BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-235H04.T7 (MSMg01no235_h04.b1) | MSMg01-235H04.TJ (MSMg01no235_h04.g1) |
ACC | AG401016 | AG401017 |
length | 728 | 738 |
length of high quality (start - end) | 517 (46 - 562) | 295 (77 - 371) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no235_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no235_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no235_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no235_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:52:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAGCAAGATTGCAAAAGCTAAGTCACTCCCTTACACAGGAATTTAC
CATCGCTTAGGAAGAAGGAAGTTTCAGACCAAAGGAGAAACCAGAATAGA
TACTATAGCAGAGTTACACCCATACACACGTATTTACAATGGCCTAAGGG
GAAGGTGGACTATACAAGAGACTAAAATAGGAACTGTGGCAAGGACGCGA
AGCCCTTGACCCTGGCTTCTAAGATTAGTGAATTTTAGGTGGAGCCCTTG
TTGATTCCAGCTGTTATCAATGTATTCTATCCTGGGTGGTTCCCGTTAGA
CCTTTTGCGTTTGCATTCCTCTGCTTTATGTAAGATTCCAGTTACCTCAG
TTGTACCTTGCGAATACGCCATCCAACTTCCTTATTGTCCTCTGCATAAA
AAGTCTGATGCTCAGTTGTAAAATTACATTCAGATTCCACACAAACTCTC
CTGCGTGTGTGTCTGTCTGTCATCATCCACGCTTTGCCCACCCGCGTCGA
GAGACCCCGTTCCACGCAGACATAGGGACCCACAAGGTCTGCGGCACTCT
CCAGCCCTGACCATCTTGCTATTGTTACCTATGCACCTGCTAACAGGCGA
TACTTCACGGAATTTGGCTTGCTTTTGATGCAATAAGAAAAACAGGGGCT
TGGAACCCTTACCAAATACAAAGGTCCC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTAAATAAAAAAGAATGACAGCT
CTATGTGACTATAAAAGACTTTGTTCTCTTTTCTTCTTAGCAAGAAGAAA
AAAACGTCCGAACTGGTCAAATTCCAAAAGAAGACTGCAGAAAAAAAAGC
CCCGTCAAGATGAGATGAAGGGTAAGGGGATGCTGGAGGAGACTCCAGCA
AGGGGGTACAGGAGGAGGCTTCAGCAAAGGCTGTAGATCTGATGGAGTTT
GTTCTGAACTCACTGGATAGGCAGGCACACAGGAGTTCTGGTCAGCACAG
CGAACTGGCTTTAAATTTCACCAGACCTGCTTTGCCACTGAGTAAATGGT
GAACTGGAACATGTTGGAACCCTGTTCTGAGGTTACACAGCCCAAGGTGA
AGGGTGCAGAGTGTCAGGTTTCCTCTTTATTTATGCACACTAGGATGGAA
ACCATCCTTCCTAACTAAAGGGAGAGTAAATAAACTTTGCTACTTTGAGA
TAAGGTACAGAAGAGGCTGGGTCCTATCCCTGACAGGCAGTTCAGAGAAA
AAGCCCCCAGAAAAGCTTCAGACAGGTGTTCTCATGTCAGTGGATGCATC
TGTCCTTGGGGGAGGCTGCTTCCAAAGTCCCCGAAAGGAAAAAAGTGTTG
TGTTCTTCCCTTTCCTCTAATGAAGGGCCACTTCCTCN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 15 19 37 43 39 39 39 34 34 37 37 30 30 33 33 33 33 50 59 33 33 33 33 33 23 21 10 10 6 6 7 11 33 33 22 26 26 26 26 30 41 53 57 36
38 38 36 36 36 36 33 33 27 21 11 17 16 17 17 11 11 11 20 25 37 41 41 47 43 48 48 48 50 53 53 59 59 59 57 53 50 50 50 50 47 47 47 47 47 51 68 68 50 47
47 47 47 47 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 54 57 32 32 19 15 19 16 24 24 42 43 57 57 57 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50
50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 43 44 43 43 44 50 47 48 59 59 68 68 59 59 57 54 46 46 43 57 57 68 68 68 68 59 59 46 46 54
57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 46 43 43 43 46 57 59 59 59 26 26 13 13 12 22 24 24 24 15 24 30 43 57 57 57 57 57 59 57 53 50 50 50 50 50 57 57 57 59
48 48 48 59 59 57 48 48 48 48 46 34 25 19 11 11 12 12 12 20 25 39 39 41 41 40 41 48 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 50 50 57 48 43 42 43
43 43 42 46 36 39 43 46 47 48 48 57 46 42 39 41 39 42 37 39 37 43 43 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 57 41 50 41 50 50 50 48 48 48 53 57 68 57 57 68
57 59 48 48 43 37 37 33 33 43 43 43 43 43 39 43 39 42 36 36 43 47 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 43 39 37 30 30 37 19 19 8 8 8 13 15 31 35 35 39 31
37 37 37 30 37 26 24 20 20 20 18 18 17 19 18 26 21 21 21 18 11 11 11 15 20 22 21 14 10 6 8 6 6 6 9 11 15 25 31 34 34 39 33 28 28 22 25 23 27 23
21 15 24 15 11 11 11 10 10 8 8 8 8 15 17 11 11 9 9 9 16 23 30 30 12 12 10 19 8 8 8 15 15 14 13 15 19 19 21 26 14 12 10 10 8 8 8 8 11 9
12 11 13 10 10 8 11 10 11 10 10 10 10 10 10 9 12 11 10 10 15 21 30 30 20 20 23 20 16 18 18 10 8 10 8 8 8 18 24 19 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8
11 10 14 24 19 20 10 11 10 11 9 9 10 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 12 11 11 12 12 | Open.Hide. 9 9 9 15 8 8 8 8 8 15 20 32 37 37 41 37 37 50 33 33 44 47 53 53 41 41 37 37 37 37 27 19 11 11 11 13 13 20 28 24 33 33 33 33 53 47 50 50 53 36
36 37 37 37 47 53 50 50 50 43 41 21 20 26 26 37 26 28 28 32 29 42 42 50 50 51 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 32 27 15 11 12 12 21 38 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 54 54 54 57
54 54 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59 42 32 36 28 23 20 20 21 23 28 37 44 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 59 59 59 59 43 43 30 30 28 28 23 31 21 14 14 14 21 14 17 13 24 15 15 14 14 14 14 14 18 21 28 30 59 59 59 43 43 40 43 43 47 47 57 48 59
47 57 47 48 57 57 43 43 40 41 41 43 40 39 37 28 22 18 18 14 20 11 12 11 12 19 25 28 32 20 20 23 23 23 28 28 28 32 31 30 30 28 37 30 33 31 31 23 28 37
37 33 37 35 39 32 39 28 24 19 19 19 28 28 34 25 22 11 11 15 25 34 39 41 47 50 50 48 59 48 48 48 46 37 37 39 41 41 41 40 39 32 26 18 22 22 28 27 24 27
30 25 25 30 33 33 39 46 41 37 37 25 17 14 14 19 23 22 28 30 32 35 35 31 29 28 24 20 22 20 23 23 34 34 48 43 47 39 33 28 24 24 28 29 29 29 29 19 15 10
12 12 15 12 20 25 22 22 25 25 33 23 16 8 8 8 8 15 16 10 12 12 9 10 14 12 12 15 14 19 15 15 8 8 8 8 12 12 12 12 22 23 15 11 11 11 11 9 9 9
9 19 10 12 12 12 16 16 15 16 16 15 15 15 10 9 9 10 10 9 10 11 13 10 12 10 14 11 11 15 15 15 14 10 10 10 10 10 10 10 13 10 10 9 9 9 13 9 9 8
8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 17 15 15 17 19 19 11 11 8 9 8 10 8 8 9 9 12 19 31 34 17 14 9 9 13 10 23 15 21
22 23 20 18 12 12 9 9 13 10 10 9 16 10 9 13 10 10 8 9 11 11 13 9 9 9 9 10 10 10 10 9 9 10 10 10 3 0 |