BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-211A22.T7 (MSMg01no211_a22.b1) | MSMg01-211A22.TJ (MSMg01no211_a22.g1) |
ACC | AG392940 | AG392941 |
length | 1,183 | 1,213 |
length of high quality (start - end) | 415 (30 - 444) | 377 (72 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_a22.b1 PHD_FILE: MSMg01no211_a22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:35:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no211_a22.g1 PHD_FILE: MSMg01no211_a22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:35:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCGGCTATGGGCCTATCGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TCTGTTTAGCTCTGTACCCATCTTTTGAGTAGGTTATTTGTTTTGTTGAT
ATCTAATGTCTTGAACTCTTTATATATTTTGGAGATTAGTCCTATGTTGG
ATATAGGGTTAGTGATGATCTTTTCCTATTCTGTAGGCTTCTGTTTTGTC
CTATTGATGGTGTCCTTAGCCTTGCAGAAGATTTTTTGTTTCATGAGGTT
CGATGAGTTCAGTGAGTTCAAGGCAGTTCCCCACTTCCTCTTCTATGGGA
TTTAGTGTGTCTGGTTTTATATTGAGATCTTTGATCCACTTGGATTTGAG
TTTTGTGTAGGGTGAAAGCTATGGGTCTATTTACATTCTTCTACTTGAAG
ACATCCAGCTAGACCAGCACTGTTTTGTTGAAGATGGTTTTTCTTTTATT
GTCCGCCCCCGGCTTCTTTGTCAAATATCATGACAATAGGGGTGTGAGAT
TATTTCTAGGTCTTTGATTTCATTCCATTAATTTATCTGTCTGTTTTTAT
GCCAATACCATGCAGTTTTATTACTATTGCTCTATAGTATAGCTTGCACT
CAGGGATAGTGAATCCTCCTGAAGATTATTTTAGCTATCCTGGTGTCTTA
GTTAGGGTTTTACTGCTGTGAACAGACACCATGACCAAGGCAAGTCTTAT
AAAAAACAACATTTAATTGGGGCTGGCTTACAGGTTCAAAGGTTCAGTCC
ATTATCATCAAGGTGGGAGCATGGCAGTATCCAGGCAGGCATGACACAGG
AGGAGCTGAGAGTTCTATGTCTTCATCCAAAGGCTGCTAGTAGAAGACTG
ACTTCCAGGCAACTAGGGTGAGGATCTTATACCCCCACCCCCCGTGACAC
ACCCATTCCAACCAGGTCACACTATTTCCACAGGGCCACCCCTTCAGATG
GGGCCCTCCCTGGCCCAGGGATTACAAACCATCCCAATCCACTCCCTGGC
CCCCCTAGACTTGTTAAAAAACTTGAGTCTTTGGGTGTCCTTACCTTAAC
CTAGCATTATTGCCAAATGGCCTTTAATCCCACTTTTTCAGGCCCTCATA
ATCCTAATCCAATCTCCAATAGGTTTTAAATTCCAAAGTTCCAAGGCTCC
TTTTGAAAAACCCTCCCCCTTGGATTAAAGGGA
| NNCCACGTGTGGCGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGTTAAACTTGGCTCCTGGGATTCTGT
CTCTGCTTTTTCCAGAGAAGTGAGAGTAACATGCAGGAATGAAGCGAGGA
TCCAAGTTTATAAGAATCACAGTAAAATCATCTATGCCACTAAGGAACCT
ACTGTGTGTGAAACAAGTAGGCAGAGGGAAGGAATCTATGCCTGGATGTT
TAAGTAAACACACAAAGAGAGGACATGCATGCTCACATACGTGTGTACAT
ACACACACATGTTCACCACCTACAGTGATATCTCACACAAAGCCTCATCA
CATACCCCACCACATCATATACAAACCTAACCTACACAGTGACTTTGTAT
TTGCACAAAGAACACATCTAGTCACACACACAGCCTTGACACACACAAAT
TTTTTTTCTACCCCCCCCCCACAGTAATGTCTCTCCCAAAAAAAAGAGGG
GGGGNNTTGCNCATANTCATGTCCCGCACAGAGAATATGCCTAATCACTG
TCACATCATACTAACATTAACTCTTGTCTCTGCCCGCACCATGTCCAGCT
GTGCAGGAAGCATCTGTCCACATGGAGCCTCCAATCCCTGGAACCCCTTT
ATCTGTGCTCTCACCCACTTTTTTTAAAAATTGAGACAGGGTTTCTCTGT
ATAGCTTTGGCTGTCCTGGAACTCGCTTTGTAGACCAGGCTGGCTCTCAT
CCACTTTTACCACCAACATCAGGCCAGGAGCCTGCGGCCAGATGGAAACA
GAGTTGCACTCCTTGCTTTCGGGCTCGGTTTCTCCATTGGGATATTAAAG
TCGGACCCAAAAAGAAGGGTATGATGCTACCGGTTTAATGTCACACTCCT
TTTTATAGGAATAAAAGGGAATTGCCCCTTGACCTTTTTTACTACTCCCT
ACCCGGTCAGCAACCCCCCCTTGGAATTGTTTTACCTTAGGGCATTTTAT
CAGGGCAAATTTTAATTGGTTTTCCCCTAAACTCCCATTTTTTAACCTAA
TCTTAATCGCAAACATTATTCCCTTAATTCCTCACCGCCCCCTTTTTTTA
TCTGTCATAATCCCCCGCCTTAACTACCCCTCTTGCCCTCTTTCCTTTCC
CCTCGTTACTAACACTTTCTCTCCCTTTTCTTACATGTGTTCTTCTCCAA
TATATCTTCTTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 7 9 12 8 10 10 8 8 12 11 9 10 11 19 19 10 8 8 8 8 8 19 21 37 37 40 40 40 40 48 48 48 48 48 57 54 47 48 48 68 68 48
57 48 48 47 42 42 42 41 41 48 48 41 50 41 41 41 41 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 57 47 47 47 57 59 59 59 59 57 57 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 44 44 19 18 13 13 18 23 24 36 32
48 54 54 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 53 50 50 50 59 59 33 33 24 20 18 9 10 9 9 9 13
9 8 8 6 6 8 8 12 12 13 11 12 22 31 43 59 59 59 59 41 31 13 12 12 12 18 24 30 22 21 8 10 8 8 8 10 12 12 21 12 18 13 14 14 28 28 43 43 50 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 59 57 59 59 68 68 68 68 68
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59
54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 44 43 44 44 57 57 57 50 47 54 54 54 54 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68
68 68 57 48 40 40 31 32 32 42 42 48 59 57 50 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 47 47 39 39 39 39 31 36 35 37 37 37 37 37 32 32 28 28 13 13 13 28
30 37 41 43 44 47 47 47 37 37 33 32 30 28 31 31 32 41 41 39 44 43 41 41 44 43 43 39 40 39 47 39 36 36 35 28 30 28 35 33 39 37 39 39 35 30 35 37 29 26
22 18 18 21 28 28 22 24 12 11 11 17 15 15 17 18 20 22 25 25 32 23 32 18 18 15 25 12 14 10 16 15 10 10 11 25 19 23 12 10 11 11 12 12 13 16 17 23 26 37
30 30 25 19 21 11 9 9 13 13 18 18 14 13 12 9 12 9 8 11 13 11 11 11 19 23 24 17 17 12 8 8 8 8 8 8 9 8 15 9 9 8 10 10 8 8 12 10 10 8
8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 10 10 15 10 8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 9 9 8 8 8 9 15 10 9 9 10 11 8 8 8 8 8 9 16 19 9 8 8 8 8 8
8 8 8 11 13 13 14 10 16 10 13 10 10 10 12 14 23 20 21 10 10 10 11 9 9 9 11 15 9 13 10 10 8 9 9 8 8 8 10 10 10 9 10 10 10 14 11 9 8 9
9 16 22 14 12 12 10 11 10 13 10 10 9 9 9 9 21 21 23 12 11 11 8 8 9 9 8 8 9 9 9 10 9 8 7 7 7 7 10 13 11 11 9 9 15 13 8 8 15 13
9 9 9 9 10 10 9 10 8 8 8 8 10 8 22 10 12 11 11 8 12 12 12 19 9 11 11 25 22 12 10 10 10 10 8 9 9 9 10 8 12 11 11 12 18 18 11 11 11 15
12 12 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 9 9 10 11 10 10 16 10 10 10 10 10 10 10 13 8 8 6 6 8 8 11 9 9 9 9 9 9
12 11 11 11 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 9 11 13 16 14 10 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 9 15 6 6 6 6 8 12 13 9 8 8 3 0 3 17 19 21 8 9 10 22 21 31 24 24 16 31 29 35 36 37 37 42
47 47 42 37 37 43 43 50 50 54 54 57 57 57 57 57 68 57 43 59 47 46 41 41 41 41 33 41 48 42 44 42 42 32 37 37 33 40 36 37 31 32 32 35 38 36 37 37 30 42
42 44 44 46 41 47 47 57 48 57 57 43 43 32 32 24 44 44 57 43 43 43 43 43 43 50 52 43 43 35 38 38 43 43 43 33 33 35 42 42 43 43 43 43 43 50 50 52 52 52
57 57 52 52 52 57 57 47 57 57 38 38 15 15 17 38 38 39 39 34 43 43 57 57 57 57 57 57 43 43 39 43 43 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 52 57 57
52 43 43 35 43 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 35 35 35 47 43 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 52 52 43 62 43 62 43 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 39 62 62 52 52 62 52 52 62 62 62 43 39 39 43 43 35 35 43 43 43 39 43 43 52 52 57 43 39 39 39 39 35 43 43 52 52 43
59 43 52 45 52 52 43 43 33 33 43 44 44 52 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 37 43 43 52 50 52 52 52 52 52 57 52 52 52 59 57 57 57 57 52 57 52 57 57 52 52
52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 50 48 48 57 57 59 57 59 59 59 43 47 47 57 59 48 48 57 47 44 44 44 46 37 37 37 46 46 47 57 34 32 14 14 14
18 15 12 11 12 23 34 44 48 48 48 57 46 48 39 39 30 39 36 40 37 48 48 48 48 59 48 48 47 43 41 39 39 32 32 37 34 34 34 34 48 59 59 59 32 28 15 12 11 9
11 11 13 19 18 16 11 11 9 9 9 15 14 24 24 16 20 12 12 10 23 23 39 30 28 13 12 12 17 16 10 9 8 8 8 11 9 11 14 18 25 21 17 9 8 8 8 8 8 12
15 10 10 3 0 0 3 27 27 3 0 3 27 27 3 0 3 27 22 35 39 59 59 59 48 48 48 48 48 43 39 39 39 39 39 39 48 57 57 48 48 57 57 47 47 35 35 35 39 37
42 39 43 41 43 43 47 43 48 48 59 59 54 57 54 54 54 59 54 57 57 59 59 57 57 43 59 46 48 48 57 54 59 59 59 59 57 57 47 47 47 47 47 47 47 57 59 43 43 37
50 57 57 50 50 37 37 43 50 57 54 50 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 44 47 57 57 50 43 43 50 50 59 59 54 54 57 59 57 57 43 46 37 46 46 57 57 57 57 57 57
57 57 46 46 43 42 42 42 42 42 42 35 37 37 57 43 43 43 43 59 59 57 54 48 48 48 48 57 57 57 48 40 41 25 25 25 40 40 48 47 48 37 37 32 32 37 24 25 18 30
30 36 36 25 25 25 34 32 48 48 46 46 40 39 37 30 30 15 21 24 35 30 39 35 35 35 37 37 37 23 23 14 10 10 17 18 13 28 28 36 33 29 24 28 15 23 20 19 19 22
22 13 11 15 19 28 30 33 32 32 20 18 15 28 19 11 11 11 18 18 24 26 24 15 11 13 11 11 14 19 24 19 25 23 23 18 13 15 12 12 12 18 20 13 13 12 11 14 13 12
14 9 9 9 9 13 9 9 9 10 8 9 9 13 10 16 18 10 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 17 10 14 16 20 15 9 8 8 8 9 10 10 9 10 8 8 8 9 9 12 8
8 9 9 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 12 14 10 10 10 8 9 11 19 17 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 15 15 16 15 16 11 6 6 6 6 8 6 8 8
8 12 13 6 6 6 8 10 11 9 9 10 15 18 21 20 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 12 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6
6 6 8 10 10 10 10 13 15 11 11 11 16 10 15 14 16 17 12 10 8 8 8 10 8 9 10 9 10 26 10 10 9 9 11 11 16 16 13 10 10 11 11 11 11 10 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 16 10 11 18 16 15 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 6 8 8 9 11 12 12 12 10 11 11 16 13 13 15 11 8
10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 16 11 10 10 10 11 12 13 10 8
8 8 10 10 8 10 9 8 8 8 8 13 8 10 10 9 8 8 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 10 8 8 9 11 18 15 10 10 9 9 10 10 19 30 23 24 20 20 20
22 22 21 12 12 15 18 12 12 11 11 9 11 12 12 12 13 13 22 19 15 9 12 9 8 8 8 8 8 10 9 8 8 10 8 12 9 9 9 9 11 13 10 10 15 13 12 8 10 8
8 6 6 7 8 8 8 10 10 11 11 11 11 |