| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-313K10.T7 (MSMg01no313_k10.b1) | MSMg01-313K10.TJ (MSMg01no313_k10.g1) |
|---|
| ACC | AG435518 | AG435519 |
|---|
| length | 1,307 | 1,313 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 106 (128 - 233) | 261 (194 - 454) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_k10.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_k10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_k10.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_k10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:36 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CGTCTTTNNNNNNNNCACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCCTTGCCATCAAGGCTCCTTTAAAGNGCCTTTCTATCCT
AACTCAGTAAACAGTCTCCTTTTAAACTATCCCACGAATTCATGTCATTT
CACCATAATGCTTCCCCACCCAGAAAGCTCTATCTTTATCCCCATTGGCC
AGTCAAGACTCCACTGTGGGGGGGTGGGGAGGGAGACCCTCATGGTATGA
AAGAAAGAACCCACTCCTACCACTTGTCCTCTCACCTCTACATATGCACC
TTTATACATGCACACACTAATTATTCTTTCCTTGTCCATGCTTCCTTAAC
TGCAAATCACATTAGCAACTTGTCCTGCAAATGGCTACTGCAGAGATCTC
TTCTTCCTTCTTGTTGAAATCCCTCATCATCATTGCTGTTCTGACCAACA
GCAGGCCCACATTTATTTGCCCCCGCGCTAAGAGATGATACTGGACTGAT
AAAAAAACTCCATTCTGGTCTCTTGCTGTCTCCATATATACTCATGTGAC
AGTGTAAAGAACTCTCATATCTTCCAGGAATGAATTTCTAGGTATGAAGA
TCTACATTTTATTACTAATATCGTTAAGATCTTCTTCCCATGCCCGTGAG
CTTGGAATCATGCTCCTCCCACTAGCGATGATATATTCTTTTCTAATCCT
AAATTTAATCTCCTCCCATTTTTATGTTCATAATCCCAATAATCTGTCTT
ATAATTAACTGATACACCCTATTTTTTCTGTTTGTTGTATTATACCCTCA
GATCTTGATAATCTTGCTCCATCATTAGTGTTATATTTCCTCAATTAAAC
ATTTTGAATTTATCATGTTTACTTATCTAATTCTTCTATATCTCTACTAT
ACCATTATTTCTTCTCTAACATTTCAACTTCTCTTTAAATCTGTCTTCCT
TATACGTTAAGTTAATTATATCTTTTCTTCTCCTTTTATTCCGCACCACT
CCTTACTTTTATTCTTAACCTTCATAAACTCTTATTTTTCTCCTGTTATA
ATTTATTCTCCATCCTTCTTTTATCATTTATCCTTACCTTTTGTTCTTTC
ACACTTTTATATTAATTTCTTTATCCCACTAATCTCTTTTTTATTCTCAT
CAGTTTACATTAGTAATTATATTCTCACTCTATTTCCGCCCTCTTAAATT
ATCAATCCATATACTAACTTACTATTATTCACACTATTTATTTCCATTCT
TTTCCCTCTTCTCTAATCTCGATCTACTATCTTCATCCTCCATTTCAAAC
TNTTATA
| NNNGGGACTGAAGGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACCTGGCCAGAGACCACAGGACAGAGG
GCCCTGCCATGGAAGAGGAGAACCCCGCTATTCTAGGAGGGTGGAAGCCA
GAAAGAGGGCAGGAAGGCCTATGTGGCCACATTTCTAGTTCCAAGGACTC
TGCAGCTCCCATTCTTGGTGTCCCTTTTAGTTCCAGCCCTTGACACTTCA
GTGGGTCCCAGGAGCTCTTTGCCAGAGAAAGGAGCTCTCCAAAATTCAAG
AGTCAGCTTCCCCACACTCTAGGACTGATACCACCAACAGAGTCTTATGG
CCAATGGCTAGCTCCCACCTCAGGAGGGAGGCTCGGTGGAGTCGGGATGG
TCAGCAGTGAACACACCCTGGTCCTTCCCTTGAATCCCAGGATCTGTCTG
ATTTTTTTTGACCCCCCCTCTGTCAACTCTTACTTGCTGAAAAAAAAAGG
GGGATTACCGATAAGTTCTCGATTATTTTTTTGTTCATATTTTATTGTTT
GTGTTTACATGTGGGTATGTGTGGGTGGGGCACATACACATGTGTGAGCA
GGCCGGCAGACAGACATGGGGTAGTTCCTCAGGAGCTGCCCACCTTATTT
TATGAGGTGGGGTCTCTCAGCAAGCCACAGGCACCCTCCTGTCTCCACCT
CCTCAGAGCTGGAATTCCACGTATACATCGCCATGTCTGTCCGACTCACA
GCCTCGCGCTGTGCAGTACAAGCTCTACAGACTGAAGCGCTGCCCTAGTG
CTATTTCTGAACCTATGTGAAAGCGTACCAAAATTCCTTTTTCTTTTTTT
TTTTTGGATTTTCAAGACAGGGTTTCCCTGAGTAGCCCTGGTTGGTCCAA
AACTCATTCTGTAAACCAGCTTGCCCCTGGAACTTAAAAAAATGCCTGCC
TCTGCCCTCCCCAGTGCTGTCAATAAAAGGGTTGCCTCCTCCCCTGCCCG
ATTGCTAAAAAATAATCTCTAACTGCGGTATATCAAATCATTTCCTAAAG
CCCTTTCCCTAATTTGTTCCTATTTACAATGGTTCTCCACACCCTTTTTC
TCTTATGTTTTTATTTTCACTCCTGAATCTCTCATATCCAAACCTTTCCT
CCCTCTTCTCTATCTTATCTCTTTCTATATCCTCAACACCTTTTACTTAT
TTCATTTTCTCCCATCTTCTTGTTATTTATCGTCGGCATTCATATATTAT
ACTTTAGCGCTCTCATTTTCTATCACATTACTCTATTACCATCTACTATC
TTATACTTACACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 9 7 7 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 8 11 15 9 8 8 8 8 12 22 27 23 24 16 19 16 20 28 33
37 37 37 41 33 32 32 28 26 29 37 37 37 34 34 22 25 32 33 33 33 37 25 19 21 11 11 11 11 8 9 10 9 8 8 3 0 3 8 19 25 33 33 33 33 33 33 36 36 38
38 42 42 39 34 34 22 22 22 31 37 41 33 33 33 19 19 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 19 21 31 32 32 23 19 19 19 31 26 39 39 47 43 42 42 42 43 43 53 48 48
48 48 42 48 48 48 48 48 46 54 54 57 57 57 57 54 54 54 54 42 44 39 44 47 57 57 57 54 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 36 28 27 23 23 24 24 24 26 32 32
42 42 43 43 43 43 50 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 43 43 27 27 27 33 32 42 35 35 37 42 32 24 13 10 10 12 10 10 18 18 11 11 20 16 15 15 12 12 12 25
32 44 44 39 37 35 30 37 37 39 39 36 36 41 41 41 36 42 39 35 35 35 39 33 36 29 23 22 29 42 43 48 57 47 47 35 35 35 43 37 35 35 35 37 33 33 32 31 23 28
21 24 12 12 11 11 11 11 11 11 22 25 39 30 32 19 15 22 11 11 11 19 23 37 43 47 48 57 48 48 32 28 16 12 11 11 11 16 26 30 43 32 37 30 32 24 25 12 11 11
16 16 14 14 24 29 28 25 12 12 8 8 8 8 11 13 23 32 43 25 27 12 12 12 18 25 33 34 32 26 19 25 10 8 8 10 10 8 10 11 14 12 19 13 16 17 31 33 28 28
23 23 16 20 11 11 11 11 9 9 9 10 10 10 18 18 19 14 17 24 24 31 28 36 36 41 28 23 12 11 11 12 15 12 12 12 8 12 10 9 10 15 25 18 22 10 15 10 10 9
9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 7 6 9 11 11 11 12 11 11 11 18 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 12 22 24 13 13 10 13 12 13 8 8
8 10 10 12 12 8 10 11 11 12 19 24 28 34 23 20 18 13 11 11 11 16 19 30 30 43 32 32 20 23 20 25 22 15 12 10 8 8 8 8 13 15 14 10 10 10 10 10 12 10
9 10 9 9 9 23 28 15 13 15 10 10 10 10 10 10 10 17 18 11 8 8 12 9 9 9 10 8 8 12 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 9 9 9
10 8 11 8 8 6 7 10 10 11 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 15 17 9 9 9 13 15 8 8 8 6 6 8 10 8 8 10 17 15 13 15 10 10 10 8 8 6
6 8 8 8 8 10 11 18 16 19 9 8 8 8 8 12 12 17 12 15 11 11 9 8 8 6 6 8 8 12 9 15 10 13 10 8 10 11 10 10 8 8 8 8 6 6 8 9 10 10
10 11 18 13 11 13 13 8 8 10 8 8 8 15 15 16 8 8 8 10 10 10 12 13 8 8 8 10 9 11 12 12 10 11 8 8 8 8 9 9 9 10 10 11 10 13 13 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 16 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 15 10 10 10 10 10 10 12 11 8 8 8 8 11 13 15 10 10 10 10 10 10 10 10 9
9 10 11 11 10 12 9 9 9 8 8 10 10 11 8 10 9 12 10 10 10 10 13 9 6 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 10 10 11 11 10 10 10 10 13 10 9 9 8 8
8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 11 12 10 10 9 11 15 15 10 10 10 8 8 9 9 8 8 10 8 8 6 6 8 10 13 14 14 14 13 11 10 10 10 10 10 7 7 8 8 8
8 8 8 8 10 12 14 12 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 10 10 11 15 11 14 13 13 11 9 10 9 10 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 11 10 9 8 8
8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 13 11 8 8 8 8 8 8 15 15 11 10 12 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 8 10 8 12 10 9 8 8 6 7 8 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 7 9 12 11 11 8 10 11 8 8 8 6 6 8 6 6 8
6 6 10 8 10 15 10 10 10 10 10 10 10 12 12 12 11 12 12 22 19 16 9 8 8 12 12 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 10 10 9 9 10 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 10 11 16 14 15 10 10 10 9 12 12 12
16 9 10 9 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 6 6 8 8 10 9 8 8 13 8 8 8 8 8 6 7 10 12 13 14 10 9 9 8 10 11 12 12 8 8 8 8 10 11 8
8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 7 6 6 6 8 8 9 9 17 8 8 8 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 21 22 20 10 10 6 6 8 8 8 8
8 10 13 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 10 10 10 11 11 10 10 10 15 9 9 9 9 9 9 8 8
3 0 3 9 9 10 10 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 0 9 6 6 6 6 6 6 8 9 6 6 6 6 6 6 8 10 13 8 8 9 8 15 9 19 23 23 23 14 17 17 29 30 36 36 36 36 47 36 36 37 37 37
40 37 37 37 43 47 57 48 50 54 54 54 57 54 57 57 57 57 43 43 40 37 28 24 22 28 20 23 23 31 31 36 36 42 41 41 41 36 47 36 32 36 39 39 39 48 48 48 43 43
43 43 34 34 34 34 34 42 39 34 33 33 33 37 37 48 40 46 40 39 23 23 10 12 12 12 15 15 28 28 33 33 33 33 33 33 39 43 43 43 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48
46 46 43 43 43 47 47 47 43 43 43 59 59 59 57 44 44 39 33 33 35 31 31 33 33 33 34 25 22 12 9 9 11 11 12 18 18 19 19 21 30 28 19 19 22 26 32 39 39 39
44 44 57 57 47 47 42 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 43 28 28 28 28 37 44 48 54 48 46 43 44 44 32 39 37 44 44 48 48 57 57 57 57 57 44 40 40 46 44 43 43
57 57 57 57 54 54 54 59 59 48 47 47 57 57 50 54 57 57 57 57 57 57 48 47 43 43 37 37 42 43 52 59 57 59 59 57 59 57 57 57 43 43 37 43 43 44 35 29 29 27
44 36 43 43 57 57 57 57 59 59 57 57 57 43 43 43 44 57 46 46 43 43 57 59 57 57 57 57 57 43 43 39 47 47 59 59 68 68 57 57 57 48 48 48 57 57 48 47 41 41
30 30 32 42 44 42 30 30 30 42 37 43 43 47 47 48 48 57 59 59 57 46 43 43 43 43 39 42 42 43 39 39 43 37 33 28 28 28 33 33 37 36 37 41 39 22 22 18 11 11
11 11 11 11 12 16 21 28 28 41 37 46 46 59 59 59 47 47 37 37 33 33 32 40 40 48 48 48 48 57 57 57 48 57 57 59 59 57 57 50 53 53 50 48 41 47 25 24 18 11
11 11 17 21 24 27 17 16 9 9 9 10 12 16 18 14 10 8 8 6 8 12 21 43 47 41 41 33 34 32 22 13 11 11 13 12 11 11 12 13 11 16 13 16 14 14 12 13 12 13
12 19 22 28 28 36 36 46 46 50 50 50 53 59 59 59 48 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 48 42 43 41 43 43 47 47 54 54 59 59 39 35 35 41 44
47 47 47 47 47 57 57 68 57 57 57 48 47 47 47 47 57 44 44 37 37 42 44 42 43 43 57 59 41 34 27 28 42 47 44 47 42 42 35 35 35 42 42 43 43 43 43 43 43 35
42 30 42 42 44 42 42 28 28 20 23 23 28 28 37 43 44 37 30 30 32 42 43 32 28 17 27 27 30 30 33 43 43 48 48 48 48 57 48 43 43 43 43 43 57 57 57 47 47 37
32 28 24 32 26 28 34 34 37 37 34 28 24 24 28 28 28 28 14 23 23 33 37 40 34 34 28 25 21 30 28 31 23 32 32 43 47 31 22 20 16 16 16 17 18 24 32 37 37 39
41 37 30 24 17 30 24 33 33 36 32 23 22 12 12 12 23 12 10 9 12 12 10 17 26 28 30 31 35 35 28 28 32 17 17 11 11 13 19 20 20 20 18 20 20 20 20 28 22 17
10 10 10 21 17 21 14 16 19 29 23 25 16 13 13 11 11 11 12 9 10 13 14 10 16 16 22 19 18 18 18 21 28 23 18 18 15 15 26 26 37 37 17 15 15 17 14 14 19 10
13 12 21 21 30 28 30 30 32 25 24 24 14 15 10 10 10 15 15 8 8 8 10 10 16 15 13 11 8 8 8 9 9 12 12 15 11 11 11 17 17 11 11 11 11 19 12 10 10 13
19 9 10 10 12 10 12 15 13 15 10 10 8 7 6 9 10 7 7 8 8 12 13 12 12 9 10 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 9 10 6 8 6 7 6 8 8 10 10 11
15 15 10 10 11 12 11 11 12 12 12 15 15 11 12 12 10 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 13 11 11 10 8 8 8 10 8 8 8 8 11 11 11 9 12
12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 15 12 10 12 8 8 8 8 8 8 10 15 11 9 9 11 11 11 13 11 10 12 10 10
8 8 10 8 8 13 10 8 8 12 6 6 6 6 10 10 6 6 8 8 9 15 10 10 9 10 8 8 7 7 6 6 8 8 8 8 6 9 10 13 15 14 11 11 13 10 10 10 10 10
6 8 7 6 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 12 11 13 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 10 15 15 15 16 16 19 19 12 11 11 11 14 14 14 19 11 10
10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 15 13 9 9 10 8 11 15 15 11 8 8 6 6 10 12 20 18 17 10 10 8 11 16 18 19 19 13 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9
13 16 16 11 17 10 8 8 8 15 15 14 12 15 8 8 8 10 8 10 10 12 11 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 12 17 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 9 9 9 12 8 8 6 7 8 8 10 8 6 7 6 6 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 16 16 21 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8
6 6 10 8 8 6 6 6 8 8 9 9 12 10 10 17 12 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 10 10 14 12 12 8 8 8 8
8 10 8 7 8 8 8 8 8 7 7 8 7 |
|---|
