BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304A04.T7 (MSMg01no304_a04.b1) | MSMg01-304A04.TJ (MSMg01no304_a04.g1) |
ACC | AG429430 | AG429431 |
length | 1,336 | 1,297 |
length of high quality (start - end) | 765 (86 - 850) | 677 (83 - 759) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_a04.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_a04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_a04.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_a04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:05 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNCCCAGTTTNNNNNNNCCAGTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTACCTTTCTGCTTGTGTCTCTTGAATTTCTTTAAGGGAG
TTGTTTACATCCTTTTTAAAGACCTTTCATATCTTCATGAAATATGATTT
TAGGTCAGAATCTTGCTCTTCGGTTGGGTTCCGGCACCCAGGATTTTCTG
TGGTAGGAGAACTGGGTTCTGATTGTACCAAACTGCATTACCTGTGTCCC
TCTGTTAGAGCAGACCTTCTGGGAGACAGACAGCCTATGGGGTTCAGGTC
AGTGTGCAGGCATGTTGGTCTGACATGGGTGCAGATAGAAGTGCAGACCA
GAAGGGCTCAGGTAGAGTAGCATAGATCCCATGTTTGCTGGGCTCTGTGG
GGTTCAAGCTACTAGGTGTATTAGTGTGTCTTTTTCACCTGTGTCCCTGG
TTAGGGAAGACCTCCTGGGAGACAGGAAGGCTTTGGGATCCAGGGGCAGG
CTTGCTGATTTGCCTAGGTCATAGGTGAAAATGTAGACTGGAATGGCAAA
GGGGAGAGTATTAAAATTCTAATAGTCCAGAGTCAACAGTCTAAGAGAAT
TTTGGTTATTGGAGTCTGACATTTTACCAAGACAATTTTAAATAAGAAAA
TTGAGACTTTTCTATCAAAGGTATTAATTTGAAAAGATATTGATATCTCT
TCATGATTTTAAATTCATTCTGAAGATTCTTGATTATTAAAGTACTGAAT
CAGCATATTTATTATTATTTTATCAGAACAGTGATTGATGTTTAAATGGG
CTTCAGTCCTTATTTTATTAGCTTTGACTTANAAAATATTTTATGATCCT
TTTTCAGGAATTCAGACACCAAGCCATGTGGTATGCTATAGCTTCTACTC
CACATGATTCCCTGGTAACATCATCCTCCTAATAGAAATCTTTCCTCTCC
CCCCCCTGGGGACTTTACCCAGAACAATTATACACCAGACCCTCTGTGGG
GGGTTGTTTAAGAAATAAGCGGTTTTCCCCCACAATTTATGCGTCCGGAT
ATATTTCTAATACTCCTTATTAAAAAAATTTCCTTTTCTTTCCCCAAAAA
TGTACCAATTTTTACCAACCAATCTTAAATTTCTCTTTTTGGACGCTCGT
TGATTCTGTATCCATCTATTAATTTATAGTCTTTAATTTTTTTATACCAT
TCTTTCTCTTTTCCTCTTTTTATTTCCACTCAATCTCTTACTTTACTACT
TCNGCATTTCCTTTTTCCTTACGTGTTCTCTNNCTCNTCACCATTTTTTT
TTTCTTATACATGTTCATGTATCTACTTCCGCCTTA
| NNNCCATTTCTNNNNNNAATGATGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTCTCAATTGAAGAAC
AGAAAAAGAAAGCTTGGTACATTCACAAAATTTAGAATTATTCAGTTGAA
ATATATATATATATAATCATTAATTTTTTAGGTAAATGGATACAACTAGA
AAAGGATCATCCTAAGTAGATTATCCAAATCCAGGGGGGAAAATGAAGTA
TGTGTTGGGGGTTTGAGAGTTACCGTGCAACCAAAAATATACCAAATTCA
GTAAAGCAAGAATAGTTTATTGAATGCACACTAAAATACTTAATATACAG
GTCCACAAGAAGTAAAAACTCAATTGTAGTGGCAATCTGTCCTCAGGGCA
AACTTTTTATATGAAAAAACAAGGTCAAAACTTTGAAGGCAAGCAGAAAA
GGGGTACTACATTTTTTACAACTAGACAAAGTATTATCAGCTAACCTTTA
AACTTACTGGTCCTGAGTGAGGTAAGAAGGCAGGTAGAGAGATGGTGAAC
AGAGGGATTTCATAACATTAAAATAACAGGGTATAAGGGATTCATCATAA
CTTTTTAGCTTATTAGTAGCATTTTTTGGTGTCTGGTAACATAATAGCAA
TAAACTAAGTTTCACCTTGTGAGTAAATTGGAGTCTGTTTCCAAAATGGC
TACAGTTATCTTAAAAGGAACAGACCTCAGCTGCATGTATTCATTTATAA
GTGGATGTTAGCCATTAAGTAAATGAAAACCAAGCTAAAGTCTGTACACC
TAGAGAGATTATACAAGGAAGAGGAAGTTTGGATCTTCTTGTAGAAGGGA
AAAAAGAATAAATTTTTTCCCTAAAAAGAGAGCTGTTGTGGCAGGGGCCC
AAAAAGTGAATAACCCCCTGTGAGACAGGATTTATATTGTAGGAAATCGT
ACCAATGAACCAATGGGCCGGGCTGTTTTATGTTATGTGGGAAACCTATG
CCGCGAAACTCCCTACATCTTGATGACCACATTGTGTTTTATTTTTTCCT
TTTNTTTTTACTTCTTTTGTTCTTTCATCTTTTCAAATCATCATCTTCAC
AATTATTTTTCTTATCTTCTTGTTTTTTCATTTGCTTTACTTCTTATTTA
TTCTTAATCGACAATTCTTTNCATAAATTTATACTNTTCTCTNCTTTATA
NTATACNTCTACTATTNTTCTTCNNNCTATAATTNCCTTTATTTCCTATT
TCTCCCTTCTCCCTTCATACACNCTTATCTCACATATTATCCTTGAT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 3 3 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 15 8 8 8 12 8 8 8 21 21 24 30 30 33 33 42 48
50 53 53 50 50 50 50 42 42 42 36 36 36 36 36 53 53 44 50 39 37 31 25 22 21 10 8 8 8 8 8 9 15 11 11 21 25 33 33 33 31 31 31 33 36 36 53 53 53 53
53 53 53 42 42 38 38 36 36 33 44 39 37 47 25 21 17 10 10 10 19 21 28 37 33 33 33 31 31 36 36 36 36 53 53 53 53 53 57 57 53 53 53 53 53 53 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 57 52 52 43 43 35 38 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68
59 59 59 59 59 59 57 50 50 36 43 43 57 59 59 59 57 57 57 41 41 37 39 39 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 57 57 37 44 44 57 57 57 59 59 59 59 54 57 54
57 57 59 54 54 46 46 43 48 43 43 43 48 43 59 43 43 43 59 47 47 47 43 43 43 43 43 57 57 57 47 59 28 28 20 31 24 39 39 46 41 43 43 44 41 37 44 43 47 43
47 46 41 44 35 36 35 35 35 37 39 43 43 47 59 47 59 43 43 43 47 42 48 46 48 48 48 48 32 37 23 20 20 32 32 43 48 43 43 43 43 43 47 30 30 17 17 17 32 32
48 48 59 46 41 34 34 34 34 35 31 32 41 41 41 41 39 39 35 30 30 39 59 44 57 39 39 35 35 35 39 39 35 35 39 59 59 59 48 46 46 59 36 47 41 43 37 35 37 37
37 37 37 39 39 35 39 39 48 59 57 48 48 47 39 35 35 37 37 40 40 41 41 41 41 37 41 44 59 59 59 47 47 59 43 43 39 39 39 47 47 47 48 48 48 57 57 59 48 47
47 43 43 39 43 37 43 43 44 44 53 53 50 48 48 39 43 43 59 57 57 57 57 37 37 28 37 37 48 48 48 41 41 41 41 41 43 41 37 37 43 59 59 59 59 59 59 48 48 59
48 48 48 57 37 37 43 43 48 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 47 47 37 37 30 22 24 24 25 30 27 30 30 37 37 37 37 41 41 41 31 31 37 29 31 37 37 31 37 37
41 39 37 28 28 25 34 38 38 24 31 27 28 27 28 26 32 25 21 10 10 10 21 25 37 37 28 24 12 13 3 0 3 11 11 11 15 17 31 30 39 39 41 37 37 30 25 19 20 17
17 22 19 11 10 11 11 9 9 9 8 8 8 11 11 11 16 14 20 9 9 9 10 10 8 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 10 11 10 10 10 10 13 17 12 18 18 23 12 15 9
6 6 6 10 10 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 13 9 9 9 14 14 10 10 8 14 8 8 12 10 9 9 9 12
14 11 11 13 13 15 12 11 8 8 8 8 10 9 9 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 10 8 8 10 8 9
8 8 7 8 8 8 8 11 10 10 10 13 7 7 7 6 8 8 10 10 10 10 10 9 10 13 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 7 7 7 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 11 11 13 15 10 10 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 11 9 8 8 13 8 8 10 10 10 10 18 18 9 10
10 8 8 8 10 8 8 6 6 8 19 19 10 7 6 10 10 8 8 9 7 10 8 6 6 6 8 13 16 11 11 10 10 9 9 9 15 11 6 6 6 8 6 6 8 6 7 10 10 12
10 9 9 10 11 8 8 8 8 10 19 23 10 10 10 11 12 10 10 9 9 9 10 12 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 11 18 10 8 6 6 6 6 8 17 13
19 19 19 17 7 7 8 8 8 12 11 11 9 10 9 16 13 8 8 8 8 8 8 11 18 9 9 9 12 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 9 9 9 10 8 8 8 9
9 3 0 3 8 17 10 9 13 9 9 8 13 7 7 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 6 3 0 0 3 8 3 0 3 15 21 23 19 16 9 8 8 6 7 9 9
9 9 9 15 22 22 16 13 19 12 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 3 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 7 8 12 13 7 6 6 6 8 7 8 13 15 20 25 24 31
31 31 29 28 22 22 25 28 32 35 37 37 37 37 37 35 35 36 36 36 36 53 41 50 50 50 37 41 28 23 12 10 10 10 14 11 10 10 16 13 26 28 33 33 33 33 36 53 53 53
53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 53 53 36 36 33 31 31 31 31 30 21 15 8 7 7 8 10 18 31 41 37 37 41 37 39 39 47 47 50 50 50 50 47 50 50 57 57 57 57 53
53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 50 50 51 51 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 41 35 39 39 44 43 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 45 62 43 43 35 35 43 59 62 62 62 62 43 35 35 39 62 43 52 43 43 43 45 45 62 43 52 43 44 43 43 43 43 43 52 57 52 57 52 57 52 57 57 57 52
52 59 57 57 57 52 52 43 43 35 43 43 43 43 43 33 33 33 43 43 43 35 44 44 35 35 35 42 42 38 57 43 57 44 43 24 24 14 27 24 37 37 43 43 42 44 43 59 43 52
43 43 28 32 32 44 43 43 43 43 23 23 32 43 43 50 50 50 46 43 43 59 57 50 50 47 47 47 44 57 43 43 37 43 43 47 47 46 57 43 42 42 35 35 35 42 42 48 57 57
54 54 59 59 44 44 30 30 30 40 44 37 29 28 21 18 26 28 30 30 37 42 46 57 59 59 43 43 28 28 20 23 23 30 30 30 30 30 43 40 47 40 43 43 59 47 48 48 48 48
59 59 59 59 46 43 43 41 41 36 36 32 32 32 32 37 32 34 25 25 25 34 30 35 39 39 41 41 41 37 32 36 36 36 32 32 20 23 23 28 28 25 22 22 34 34 39 34 31 37
35 47 37 37 31 28 24 34 34 41 37 32 27 29 37 37 37 37 37 37 37 37 37 35 31 31 34 32 28 28 30 30 20 17 17 30 22 23 28 32 32 30 30 28 34 32 37 28 24 24
31 31 25 30 28 32 20 15 15 28 29 31 16 18 15 15 13 16 23 30 39 47 30 34 28 22 19 28 27 24 22 25 37 39 43 17 10 8 8 8 17 23 37 37 18 18 11 11 11 20
20 13 21 22 22 12 24 21 15 13 11 11 11 17 12 19 16 16 16 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 10 11 15 16 11 10 10 11 8 8 8 9 10 15
17 17 11 8 7 7 9 8 6 6 7 7 6 8 12 15 10 10 9 9 9 9 9 9 14 9 9 9 9 7 7 8 8 8 8 8 8 9 11 11 16 13 8 8 6 8 8 8 8 12
24 25 18 14 9 9 9 12 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 12 10 10 10 10 10 19 17 23 11 8 8 8 6 6 8 19 13 12 11 8 8 7 7 6
8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 19 19 21 18 16 11 9 10 10 11 11 12 8 8 8 8 10 25 10 9 9 9 10 8 8 10 13 10 8 8 8 9 12 23 9 8 8 10 17 19
9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 8 9 12 11 10 8 8 6 6 8 8 11 11 8 12 15 10 10 10 9 9 8 17 12 12 8 8 10 10 10 8 8 10 15 11 10 10 8 6 6
8 7 3 0 3 9 9 9 9 9 11 8 8 6 6 8 8 9 10 11 11 16 9 9 9 10 10 16 13 20 20 15 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 9 10 15 12 8 8 6
6 8 8 8 6 6 8 8 10 9 9 9 15 13 11 9 9 9 12 15 8 8 8 8 10 10 9 8 8 7 7 8 22 22 15 17 8 10 8 8 7 7 7 7 8 8 9 12 10 11
11 9 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 11 7 7 7 3 0 3 7 7 15 14 25 15 11 6 6 8 8 8 3 0 3 6 6 8 8 3 0 3 7 8 8 6 6 3
0 3 8 8 7 3 0 3 10 10 10 14 9 9 8 3 0 3 6 6 6 8 3 0 0 0 3 13 9 8 8 7 7 3 0 3 7 7 9 7 7 8 15 8 6 7 7 7 6 8
10 10 9 10 10 11 11 12 11 11 11 11 12 11 8 8 8 8 15 8 8 3 0 3 6 8 6 7 8 21 17 22 17 15 10 8 8 6 8 6 8 8 6 6 6 6 6 |