| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-232D24.T7 (MSMg01no232_d24.b1) | MSMg01-232D24.TJ (MSMg01no232_d24.g1) |
| ACC | AG398817 | AG398818 |
| length | 728 | 735 |
length of high quality (start - end) | 293 (436 - 728) | 264 (440 - 703) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no232_d24.b1 PHD_FILE: MSMg01no232_d24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:48:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no232_d24.g1 PHD_FILE: MSMg01no232_d24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:48:42 2005 |
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (90,347,783 - 90,348,075) | (90,507,812 - 90,508,075) |
|---|
| sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCAATGGTACTTCACAAACAACTGAAACAGAAACAACCTTAGGGCTTC
CGGTTCTAACTTTAACCCTTTGCACAGGATGTGTAAAGTTCTCCTGCGGT
AATTACATTAACAAACCTTTAGTCTTTCACAGTTTTGGCCGCCACATTTT
ATGCACAGCAGTGAGTTGTCAGGCTCTGTGAACTTGGTTACAATTTCTGC
TTCAGAAGGAATGGCTGTCAGGCCCAGATCCCTTTTCTCCTTGGGCTGTG
TGAGAATATTTTTAGGCAAATTGGAAGAGAAAATAAGCGCCCTGCCCACA
CTGTAGTGAGTGGTTTTTTCAACCCAAGACGGAAACGTGCTGACCAGCCA
GCAATTTTCCTTCGGAGACCGCATAATGAACAGATAGAATTACTCAGTTA
CACAGTGACAGAAAAATAATTGCGAGCTTGAAGTACCCTGAATACCTGGA
ATTGAATTTTGCAATAAATCTTTAAAATAGTCACTCATGTTTGATTTCTT
TATATGGTGTATAATGGCTTCTCCACTGAAATACAGGCGCCTTTGATTTT
CCATCTTTCTATGATGCCTCTTTTAAAAATGACAATCTTGTCTTGTGGTA
CCCACAGGTTGGCACCGTGGGCTGACTTTGCACCCAGCAGCATCACAGCT
TGGGACAGCCCTCCATGCTGCCAGCTGT
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACAGAAAGGAGAGAGGGCAAAGACTGT
GTGTGGCAGGTGACAAGCAGCTGCCTCTGCCCCAGGCACAGTCGCTGCAC
ATAGCAAAACACTAGAAGCTTACAAAACAAACACAAACAAACCACTCACA
AAGTGAGTGCCTTCTCTAAAACCACATAATGGAGAGAAAAGAAAGCTGTT
CTCAAAAGTCAAAATAAACACAAGCCAGGCTGGGATTTGTAGACTTCAAA
TTACAAAAAAGAAAAAAAGGAAAAAAAAAAGTAGCCCTACAGGGAAGAGC
TTCCTTTTCAATCTTAATTAATCCACCACACCCCCCATGACCTTCTGTGA
CTTCCAAAGCCAAGTGCAATGACCCCTGAAAAAACCAAAGGCAACATCAT
CACCACCACCGCCAGGGGCCTCAGGAGGAAGGCGCCTCCTCAGAGCAGGC
AGACAGAGGCCAGGCTCCCAGGAGCACATGGGAAGGAGCAGAGAAGGCGA
GAACAGGGGCCCCTTGCACTCCACGCCTTCCCAATTTTTAGTTTTGTCTT
TCACTTGGGAGGTTGAGGTAGAGGATCAGACGGGCCACAGCCTCCTCAGA
TGCATGAGGTATTGGAGGCTAGCCTGTGCTAAAACAAAAAACAAAGCTAA
CAAAAAGAATGAAGGGGGAGGAGAGGAAAAATCTN
|
| quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 9 9 9 10 28 34 33 32 32 28 28 37 23 18 9 9 9 21 21 39 33 33 33 33 33 30 22 19 12 7 7 7 9 9 9 10 10 10 11 13 18 28 36 41 33 33
33 33 53 50 41 37 37 47 34 25 16 12 8 8 6 6 6 6 10 8 10 10 22 30 46 48 48 47 47 53 53 53 50 50 50 53 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57
59 59 59 57 57 59 59 59 59 50 50 50 50 41 33 10 8 8 8 8 13 19 9 9 9 9 9 10 17 23 30 33 39 41 48 50 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 40
42 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 44 34 30 13 13 12 12 12 14 19 24 40 43 57 50 50 48 50 50 50 53 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 28 27 13 9 9 9 9 11 14 17 12 12 13 15 20 11 11 11 11 11 11 12 12 12 15 24 32 37 59 48 59 59 50 50 50 57 57 57 48 48 48 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 36 25 18 15 10 10 10 10 10 17 15 15 15 25 12 8 8 8 8 10 8 17 25 41 41 50 50 50 50 48 48 48 43 43 43
46 48 43 43 48 48 48 48 48 57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 59 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48
57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57
57 57 48 48 47 59 47 59 59 59 47 47 47 41 41 31 36 43 59 34 34 40 39 39 43 43 50 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 54 54 54 57 57
68 68 57 54 54 47 47 43 40 43 48 48 48 48 48 48 48 48 57 59 57 50 41 41 41 41 48 48 48 42 42 37 37 43 43 43 48 48 48 48 48 57 43 57 48 48 48 57 43 43
43 43 48 41 40 40 39 39 39 41 32 29 33 28 28 28 37 37 37 33 25 25 12 21 12 25 25 41 39 40 40 40 39 39 39 36 37 37 30 30 30 37 37 47 41 39 39 37 28 17
9 9 9 9 10 12 21 23 24 22 27 23 28 28 28 34 34 37 33 30 22 22 28 24 28 28 33 27 | Open.Hide.10 10 9 9 11 10 9 18 11 11 11 23 27 37 37 44 39 39 41 42 50 50 50 50 50 53 57 53 53 50 44 44 43 32 32 19 15 10 13 10 21 21 22 11 11 16 25 33 50 50
50 48 43 42 32 32 44 44 33 36 26 26 33 40 44 57 48 47 47 47 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 48 48
57 57 57 57 50 50 50 50 57 47 47 38 36 36 33 44 37 34 28 25 19 21 15 15 17 19 19 36 36 59 50 50 50 50 53 53 53 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 47 47 43 43 43 36 36 27 27 29 29 48 48 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 59 50 50 50 39 39 32 17 15 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 7 7 7 7 9 10 9 10 8 9 10 15 22 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 39 30 21 11 10 10 10 16 22 13 12 12 12 16 18 16 27 11 11 11 11 14 15 18 15 30 30 47 47 47 43 39 35 35
39 39 43 43 46 48 48 57 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 47 43 43 43 43 43 48 48 48 54 54 59 59 59 48 48 48 48 42 39 39 42 47 57 47 48 48 47 57
48 44 43 42 37 43 43 43 47 47 59 57 57 57 54 54 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 57 48 46 43 43 43 43 43 59 48 47 43 37 37 35 35 35 43 43 48 48 48 40
37 37 37 37 37 32 31 31 39 39 39 41 41 37 37 30 30 32 37 39 57 48 48 48 57 57 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 54 48 48 43 42 36 36 43 43 37 37 30 42 32
46 37 37 37 42 32 43 43 34 31 31 28 30 42 33 34 34 29 33 43 43 43 43 43 48 43 43 43 43 43 39 39 48 46 47 43 37 37 41 41 36 37 41 39 39 37 37 30 35 35
37 39 46 46 47 48 41 41 41 39 37 39 39 32 36 41 43 47 47 37 32 32 27 24 29 37 37 39 40 40 41 43 43 48 48 47 47 47 47 37 37 36 36 36 43 37 32 27 24 22
27 28 22 22 23 19 16 10 16 16 16 12 19 19 18 18 23 23 22 22 19 23 20 20 18 18 28 32 32 32 18 18 11 3 0 |