BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-261P09.T7 (MSMg01no261_p09.b1) | MSMg01-261P09.TJ (MSMg01no261_p09.g1) |
ACC | AG404196 | AG404197 |
length | 728 | 724 |
length of high quality (start - end) | 536 (70 - 605) | 580 (77 - 656) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no261_p09.b1 PHD_FILE: MSMg01no261_p09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:58:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no261_p09.g1 PHD_FILE: MSMg01no261_p09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:58:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCAGAAGATCCGCGG
AATTCACCGAAGTCTCCACCACAGACGTTCTCAGATGGTGCTAATAAAAA
GAACAAACCCAAACCAGAATTGGCGGTCCACACTGTGAGAGTTGCTAAAC
GTCATCACAAAGCAGTAATTATCCTGTAGCATGCTTGGTGGCTCAACATC
CTGAAATGCAAATGTCAAGGGCATACAGTCTCTGCGATGTTGCTAATGGG
AGCTCATGTTTTGTGTTGGGTGGTCCTGTGTTCTGCCTGGTGGTCTTGTT
TCTGCTTGCTATGACAGCGCTAATGATTTCATGTAACCCCCTCTCCATCC
GACATAGTATTCACTTGTCTCCCTTTGGTAATTCACAGCCAGTCATAAAA
GACAGACTACCCAGAAATGACACTGCAGTGTTCCAGACATGCTCTCTCTT
GGTGGTGACAGTTCCAAATCAAGCTGGCTCAGAGCTTAAGTCAAAGCATT
CTTCTACGTTCTGGTTCAAAAATACAGTCTTAGATCTGGAAAATCAAAAC
TGGGCTCCGCTTGCCTCTTCCATCATTGCTTGTAATAAATATTCAACTCT
CGGGCTTCAGCTGGCCATTTATGATAGATGACACATAGATAGATCCAACT
CTCTTTCTCTCAGATGTAAGAAACTTGTCTTTTGGTTAAAAAGAATTCAC
TACCTTTTGCTAACCGAAGGCAGATCAT
| CCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCT
GAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAGCATCCTTAATCATCAGGGAAATGCA
AATTAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGCCAGAATGGCTAAGA
TCAAAAATTCAGGTGACAGTAGATGCTTGCGAGGATGTGGACAAAGAGGA
ACACTCCTTCGTTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAA
ATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATC
CAGCAACACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTCCCAACCGGTAAG
AAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAACCAG
AAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTAAACAGAGGAATGGATACAGAAAA
TGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAA
TTTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAG
TGAGGTAACCCAATCACAAAGGAACTCATACAATATGTACTCACTGATAA
GTGGATATTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTT
GCTAAACGCATGGAACTCAAGAAC
|
quality values | Open.Hide. 7 7 10 8 8 8 13 15 36 39 34 39 39 39 37 37 44 23 23 25 26 28 28 39 48 28 28 28 25 23 19 23 9 10 11 12 12 9 9 11 10 10 10 15 17 22 32 41 41 31
31 31 31 33 33 37 30 27 23 18 9 9 9 11 12 12 11 11 11 22 22 34 28 36 36 43 43 48 53 53 53 50 50 50 50 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 53 53 41 37 37 22 22 27 23 22 10 8 8 8 8 10 25 30 42 47 47 48 48 48 39 39 39 31 31 39 43 47 47 59 59 57 57 57 50
50 50 47 47 47 43 43 57 59 59 57 57 59 54 54 54 54 54 68 68 68 54 54 48 48 36 36 40 40 44 36 44 47 57 59 59 68 59 59 54 54 54 59 57 57 57 57 57 68 59
57 57 57 50 51 47 57 57 57 57 57 48 57 50 57 57 54 50 57 50 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 57 57 52 52 57 52 57 57 57 68 57 57 57 57 52 52 52
52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 59 45 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 57 44 43 35 35 35 43 43 57 57 57 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 44 35 31 35 35 35 35 35 35 43 43 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 52 62 52
52 52 62 44 62 62 62 39 43 44 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 34 26 26 31 35 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 68 57 57 57 43 43 39
39 43 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 45 45 45 43 43 45 43 43 43 43 29 43 23 23 18 23 23 33 43 43 57 43 43 35 35 32 32 23 28 28 43 44 57 57 57 52 43 43
27 27 19 22 17 24 27 43 43 43 37 43 50 50 43 43 43 50 50 43 35 35 35 39 39 37 43 43 41 41 17 17 17 30 29 39 44 44 37 42 30 42 42 43 44 44 43 43 44 57
57 57 48 47 39 39 43 32 32 20 24 24 32 26 36 39 46 48 57 48 48 43 32 32 20 20 20 28 32 34 34 20 20 20 32 32 43 40 43 43 43 43 39 47 35 30 28 33 30 33
28 30 20 20 30 21 22 23 28 20 33 37 35 28 35 43 39 39 37 37 37 37 37 30 36 33 33 28 33 37 37 37 28 28 21 21 9 10 11 12 14 20 30 30 25 28 34 34 37 34
28 21 14 14 12 22 13 13 11 12 12 15 11 10 8 8 10 19 32 37 43 36 36 24 25 11 10 10 17 17 21 15 12 12 11 11 6 8 6 6 8 8 10 16 23 22 24 24 30 22
29 28 25 17 15 9 9 9 11 11 11 11 11 9 9 9 10 13 9 10 12 21 19 25 28 28 28 32 37 39 41 31 24 14 14 17 23 17 20 17 17 12 10 9 8 8 8 11 18 28
26 21 19 19 19 21 11 11 10 10 10 14 10 10 10 10 11 12 12 12 18 12 13 13 22 22 22 17 | Open.Hide. 6 6 6 6 13 10 10 9 10 17 23 37 39 39 41 47 47 47 41 50 41 53 53 53 50 50 50 50 47 37 34 23 12 9 9 10 9 9 9 9 10 10 21 19 34 32 39 44 36 36
36 36 36 50 53 57 57 57 57 43 41 22 22 28 19 23 10 12 12 24 19 42 42 42 42 47 68 68 68 68 51 68 68 68 68 50 51 50 50 50 51 68 68 68 68 57 57 68 59 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 48 48 48 48 48 50 47 47 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 50 50 68 68 68 50 50 57 50 50 50 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 43 35 35 35 35 35 57 57 57 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 54 52 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 57 57 48 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 68 59 59 59 59
59 59 59 54 54 57 57 54 54 54 48 48 48 48 48 47 48 48 48 57 57 59 59 57 44 39 39 35 39 39 39 39 41 41 39 39 39 39 30 31 37 37 37 37 41 37 43 32 35 35
39 39 39 39 43 43 57 57 57 57 57 40 40 36 32 32 34 34 43 57 57 43 39 35 35 39 39 43 43 44 43 40 46 41 39 39 39 30 25 25 27 27 32 44 44 47 47 37 37 37
37 37 37 44 44 44 32 32 37 37 37 37 47 50 47 47 39 39 35 32 29 37 22 22 28 24 22 22 32 39 39 39 32 36 39 39 34 37 41 44 44 47 42 59 59 48 46 34 34 34
34 39 47 34 28 20 20 23 22 26 28 39 39 41 36 30 30 30 30 29 27 37 29 32 41 41 41 59 25 23 10 10 10 20 28 37 36 37 47 39 48 37 37 37 37 37 36 33 29 28
20 20 18 21 24 25 25 19 25 24 24 21 18 19 22 27 22 27 30 37 26 21 13 13 16 25 28 32 27 23 24 15 12 15 16 19 19 21 22 19 11 8 10 10 11 9 14 14 18 24
23 28 28 22 22 30 22 20 18 12 10 9 9 9 15 25 25 28 28 22 21 16 19 19 |