BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313F11.T7 (MSMg01no313_f11.b1) | MSMg01-313F11.TJ (MSMg01no313_f11.g1) |
ACC | AG435296 | AG435297 |
length | 1,309 | 1,296 |
length of high quality (start - end) | 727 (87 - 813) | 379 (73 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_f11.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_f11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_f11.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_f11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:55 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (168,253,881 - 168,254,607) | (168,111,094 - 168,111,472) |
---|
sequence | NGTATTTNNNNNNGGCACTGGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXTGGGTATCACTTAGATAGTGTATAAGAAAGCCAG
CTCGGTCCTGACAGTGTTTTAAAGAACAGTGTTCCTCTGCAGTTTCTGGC
TCTGTCTTCCTCTTTTGAATTCCTTTTCTGATTTCCCTCAGGGATGGACT
GTGATCTGGAAGTGTAAGCAAATAAATTCATTCCTGCCCTAAGCTGCTTG
CAGTCTGAGAGTTTTATCCCAACAGAGGGGAACTAGAACATAGCTCCTAA
GTCTACATATCCAAAGACTGTAACCATGACATTCAGGATTAGTGTTCTAA
CATGTGAATAGAGGACCAGGGTTGCAGGCACAAACAATCCACAGAACAAG
AGAAATAAAGAATTCTCCTGAAGAGGGAAGGCACCTTGCCCAACATCCAG
TATTTTTCTCATAATTATCTAGAACAGTGATTCTCAACCTTTCCAATACT
TCAACCCTTTAATACAGATCCTCGTGTCGTGAGTTCCCCCTCCAACCATA
AAAATATTTGTGTTGCTACTTCATAACTGTAGTTTTGCTACTGTTATGAA
TCACAGTATAAGTATTTTTGGAGATAGAGGTTTGCCAAAGGGCTCGATCG
AGATGCACAGGTTGAGAACCTTAAATCTAGAGCCTCTGGCAACAAAGCAG
AAAATTAATACAGTAGAACACAGTGTCTGCAGTGGGAGAGGAGACATGGA
GATACTGGAGCGATCAAGGAAAGACACTAAAGGTCTTTTCTAACCAAGGT
GGCGGCACAGATGGGTTTATAAGTCCAAAACAAGTGAAGCCTAGAAGTTG
TCCCAGGCTTTAGTGGGATTTGTCACTGAGCTGCAGTGGAAATAATCTCT
CTGGTGCCCTGAGTGAGGATGCTCTGTCTGAGAAGTCTGCCAGCAGATCA
AACTTGAAAAGCTGCTTTTTCATGCTTTTATAACCCCGGAGAAAAATATT
GATGCCCCATTATAAAACTGGTATTATACATGGCTTTTTGGTTTGATTTT
CCCCATTCCTATTAAAAACTTTTCCTCCCTTGGTAACAATGTTTTTTTCT
CCACTGTTTTAAATTTTTTCTTCTATCATATTAATTATTTAATTATCCAC
TGTCCCTCTTCAACATTATTTTTATCTTTCATATGTTTCTACATACTCTT
TATTGTCTCTCCTTCTTCCTTCTACTCTCTCATTATATTTGTTCTACTCT
TCCTCATTCTTCTATCATAATCTATCATCTTCATTTTTCTCTTTCCTCTC
TCTTCTCTC
| NNNNGGCTGTGGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTACTGGTTGCAGACCAAGTTAAACTAAA
CTTGGCCTGATTCCTTATGTAAGAAGCTACAATCTAACTCAACAAGTAAA
TAAATAGAAAACCTAACAACTGAGGAATTGGCCCTATAAGGAATAGCTGG
ATCCCAGCCATTTACAGCCATAGGCATTGGCCAATCACAGGTAGCCAACT
GTCTAGACTACATTCAGGTGAAGCCAACAACTGTGACCAACCCGACTCCC
TTTGTGCCTGCCTCCATCTCTGTGTCACCTCCTTTTTTCTCACTAGAAAT
GTAATTTGCAAGCGTGCTGAGCTGCAGTAGTCTGTTTTGCTGCCAGATTC
TAGAATTGCAAATAAAACCCAATTAAGACTGCAAAACTAGATTTGTTGTG
ATTTTTTCTCTACCCCCGCTTTTCTGTGGTCATCATTTCCCAAAAAATTT
CTATATGCTCCTGTGTATGGAGGTGGCATTCTCAGGCAGAGAGAGAGAAT
GATAGAGAGATGGACAGACAGACAGGCAGACAGATGGCAGTGTGTATTGT
GGAAGCTATAGAGAAATAAAGCCCAGACCTGTCCACCGAGTTGCATTTAA
ATCATGTGGCCAAGGCTATGAGGTGTATGGATCTGAAAATGTTTGCTTAG
GCTCCAGACCCTGAGACTACCCTGCCTCTAGGAGACATTGATCCCCAGAG
AGACCCTTCCTGGTTAATAAAAAATCTGAAGTTCCGCTCTTGACAGCATG
GAGGCCTCCTAGGTCCAGAGGTTGAGAGCCCCATGAATGCGCCTTCCTTA
CTTCTTCTGAATCAGACCCCGCTTGATGCTTGAAACTGACATGCCATGCC
CCCATGTCCCCGAAAAAACCCGGAATGATTGGGCTTTTCCCAGCGTCCGA
ATGACCCAAAATAAATACTTTCCTCAGGTAAATCCATTTTGTTACTTGCC
ACCCGCCAATTATTTATGTTTATAAAGTTACCTTTTTCTAACCCACCTAT
TGGTTTATTATCTATAAACATCTTGTCATCCTCATCCTTCTTTTCCTCTT
TCCATACACCAATCACCTCATTCTTAATCCTTCACATCTTTTCTTTCATC
TTATCATTTTTCTTCCGTCTCTGCTCTTATCTCCTCTCCATCAATTTTCA
CTTTTATTCTTTTTCCTACTCTCTATATTCCATTTTATCCGCCCATTCCT
CCACCCTTCACATCCCATATCCATCCGNTCCCTCACTTATCTTCCG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 3 7 7 6 6 6 7 7 9 12 12 10 19 8 6 6 8 13 15 8 8 8 8 8 8 8 21 21 19 25 19 22 18 28 32 33 37
37 30 30 27 27 23 23 19 17 13 13 18 23 30 31 36 47 35 30 31 28 24 22 17 18 14 14 6 6 6 8 8 8 13 13 12 14 19 26 36 36 38 57 57 57 59 59 43 39 34
38 38 36 35 30 35 28 28 33 39 37 23 22 10 12 9 9 9 12 12 13 29 30 47 47 48 37 37 32 37 26 22 28 33 42 42 50 50 50 50 50 57 50 50 53 53 54 50 48 48
48 50 50 68 68 68 68 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 43 36 33 32 19 13 18 32 44 43 46 44 44 43 43 43
37 43 43 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 43 43 43 52 52 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 43 44 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59
59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 48 48 48 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 48 48 48 57 57 48 48 48 59 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57
32 25 15 13 11 11 11 11 11 19 24 37 48 54 54 59 59 57 57 48 54 54 68 68 68 68 68 68 57 57 54 47 42 39 39 43 59 43 43 43 43 59 59 59 59 59 59 57 50 50
48 48 47 59 59 59 28 24 13 8 8 8 8 11 17 36 59 59 30 30 17 24 25 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 43 47 31 31 27 28 28
28 22 27 32 37 48 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 43 57 57 50 50 54 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 59
57 54 54 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 44 44 37 30 30 42 43 59 59 47 47 41 39 43 47 48 43 48
48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 37 27 27 21 28 26 32 28 37 43 43 59 59 59 43 32 32 19 25 37 43 32 36 30 33 33 33 37 37 41 41 59 47 39 38
28 28 28 28 37 37 37 43 59 43 39 36 32 32 37 24 22 21 22 33 37 35 39 35 39 35 39 43 43 39 43 48 43 48 39 39 35 37 37 43 28 26 12 12 13 19 23 20 31 35
31 34 34 34 39 39 31 39 37 30 30 37 30 30 17 17 15 25 25 30 34 37 59 35 31 31 24 24 10 10 10 22 22 14 16 24 27 37 37 37 33 30 24 25 24 24 24 32 31 41
25 25 27 28 30 37 33 33 28 25 22 23 18 15 15 11 18 15 18 12 15 15 10 8 8 8 8 9 13 24 30 30 32 37 39 30 26 17 10 10 6 6 6 7 14 13 17 15 16 17
25 27 27 17 15 10 9 10 10 12 15 8 8 8 11 11 16 18 23 22 25 15 13 10 10 11 11 19 11 11 12 25 24 15 12 10 8 8 7 8 9 15 19 14 11 11 11 18 13 14
10 15 10 9 9 9 9 9 13 17 9 9 12 10 10 9 8 8 10 8 9 9 9 16 18 10 10 10 10 10 9 9 10 12 12 10 13 17 12 18 18 12 9 9 8 8 8 8 8 8
15 12 10 8 11 10 8 8 11 13 12 11 11 9 9 11 15 18 17 11 10 10 10 10 8 8 8 8 15 8 8 8 8 10 15 15 11 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 11 8 6
6 6 6 8 8 12 12 12 12 9 10 10 8 8 8 10 10 12 11 10 11 11 10 9 9 9 10 9 9 9 11 12 9 9 9 15 8 9 9 9 10 12 8 8 8 8 8 12 12 13
15 18 25 12 9 9 8 8 6 6 8 10 8 10 8 8 9 10 10 10 15 11 8 8 6 6 8 8 10 15 10 10 10 9 9 9 9 9 10 10 12 14 23 28 34 19 19 13 14 8
8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 9 9 9 12 12 11 18 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 10 8 6 6 8 8 10 10 8 9 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 11 11 9 9 10 9 9 9 12 11 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 9 10 11 11 12 9 8 8 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 11
11 10 9 9 8 8 10 10 7 7 8 8 8 6 6 9 11 12 13 16 15 15 9 8 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8
8 8 10 10 10 10 8 10 17 8 8 8 8 10 13 8 9 6 8 6 6 8 8 8 6 6 10 10 11 10 11 9 9 9 9 24 24 20 16 10 9 8 6 6 6 8 8 8 8 11
13 16 15 10 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 6 6 6 6 6 13 6 6 6 7 9 14 15 8 8 8 6 8 10 10 17 16 19 9 10 10 21 21 28 20 20 28 37 47 50 50 37 37
37 47 47 40 43 43 57 48 48 57 57 57 57 48 48 57 47 42 28 28 30 36 36 44 44 48 54 41 50 50 50 53 68 68 57 57 57 47 47 41 41 48 48 50 50 50 50 50 50 68
68 57 57 57 57 48 39 32 25 12 12 12 28 28 47 47 42 42 48 50 42 42 26 24 18 16 20 24 22 16 27 38 50 50 50 50 47 47 48 57 57 68 68 68 47 47 41 41 42 53
48 48 54 43 43 48 48 48 48 48 48 47 42 47 42 47 57 50 50 50 50 53 47 50 50 50 50 46 43 37 37 17 14 13 17 18 23 37 37 37 47 43 33 33 30 30 30 39 39 43
46 57 59 59 57 57 53 53 50 50 50 53 68 68 68 57 57 54 54 54 54 54 54 57 59 59 54 57 54 54 54 54 68 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 37 29 32 27 24
22 12 12 15 28 35 47 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 48 48 59 59 59 59 57 48 48 48 57 48 59 59 48 34 29 21 13
20 18 12 13 14 18 12 13 13 21 13 11 10 9 7 7 8 8 10 22 32 59 59 59 59 50 46 46 34 32 23 28 28 31 31 21 23 15 13 12 12 12 16 17 19 13 13 13 18 19
18 24 32 37 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 48 47 57 54 47 47 47 43 39 39 39 44 46 54 54 57 54 54 48 43 40 44 44
48 42 43 44 43 43 44 44 46 46 57 57 57 54 54 54 48 57 57 57 57 48 44 44 43 42 42 39 39 46 44 44 48 48 57 59 48 44 44 57 59 43 46 44 57 48 44 44 37 37
35 44 39 48 48 47 57 47 47 39 43 43 47 48 47 47 54 54 54 57 47 47 39 42 35 43 43 43 43 48 48 48 48 48 57 50 43 43 43 36 36 39 37 37 37 37 37 37 41 37
41 43 47 47 59 59 59 59 41 36 36 38 38 42 42 47 59 48 47 47 47 43 43 43 57 57 57 57 47 47 47 47 47 47 57 57 48 48 48 44 41 39 37 37 37 47 34 30 22 22
19 25 21 26 23 23 32 34 39 40 40 37 41 37 33 22 30 30 48 48 37 37 30 30 30 37 37 40 40 43 39 39 39 39 36 39 43 39 39 41 33 31 31 31 25 21 21 22 20 24
27 17 15 12 12 13 13 20 24 15 23 21 23 30 18 16 9 9 9 19 19 20 20 24 19 18 28 21 18 18 20 23 18 15 20 28 23 24 24 30 27 24 15 12 12 21 21 28 31 14
19 11 11 10 13 10 10 12 15 17 12 12 12 12 12 12 13 13 19 14 11 11 9 15 8 8 10 15 12 14 10 8 8 8 6 10 8 8 6 10 6 6 6 6 8 9 9 15 16 11
11 11 13 13 15 21 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 12 14 19 17 9 10 9 9 9 9 13 12 12 15 16 15 14 10 10 10 10 11 21 17 8 10 8 13 13 24
22 22 17 11 11 11 19 28 13 11 10 10 11 14 10 11 11 8 8 8 10 12 12 19 20 18 18 12 10 9 9 7 12 10 10 10 12 14 11 9 9 9 9 9 9 18 17 15 10 9
10 10 10 10 15 12 11 10 10 10 10 13 10 10 8 8 8 8 8 15 15 13 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 14 10 12 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10
10 10 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 10 10 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 9 9 8 8 10 8 10 12 9 9 15 12 13 13 15 15 11 10 10 13 10 10 8 7 7
8 8 10 12 10 15 10 10 11 13 8 8 6 6 6 6 8 8 7 7 10 8 8 9 9 9 9 9 9 10 12 17 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 15 15 15 15 8 8
7 9 9 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 10 8 8 8 10 12 14 14 12 11 9 13 10
8 8 6 7 10 6 7 8 8 8 8 8 15 9 9 9 9 9 12 9 9 6 6 6 8 11 8 8 8 8 10 8 8 6 6 9 10 9 10 11 12 9 10 10 9 10 10 11 13 8
10 10 12 10 8 6 6 8 8 10 8 8 12 10 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 10 8 8 7 7 10 8 9 10 9 9 9 9 9 10 10 10 11 17 12 11 9
9 9 9 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 13 13 10 10 10 10 12 9 9 9 9 9 3 0 3 10 8 8 15 12 13 13 10 10 9 7 10 8 8 8 6 6 |