BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-198E15.T7 (MSMg01no198_e15.b1) | MSMg01-198E15.TJ (MSMg01no198_e15.g1) |
ACC | AG385684 | AG385685 |
length | 872 | 742 |
length of high quality (start - end) | 255 (96 - 350) | 289 (77 - 365) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no198_e15.b1 PHD_FILE: MSMg01no198_e15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:18:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no198_e15.g1 PHD_FILE: MSMg01no198_e15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:18:28 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (80,578,483 - 80,578,733) | (80,490,875 - 80,491,163) |
---|
sequence | TTTTTTTTTTTTCACNTNNCNNCTCTCAATNCTCATGAATAGTAATTATT
CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCACAGGTGTGCCTACTGCAATCAAACTTTCCCCATACATATCATCT
GCAGGATCATAGGGGCCCAAAGCCACACCAGGATCACCTCGCAGATTCTT
GTACTCTGTCTCATTTAAACTTATAAATGATTAACAGACTGTTTAATTTT
CTTTAAAGTCAATCAGGACTACCACTAAAATAAATGTTCGTTCTCATATC
TGTACATCTAAAGATACTCAGTGCAGAGATATCTAAGATTCTCATGCTGT
CAATGGCCCAGCAAGTGGTGGTCCACCTCTGCTTGCATCCTTCCAGTGAC
AAGACTCCTATTATTTTTTTCACCCACCCCCCCGCCTCTGCCTTTCTATA
GTTTTATTATTTGATACCTTATTTTTATAAGAATAATTATTGCTGCCTTA
TGAATTTCTATGTAAATGCGCTACCATTGTAATACAACCTCAGTCCATTG
CAAGATGTTTTATTATTATAAATTATTACTTAATATATTCTCCGTTCCGA
CTGGCTCCCTCAAGCTTTTTGATACCCTGTTTTTCATGCTTGCTTTTATT
ACCCCCATTGCTAGAACATTATTATCCCTCTGATCCTATGCTATGTTCTT
AATTATACATCGTTCTTATACTCCTCCCTCTACACTTTTTTTTTACATCC
TCGTTTTATCAATTACTCCCTTACATCCACAATTATGTTATGTTTTTGCG
TGCTACCACCTATTCCTTACTCGCTCTCATAGTTTAATATTCTGTAACTT
ATAATTTATATGTTCTTCTACT
| ACGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTTATGCATGAACTCAGCAAGCT
TTGCAGAAACTTGTACCCATGCCTGGATCTCTCCTTGCCTCTGGAACCCA
AAGGCAAACACTGAAGTCTCAGCCTCCAAGGACTTGCATGCTTGGGTTCA
ATTAATTTTCTGTCTTCCACAGATTTCTCTTTTCATTACCTTATGCTTTG
CGACATCAGGAGAAGGTGACAGTCCCCCCACTCCGCCCCCCTCCCCCGTT
TTGGCAGCAAGAAATCTTTCACGTCTGATTTCAGTTACTAATGTCACGAT
GCCATAGTGTAGAAAATGTTTGGCACCGCCCCCCCCAAGAAAATCTTGCT
TGTTAATTTAAGCCAAACAGTTTAGGCTTCAGAGAACACATCATATCCTG
GAGAAAACAGACATCCCAGGCATCCGTGAAATCTGTTAGGAGATGGAACT
GGTTAAAACGATGCAAGGCTTCCACCTGTAACAACCTTGCATTACTCAAG
GATACTTGTGAGAAAGAGTGGGAGTGTTGTCTGTCACTCCAGACAAGAGC
TATTTCTAAGACCTGCAGAGGAGAGCCCTGAATTGCACTTAGTCAAAAGT
ACTCTTTTTTTTTTTTTTTAACTATTCGCTGAAAGGACTAAAAGGAGATG
CACATTTTGGCCAGAGTGGGAAAAAAAATCATTAATAACTAT
|
quality values | Open.Hide.29 32 37 37 26 23 14 14 14 21 21 21 19 8 3 0 3 0 0 3 0 0 3 17 9 9 9 9 10 3 0 3 10 10 8 11 10 10 10 8 9 9 8 8 7 6 6 6 6 8
8 8 10 12 12 12 12 12 28 28 39 39 27 22 22 25 27 19 17 22 27 19 20 20 28 28 28 33 33 36 47 59 59 46 37 25 28 28 25 23 22 17 8 8 8 17 23 27 28 20
28 28 24 32 30 33 33 42 47 42 48 48 48 48 48 59 48 48 57 36 36 32 30 30 30 33 39 42 41 48 48 48 57 54 47 54 54 54 48 50 50 48 47 47 57 47 47 47 57 57
47 43 41 41 35 36 36 36 30 37 30 30 35 42 42 43 43 43 43 43 44 34 37 20 20 20 32 41 44 37 25 25 23 35 20 30 32 43 44 43 33 33 27 28 28 43 43 57 57 52
43 43 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 43 43 38 35 43 43 57 57 57 57 57 43 43 39 43 39 39 33 33 33 43 39 33 33 39 42 33 43 43 57 52 52 57 52 57 57
59 57 57 44 44 35 35 29 43 43 52 52 43 43 33 33 23 33 33 39 42 35 33 33 38 34 33 33 33 35 44 43 43 37 37 37 32 43 43 43 43 43 50 37 38 38 46 50 52 57
52 52 43 43 27 27 33 44 43 52 52 52 43 43 37 37 43 43 38 24 20 20 20 32 32 15 15 15 32 32 43 37 33 33 36 28 28 23 28 28 42 42 43 44 44 57 32 27 11 11
10 23 18 22 22 15 15 14 22 12 12 12 12 24 26 24 13 12 9 9 10 17 18 18 19 23 32 41 41 41 35 35 32 30 24 19 19 19 24 29 37 33 33 23 28 28 28 19 18 11
11 11 19 18 23 23 23 19 10 10 10 8 8 8 18 15 10 10 11 16 11 10 8 9 7 9 9 13 12 14 16 11 13 10 11 17 19 23 31 20 25 25 29 25 25 25 25 34 28 30
17 15 15 23 25 28 30 33 37 37 37 28 26 13 12 12 12 12 12 15 21 24 22 17 12 12 10 11 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 19 28 28 25 28 28 23 23 12
14 12 18 19 27 29 20 15 15 11 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 10 15 12 10 10 14 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 14 13 10 16 11 10 8 8 8 10 8
6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 13 10 17 12 11 11 15 10 10 10 13 13 11 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 7
6 8 6 10 12 12 12 12 12 12 9 9 9 9 9 10 10 9 12 10 10 9 7 8 8 8 8 11 11 15 11 11 11 11 11 9 10 10 8 8 7 6 8 10 10 10 9 9 9 9
10 10 12 12 11 9 15 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 8 11 12 11 12 12 11 10 9
9 10 8 8 6 6 8 6 11 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 11 11 11 8 8 6 7 8 10 15 19 24 23 24 19 19 16 8 8 8 7 7 10
13 9 9 9 13 10 13 8 6 6 6 8 10 9 10 10 10 10 11 11 11 11 8 8 8 10 8 8 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 9 8 8 8 9 8 8
8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 18 18 13 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 10 10 15 12 9 9 9 10 11 11 11 11 17 17
10 9 9 9 9 8 9 9 8 13 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 6 8 8 8 6 8 8 9 9 9 15 19 37 37 47 42 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 53 53 48 48 48 48 43 43 39 33 28 34 36 42 42 43 39 35 35 42 42
48 50 50 51 51 57 57 48 48 48 48 33 48 36 36 41 41 44 57 57 41 50 50 50 50 50 59 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 38 21 16 15 24 24 43 44 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 57 68 57 57 57 57 68 68 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59
59 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 48 43 39 42 39 43 47 44 43 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 48
48 57 59 59 59 59 48 48 30 41 15 15 11 12 11 11 12 12 9 9 9 9 10 13 9 9 9 9 9 9 11 15 15 11 15 12 12 12 13 24 34 39 50 50 50 48 59 48 57 57
59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 46 46 59 30 30 23 23 11 10 10 8 8 8 8 15 24 28 43 47 47 48 48 48 48 47 47 43
39 41 43 47 57 48 48 48 42 42 42 48 48 53 59 68 68 59 59 59 59 57 48 57 57 48 48 54 54 54 54 57 57 57 54 47 59 35 35 35 42 42 48 57 44 43 43 44 44 44
43 43 43 59 59 57 57 48 48 48 48 59 59 57 43 43 43 46 57 57 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 54 57 57 68 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 48 47 46 57 57 39
43 36 36 36 39 37 48 59 39 39 35 35 35 59 39 41 41 41 37 34 34 41 41 41 41 46 46 46 48 48 59 59 57 48 48 48 48 46 43 40 41 41 37 34 29 22 25 25 28 31
28 34 39 37 37 39 34 37 22 17 12 22 22 34 25 30 30 18 18 28 28 34 30 30 30 28 24 30 33 22 17 17 19 27 29 33 37 37 37 37 28 28 32 28 32 39 36 31 22 18
19 19 19 30 37 37 40 41 59 59 44 44 44 37 37 39 37 36 30 24 23 30 23 23 21 28 23 32 23 28 28 31 31 37 30 28 28 28 28 25 30 37 39 32 31 28 28 16 21 12
12 12 26 26 32 24 20 15 15 12 14 23 22 20 20 24 15 15 10 12 12 19 27 37 43 21 12 10 9 8 8 8 10 9 11 19 13 9 9 12 9 9 |