BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-321M04.T7 (MSMg01no321_m04.b1) | MSMg01-321M04.TJ (MSMg01no321_m04.g1) |
ACC | AG440645 | AG440646 |
length | 832 | 735 |
length of high quality (start - end) | 151 (75 - 225) | 652 (76 - 727) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no321_m04.b1 PHD_FILE: MSMg01no321_m04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:04:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no321_m04.g1 PHD_FILE: MSMg01no321_m04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:04:34 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATCGNGAGGGGCGCGCG
GAATTCCCAAGATTTCCACATAGAACTCAAGGTTAACAAACCAAAGGGCC
CAAGTGAAGATGCCTAATCCTACTCTGGGAGGAAGAAGAAAGAAGAAAGC
AGGAAATCACATGATGGGGGAGGGATGGAGGGACTTAGGTGGGAAAGGGA
ATAGGGAGCAGAAAAGGGGGACATACTCAGGTATTTGTGGGGGGAGAATA
GGATTGTTTTTTCGAATGCCTGTCCATCACGTGTTGCCGTGTTACCCCAG
GCCCCCGGGAAGAGCCGCGTTTTAGTAATTTTTCGCCGACAACACCAAAG
CCAAGCCACCAAATTTTAATAATTTTCCCCGGCGGCCCCCCCAGAANAAA
AAAAGAGAAAAGGAGAAGAGGGGGNCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAACGCGGCGGGGGCGGGGCGGCCCACCTCAGCTATTTATTTGTGGCC
CGTATTCGCCGGCCCTGGCTTACCGCTGGCGCCCGTGGGTACTTTTTTTT
ACGCGCCTCTTCTTCTATTCCATCTTGTTTTGTACTCTATCCCGTAACCA
ACTATGCCACACTCTCCTTCCCCCATTTACCCCTATGCCTCTAGTTTTTG
TTCTGACCTCCTTACAACACACTTTATGACCATTATATATACGCCGCTAT
GTTTCGTTGTAACTACCTCCGCTGCCCTTGCCTTGTTGTTTATTCTCTGG
ACACTAACCAGTCTCGCGTTTCCTTTTTTGTCCCCTCTTGTCTATGTGGC
TGCCCCCGAGTCACCTCTTCTCCTTTATGTCG
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCATTTAAGGCTTGCTATGAAATTC
TTACTTTGACCTCTTTTGGTAAAATGAAGCAGAACAAATCAGCAGAAGAA
AACCACTCACTTTGATCCACGGTGTGGCAGAATCCACATGGAATACTTGA
ACTAAGATGTAGATGGGTTCTTTGAAGACAGTCCCTTCCCCCTGAATTTA
TGCTGCATCCTAAAATGCTAGGCAGTCACTCTCATATATGCCGTTATCTC
TATACATGTTCATTGTCTCAAATACCAGCCTGAGACCAATATAATGTAAT
GGGAAGAGTACAGACATATGGATAGATGGATTGAAATATTGGTTCAACCA
ACGTCCATCTCTGTGACTCCAACGAAACTGGCCATCATCACAGTGCCCCA
GTTTCTTTATTTTTAATAGGGATAACTAATAGCCAAGTGCACAGCAGGTG
GCCAAATGGGTTTTGGATCGTAAACTTACATGTCGGCTCTGCTACTTACT
GACCTCTATGGGGCTTTTCATGAAAATACTAATATGCTTCAGGTTTCATT
TCTGTAAAAATGGCACTATTCCATAATATCAAACCCCTAACAGTGCTTGG
CATAAATGAGCATTATCTGTATCTTACTAATAGTAAAAATGTTATTAGTA
TTCTTGCTGTTTTTAATCCCAAAGAACAGAATTAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 8 11 12 10 15 16 33 41 37 37 32 29 29 39 34 22 14 14 16 28 28 41 28 28 25 19 19 8 6 6 6 6 6 3 0 3 12 14 7 6 6 6 6 8 8 22 27
31 31 31 31 39 37 37 37 23 18 9 9 6 7 9 9 9 9 9 15 15 10 11 11 19 22 30 30 37 37 37 59 59 53 53 57 57 57 43 39 39 39 35 43 43 59 59 59 39 39
39 39 44 47 59 59 59 53 53 53 48 48 48 48 48 41 41 30 32 37 28 20 11 9 9 10 10 10 28 34 50 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48
47 48 57 42 42 42 36 32 32 46 46 43 47 50 50 50 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 68 57 57 47 47 39 43 47 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 54 47 47
48 50 50 50 54 42 42 37 37 32 36 32 30 30 30 41 32 35 33 32 28 20 18 15 14 14 14 18 17 18 12 11 11 15 15 15 12 12 15 23 23 20 20 15 21 18 17 15 19 12
11 10 12 10 7 8 8 8 9 10 12 11 12 11 11 11 12 17 22 15 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 12 10 15 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 16 9 9
9 8 10 10 11 9 9 12 8 11 11 18 12 8 10 10 10 7 7 8 9 27 9 8 8 6 6 6 7 7 6 9 11 9 8 8 8 8 8 15 12 10 9 10 9 10 9 9 9 8
9 8 8 8 9 9 9 9 9 9 14 15 10 9 9 10 9 9 9 8 6 6 6 7 6 8 8 16 13 10 9 9 9 9 9 11 16 11 8 8 6 8 6 8 15 3 0 3 8 17
15 10 12 9 9 8 8 7 8 10 10 11 11 11 15 9 9 9 9 9 17 11 8 3 0 3 7 7 7 16 9 9 10 10 10 14 14 20 30 30 32 35 35 35 37 37 31 31 14 14
19 17 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 9 9 9 13 12 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 9
9 9 9 9 8 8 10 8 8 6 6 6 6 9 9 9 10 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 10 9 9 9 9 9
9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 9 8
8 8 8 6 8 10 10 8 8 10 8 11 11 10 10 13 8 8 8 9 9 12 15 8 8 7 7 8 10 11 11 10 12 9 9 9 10 9 9 9 9 9 10 12 12 12 12 13 11 11
11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 11 12 8 10 10 9 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 11 8 6 6 6 6 9 10 10 10 12 10 10 10 10
10 10 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 10 12 10 10 8 8 8 8 7 7 8 10 15 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8 8 16 10 12 12 12 12 12 15 9 9 9
10 10 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 10 9 9 9 11 11 17 17 12 10 10 13 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 13 12 10
7 7 8 8 10 10 11 8 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 8 10 8 8 8 10 11 12 10 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 8 8 8 15 14 9 11 9 9 23 17 30 32 37 41 37 37 41 39 39 41 41 50 42 50 50 41 41 37 25 23 9 9 9 9 9 9 8 8 9 9 9 9 10 10 10 29 25 39 44
44 37 37 39 41 41 41 25 25 11 9 9 10 10 11 11 10 10 10 10 12 22 24 33 33 33 36 33 36 38 59 59 59 59 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 68 43 43 39 43
48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 44 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 57 57 54 57 57 37 37 32 42 42 48 57 57 59 59 59 57
57 57 57 50 50 50 46 43 43 43 50 57 50 50 50 50 46 38 52 43 43 50 50 68 57 59 54 54 54 57 43 43 43 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57
54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 52 52 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 43 43 57 57 57 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57
59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 59 52 52 43 43 43 43 52 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 57 57 54 54
54 57 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 52 43 43 28 24 24 18 15 13 12 21 24 41 43 44 44 57 48 57 50 54 59 59 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59
59 59 59 68 68 68 68 59 59 43 43 42 44 32 30 30 41 44 47 44 43 43 43 39 43 43 43 43 48 48 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 57 48 57 57 57 48 48 48
59 59 59 57 48 59 59 48 48 48 43 43 43 37 24 28 12 8 8 8 8 8 8 10 19 23 41 41 37 37 37 35 35 37 39 48 46 46 43 48 43 43 57 43 47 47 47 48 47 47
59 59 57 47 47 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 68 68 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 48 48 48 48 57 59 43 44 44 47 47 54 54 48 57 48 57 57
57 48 54 54 59 59 59 57 57 54 59 59 59 59 68 57 57 57 57 52 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 68 59 59 59 59 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 48 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46
43 41 36 40 44 54 57 57 57 57 46 46 43 46 47 54 59 59 59 43 43 36 36 36 43 47 57 57 48 48 48 59 59 43 47 48 59 59 48 48 43 39 36 39 47 59 39 37 32 30
32 36 35 31 34 35 37 37 47 37 35 37 37 59 59 46 34 34 28 34 34 39 39 41 39 39 39 39 34 34 39 37 31 31 31 47 39 41 27 27 15 15 15 27 30 37 33 22 22 19
30 32 47 37 37 30 23 23 14 13 13 22 22 21 18 30 32 37 37 22 20 24 29 19 12 11 15 16 16 32 24 14 14 3 0 |