| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-176A11.T7 (MSMg01no176_a11.b1) | MSMg01-176A11.TJ (MSMg01no176_a11.g1) |
|---|
| ACC | AG370848 | AG370849 |
|---|
| length | 1,204 | 1,169 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 570 (119 - 688) | 338 (123 - 460) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_a11.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_a11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:16 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_a11.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_a11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:16 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (88,968,633 - 88,969,191) | (88,820,519 - 88,820,856) |
|---|
| sequence | GCATCTTTNNNGGCATTGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCG
GAATTAAGCAGGTCAGGAAACCGATTAAGACGCCGAGGCCATGGAGGGAT
GTTACTTGCTGCCTTGCTTCCCCTGGCTTTCTCAGCCTGCTTTCTTATAG
AACCCAGGACTACCAGCCCAGGGATGGCACCACCCACAGTGGGCTGGGCC
CTCCCCTTGATCACTAATTGAGACAAAACCTTACAGCTGAATCTCATGGA
GGCATTTCCTCAAGGGAGGCTCCCTTCTCTGTGAAAACTCCAGCTGGTGT
CAAGTTGACACACAAAACCAGCCAGTACAACGTTCTTCTGTGTGACCGGG
GCTTTTAATACTTTGGCTTTAGTATGTTACCTGCTCTACCTCTGCAGCCA
GTTCTTGGGTGGGGCCTTAGGCAAGAACTGAGCTGTGTGTGGTTACGTTA
TTTGACCCTTGCAAACTTGAAGCTCACTCCAGGAGGTGGAACCTGGAAGC
CATGAAGCATCCTGTACTCCGTACAGGGCTTCTCATGTCTGAATTTTCCA
ATGCGCTTCCAATGCCTGCACCTCTCCCTCACCTGGTCTCTGTCTCTCAC
TCTGCCCCAACCCGAACATTCAGTCTTTCTTTCAGCAAAGCACTGCAGGC
GTTATGCTGTGTCATAGTTCATTTTATTATTGCCAAATCCCCCAGGAGAA
TGACGGAAGCATACTTTGCTTGGACATTAATGTGCAAGCCGGCCCCAGAG
GCACATGTGTGTAATTATAGCACCTGGGAGGTTGTGGCAGGAGGATCATG
AGTTTGATGCCACTGGTGTGACCTGAGGACTGTCCAAGAGCCTTGGCTAC
ATCAACCTCTCCAGGTTCTGTTGTGTGTGCTGTGTACACTGAAGGCAATA
GATGCCAGCCCACTCTTGTTCATCCTTGCCCTATGGGGACACCATGTGCC
TTTGTGGCCCTCAGGAACAGTCTGGAACTTGTGACTGATGTTTTGATTTG
ACAATTCTCTGGGTTTCCATAATCCGTTGTAAAATCTCCCGTGCTTGTAT
TTTCCTTGGCCCGTCCCTTTATTTCTCTTTTCTTTTTACACTCTGTCTTA
TCACCTTACTCTCCTTGTTTTATATCCCTTCTGGTTAGTGTTTATAATTT
TTCCTTTTTATTTTTTTCTTCCCATTTTCGTTACTCTCTTATACTTCTAC
TCTT
| TTTTTTGAGACGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTAAGGAGCAAGGTTTTGTTGAGCACAT
TCTCTGCATCCCTTCCAAGGCTCCCCTGACTGGCTCTGGCTTCCTGGCTC
CACAGTAGCAGAGAAGCTTGTCATGTGGCATTAGCAGAGCCACGAGGAGT
TCAGTGGGTGAGTGAGTAAAAGAATGGAACAGGGAAAAGTCATTTCAGGT
GCTTCTGAGTCCCATTTCATCTTTGTCTTATAAAAAATCAAAGAGCTTAA
GAACCACATTCATTTTCAAATACTTGCCAGCTCTTGAGGCTTCTTTTTGT
GGAGTCAGAGTTAAAAATTCCTGGCTAGGTAAAAGAGACTTTCCAAGAAT
GTCATGCCATTTCTCTCTGCCCATAGTATGTCCTCACGAGTGCCACTTCA
TTACTGACTGACCCGTCGAAGAACAGGACTGGTGACCTTAGACTTTTATC
ATTTTTTAAAACAATCTGGAATTTGACTCAGCATCAGCTGTGTCAGTAGA
ACTGAGAGAGAGAATTGGTATTAAGGTTTTGGCAACTGCCATTTTTAAAA
GTGGTTGTTGCACCCCTTCCTAACCTAGGAAGGTCAGGGTAAACTTTGAG
TGGTCATTCCAGCTAATGAGGCTCTTAATAGACACTGCAGCACTCACCTG
GTGGGTCTCTGTGGCAGTGTTCTCAGGTTACGGCACCTTGTATAAGTACT
CTCTTTGTCCCTTTCTTCTGATATGTTTTAAATCAAATTTTTTGCCTTCC
CCTTTATTCTTGACCCCATTTTATCTTACAAGCTTGTTCTACGTTAAAAT
TTTATTCCCTTATTCTAATGACAGCTTATTTCTCTAAAATTTTTCTTCTC
CAATCCTCCTTTTGTCTCCTTTTTAGCTCCTTTTTTTATCTATATCCTTT
TCCTTCCCTTTCTTCTCTTGTTCTCTTTTCTCCTCTTCTATTTTCCTCTT
CCTTTCCTTTCCTTTTTTTATTTCTCTCCTTCATATTCTTTTTTCTTTAC
CTCCTTTCTTTTCTACTCTCCTTTTCCTCCCCATATCACTTTTTCAATCT
CTCTCTCTCTTTTTTCTTTCTTTTTCATCTCTTCCTATCTCTTTATCATA
ACATATCATCCTCTCTTTC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 11 11 10 3 0 0 0 3 6 6 7 7 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 19 19 10 8 8 8 8 8 19 22 36 32 32 32 33 33 33 37 37 37 41 37 37
37 21 19 11 10 10 21 21 41 39 44 33 33 33 31 31 27 34 16 12 9 7 7 7 7 8 8 17 16 12 12 12 11 11 11 15 25 29 41 37 37 31 31 31 35 35 35 38 53 53
36 36 31 31 31 31 28 24 21 10 10 12 10 10 10 10 10 15 19 23 30 30 23 19 10 15 23 29 36 37 43 43 43 53 53 53 57 57 57 57 53 53 68 68 68 51 51 68 68 68
50 59 59 57 57 54 57 57 43 50 50 50 50 50 57 57 54 54 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 57 57 48 48 48 57 57 43 47 47 48 48 48 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 54 59 59 59 52 43 43 35 35 37
44 44 68 57 57 54 57 57 57 48 48 50 59 57 57 57 50 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 44 43 47 57 59 59 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59
48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 54 59 59 59 68 59 59 57 57 57 43 40 28 30 30 43 43 57 59 59 50 53 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 59 34 26 19
11 8 8 6 6 8 8 11 14 31 41 59 59 59 59 48 59 59 48 47 59 43 43 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 57 57 54 54 54 54 48 34 25 11 11 15 25 28 37 41 43
43 47 59 59 37 37 37 39 44 44 57 40 40 40 43 32 34 27 24 18 41 34 57 57 57 57 57 57 46 44 43 44 44 48 48 44 59 43 43 43 50 50 50 57 43 43 37 43 43 43
52 52 52 57 52 52 52 52 57 52 57 57 59 59 52 52 52 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 42
43 57 57 52 52 52 57 57 57 52 57 52 57 52 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 57 52 54 59 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59
59 59 57 50 48 48 50 50 28 28 23 23 28 37 44 57 57 57 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 44 32 24 18 18 24 24 37 36 36 30 35 37 40 25 23 23 36 37 43
47 48 46 48 48 48 43 43 43 48 43 43 43 40 37 28 25 25 33 33 43 43 37 39 30 28 28 33 33 36 30 21 21 21 19 15 10 11 11 11 11 14 13 20 15 24 24 21 11 14
18 28 25 34 28 15 13 13 15 19 19 22 11 10 10 22 23 28 27 28 34 25 28 33 30 30 28 27 20 20 28 30 24 19 19 16 17 19 22 26 15 15 14 14 24 21 30 33 37 32
31 10 10 8 8 8 14 15 18 18 26 30 39 43 43 48 43 34 28 16 12 10 10 11 17 11 10 10 15 19 24 28 33 26 21 15 12 12 11 18 19 19 19 13 13 21 16 21 24 29
14 13 11 10 13 13 12 11 11 16 9 9 9 8 8 8 12 8 8 6 6 6 8 15 17 22 22 22 22 25 23 22 22 12 12 12 12 12 15 21 19 22 28 24 17 12 12 11 13 10
10 10 12 12 24 10 12 13 23 19 16 16 14 12 12 15 16 18 24 22 15 10 6 6 6 10 8 9 10 10 10 10 16 10 10 9 9 9 8 13 13 13 10 10 10 13 10 10 10 9
8 8 8 8 8 8 8 9 13 9 12 11 12 12 21 12 17 16 10 10 8 8 6 6 6 8 10 11 11 11 13 13 10 10 9 9 10 9 9 9 8 10 12 8 8 8 8 10 8 9
11 9 9 10 10 8 7 9 9 10 10 8 9 8 8 8 10 10 10 8 10 10 10 10 15 10 9 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 11 11
11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 9 10 10 9 10 10 9 9 9 12 15 9 9 11 10 8 8 8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 13 10 10
13 21 14 12 9 9 9 10 8 8 10 8 8 10 10 9 9 12 15 10 10 9 9 12 9 10 8 8 8 8 8 10 11 12 12 12 11 10 9 9 9 9 9 9 10 9 8 8 8 6
6 8 8 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 12 12 12 12 10 10 10 11 12 12 12 8 8 8 7 8 8 8 8 10 10 8 8 11 10 11 11 11 11 8
8 10 8 7 6 8 8 11 11 8 8 8 10 10 11 11 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 10 8 8 6 8 8 8 6 7 10 10 8 8 11 9 8 8 10 15 15 13 8 8 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 6 6 6 6 6 9 6 6 6 7 7 6 8 8 8 8 6 8 8 18 18 18 8 8 8 6 8 8 12 19 15 15 10 10 10 22 19 29 22 24 33 36 35 35 35 37 37
37 37 36 36 42 38 50 53 53 50 50 50 50 42 41 27 23 11 12 6 6 6 6 7 8 12 11 12 12 12 12 12 12 20 23 30 41 39 44 44 47 47 57 59 57 57 53 53 53 53
50 50 39 37 37 27 21 9 9 9 9 9 12 11 9 8 8 8 8 8 8 11 17 21 28 33 33 33 33 37 37 37 37 39 47 47 47 47 50 43 43 47 43 43 43 57 47 47 47 47
43 68 54 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 44 44 35 35 35 47 47 59 59 59 48 48 48 57 48 54 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 43 43 43 50 57 59 59 57 57 54 57 54 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 57 57 59 57 43 43 38 43 43 57 57 59 52 52 52 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 54 44 44 52 52 43 44 44 57
57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 47 47 43 43 43 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59
54 47 42 42 37 37 37 39 43 46 57 57 59 59 59 59 59 46 54 57 59 59 54 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 53 59 59 59 46 41 34 18 19 11
12 12 11 11 11 12 12 24 30 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 48 48 57 59 48 54 54 48 48 48 48 48 47 47 43 43 39 39 30 28
23 28 21 28 25 28 23 28 13 11 10 10 9 9 11 11 12 18 19 32 32 36 59 47 48 37 39 37 39 37 32 30 30 30 37 39 43 30 30 22 23 23 34 34 47 43 48 47 59 46
43 34 30 22 20 20 29 34 41 41 59 59 41 41 32 39 39 47 39 42 47 47 47 47 48 57 43 34 29 18 18 24 34 40 43 43 43 43 42 42 43 42 42 36 37 30 24 16 16 19
30 36 36 36 23 25 23 32 28 35 35 26 25 29 24 23 13 14 14 20 32 25 33 33 42 42 46 46 42 37 35 35 42 42 44 47 43 50 44 43 43 44 44 57 57 44 36 23 23 23
28 28 33 27 28 28 27 28 36 37 33 33 33 42 44 46 43 42 42 28 22 12 9 9 9 10 18 18 22 18 15 12 10 9 9 9 18 15 15 15 18 18 20 23 37 36 32 31 16 16
11 10 10 10 10 12 18 23 29 21 25 28 32 32 23 23 19 24 19 14 14 14 16 15 15 10 9 9 9 9 10 11 18 13 17 28 19 15 12 11 11 19 22 24 16 13 13 19 25 10
10 8 8 8 8 9 10 15 15 28 16 23 11 11 8 10 6 6 8 8 9 19 22 15 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 10 12 9 9 9 13 10 12
12 22 20 17 12 13 8 8 8 10 10 18 31 32 28 19 19 12 11 8 8 10 10 10 19 23 16 13 14 12 11 10 8 6 6 8 8 11 10 9 9 8 10 6 6 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 16 10 10 8 9 9 9 11 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 10 10 8 8 10 9 9 9 11 11 10 10 8
8 8 8 8 9 11 10 8 15 10 8 8 11 12 12 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 11 16 17 8 10 6 6 8 8 9 12 12 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 12
10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 14 20 11 8 8 10 10 10 9 9 9 9 10 10 9 7 10 8 11 8 8 6 6 6 7 6 6 8 8 12 11 11 9 8 8
6 6 10 8 9 9 10 19 13 12 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 13 13 13 11 11 8 8 6 6 10 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 12 12 8 8 8 6
6 8 8 8 6 7 10 8 10 9 10 10 10 14 12 21 12 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 13 10 10 10 8 10 8 8
10 6 6 8 8 8 8 10 11 10 8 8 6 6 6 6 8 9 11 9 9 10 11 13 8 8 7 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 8 6 6 6 8 6 11 8
8 6 6 8 8 8 8 10 8 9 9 10 11 11 9 9 8 8 6 6 8 10 12 10 6 6 6 8 6 6 8 8 11 8 8 8 6 8 7 7 7 7 8 8 8 10 8 6 6 8
6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 |
|---|
