BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-150F22.T7 (MSMg01no150_f22.b1) | MSMg01-150F22.TJ (MSMg01no150_f22.g1) |
ACC | AG352829 | AG352830 |
length | 732 | 706 |
length of high quality (start - end) | 272 (50 - 321) | 501 (79 - 579) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no150_f22.b1 PHD_FILE: MSMg01no150_f22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:13:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no150_f22.g1 PHD_FILE: MSMg01no150_f22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:13:55 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGTAACTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTTTCAAAGAATCC
GCGGAATTCTGTTTGTTACATTTCCCCTGTGCCAATGAGTTCGAGGCTTT
TTACCACTTTTCTTTATTAGATTCATTTGTACCTGGTTTTATGTTGAGGT
CCTTCATCTACTTGGACATGAGCTTTTTGCAAGGTGACAAGTATTGTAGG
GCAGTGGGCATGGGGGAATAAAGGGAGTGGGAGAAAACCGGAGTCCTGCC
AGAGTTCCAGTGATCTGGTTGGGATAACATGGCAGGACTGCTGCATGCTT
TTCATGAGGCCCCAGGTGGGTGTCTGTTTGTCGCAAGCTATGGACCCAAC
CCACAGGAGGTGCACAAAGGGCATTCTGAAGTCTCTGGGCCTCATGGAGA
CCAGTGATAACTGGTTCCCACCCCCCCTGCTCCCAGACACGGAATAACTC
CGTAGAAAAACATAATACATTTGTGTAAGCCCAATGATCTAATCTGACAT
CCCCTGAAAGAACGGATGAAACGGTAATTTACCAACGAAATGACAACCGA
CGGAAAAACCAAAAATGGCCCACAATGCAAAAATTGTTTTGTTGTTGCAA
TGTTAACCCGCCACCCCCCGGCATTATCAAAATACACGATATTGTCATAT
TTCCTTCTCCCCCTAGCAACAATTTGGTAACAATGAAAATTGCGCGAAAA
CACCTCCAACACCTGTACAACTCCACGGGACG
| AAACCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGGTATTTATTATTACATGAAC
TGAACAATATTCTCTCCATTGCTTATATTAATTAGCTAATAATTCTTAAA
CTATGAATATATATTCACATAGGTAATGAAACATTAAGTTGTATATAACT
GTGTTTTATTTGGATTCAAATGGGGACATTGTCATACTTTAAACTCTAAA
TGCAATGTGATTATCTTTGCATTGCATTTATGGATTTTAGAGTAAATATT
TCATGCATAGACATAGCCATTTCATGAATTATTATATGTCTGCTAATTTA
CCCAACTATTTATTGAAACAAATAGGTTGGATTAATTTTCTTCATGAATT
TTTTAGGTATTGTTGTTAAATGACCTTCTGTACTATTTACAATTCTGTAA
TTATATATTAGTCCACAATGCAATGTTTGGTTTTGATTAAAGCTATATAA
TAACAATGCACAGGGTCAATTTTCACTGTTCAAAGAGTCTATGCTTTTCT
GTATAGATAAGCCTAAAATAAACACTAATAAGGTGTGAGAATAGATAACT
TAATGCAGAACACTTGTTGCGTATGAGATCAAACTATAAAATATGGCAAC
ATTTGCATAGTCAAATGAACATACTCAGAAAGAACTTATGAAAGCACTCA
CAAGCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 15 10 11 11 16 20 28 37 34 33 32 30 25 25 37 37 37 37 37 37 37 37 37 27 21 11 9 9 15 15 13 9 8 7 6 6 6 8 8 8 9 9 10 17
23 30 34 30 30 31 29 31 31 42 39 27 27 15 12 12 10 9 9 9 11 12 18 28 28 33 28 34 35 47 37 47 50 50 42 38 44 40 40 43 47 59 59 59 57 57 57 57 68 68
68 68 50 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 57 57 47 47 57 57 48 48 59 59 48 57 44 59 59 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 36 50 50 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 52 52 52 43 50 38 37 37 50 50 54 54 54 54 57 57 57 42 42 43 43 52
52 59 59 39 38 38 43 43 43 32 43 32 43 44 52 50 50 50 42 50 47 43 43 43 43 52 52 43 42 43 43 39 50 50 57 57 57 57 50 43 43 37 43 42 42 42 44 43 47 42
48 48 48 47 47 43 46 42 44 39 40 40 57 57 57 57 48 59 59 57 47 47 47 47 57 57 48 48 37 37 30 36 36 43 42 42 42 42 42 39 43 39 37 30 28 25 30 30 39 43
30 32 30 39 27 43 47 41 41 43 47 43 43 37 37 23 21 15 12 12 9 15 11 6 6 8 7 9 15 10 8 8 8 8 8 12 15 23 32 32 37 28 28 23 28 22 23 11 11 11
13 22 32 32 28 18 14 14 14 15 18 11 11 11 12 12 13 19 21 15 11 12 12 15 15 23 28 28 20 19 18 19 12 12 15 15 16 15 12 11 11 12 15 18 24 21 19 15 15 15
17 12 19 19 19 19 22 21 16 13 11 11 11 16 16 25 17 15 10 10 10 18 19 22 20 12 8 8 8 8 8 8 8 12 16 17 13 15 11 13 11 8 6 6 6 8 8 8 8 9
12 8 8 6 6 6 6 10 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 13 12 12 12 11 11 12 12 11 8 8 8 8 8 9 10 8 6 6 7 8 8 10 13 11 11 11 15 10
10 8 10 10 11 10 9 10 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 6 8 10 10 8 8 8 15 10 10 10 10 9 8 10 8 8 8 8 9 12 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 9 9 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 19 15 13 9 9 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 9
9 9 9 11 12 10 10 10 10 12 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 6 6 6 8 10 8 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 11
11 11 12 15 11 11 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 9 9 9 9 | Open.Hide. 7 7 6 6 7 7 7 12 9 9 9 9 15 16 20 19 22 28 32 37 39 37 37 40 39 39 43 37 37 37 34 36 22 23 12 6 6 6 6 8 3 0 3 10 15 15 26 22 33 37
37 33 36 36 50 36 36 53 53 41 44 25 23 9 9 10 13 18 10 12 16 22 17 30 33 33 31 31 37 39 39 44 57 57 57 57 59 59 59 59 59 53 44 44 37 37 42 43 48 42
48 48 42 42 42 47 47 47 68 68 68 68 68 68 48 48 48 48 41 41 47 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 50 50 50 50 51 51 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 57 68 68 57 57 52 52
43 52 52 59 59 68 68 57 57 57 57 45 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 44 44 57 57 57 57 52 57 52 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
43 43 39 59 39 43 39 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57 52 57 52 59 59 59 59 59 57 57 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68
59 59 52 52 52 57 59 59 57 57 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 57 57 52 52 52 57 52 52 50 59 59 68 68 59 57 50 50 43 57 57 50 50 48 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 57 57 57 57 47 43 43 42 42 37 30 30 42 44 59 59 59 54 57 59 59 59 57 57 57 54 54 57 59 59 59 59
59 57 43 43 43 43 43 43 47 47 47 40 43 43 48 43 39 34 28 19 12 12 12 12 12 12 30 30 37 31 35 35 39 43 48 48 57 47 47 47 47 47 47 59 59 39 35 35 59 59
59 59 48 54 54 59 59 43 42 35 35 42 43 48 57 44 44 39 32 32 40 40 37 37 41 41 43 46 39 41 41 47 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 48 54 57 57 57 57 47 59
43 44 44 43 43 43 44 44 57 47 46 44 37 35 35 35 35 35 39 44 44 44 42 28 28 36 36 30 30 42 37 37 37 39 43 44 46 48 59 59 43 43 43 47 48 57 54 54 57 57
43 43 43 43 40 30 28 32 32 28 31 32 40 37 39 39 39 39 40 43 43 43 43 43 33 23 19 15 12 12 20 12 19 13 10 8 8 8 10 11 26 32 34 37 37 37 30 30 27 25
24 18 20 28 19 15 10 13 13 9 7 7 8 8 13 10 25 25 26 26 14 14 14 23 22 11 11 11 20 20 30 22 20 24 22 25 22 28 30 33 30 37 25 16 11 10 10 10 21 18
32 32 40 37 37 28 28 25 21 21 14 14 14 15 21 23 25 17 17 15 15 12 22 16 16 11 13 11 12 14 24 25 24 24 37 32 34 31 28 28 18 9 12 10 10 8 12 15 11 11
12 13 12 21 12 12 |