BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305F08.T7 (MSMg01no305_f08.b1) | MSMg01-305F08.TJ (MSMg01no305_f08.g1) |
ACC | AG430338 | AG430339 |
length | 1,299 | 1,274 |
length of high quality (start - end) | 424 (33 - 456) | 703 (86 - 788) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_f08.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_f08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_f08.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_f08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:08 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NNNCCAGTCAATCGCGCTATAGACTCCTATGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CCACAGACAGTGCAAGGGCAGCAAAGATTAATGCAGCCATCCCTATGCCT
GTCATTTGATCACCACAACAAAAATGTCTTCAAAGACAGAAACTGCAAAC
ACTCAGAGACAGATACCTCCACCTACTTATATGACAGGCACTGAGCCAGT
GATTAACCACCCTATTTATTCCCAAAAGACACAGCACACTGCTGGTATCA
CTAGTGGACTTGCCCAAATGTCACAGGAGAAATGGTGCTTTCTTAGGACA
TCTGCAGGAGCAGAAGTAGCCCTGACTGAGTCCCTGTTGGGGGCATCACA
CACCTTCGTCTCATCTTTTCTATTTTTATTTTGAATTATGCATGTATGAG
TCTGTCTCAGTGTGCTTCCTACACACAAGTACAGTGTCCATGGAAGGCAG
AAAATTTTGTCTGACCCCCCCCCTGGCATGAGAGGCAGTTGGAAAAAAAA
GGATAGGTGCTGGGGACCCAACCCATGCCCACTACTAGGGCAATATGAGT
GCTTAAACCTGGGCCATCTCTCCTATCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGANANANANANANANNTNTNNNTNTNTTNTTATTT
TTTTTTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTNNTTTTTTTTTTTTTTTTTT
NTTTTTTTNNTNTNTNTTTTTTTTAATTTTTTTTTATTAATATTTNAATA
TTATTTAATTTTTTTATTTAAATAAAAATTTTTTTTTTATTATAATTATT
AATATATTTATTTTATTTTATATATTTTTTTTTTTAATAATATNATATAT
TTATTTTTTTATTTTTTTATATTTAATATAATNTAATTTTTTTTAATTTT
TTTTTTTATTTTTATTATTATTATTTTTTATTATAATTATTTATTATATA
ATTTTTTTTTATATTTTTTTATATTTATATTTAATATATTTATTTTATTA
TTTATATTTTTATATTTATTTATTTATTATATATTATATTTTTTTTTTTA
TAATATTTTTTTTATTTATATTTTTTATAATATATTATTATATATTTTTA
TTATATATATATTATTTTTATATTTATATATTTAATTTTTTTANTTTATT
TTTTATATTATTTTATATATTTTATATTAAATATNAAATTTNTTAATTTA
TTTTTTAAAANAATAATATNTTTNTTTTTTTTTTTTAATAATTATTATTT
TATTAATTATTTATNNTNTTTTNAATTTTTTTAATATAAATACACATTG
| NCCCACTATTNNNNACCATGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAAAACTGTCCTGACTCCCAC
TCACTCTGGTTAGCCCCCTTGATTGCTTCATGAAACATACAGCTGTTGCT
GGGTTATGGCAGGAGCTGTCCAGATGTGCTATTTACTAACGATGGTAGCC
AGATATAGTCCTCTTATCTCCCCATTTTAGTACTAACTTGGTGAGCAGGG
AGAGGAGATGATAGGCAGAGCTGGGTGGATCAATTCGAATTTATCTGTAT
GTCTGCCCTGCTTCATTTCTCCCTGACAAGAGTGATTTGTGTCTGTAGCT
GATAGAAAAGCCCAGATAGCTCTAGAACAATCTGAAAACAATACAGGAGG
TGGAGAGATTCTACTCCACAGAAGTAGAGATGAAAACACCTCAAGGAAGA
GAAGATAAGTTTGCTCTCCCTGGCATCAGTGCAGAGACTTTGATGGTGTG
GGACTGGGAGGGAGCCTGCAGTGAACTGTCCATGGTGCTGAGACTAAGTT
TGTGATCAAGCCTGCAATGGACTGAAGGGGTTGATGTAGATGACCCTCTT
AAAGTTAGAAATGAGTCTGAGGTGAGAGACAAAGGACTTGTCCAAGTCCA
TTTTGGTCAAAAGAAGAGAAAACGTGGACTCGGGTCTTTGCCCAACACTC
TGGGTCACCTTCTTGTACCATCACTGCTGGGTGACACCCTGTGTGTGGCA
GAGATTGTATCCACTCTTGAGAGTCTGCAGGTCAAGGCAGCCAGTCTTGT
AGTGGCCCAGGGCTCTGGACCTTGTTTCACCTGCAGCATCAAAATTCTTG
TTACTCTCTCAGACACAGTGAGTAGATAGGAAGCATCTTGCGTAGTAATT
CCCCTGAATACACTGTTTTAAAACTAAAATCCTTGTTTCCCCTCTGTGGG
AGGGGGGAGCACCCCGCAAAAAAAAGGCTTCCCCCCACATGGTTTTCTAA
GGAAAATCCTCCCCCTGTTCTCGAAGCACTTGGAAACTCTAAAGGTTAAT
TTTTCTGCCCTACCTCTTCCTTTTTAACCCATGTTCTTCCTCCTGGAGAA
ATTTCATCTGATTTTCTCTCAAATCACTCGGTTTGGTGGTGGATTTATCT
ATATTCTTGCAACCAATTTAAATATTCCCCCCATCCCTGGGGTTTTTTTG
CCTGAACGTGCCGTATACTATATACTTTTCACTTTTCTGCTTATCACCTA
CTCGTCCTCAACTTTCGCTTATTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 6 8 8 6 8 8 13 12 14 10 10 8 8 8 10 15 9 8 8 10 8 8 8 21 19 28 28 28 28 36 37 37 40 47 47 50 50 50 50 50 50 42
42 36 36 30 35 47 53 36 35 31 31 31 30 33 37 21 14 9 9 9 9 13 21 25 37 39 37 41 41 53 53 53 59 59 59 59 57 53 53 53 50 42 37 36 36 36 38 38 36 36
33 33 33 37 42 39 34 17 14 10 10 10 17 23 39 59 59 59 59 59 59 39 39 32 39 30 30 30 34 34 47 48 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 68 68 68 57 57 30 30 12 12 12 24 32 35 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 41 41
12 23 15 21 17 17 12 23 12 26 34 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 50 59 50 46 46
25 24 16 12 12 12 13 9 11 11 11 11 11 8 8 8 9 11 10 14 12 11 11 12 12 18 27 34 42 50 50 48 43 43 37 37 34 34 28 32 26 21 19 23 14 12 12 10 10 10
10 15 13 13 15 24 30 41 59 59 59 59 59 37 37 30 37 39 47 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 47 47 39 39 39 59 59 68 59 59 59 59 59 48 48 48
48 48 54 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 54 59 57 59 59 59 57 57 57 59 48 47 43 43 43 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 37 25 23 19 15 3 0 3 0 3 0 3 0 3 0 3 0 3 0 0 3 0 3 0 0 0 3 0 3 0 3 3 0 3 9 10 10 9 9
9 9 10 9 9 8 6 6 7 6 6 7 9 9 9 12 9 9 8 8 8 8 9 16 10 10 10 9 9 3 0 0 3 10 9 10 10 10 8 9 9 9 10 15 11 8 8 10 9 3
0 3 16 15 18 9 9 3 0 0 3 0 3 0 3 0 3 7 11 13 20 16 16 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 10 8 8 8 15 11 7 6 3 0 3 6 8 11
8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 7 8 8 6 6 6 10 10 8 7 7 8 9 9 9 9 12 12 12 12 13 12 9 8 8 8 10 10 10 8 10 8 8 10 8 15 15 19 17
15 10 8 8 8 6 6 10 10 12 10 13 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 13 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 3 0 3 6 6 10 10 10
10 11 12 13 15 15 14 14 10 10 8 6 7 8 8 17 18 10 8 8 8 8 12 12 12 9 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 9 11 17 9 9
9 15 15 21 21 10 10 6 7 8 6 6 6 6 8 8 10 11 8 8 8 7 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 13 8 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8
9 9 14 10 13 10 10 10 8 8 8 8 15 15 24 24 12 13 7 6 8 8 8 7 10 11 10 11 9 9 12 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 13 10 10 8 8 8 8 8
12 13 9 6 6 8 10 8 8 9 10 18 10 10 10 13 10 13 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 10 8 9 10 13 11 13 8 13 7 6
8 8 10 9 9 9 9 11 11 13 13 11 9 9 9 9 9 8 8 6 6 10 15 13 7 6 6 8 8 8 8 9 9 12 12 10 8 8 8 10 10 16 15 9 9 9 9 9 10 11
8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 10 8 8 7 7 8 8 13 10 8 8 8 6 9 8 8 8 11 9 9 9 9 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 8 8 13 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 10 15 8 6 6 6 8 8 10 17 10 10 10 10 10 3 0 3 12 12 12 12 3 0 3 8 8 6 6 8 8 6
7 9 9 9 7 6 6 8 8 3 0 3 6 7 10 8 8 8 3 0 3 9 3 0 3 17 17 24 16 9 8 7 6 8 10 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 12 8 7 6
8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 3 0 0 3 0 3 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 6 8 8 13 9 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 8 6 6 6 6 7 7 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 13 8 8 8 11 8 8 9 9 16 12 19 19 15 9 9 9 21 19 21 10 10 19
24 35 35 35 37 37 37 35 34 35 38 38 36 36 41 41 50 50 47 41 30 27 12 9 9 9 10 10 13 11 12 15 18 20 16 16 26 30 31 36 53 53 38 42 42 42 43 42 50 50
50 50 50 50 36 36 31 31 31 30 28 25 31 27 25 19 15 11 11 11 21 15 28 28 33 33 33 33 36 39 39 43 43 48 48 47 47 53 53 53 47 50 50 50 50 50 53 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 68 68 68 57 23 23 11 11 11 24 26 44 44 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53
53 48 39 30 22 12 10 8 8 8 8 8 8 15 28 32 36 47 46 48 50 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 48 48 59 59 48 48 57 57 68 68 68 68 68
68 57 50 47 43 46 46 43 43 43 59 59 48 54 54 57 57 59 59 44 42 30 28 28 42 36 42 44 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 59 68 68 68
68 68 59 59 59 59 57 57 59 44 44 33 30 28 38 38 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 42 48 44 57 48 43 43 47 47 47 57 48 54 46 59
59 44 44 30 24 24 34 34 57 57 57 59 59 59 59 54 57 43 43 32 32 32 43 44 47 47 43 43 43 43 43 57 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 37 35 31 29 34 28 28 28 41 41 41 41 41 39 29 32 32 37 37 37 46 41 59 47 59 48 50 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48
47 59 59 59 37 37 32 29 31 37 43 47 47 59 37 25 15 10 10 10 22 26 47 47 47 47 48 48 48 59 59 39 39 39 39 37 37 37 41 30 27 14 10 10 23 25 37 32 37 21
21 11 11 11 14 14 27 34 47 39 39 36 37 37 37 37 48 30 30 28 28 28 37 34 41 47 47 37 37 28 30 33 33 28 31 28 24 21 17 11 11 11 18 18 20 24 19 24 12 12
11 18 14 16 17 14 13 17 20 18 19 28 27 30 37 37 9 9 8 8 8 10 21 16 18 22 17 11 8 8 8 8 9 11 12 15 15 12 12 12 21 24 37 25 23 18 23 18 21 24
29 25 27 25 20 26 28 19 15 10 9 9 9 9 9 11 11 9 9 9 12 10 10 7 8 7 10 8 12 18 11 8 8 8 8 8 12 17 13 6 6 6 8 8 8 13 6 8 8 8
8 10 11 20 17 16 11 8 8 8 8 8 8 11 12 10 10 10 10 9 8 8 10 10 10 15 19 11 9 11 8 8 10 10 8 8 8 8 12 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 12 13 22 16 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 19 18 14 17 20 10 6 6 6 8 8 8 8 10 10 15 12 12 8 8 8 8 8 8 10 11 12 15 10 12 8 8 8
8 8 8 10 8 10 8 6 6 6 6 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 12 11 10 8 8 8 8 8 7 7
8 8 8 8 8 8 12 10 8 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 13 13 15 15 15 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 10 15 10 10 9 9 9 9 9 10 9 10 10 10 10 16
19 21 13 8 12 8 8 8 10 8 6 6 8 10 17 12 12 11 11 11 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 9 10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 11 13 15 19 11 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 7 6 6 8 8 10 13 10 10 11 11 12 15 10 10 11 8 13 8 8
8 8 9 8 8 10 9 9 9 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 15 8 8 6 6 8 8 18 18 10 8 7 8 8 8 10 10 7 9 11 12 8 8 8 8 8 8 8 11 8 7
9 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 9 11 8 8 8 6 6 6 8 8 6 |