| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-234B15.T7 (MSMg01no234_b15.b1) | MSMg01-234B15.TJ (MSMg01no234_b15.g1) |
|---|
| ACC | AG400094 | AG400095 |
|---|
| length | 2,006 | 742 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 356 (387 - 742) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_b15.b1 PHD_FILE: MSMg01no234_b15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:50:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no234_b15.g1 PHD_FILE: MSMg01no234_b15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:50:58 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | GTGTTTCTTCTTGTGTGTGTGNTGGTAGTCTTTNCCGTGGTCGNNTTCTT
TTCTTTCTGTCCTATTTCTCTANCCTNATTTCCCTCACTCTTCTCCACCA
CTCCCAATAATTCCTGCGACTAACGCTGCTGGCCGCCGGCGCGCGTCGCA
AACATTGTTATCTCGTCACTCTTATATATCTGTCCTAACACACATAAATA
CACAGCAAGTAATTATAGCTACAACATATAGTCTCACACTACTCGTCCCT
ATCTCTCGCTCTCCGTTCNGCTCCTCTTCATTCGNCGTNACATGTCCACA
CTATCTGTCTGTGGCGCTGTAATCATCGCGCATTCTGCGGTGCCTGCATA
CTCGTGGTCGCTTACGTTGTAGTGTTACACATAGCACGACCACACATATC
GTAANTAAACGTGAGACGTNATACTCCTGTTGTCTCGCGTTGCTCCACTC
CGTCACCTCCTCTCCCCTCTCTCTTCACGTACCTCACACACACTATACCC
TCCTGCGCTTCCGTCTCCTACTCTCCCCTCATCTCTGTCTTTACTTTCCT
CGTCACTCCTAACTTATATACTCCCTCGCAACAGTCCGGCGAANCACCCA
CACGTCTGGACTGCCTGAACGTTTACCGCCGACGGCTCCGACGTATACAT
TTCTGCTCTTNTATTGCGCTCATACGCGNTTCTCTATTTCTATATGTTAC
ACACTCCTTTTATCTCTTCACATACTCTATATTCTTCTCTCTTTATGCCC
GTCTCCTCTCCTTCGTTCTTTCTCCTCCGCTTCGCTGCGGCTTTTGTTAT
ATAATTACACGCTAAGCGTCCGATATCNATCAATACAAGTCAATGCACAA
GAGATGCGCNGCGCCAGGAGTCTGGCACCCTCACTGTCCTTACTGATGTG
CCTCGCGTTCTTCATCGACTCCCGCCGCCTCCCTCCTTCACGAGAAGACG
TATGCCACACACACGCGTCACCAATACCTCGTGCGCTCNCACCACAGCTT
GTTATACCACACGATTTGACGCGTCGAGACCTAGCTCGCTCACTCCTATC
CCTTCATACACTCACATGCTCATATACTCATATGACGTGCCTACATCTGC
TCTAGTCGTCTACGAGATCATAATATATATAGAGAAGATGTCCGTACGAT
AGCACAATATGATGAGCTTCTTAGCTCCGCACACGCTCTGTCTATCAAAT
GAGTACACGTCTCTCATGACGTACTCTNGTGAGAGTCGCTTCNCATCTCA
TTCACTATCGTGTCTGCCTCNACATCATGTACCTTCCGCCATATATCTCT
AATTTCACTGGCATCATATACTACTTCGTGANGAGATAATGATTCCGCAT
CATACCTCACTACACTTCAACAGATCCTAGACATATACTCGCTATCATTG
CTATATGTGTATCACGCCTCGTNGCTACACACNCCTCACACGTGCCTTCT
TATTGACACGTGTACATTCACACGCCACTNTGCGTCTCTCTCCGTAGATA
TCTCTCGTCCTGTCCTTCTCACTACTCTCATGTGAACTCAATGACATNAT
GATACTGCTCTCACTGTCCTGACCACGCACTCTAGCATCTCNTCTGTTCT
GAGAATCGCATGCAGAGAGACATATTCTGACCTCTGGCGACTAGTATCAA
CGTGTACTAGATAAAGNATCGGACGCTAATGTCTATCTCTACACTCANCA
TGTACTACATAACATCTGTNTGCTATATGTCCTAGCATAATACATACGTC
AGTGATACTATNCCAGCTACTGAGACTTATCACACTCATAGTATACTTAT
ATCTACCATATTCTACTCTGTGCAAATATGTACATATGCATACCATTCAT
CTATAATGCCTCTATCTCGTGCTCCATCATATATCACGACCCTNGCATAC
ACTCAACTACATCACTCATCTACTCATNAATATAACAACTAAACCTGCTC
GCATATCACNTATATGCTGCTCTATACCGTATGACGTCTCTCATCTCACT
CACTAT
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGTTTAGATCTGTACCCCATGTTT
TAATTGGATTACTTGTTTTTTTTTCGAGTAACTTCTTGAGTTCTTCATAT
ATTTTGTCTATTAGTGAAGATCATTTCCCAATCTGTAGGCTGCCACCAAT
CAAAGAGCATGCATGGACTGGTTGAAAGACTGCCTTGTCTGGCCTCAGTA
AAATTGGATGTGCCTAGTCCTGTAGAGATTTGATGCCCCAGGGAGGGGGG
ATGTCTGGGGTCAACTTCTCAAAGGTGAAAAGGAGAAAGGATGGGAGAGA
GAACCCTGTAGGATTTTTTTTGAACGCCCACCACATTTGGGCTGCAAATA
AATTAAATAATTAATTAATTAACAATAGAGATCATTGACATTTCTACATG
CTATTTATGAAAATAGAATTATTATAAATGTCAATATCAGACTTTTCAGG
GCCATACATATCTATAATTCATGTGTAATGCAATTAATGTTTCCAACTAA
AATCCATGATAAGACAAAGCTGTCTACTTTCTCCATATCTTTTTAAGTAT
AGTACTTGAAGTCTTAGCTAGAACAATAAGATAGACAACTTGTCAGGGAC
CCAACAAGTCTTGTAGCTTGCAGGCAGGAAAACAATCTGGGGAGGTGAAG
AATGAAAGTCAAGTCAACACCAATTTCCCAGGTGCTGGGGCA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 7 8 7 7 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 3 0 3 8 8 8 11 11 11 10 6 6 3 0 3 6 8 8 8 11 10 17 3 0 0 3 6 6 6 6
6 8 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 3 0 3 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 7 7 7 10 8 10 10 9 10 8 6 6 8 6 8 8 6 6 6 8 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 8 6 6 6 8 10 9 11 13 11 9 6 6 8 8 6 6 16 6 6 6 6 8 8 10 6 6 8 8 9 10 10 10 10 10 9 9 9 6 6 6 6 8 6 10 10
10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
10 8 11 11 11 12 11 12 12 15 16 15 10 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 3 0 3 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8
6 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8
8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 10 6 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6
6 8 6 3 0 3 6 6 6 7 8 9 8 8 8 8 8 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 9 10 10 10 19 19 8 8 8 8 9 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 10 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 12
7 7 6 6 6 6 8 8 10 8 11 7 7 8 8 8 9 9 9 9 10 10 9 10 9 9 10 12 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 14 15 11 8 8 8 10 11 11
10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 3 0 3 8 7 9 9 11
10 7 8 10 10 9 9 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 9 9
10 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 9 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 9 3 0 3 8 8 7 6 8 6 6 8 10 8 7 6 6 6 11 6 6 6 6 10
10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 10 10 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 13 9 9 12 9 13 12 14 7 7 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 10 13 12 11 9 12 15 13 10 6 6 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 6 6 6 6
6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 3 0 3 6 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 10
12 9 9 6 8 7 6 6 3 0 3 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 9 8 12 10 10 10 11 12 12 12 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 9 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 7 7 7 8 8 8
10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 3 0 3 13 10 10 8 8 8 8 8 6 6
6 6 10 8 8 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 13 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 10 13 13 8 8 6 6 6 6 11 7 7
8 8 8 10 8 7 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 6 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 8 10
11 10 8 6 6 8 8 11 13 13 8 8 8 6 8 6 6 6 6 10 9 9 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 11 10
6 8 6 6 6 6 8 8 12 9 12 9 11 10 8 7 7 6 8 8 6 6 6 7 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8
8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 7 9 9 9 9 10 10 10 12 8 6 6 7 8 7 3 0 3 12 16 11 10 10 9 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 12 8 6
6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 11 11 17 15 11 11 11 3 0 3 7 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8
8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 7 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 11 11 13 11 11 8 8 6 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8
7 7 9 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 9 8 8 8 6 8 6 6 8 6 6 6 7 8 8 8
8 8 8 8 8 9 11 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 9 12 7 8 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 10 11 9 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10
12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 8 10 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 8 6 8 7 3 0 3 7
7 8 8 8 7 6 6 6 7 7 12 10 10 9 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 7 7 8 10 10 10 12 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6
8 9 9 10 13 13 8 8 6 6 6 7 10 6 6 8 7 7 8 8 6 6 8 6 9 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 10
8 8 6 6 6 8 8 8 11 12 10 9 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 6 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 11 12 13 10 9 3 0 3 9
10 8 8 8 8 8 8 8 15 15 12 14 21 19 17 11 10 11 3 0 3 6 6 6 10 6 8 8 8 6 7 6 8 11 8 10 12 8 16 11 12 10 10 10 10 10 10 7 8 8
7 9 7 7 7 7 6 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 9 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 6 6 6
8 8 8 8 6 8 6 6 7 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 7 7 8 8 12 11 8 8 8 10 10 8 12 7 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6
8 10 9 8 6 6 6 6 6 12 11 12 12 12 12 12 11 9 7 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 12 12 12 10 10
10 8 6 6 6 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 9 9 10 10 10 10 8 9 8 3 0 3 9 8 8 8 8 8 11 9 11 8 8 6 6 6 6 6 8 11 10 8 8
8 8 8 8 10 10 10 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 11 11 11 9 6 6 6 6
8 8 10 9 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 13 13 8 8 8 8 19 27 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 68 53 53 54 57 27 25 11 11 11 25 21 48 54 54 26 26 12 12
11 26 26 68 68 68 68 68 68 40 40 30 30 38 40 59 59 57 50 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 59 59 59
57 57 50 50 53 43 43 43 53 53 53 57 57 53 50 59 59 59 59 59 59 25 15 11 9 9 10 12 25 26 37 41 50 50 50 50 50 57 57 57 59 59 57 53 53 50 50 50 53 57
57 57 53 53 68 68 68 47 68 68 68 68 47 68 68 68 68 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 47 43 42 39 43 43 43 43 43 59 59 59 68 68 59 59 59 57 50 50 53 53 53 59 59 59 59 59 59
57 57 53 53 41 41 59 43 31 20 12 11 12 12 11 13 14 14 12 12 11 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 12 19 23 24 34 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 28 24 10 10 10 10 14 19 31 34 19 22 12 15 15 20 17 12 8 8 8 15 23 59 59 59 44 44 43 33 33 37
37 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 68 59 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57
59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 59 54 57
48 48 48 47 57 48 54 57 57 54 54 54 54 48 48 43 43 43 47 47 48 57 57 48 48 48 59 57 39 39 35 39 39 39 36 36 33 33 33 40 47 41 41 43 41 37 22 22 20 19
19 32 37 39 41 46 47 47 43 43 47 59 47 48 48 46 39 59 47 37 37 35 32 34 41 44 37 32 28 26 26 20 22 25 27 32 43 39 35 36 34 37 37 37 36 36 35 36 31 32
29 29 32 37 37 39 39 32 32 30 26 26 32 37 32 28 31 35 27 21 21 24 24 22 30 29 37 41 41 39 32 28 35 35 35 35 31 28 37 37 30 25 |
|---|
