Query= MSMg01no196_k07.b1 MSMg01no196_k07.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no196_k07.b1 PHD_FILE: MSMg01no196_k07.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 20:16:16 2005
(512 letters)
>mm_chr1_68961079_68961990
Length = 912
Score = 965 bits (499), Expect = 0.0
Identities = 508/513 (99%), Gaps = 4/513 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 4 ggaattcctattcagatctggaatcagtggtaacacatatatacatgaatacaaacatat 63
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Sbjct: 897 ggaattcctattcagatctggaatcagtggtaacacatatatacatgaatacaaacatat 838
Query: 64 ataaatgcatacatatatacatacacacacacatatatacatacacacacacacatacac 123
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Sbjct: 837 ataaatgcatacatatatacatacacacacacatatatacatacacacacacacatacac 778
Query: 124 acacacatatatatatac----atatatatatatatatatatatatatatatatatatat 179
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Sbjct: 777 acacacatatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 718
Query: 180 atatacagatttgtgcaataaatatattgctcttaactttgaaactgaatgaaccctgct 239
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Sbjct: 717 atatacagatttgtgcaataaatatattgctcttaactttgaaactgaatgaaccctgct 658
Query: 240 aatacagctcattgatgctttacagaaaatggtatggctagagtaatggctaacaggacc 299
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Sbjct: 657 aatacagctcattgatgctttacagaaaatggtatggctagagtaatggctaacaggacc 598
Query: 300 tgagagaggcattctaacccattgcttgtctaccttgaaactcagccttaggaaagaagc 359
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Sbjct: 597 tgagagaggcattctaacccattgcttgtttaccttgaaactcagccttaggaaagaagc 538
Query: 360 cagaagcataacacttaagctcacatttatatgcaacatatgagctcctgtcttcttaag 419
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Sbjct: 537 cagaagcataacacttaagctcacatttatatgcaacatatgagctcctgtcttcttaag 478
Query: 420 cataaactgagaatgttggatggcatgtacttatatgctttaaatataaaaaagtcacag 479
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Sbjct: 477 cataaactgagaatgttggatggcatgtacttatatgctttaaatataaaaaagtcacag 418
Query: 480 cttcctataacaatacataatttatacagagtt 512
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Sbjct: 417 cttcctataacaatacataatttatacagagtt 385
Score = 91.6 bits (47), Expect = 1e-22
Identities = 53/55 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 130 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 184
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Sbjct: 714 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatata 768
Score = 91.6 bits (47), Expect = 1e-22
Identities = 53/55 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 130 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 184
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Sbjct: 716 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatata 770
Score = 89.7 bits (46), Expect = 5e-22
Identities = 52/54 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 131 tatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 184
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Sbjct: 713 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatata 766
Score = 89.7 bits (46), Expect = 5e-22
Identities = 52/54 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 130 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 183
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Sbjct: 718 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatat 771
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 115
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Number of successful extensions: 35
Number of sequences better than 10.0: 1
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Effective length of query: 502
Effective length of database: 902
Effective search space: 452804
Effective search space used: 452804
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
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