BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217C02.T7 (MSMg01no217_c02.b1) | MSMg01-217C02.TJ (MSMg01no217_c02.g1) |
ACC | AG396763 | AG396764 |
length | 1,266 | 1,385 |
length of high quality (start - end) | 409 (42 - 450) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c02.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_c02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c02.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_c02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NTTGTCTATGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTCCCTCTTTTTATTTTTTTTTTCTTTCTACTGAGTCACAGGAAGAAATG
TTGATCACTCTGTCACCCTCATTTCCCCGAGAACATCTGCAGATACAACT
CAGATCTGTTAAAGAGGTATAGCAATTATTCATGTAAATAATTAGAATTA
AGATGTTCTCTCCGGTTAAACCAAGAGCTGGCACGGATGCCAGCTTTTCT
TTGGAACATGGATTGGCTGCTGTGGCTACCATGCTTCTCTCTGCACTGGC
TTATGAAGTTAAATTTAGGCAGTGATCTCTTGGCTCCCAGACCACCCAGA
CACCCTGGTCCCTCATTCCAAGCACAGTAGCCACCACCAACTACCAGGGT
CTTTCATTGCTGCCCTTTGTTACTGGATGGCCCGGTCATCGAGAGTGGTA
TGTTTTTTTTCCCCCCCCCCCGGAAGGATGTCTCCTTGCCAAAAAAAATG
GGGCGGCCAATTTCTAGTTCCTTGTACAAGGCTCATCGTGGATGCAGTAA
TGGCTTTCTCTGGGTGATTTTTCTTGATCTTAGCCTCTGGAATCCTACAT
TTATTTATGTGTCCACAAGGTGGCGCACATGTCACTGTTCTCCTGACCTC
AGCTAGGAAGGGCCCCAGTCTCCCTCCAGGTGAAGCTTCTGTTCCTGGAA
GTAGCAGTTGAAGTGTTTACTGAATTCATTAATTTTAACTTTTCTCCCTT
CTCCGCTCTAAGGAGTTTATCACAATGAAGAGTTAATGCCCTGTTATTGG
TTCTGAGACAACACTGCCACTGTTTCCTTACAAGGAAATTTAATCTGCAA
AGATGCTTGACTCGACTGCATAACGCACCGAACATAATCGGTTCCACGGG
TCCTCATTGTGCTACCCATCAAATCCCCATATGCTCCGCTCTCATTGTTT
AAGTAAGGTGCCCGCTGCTTGTGTGCAAATTGTGTTTTTGTTGCCTTTCT
TGTCTACTCTCTTTTCTTTTTTTTATTTTCTCTTCATACTTCTTCTATCT
ATACTTTTCTCTTTTTTACTACTATTCTCCTTTTCTCTTCTTCTTTTTTA
CTTTATCTTCTTTACTCATCCTTTTTCTTTCTACCTTCTTTCCACCTTCC
CTTTTCTCTTACTTATTCTCTATATTATATTTTTTCTCTTCTATTACTTT
TTATTCTTTCTCTCTCTCTCTTATTTCTATTATTCTATCTCTTCACTTTA
TTCTTCTACTTNCTTT
| TATCATGTTCGTATACTCCGCCTTTGCTGCTTTNTGCTCCCGACACTCGT
TATNCACGCACGCCTGTCTCATCATATACTNATTTTTGCTTCGTCCTAGT
TCGTAGTATACGTACTGCTTCCTCTCTTACACTATTAACTCACATCTCTA
CCTTCTCGCGCTCATATTACCACANTGTACTAACTGTCTCTGTCGATGTA
TAGCAGCGTCATCACTGCGCTGCGTCGCCGCTTACGCCTNAGTTACGTAT
GATGGCGTATCTTAGCGGTGTTATATGGATCGCAGTGCAGTCTATGCGTC
ATGATAGGCGTCGCGAGATTACGACGCCGCTCAGGATACTCGTATATATT
AATACGTATATAGCATGCCGGTGTATTGCTCACGTTATCAGCGATGTCGT
ATCTCTATACGCGAATAGCCGCATCGTGTGTTCTAGCGGACGCGAGGGAA
GAAGACAATTGAGTTAGTGCATAATATGCNATGAGTGGCTAGCAGTGAGG
CATGATGAGCGGAAAAGATACACACAGTCGCACTCAGCGCGCGCGCAGGA
CGACTGAGGTACACTTCATCGAATATAACGCCACGCGTGTTTATATACGA
ANCGAGTATTAACGATGTATTGAGAAATTAGCGATAGATCGCGAATATGA
TGCGACGGAGTCTATCATAGCCGAGTGCGATTCGCGACTTGCACTTATAA
TAGAATCGTGTACACGATCAGTACGCCTGTTGCTCCTTCTTCTGTGTACT
AGAATGTGTATGATGTACATCCAGAATCGCGCGCCGGCTGAATATTGTCG
TACTGTCTGAGCATCGATATCGATTACATACGCTTATTCATATCGATATC
TCTCGTGTATGCGCAGACAATGATCTGGAGATTTAAGTTGCGTAGTAGTG
TCTTGCAAGGGTAGCGTATGTATTCGGATTCGATGCGGTGTATCCGCTGC
GAACACCGGTACCACTTCGCTCCAATATTATCTGTGTATGATGCACCGTT
ACACATCGCGTGCGATACTATATATGACAGCGCGTGGTGATCGGATATGT
CATCGCCGCTGCGTCGTATATTATAGTTATCAGCGATTCGGCTACCGCGG
CGTAGCGCACAAACATAATATCTCAGTCCGTTATAGAGTCGTCTTCCGCT
ATATCGTATCTAACCGGTACAGCGCGAATTGATCGTTTATCGCGCTCTCT
ATTCGNCGCCGTGCACGAGAGATGCGTAGTGAGCTCACACGAACGTACTA
TATCGCGGTTCGCACCAACTTATGATGATATGTTCGCTCGCACCGCGACA
ATGCGTGAAATGTCAACTATGTGCGAAAGTGTGCACACTGGCGGACGCGC
CGCGGGCTCGAGGACTATTTGCGTATTACGCGGAN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 3 6 7 7 9 10 8 9 12 12 16 12 10 10 10 11 11 11 15 19 9 8 8 10 14 12 24 24 42 40 36 37 48 48 48 43 48 48 48 48 48 57 48 53 50 68 68
68 68 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 59 59 43 43 43 44 47 47 54 59 59 50 48 50 50 50 50 50 50 50 50 47 47 43 29 30 29 25 24 24 30 40 39 43 43
43 46 57 57 57 50 53 47 42 42 42 36 38 36 36 33 33 33 33 33 33 24 19 13 8 8 8 10 11 11 20 30 39 46 37 37 41 41 47 47 48 47 47 47 47 47 42 48 57 57
57 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 57 48 54 59 57 54 47 47 50 48 47 47 57 50 50 50 50 48 48 36 36 25 36 28 25 25 37 37 57 48 43 46 44 44 57 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 48 48 50 50 47 47 47 50 57 57 57 57 52 43 43 35 59 59 52 52 43 43 50 43 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 50 43 43 50 44 59 54 54 43 48 44 57 57 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 44 44 43 46 43
37 37 43 46 46 48 48 48 48 48 48 57 59 54 54 54 57 48 48 48 43 43 39 39 43 43 37 37 28 28 28 37 37 59 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 39 22 22 11
12 12 14 12 11 11 11 27 28 43 43 47 59 59 59 48 48 48 48 48 50 50 57 57 48 48 47 37 28 23 23 28 34 37 39 44 39 47 48 48 48 48 39 39 35 33 25 21 11 11
9 10 10 19 15 19 23 20 16 15 16 16 24 31 36 39 39 36 27 16 12 9 9 11 11 25 25 36 37 24 26 14 18 18 15 15 15 15 11 11 12 10 11 14 12 10 10 10 9 9
10 9 11 11 11 23 25 47 59 59 59 59 48 48 47 47 46 46 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 46 43 43 43 46 46 48 47 39 41 30 30 44 42 39 37 41 41 36 36 28
28 28 37 37 44 43 47 54 59 59 59 46 43 36 36 33 36 42 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 50 57 57 57 57 57 50 50 50 50 38 42 47 44 43 43 43
57 57 57 59 57 57 57 57 48 48 48 57 44 44 32 28 28 25 36 31 39 39 43 36 36 28 28 37 37 37 39 39 36 36 36 30 28 28 41 41 34 35 35 29 40 33 43 43 40 30
25 25 29 34 40 35 35 35 33 37 28 28 28 34 34 28 25 22 17 17 19 19 18 21 28 30 20 28 23 28 28 34 32 25 25 28 27 32 39 41 30 30 33 33 33 33 32 28 28 28
24 26 21 24 17 24 24 28 30 32 24 24 30 37 32 27 20 25 17 22 16 19 13 20 22 19 16 11 11 10 13 14 19 18 17 19 17 18 21 23 24 30 36 36 36 31 31 41 43 39
37 33 33 33 32 32 22 28 21 32 32 27 21 15 16 19 24 29 29 21 8 8 6 6 6 8 13 12 11 12 13 19 17 21 15 13 12 10 10 10 15 15 14 13 22 19 18 21 9 9
15 17 22 19 27 18 18 18 23 21 25 22 20 16 17 12 12 8 8 8 8 8 8 12 19 21 28 21 19 18 11 11 10 15 15 16 9 9 9 9 10 10 9 8 8 8 8 10 10 10
12 11 11 16 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 8 8 9 10 10 11 11 12 13 11 11 11 20 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 21 12 12 8 8 8 8
8 8 10 14 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 12 10 10 8 10 8 8 8 11 10 13 12 11 11 11 11 14 15 8 8 8 11 8 8 8 16 14 19 12 9 10 13
12 10 10 9 9 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 10 15 15 10 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 30 21 13 10 13 10 11 11 11 11 11 11 10 11
12 10 10 15 8 10 8 11 10 8 6 6 8 6 8 8 8 10 11 14 11 11 10 10 11 13 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 17 13 14 12 10 8 8 6 6 6 6 13 10
10 6 6 6 7 10 8 10 10 10 10 10 10 11 13 10 8 8 8 10 19 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 13 16 13 21 22 15 13 8 8
8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 11 7 7 10 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 10 13 10 12
12 13 12 8 9 9 10 14 9 8 8 8 8 8 6 8 8 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 11 8 9 8 8 8 8 10 13 10 13 13 8 8 8 8 8 8 10
13 10 9 8 8 8 10 9 9 15 15 9 9 11 10 10 8 11 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 11 12 10 10 8 6 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10
8 8 6 7 8 6 6 8 6 6 3 0 3 10 11 11 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 8 3 0 3 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6
6 8 3 0 3 6 6 6 8 8 10 8 6 8 6 6 8 7 7 7 7 6 6 6 8 10 8 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 7 7 8 11 6 6 6 6 8 6 6 6 8
8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 10 6 8 8 6 10 7 7 6 6 10 6 8 8 8 8 8 12 13 13 10 9 7 6 6 6 8 6 9 11 11 9 11 10 10 6 6 6 6
8 6 8 10 10 10 10 10 9 10 10 10 11 11 10 10 10 13 10 10 6 6 6 3 0 3 6 6 7 7 8 9 6 6 8 8 10 8 7 7 7 8 6 6 6 6 7 7 6 8
6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 10 12 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 6 6 6 8 8 8
8 6 8 8 6 6 8 13 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 8 9 9 9 12 10 10 9 9 9
8 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 7 12 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 8 7 7 6 7 8 6 6 8 8 10 10
10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 13 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 7
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 7 8 9 11 11 11 10 11 10 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 9 9 9 8 8 8 8 7 7 7 7 8 10 6 6 7 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 9 10 10 10 8 6 6 6
6 6 10 9 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 7 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8
3 0 3 12 11 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 8 6 6 6 8 6 9 10
12 9 9 8 8 6 6 6 8 11 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 13 12 8 8 10 8 8 8 10 12 10 10 10 10 10 11 22 6 6 6
6 8 6 8 8 10 9 8 6 6 6 8 10 11 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 6 8 8 6 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 8 7 7 7 10 11 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 10 7 6 8 8 7 7 8 6 6
8 8 6 6 13 8 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 12 10 10 10 12 12 11 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 14
17 15 17 11 9 8 10 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 9 9 8 8 7 7 7 9 12
10 11 8 8 6 6 6 8 9 9 9 10 10 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 11 11 6 8 6 6 8 8 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 11 12 12 8 8 6 6 8 6 9 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 11 10 8 11 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 6 10 6 6 8 10 10 11 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 6 6
6 6 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 10 8 10 11 8 8 8 10 8 6 8 7 7 7 7 8 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 11 11 12 10 8 6 6 6 6 6 8 10 8 9 9 10 10 10 8 8 8 10 8 8 6 6 10 7 6 6 6 6 8 6 7 11 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8
8 9 10 9 3 0 3 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 6 6 6 6 10 10 10 8 8 9 8 8 9 9 8 8 8 9 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 16 12 15 13 10 10 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 |