BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-168K05.T7 (MSMg01no168_k05.b1) | MSMg01-168K05.TJ (MSMg01no168_k05.g1) |
ACC | AG365752 | AG365753 |
length | 1,011 | 1,145 |
length of high quality (start - end) | 258 (513 - 770) | 372 (71 - 442) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no168_k05.b1 PHD_FILE: MSMg01no168_k05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:38:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no168_k05.g1 PHD_FILE: MSMg01no168_k05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:38:00 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (171,265,861 - 171,266,116) | (171,410,653 - 171,411,024) |
---|
sequence | NGGAACAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCACTTTTTTATTGGAAGACTCTGAGTAAAGTACATTGCCCTTCACACAG
CGGATAATCTCCATCCAGTCAATGGAATGCCTCAAGAGAGCAAAAGGCTG
ATCTTGCCCAACCGTCTTTAGTTTCATTTGCTGCTGGTGTGATAAAATAC
CCTGTCAAAGCAACTTAGTGGGGAAAGAGCTTATTTCAGCTCACAATGCC
ATACTAGTGGAAAAACCACAGCAGAAGGAATGTGAGGCAGCTATTCATCC
AGAGTCAAGAGCAGAGAGTAATGAATTAATTAATACATACAGGGGATGCT
CTTCTTGCTTTTCCACCATTATACAATTTCATTCCCTTCTTAGGGAATGT
TTATTCCCACTGTGGGCAGGTCTTCCAACTTCAACTAAATTAATAAAGAT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCACANAGGANAANATGATTTAAAAAAAAAAAGG
TTGAGANCTTGNCAGATGGTTCTAGATTGTGTCAAGTTGACAATTAGAAC
AAATAAATGAGCATATCAATCAAGTGCAAATACAGCCAACAGATCACAGT
TGATATCAATCTGTGACTTTAGCTTCTGGGTTTTTCTATCTGGTGATAGA
TTGCAGCCTTAAAACCTTCATAATCACACAAACAAATATATTTAAGAAAA
ATATGGTTCTGTTTCTCTGGTGAATTCTAAGTCAAGAAGAGTTTAACACC
CAGATATAAGGAGACATATCATATATATGGGAAGAGCAAGGAGGCTTCAG
TTCATGAAACAGATTGCATGAGACATATAAAAAAGAAAAGAATGAAAGAA
AATTACTGAGGTAACAACTTTATTTTTTTCATGGGTTGATCAAAAGAACA
TCCTGTGGTGGCGACAACCTGGCTTCAGATAATCTTTCTAAATGGATACA
TATATATCTCTCCCCACCATTGTTTCGGACTTGTGTACAGGGATAATTTT
TGTTCCTTCTA
| NTTGTAGACTGGAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTACTGTCATGTTTACACCACTATCTTGG
TGGATGAGGTCTCTGACTGTAATGTGTAATGGCGAGGCAACCCCCCTCCC
TAATTAGATACTAAAAAGAACCAGGCTAAATGTGTTCAATTATTTTACTT
TGTCAAATTGTTTTCCTCAGAACCAGCTGAGAACCTGAAGAACTGGTGCC
AGGACCACTGTGTATAACAAGGATTTAAAACAAGCCCTGAGTTCTTATCA
CCTCTCAGTGCCTAAGATCCCTGACCACCCAAGTCAGAAGAGCACAGCCC
TGTCCAGTCCTACATACCTGGAATTTGGCCAACAAAGCACACTGTTTATT
CCTTCCTTCATCCGAATAAAATTTTTTTTTTGCCGGTTAATGCTTTTTTT
TTCCCCCCCCCCCTCTCTCAAATGTGTGTGCAAAAAAAAAGGAAGGATCC
GAACAGCAGGGTGAACTGGTGGTACATTTTCAAGTGCCAACCGTGAAGAA
GAGGTGTCGTATTATTTACCTTTAGATTGCTCTAGGACAGGAGGAGGCGG
GGCTTGGTAGCGGAGCTCTTGCCTAGTGTGCTCAAAGCCCTGCCTTTGAT
TTTCAGTTCTAACAAAATAAATCCTCTCTAACTTGGTTCCGTTTTAAACT
TTTAACATTTTCAGATGTTCAAATTGCACCTGTCCTTTTGTGTAAGAGAC
TCAAATTCCTTGTTCAAAACAGAAATATTTTTAATTGTACTTACATATGT
AATCCTTTTCTTGTAAACATGCGTTTTATCCGACGCGCTGTGTATCTCTT
TCTTCCTTGTATTTTTTAAAGATGACGTTCAAATATATTTGTTAATTGAA
ATTAGTGTCTATTTTACCTACTCTCGTCTTTCTTAATAATTCACATAATT
TTGTTTTTTTGCATCCTTATTCTTTTCCATTTTTTTTTTATTCTTATTCT
TTTCTTTTCTTTTTGTTACATTGTTTTTTTCCTTGCTCTTTTTTATATTT
TTTTATGCTTTTCTTCTCTTTTTTCTTATTCTATTTTTTTAACTTTTTTA
CTATTTTCTCTCAATTCTTTTTATTATCTTATTTACAATATCTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 7 7 7 7 8 8 8 11 11 9 8 8 12 12 9 9 10 15 20 24 24 24 20 15 15 19 19 36 35 36 36 36 36 31 33 33 33 37 37 39 37 32 28 28 29
37 30 30 33 33 50 59 31 36 35 35 35 36 47 27 23 15 11 11 12 12 20 15 15 11 12 15 24 32 42 48 48 50 53 68 68 68 68 44 35 29 24 24 15 24 24 44 25 25 12
12 12 22 32 48 68 44 44 30 32 32 30 30 35 43 38 47 47 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 42 37 42 44 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 53 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 42 53 42 38 38 36 36 33 33 33 33 33 36 34 21 18 11 11 11 16 23 32 43 47 47 50 50 53 53 57 59 59 59 57
57 53 50 50 50 50 43 57 57 59 59 57 68 68 54 54 42 42 32 41 41 43 43 47 59 59 59 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 44 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 48 48 34 27 21 12 22 11 15 12
11 11 11 10 11 16 19 27 34 41 46 50 48 48 48 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 38 29 17 11 9 9 9
12 14 16 19 19 19 9 9 9 12 13 17 26 37 32 17 15 9 9 9 3 0 3 27 27 3 0 3 3 0 3 11 18 18 22 12 12 14 27 27 37 14 14 14 11 10 8 10 12 12
12 16 18 23 23 3 0 3 27 29 3 0 3 27 27 44 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 68 68 59 59 59 57 57 57 57
59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 43 44 43 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 59 59 59 59 59 57 48 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 42 42 42 42 37 42 46
54 54 57 48 57 57 54 57 57 57 57 46 42 39 39 39 42 43 42 48 59 59 59 59 59 48 43 43 39 39 41 43 44 48 53 53 53 50 50 50 50 47 41 59 41 28 24 26 28 30
33 37 37 37 42 48 48 48 48 48 50 50 50 42 47 44 39 39 37 37 39 30 30 28 33 37 33 34 41 41 41 41 41 41 41 40 36 28 27 25 25 20 24 25 31 25 24 25 20 18
19 25 17 23 32 34 34 48 48 48 48 32 32 30 24 24 19 14 10 8 8 8 8 13 16 16 16 15 20 12 21 21 23 30 32 32 32 39 39 32 37 28 28 28 28 28 29 12 12 12
10 11 9 15 10 15 9 10 15 13 15 28 23 22 16 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 12 15 13 11 13 13 23 21 12 15 15 24 20 17 13 11 11 19 21 24 14 12 8
8 8 19 8 8 6 6 8 8 12 13 10 10 10 15 14 12 19 17 15 9 9 8 17 14 11 18 16 20 14 13 15 9 9 9 9 10 15 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 12 13 12 11 11 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 17 12 12 8 8 6 6 8 10 10 10 10 10 11 10 13 12 10 8 6 6 13 10 10 9 6 8 6 6 8 8
9 10 8 8 6 7 8 8 8 6 6 6 7 10 10 6 6 8 8 8 11 13 13 10 9 9 9 10 10 11 11 12 11 6 10 6 6 10 8 11 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10
9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 18 9 8 8 8 8 12 15 28 27 25 25 22 24 24 30 27 29 22 23 33 36 35 36 43 43 43 50 57
48 53 53 53 57 53 57 68 68 68 68 68 44 43 32 32 39 39 48 57 54 54 50 48 50 50 43 50 43 46 47 50 51 51 51 68 68 32 34 12 12 14 14 15 32 32 36 32 24 19
32 32 57 44 44 42 43 37 37 42 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 36 28 15 13 13 16 38 38 52 52 59 59 59 59 68 59 59 57 59 59 57 50 50 50 50 50 50
50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68 68 57 57 57
57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 43 43 43 59 43 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 44 44 42 44 46 42 42 35 35 37 42 47 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 54 54 54 48 57 57 57 54 59 59 59 57 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 53 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 48 48 47 59 39 22 22 11 12 10 12 10 10 10 23
23 41 47 47 47 59 48 59 48 59 59 57 57 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 37 34 28 25 25 34 25 23 15 9 9 9 10 9 11 12 14
14 8 9 9 11 13 16 23 23 14 12 10 9 9 9 27 27 41 47 41 28 28 24 22 20 18 17 15 10 10 10 10 11 13 15 18 17 16 18 14 12 12 11 11 12 23 20 30 37 37
47 59 59 50 50 50 57 57 57 59 57 48 36 43 39 39 39 39 39 43 39 35 35 35 39 39 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 48 59 48 48 47 37 41 30 24 32 24 24 32 39
39 48 57 59 59 59 57 48 47 47 48 48 44 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 44 43 43 57 59 44 44 33 43 43 44 44 57 57 57 57 44 52 52 52 52 52 52 43 38 32 20
20 19 32 38 38 19 19 19 14 14 20 20 22 16 16 16 19 32 32 47 43 43 42 37 36 36 32 32 18 15 20 32 32 42 43 42 42 42 43 37 37 28 28 37 40 48 48 48 47 54
54 41 41 30 30 30 26 37 39 42 43 39 30 30 37 33 39 33 36 32 26 31 28 23 23 32 23 23 16 24 18 28 21 31 24 30 21 28 19 24 24 30 30 29 27 18 18 15 20 13
15 16 20 15 22 28 30 37 29 27 15 13 10 17 13 15 8 8 8 10 13 15 23 32 30 28 25 25 23 30 25 11 11 9 9 13 22 22 15 7 7 8 10 11 10 10 10 10 15 26
30 23 23 20 19 18 18 19 19 11 15 8 8 8 8 10 10 12 16 16 10 10 10 10 10 21 13 13 8 8 8 8 12 14 28 34 34 30 21 20 19 16 12 8 8 8 10 10 8 8
8 8 7 7 8 15 13 21 18 20 15 15 12 12 9 9 10 10 10 10 19 14 30 30 18 15 12 14 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 7 7 8 6 11 11 13
11 8 8 8 8 13 11 16 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 12 17 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11 12
13 13 17 11 9 9 11 11 8 8 8 8 15 13 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 13 11 8 8 6 6 8 8 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 12 14 8 10 13 10 8 8 8 9 10 10 10 11 11 9 9 10 10 10 10 10 6 6 8 6 6 8 8 11 12 16 20 10 10 9 7 10 6 6 8 8 9 10 10 10 10
13 15 10 10 15 12 14 8 8 8 10 12 13 10 8 8 8 10 9 7 12 8 10 11 11 9 13 20 24 22 19 19 13 9 8 8 8 6 6 8 10 14 10 8 8 8 8 8 10 10
10 8 8 6 6 8 8 8 8 15 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 6 8 8 8 12 6 6 10 6 8 8 8 11 6 6 6 6 8 8 13 13 10 14
9 9 9 9 16 15 9 11 9 10 10 12 11 11 10 9 9 9 9 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 6 8 8 8 8 12 8 |