BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-160L02.T7 (MSMg01no160_l02.b1) | MSMg01-160L02.TJ (MSMg01no160_l02.g1) |
ACC | AG360294 | AG360295 |
length | 741 | 781 |
length of high quality (start - end) | 313 (47 - 359) | 105 (135 - 239) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_l02.b1 PHD_FILE: MSMg01no160_l02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_l02.g1 PHD_FILE: MSMg01no160_l02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:43 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCCTAAGTATGACAGGACACTTGGGGTAGAGGGTTGAGGAGGAGTA
TGCAAATCCTTGAAGCGTATGAAAAGAATAGCCAGCCGTGCAGGAGGGCT
TAGGTGAAGCCTTCCCCTATCCGACACACTCGGGTCTAATAGAGTGGTCA
CCACTGTGACTCCATGCAAGGCAGAGAAGTAACTGTGTTGTACTACTGCT
CATAGAACTTTCTAGAATTCCATTGTAGTGTGCTAAGGACAACTGAATGT
GCACAATGTCTCAGCAGAGGACTCTGCTACGCTACCCTACGGAGGTGCAC
GCACAGCATTTTTGGTACTGCCGCCTCTGTGGAAGTCTCTTGCCCCTCTG
CACTGAGAAGCCCAACCCACCTCCTCTTACATCTGCAGTTCTCAACCTGT
GGATCAGGACCATCAAAAAACACATATTTCTGATGGTCTTAGAACACCTC
CCCCAACCATGGGTTTATTTTCACTGCTACATTGTAGCTATAATTTTGCT
ACTGAGCCATATTGAGAAACACTGTCCTATAGATTCTCTCTGTCTCTCCC
ATTAGTGACTTTGTACAGCCTTGTGTCTGTGGGAATCAGGCTATTAGGCT
CAGTTTCTAGTCTTTCTATTGCTCTGCCCATTATAGTTCTAGGTTGCGCC
TGACTGTCCTGTGGCTGATGATTTGGAGCGGGCGGCATAAG
| ATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTAATGTGCTTTAAATCAGGCCTGCA
AACTCACTTGGTGGTTTTTCTGCCCTAGATAATGGGAGACCCCAGCATGC
TGGACTTCTGCAGAATAAAACACTCTTTGCATTTACATACTATCTGAGTC
CCGGGTATCATTCTGCGGAGAATTACTGGACTCTACTCAAGAATACAAAA
ATAGAACAGCTGACAAATGAAAGATTGTATACATCACAAAACTGCTCCCA
TTAACCTGCTTTGGATACTTTATCCCTGTGCATAGGCTCATATGAACATT
TGAGTTCAAAGCCTTCGAACAAAATCTTGCATGTAGGATTAATAACAAAA
AGCATATACTATCTTCCTATCTCCCCTTAAAGAAAAACTGAATTCTCCTT
AATTGCTATAAACTTTTTCAATAAAGATTAATTGTGTTAAAAGTTAGTAT
TTGTTTGCTTGATTTGTTTATTTTTCAGTGATACATTTTAATAATATCTT
TGCCTCCTGACTTCTAGATACCTTCCTTCTATAATCTATTATTTTTGTCA
TATTCAATAATTGAACTTTCTAACACCCGCCTTTTCCCTAATTTTTTATC
TATCTCTTTCTCTCCCAATTTTTTTTTTATGCACCAATCTCTATCAGATC
TCCTCCTCTCCTTCTCCCTTTTTACTTTGACACTCCATTAGTTTTCTAAC
AATATATTATTAAAACATTCTCTCACTTCAA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 10 16 37 59 43 37 37 37 31 31 37 37 33 33 33 37 33 33 48 48 35 28 24 24 24 35 43 50 47 48 48 57 57 57 57 42 37 36 36 36 40 43 57 57
47 47 47 42 50 48 57 57 57 57 68 68 68 54 53 50 57 47 47 50 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 51 50 50 50 50 50 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 59 52 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 57 57 59 59 59 52 52 52 52 59 59 57 57 57 54 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 57 57 68 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 54 54 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
48 48 48 48 48 48 57 48 54 54 57 59 48 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 54 57 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 59 48 48 48 48
48 59 47 32 28 15 12 12 12 11 15 15 23 12 13 15 23 12 15 13 11 10 10 10 10 12 12 18 12 13 26 28 43 44 44 43 43 43 47 48 57 43 43 43 43 43 46 43 42 43
42 48 48 43 47 43 43 43 47 26 19 10 8 8 8 9 34 41 43 43 39 41 41 41 41 43 36 33 28 28 35 37 39 42 42 32 44 37 37 23 37 37 42 35 39 39 44 57 47 47
43 43 43 57 57 57 57 50 37 37 37 35 36 43 43 43 43 44 44 57 57 52 43 43 43 57 44 57 48 48 44 57 43 50 43 43 35 35 40 44 37 37 37 37 37 40 57 57 59 59
54 46 43 43 43 48 37 37 39 39 42 41 43 43 57 57 59 57 57 48 42 30 25 22 25 25 26 30 30 35 39 39 42 24 24 18 18 18 28 32 32 35 35 39 40 44 43 36 36 36
59 43 43 43 39 39 32 30 30 32 37 37 37 39 37 39 18 14 14 14 14 18 34 34 28 25 32 28 28 28 32 34 43 57 43 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 47 47 47
39 37 37 30 30 39 24 30 22 28 23 27 19 19 20 24 24 17 16 11 13 13 19 23 32 32 30 34 28 24 24 20 18 16 18 23 23 22 23 23 24 28 18 13 13 12 16 16 21 12
15 14 26 26 30 21 13 10 10 10 13 13 10 10 14 14 23 28 28 34 28 21 21 12 16 11 12 12 18 18 28 18 15 10 15 8 8 8 15 21 25 25 15 13 11 11 11 11 19 19
21 24 16 15 10 16 10 9 8 8 10 11 13 15 20 14 16 17 16 12 11 12 12 10 9 9 9 9 9 13 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide.12 13 14 13 10 9 8 7 7 9 9 14 18 40 41 39 37 37 37 39 37 37 43 36 39 39 47 25 23 11 9 9 11 8 8 8 8 8 12 17 17 26 22 27 37 41 41 53 53 53
41 41 50 50 42 34 27 15 9 9 10 10 10 14 14 12 12 10 16 16 25 28 33 47 47 44 48 39 32 34 34 34 37 47 57 57 59 57 47 42 42 37 30 30 32 39 43 43 43 43
43 39 34 36 36 36 36 33 43 41 37 37 31 31 20 27 14 16 15 8 8 8 8 8 8 12 12 11 11 11 10 20 18 21 21 25 25 28 28 43 47 57 43 43 39 33 36 33 30 28
37 31 36 36 43 43 48 48 48 37 37 30 37 37 39 39 35 36 37 39 39 36 44 37 39 41 47 42 43 43 43 39 37 36 28 23 23 36 44 57 57 47 47 41 35 32 32 30 35 42
47 44 42 33 32 29 32 36 44 57 43 43 32 32 15 15 12 15 12 11 11 25 25 42 35 32 32 24 28 28 32 32 43 42 43 32 26 14 14 14 19 12 8 8 8 8 9 13 14 14
24 16 20 19 20 20 20 23 23 23 43 38 37 28 28 25 32 25 19 16 16 23 23 32 24 24 20 27 27 43 20 16 19 19 30 17 25 28 37 26 36 28 32 28 32 24 24 24 28 28
28 19 15 16 24 16 32 27 27 23 21 24 19 21 12 20 15 13 12 12 12 12 12 15 15 18 21 14 14 14 14 13 13 25 24 28 23 23 26 23 20 20 16 19 9 9 9 13 15 28
28 21 15 14 15 15 20 20 20 23 16 10 10 8 8 10 10 9 9 11 15 10 10 16 15 12 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 11 8 10 12 13 14 8 8 8 8 10 10 10 10
10 9 9 10 15 16 8 8 8 8 8 12 10 12 10 10 10 8 8 9 18 13 14 14 12 14 13 13 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 11 12 9 9 9 11 10 18 13 10 9 9
9 8 10 13 8 8 8 14 15 9 9 9 9 10 10 12 12 15 16 14 14 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15
11 10 9 10 10 12 9 8 8 8 6 6 8 8 10 9 8 10 9 6 8 8 10 10 8 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 8 8
8 8 8 8 8 9 13 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 12 12 10 10 10 12 12 10 10 11 11 11 11 12 10 10 9 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 9 11 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 13 9 8 8 6
6 8 6 8 8 8 8 8 8 15 12 17 10 8 8 6 6 8 8 10 15 21 18 12 10 10 10 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 11 10 10 13 9 9 9 9 11 14 21 15 12 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 12 8 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 13 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |