 8 16 19 19 22 19 12 12 21 23 35 37 36 23 24 14 14 14 26 22 32 27 24 27 25 20 19 19 9 10 10 16 15 13 12 12 10 15 13 13 12 24 25 39 39
28 28 22 31 25 25 19 28 22 24 23 15 15 10 8 8 11 8 10 8 9 10 15 13 14 10 15 8 8 8 10 21 15 8 8 12 12 14 8 12 10 10 10 13 9 8 8 8 12 15
17 11 11 13 8 8 8 8 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 6 7 8 8 8 6 6 8 8 8 11 8 10 10 10 10 8 10 7 7
8 8 9 8 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 10 11 11 11 10 10 10 10 8 8 8 11 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 19 15 13 13 10 10 10 10 11 11 18
11 10 9 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 18 15 11 10 10 11 11 13 10 10 10 10 10 9 9 7 8 8 11 8 8 10 10 8 10 6 6 8 8 8 14 13 10 10 9 12 12
8 10 8 8 8 8 8 8 12 11 6 6 8 8 9 10 10 11 11 11 11 11 10 8 13 8 9 7 6 8 8 9 9 8 10 6 6 6 7 10 10 10 8 8 8 8 11 10 17 13
21 14 14 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 11 17 17 12 12 11 9 9 9 9 9 9 9 11 11 18 12 11 11 10 13 10 10 10 11 12 12 13 13 11 12 8
8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 16 12 12 15 10 8 8 8 8 13 10 8 8 10 8 8 8 11 8 6 6 6 6 6 6 7 10 6 6 6 8 8 14 10 9 12 10 18 10
10 10 10 10 11 14 15 13 10 9 9 13 13 10 8 8 7 8 6 8 8 10 8 7 7 7 7 8 11 8 9 10 9 8 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 9 10 10 11 14 13 10 10 9 9 10 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 13 10 10 12 12 10 8 9 17 12 10 10 10 8 10 10 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6
6 7 6 8 8 7 7 8 8 8 8 8 6 6 8 11 8 8 9 11 11 11 11 11 12 12 15 13 9 9 12 12 9 |