| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-161P18.T7 (MSMg01no161_p18.b1) | MSMg01-161P18.TJ (MSMg01no161_p18.g1) |
|---|
| ACC | AG361246 | AG361247 |
|---|
| length | 1,243 | 1,209 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 413 (43 - 455) | 335 (118 - 452) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_p18.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_p18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_p18.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_p18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:29:14 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | plural |
|---|
| sequence | NNGGCGCATTGCGCGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCATTACAAATTCAGTAAGAATGTTACTTATTCAGTAACATTCAAATTTA
CTTCTAGTAGAGACAGTGAAACTAATTAGGTATTACAAAGAACAGAGCTG
GAATAGCTCAGGGCTGGTCTGCAGATAGATTACTTAGGACAGTAGCCAGT
CTCACCCAAACAAGGGAACACATAATGGCCTAGCTAATAGGTGGGTTTAC
CATGTAAGAGTTAGGGAATCCCACTGAGACACAGATCTTCTCTATAGCCA
GGTATAGCAGGCTACATTGCATATTAGAAGCAAGTTGGTGAATTCTTCTG
ACAAATGGAGATTCACCACAGATACTTAAAAGAACAGCCAAGTTACATTC
ATACAAGAATTTATCAAGGCCTAGGAAATAGGGGGTTTGTGGTATTGCAC
TATTTTTTTTCCCCCCCCCCAGAGNAGAACCCCCTGGTGCTAGAAAGGGA
GAGGCTCAAAGGAGTAGCACAAATTGTGACTAGGGTGTGAAATCCTTACC
TGTCATTAGCTGACCCTAGGCAGGGCTGTTTTATCTTTACTGTAAATATT
ACCTGGTTCCTGTAAGTCCTTTTGAAGTCATTCCTTTGTTTTGTGTCAGG
TAACTTCAATGTACTTTGTCTGCTGTGACACGCTACCCCTTTGTTTTCTG
TATTATATAAGACTGGTGTACATTTTGTGAAAATACATTCAGATTCTACA
CCATCTCTCATGTAATTCTGTCTGTCATTCATTCGCTGACTCCTTGTCCA
CCTGCAACCAGAGACTGGTTCCATGCAGACAGGGACCCAAAAGGGTGTGC
GGCCGCATATAGCCCCTGTTTTTAGAATTTACTGCTGGGAACTCCCCCCT
TGTCCTAGGTGGCTCTTTTTAGGGACTATTTATTGGTGCTTGTCTTTTTA
TTTTAAATGTTTATATGCCTTTTTTTCTTCTTTCTCTTTATCTTGGCCTT
CCCCTTTTTTCGTCTTTTTGTTATTATTATTTTATAATTTTCACCCTTCC
TCCTTATGTCTGCTCCATATAAAAATGTCCTTCCCTCCTCCCTCGTTTGG
TTCTTTAATCTCCCTGTATCTGTGGTGTCCCTCTTCCCTTCTTTCCACAC
TCCTTTTTCCCGTTTACATCTCACTACTTTTCTTTTACTGCTTCTCTTTC
TTATCTCATCTTTACTCTTATCTATTAATAACTTTTCNTTTCG
| NNNGGGCCGCACGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACTGAATTCTGCTTGAAATGAAATGTT
GTTAATTCACCTTAACTGACAGAATGATGACTGGGCATGAAAGAAAATCA
TGAAAGGCAGTAATGAGCACCTAAAAGACTTGTGCCTATTTAGAGACAAA
AGCAAGCTAAATTCTTGTCCTTCCTCTAAGGCTGGAGATAATTTTCCTAA
CCTCTCAGTCCTTGCTGGTTCCTGTTGAGTAATGTGTACTATTGTGAAGA
TCAGAGAAGATACATGCAAAGTACCTGGGCAGGTAGAGACAGGCTGTTGC
TGTGGTAACTGTTGTTCATATTCATTCCTTCTTTGCATTGTTCTGATATG
TCTAGTTCAACTCACGTTTATCAACAAGTGATGCTTCATGTTTATTCTGA
ATTTTTTTTTCCCCCCCCAACTGTGGCTCACTCTTATTTTCAGAAGAGAA
GAATTTTCTTTTAAATCAACTCAATAAGGACATCTACAAACCTCTTATAG
TTAACTTCTCAGCCCAAACTACAGCAGCCCAAACTCAGAATATCATCATG
TCGAAACTGGACAAAAGAAGAAAAGGAGTTTTTGGCCCTCCTTTAGGCAA
GAGAATGGTAAGGGCTTCTCCCCACTGTTCTATCTCTAGTATAATCCTGG
GCCCATTTATGTCCCCACTGCCACAATCAGAACAAGGAAACCTGGCAAGC
TAAAGATTGTCATCTTTGGTTTATTTTTTGTTTTAAATGATTTGATGTGC
ATGCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTCCCCCCCCCCCCTTC
CCTTCCTTTTTTCTCTCCCCTCTTCTCTTCCCTCTCCCCTTCTTTCTCTT
CTCTCTCCTTCTTCCCCTTCCTCTTTTTCCTTTCTTTCCTCCCTTCTTCT
CTCTTTCTTCTTTCTCCCTTTCTTTTCTTCTTCCTTTCTTCTTTCCTCTC
CTTCTCTTTCTCCCTTTCTTTCTCTTCTCTCTTCCTTTTTCTCCTTTCTC
TTTCTTCTCTTTTCTNCTTCTTCCTTTTCTCTTCCCTTTTCTCTTTTNTT
NCTCNCTCTTTTCTCTTCTCTCCCTCTCTCTCCTTCCTTTTCTTCCCTCT
TCTTCTCTCCCCCCTCCCTTTCCCTCTCCTCCTCTTCTTCTTCCTCTCTC
TTCTCCTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 8 13 8 9 9 12 12 16 22 16 16 16 16 16 19 22 10 10 10 12 12 15 26 26 42 42 42 42 42 42 42 47 48 48 54 46 46 41 41 47 47 42
42 41 41 41 42 42 32 32 32 41 57 57 47 47 47 48 57 47 48 57 57 57 57 48 47 47 47 50 50 51 51 51 50 50 50 50 51 51 68 68 35 35 20 20 20 24 32 44 57 57
47 50 50 50 42 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 47 50 50 51 50 48 46 46 46 48 50 50 42 37 30 30 30 37 43 43 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 57
57 57 57 57 57 59 57 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 37 32 32 15
15 11 12 11 11 11 12 18 30 36 47 50 59 59 59 48 48 48 59 48 48 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 59 59 57 57 50 53 50 48 59 25 25
12 12 9 15 12 14 13 10 15 15 15 18 20 22 30 26 20 12 10 10 10 10 23 3 0 3 27 23 32 32 32 28 32 19 19 12 12 12 11 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 8 11 23 25 39 43 47 48 48 53 53 50 50 50 57 59 59 48 48 48 59 59 59 57 48 48 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 57 59 59 59 59 43 43 43 43 43 59 59 57
48 48 48 39 39 43 59 43 48 48 48 48 50 50 50 57 59 48 48 48 48 48 50 47 47 47 47 47 43 41 36 36 38 41 41 41 59 59 59 47 47 35 35 35 59 47 59 48 59 59
47 47 43 29 28 34 34 28 34 29 31 20 31 31 42 42 43 43 43 43 48 59 59 48 43 43 37 37 30 30 30 43 43 48 48 43 37 37 43 43 36 39 39 39 33 37 28 23 23 28
28 30 39 39 27 23 14 14 12 18 10 11 11 22 27 36 41 20 20 20 32 32 34 34 32 32 35 47 35 36 36 43 40 27 27 12 12 12 27 25 26 30 28 22 22 34 34 39 39 25
25 17 25 25 30 28 35 39 39 24 23 15 21 19 24 16 18 18 16 16 20 23 23 34 34 37 36 36 32 29 29 39 37 37 33 28 23 16 16 11 12 11 25 21 19 25 17 19 9 9
9 10 12 16 31 37 35 32 35 34 34 28 34 22 22 22 33 27 39 40 43 39 40 30 20 17 11 11 11 17 17 31 34 28 30 30 37 37 39 39 36 25 24 16 19 12 12 14 17 28
34 32 30 21 23 15 12 15 10 10 11 14 13 10 13 12 10 10 8 9 8 8 8 13 12 12 10 10 10 12 14 18 16 16 16 17 11 11 12 19 19 21 21 22 22 22 25 24 28 24
14 10 10 10 9 10 10 10 16 19 12 13 10 17 13 8 8 8 12 15 17 8 8 8 10 8 8 11 19 10 11 11 8 8 8 8 6 6 8 10 10 12 12 12 21 19 15 13 8 8
8 8 10 11 8 8 9 9 10 10 10 10 11 10 10 11 11 11 12 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 13 12 10 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6
8 12 11 8 8 8 8 10 13 12 13 11 8 8 8 10 8 9 9 9 9 12 14 14 14 15 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 9 9 11 12
12 15 14 15 15 12 10 11 11 11 9 10 11 15 16 12 9 8 8 8 8 8 15 10 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9
9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 11 11 12 8
8 7 8 10 11 12 8 8 6 7 8 8 10 10 9 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 16 12 12 11 11 11 8 8 8 8 8 8 13 10 9 9 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 7 8 8 16 17 11 6 8 6 7 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 7 10 10 9 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 15 10 10 8 15 12 11 8 8 8 13 10 12 10 10 9 9 9 17 3 0 3 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 9 9 17 11 8 8 8 3 0 3 15 9 11 8 9 10 21 21 31 25 28 29 36 35 36 36 36 36
36 37 37 42 43 53 53 53 57 57 59 59 59 68 35 27 10 10 10 10 11 11 10 10 15 17 23 29 36 39 57 48 48 48 43 43 47 47 50 53 57 59 59 57 57 57 57 57 48 50
33 33 33 33 37 37 27 18 13 11 10 10 17 10 10 10 19 26 30 23 23 23 28 34 41 59 57 57 43 44 43 32 28 28 34 43 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 44 44 36 36
36 44 59 59 57 59 57 48 48 48 48 48 50 57 59 44 44 36 39 34 33 33 33 36 44 48 47 47 47 30 30 18 10 10 10 10 20 20 37 29 34 25 19 17 28 28 23 23 23 34
34 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 68 68 68 54 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 30 30
18 14 14 14 18 24 44 44 59 59 54 59 54 59 59 59 59 68 68 59 59 57 54 48 59 59 59 59 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 41 30 28 15
12 12 11 10 11 14 16 14 9 10 10 16 16 19 24 16 16 12 11 11 23 27 47 46 34 41 24 28 23 23 20 24 18 20 20 23 21 21 12 11 11 12 12 10 8 8 8 8 8 10
17 25 34 47 59 59 59 59 59 59 53 57 57 57 44 39 35 35 35 47 59 43 43 43 48 59 57 57 57 57 48 48 48 48 40 40 30 30 30 41 41 32 32 35 43 43 47 39 43 43
43 59 59 59 59 59 47 39 34 32 25 25 32 32 41 44 47 59 47 47 47 48 48 48 48 47 47 43 43 43 48 43 47 43 37 32 23 23 33 40 40 43 43 43 39 39 35 35 35 30
30 27 23 23 41 37 48 48 48 43 42 35 35 35 43 39 39 39 39 39 40 59 59 48 48 43 43 43 41 41 59 59 59 43 41 32 32 36 37 41 41 41 24 25 14 18 22 28 28 28
34 28 28 28 34 34 31 36 39 39 39 41 30 30 17 24 28 31 31 25 34 34 35 35 28 32 24 30 25 32 32 39 59 39 39 35 25 25 15 15 14 26 26 39 39 32 31 33 28 32
37 40 36 31 41 41 47 59 41 41 41 47 47 59 59 32 32 31 39 34 36 28 35 30 32 26 29 15 11 11 21 25 41 41 41 44 59 41 39 38 31 30 37 25 31 24 23 15 15 18
24 23 44 26 26 20 21 21 26 28 23 17 16 10 11 10 17 17 30 30 28 30 23 25 25 30 32 39 59 46 41 41 43 43 37 37 41 41 41 41 41 41 23 18 9 9 9 10 13 21
26 23 18 18 15 13 21 22 39 59 59 39 36 36 43 43 43 43 43 43 47 32 21 15 15 26 24 23 28 15 11 9 10 10 9 9 10 10 13 17 26 28 28 19 16 14 10 10 10 8
8 8 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 9 9 9 11 11 10 9 9 9 10 10 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 15 15 15 9
9 9 10 9 9 10 12 11 11 10 10 10 9 10 8 8 7 6 8 8 8 6 8 8 8 10 14 8 8 10 10 8 6 6 8 8 6 6 8 15 8 8 10 10 10 11 11 8 8 8
10 10 10 11 16 11 11 12 12 10 11 10 6 8 8 8 9 9 8 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 8 10 8 8 9 9 10 10 10 11 11 11 11 11 11 11 9 8 6 6 6
8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 10 15 17 9 9 10 12 12 12 12 12 10 10 12 10 9 10 10 10 8 8 10 11 10 10 10 10 10 9 10 10 9 9 9 10 8 9 8 8
8 8 8 9 13 10 8 8 6 6 10 10 8 8 3 0 3 10 19 15 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 3 0 3 3
0 3 8 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 10 8 10 10 13 8 8 7 6 8 8 10 10 7
7 8 8 8 10 8 8 8 8 7 9 9 8 15 12 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 11 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8
8 6 6 6 8 7 8 8 6 |
|---|
