| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-332F07.T7 (MSMg01no332_f07.b1) | MSMg01-332F07.TJ (MSMg01no332_f07.g1) |
| ACC | AG448391 | AG448392 |
| length | 1,387 | 1,327 |
length of high quality (start - end) | 684 (98 - 781) | 722 (94 - 815) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_f07.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_f07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_f07.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_f07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:40 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | plural |
|---|
| sequence | NCCCACCATACCAATNNNNNCCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXCGCGGAATTCCATGATAAAACCAAATTCCTACATGACTCCTCCA
CAAATCCAGCCCTTCAAAGGATAATCATAGAAAAAACCAATACAAGGATG
GAAACCACGTCCTAGAAAAAGCAAGAAAGTAATCTTTCAACAAACCTAAA
AGAAGACAGCCACAAGAACAGACTGCCAACTGTAACAACAAAAATAATAG
GAAGCAACAATTACTTTTCCTTAATATCTCTTAATATCAATGGATTCAAT
TGCCCAATAAAAAGACATAGACTCACAGACTGGCTACACAAACAGGACCC
AACATTTTGCTGCTTACAGGAAACCCATCTCAGGGAAAAAGTCAGACACT
ACCTCAGAATGAAAGGCTAGAAATCAATTCTCCAAGCCAATGGTCTGAAG
AAACAAGCTGGAGTAGACATTCTGATATCTAATAAAATCGACTTCCAACC
CAAAGTTATCAAAAAAGACAAGGAGGGACACTTCATACTCATCAAAGGTA
AAATCCTCCAAGAGGAACTCTCAATTCTGAATATCTATGCTCTAAATGCA
AGGGCAGCCACATTCATTAAAGAAACTTTACTAAAGCTCAAAGCACACAT
TACACCTCACACAATAATACTGGGAGGCTTCAACACACCACTTTTATCAA
TGCACAGATCATGGAAACAGAAACTAAACAGAGACACAGTGAAACTAACA
GAAATTATGAAACAAATGGACTTAACAGGTATCTATAGAACATTTTATCC
TANAACAAAAGGATATACCTTCTTTCAGCACCTAATGGGACCTTCTCCCA
AATTGACAATATAAATGGGCACCAAACAGGCCTCCCCAGATATAAAATAT
TGAAAAATTTCCCTGCCTCCCATCAGATCACCATGGACTAAGGGTGATCT
TCTTTACCACCTAAATAAAGAAAAGCAACAACCTGGGGAAACTTATAAAA
ATCCTCTCATGAAACCTGGTCAAGAAGGAAAAAGAAAGAATAAAAACTTT
TAATTTATAAAGGGAGCCCACAAACCCACCTATGGACAAATGGAGATTTC
AAAGAAAAATAAATTTGAGGCTCCAAAAAACAAAGAAGAGCAAAACTTGG
CAAACCAAAGTTAAATAAGAGAATTCCCCAAAAAGGGGGAATAAGTCGGG
AACCCCGGAAAAATTCAAACCAAGAGGTTGAAACAAAAAATCGTCAAGCG
GCCTTAACAAGGGAAACGGAACCCCGGCAAGAGCTAAAGTCANCNNGNNN
NNNNNNNAATCAAATATCGAACTGTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
| NCCATTTCTTTNNNNNAAGAAGTGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTATAGCTATTGGTATGTG
TTTGTGATACACAAAGAATGCTTTTTGGGTTTTTTTGGGGGTTCTGATAC
TACCCTAGAGCATGACCATCTTAGAAAAGGACCACATCTAAGACTGACTT
GGTGCTTCTTCATATAACAAGTGTGATGGATAGAGTTTTCTAATTCTTTT
TTGATTTTGTGAAGCTTTGTCTTGCTTTAATTTTGGTGGTGTGATGGCTA
TTCCTGGTTGTCAACTTGACTACATCTAGAATGAACTACAATCCAGAAAT
GGAGGACATGTTTTTCATTTTCTTTTTTTTTTCTTAGACTTTGTAACTTT
GTTTAATTACTGGAATCTTGTTAAATCTACAGGAACCACATAGAAATTTA
GAAAGGTATTCAGTTTTCTTATAGTATTTAATAATATCTTTATAATTTTG
TTATCAATAGTAATTACAGTGACTATAAAAACATTTCCTCCTTTTGAGAA
TTTAATATATGAATAATGTATTCACATCATTTCCACCCCTGGCTTTTCCC
ACCCAATTCTTCCCCCAACTCCCTCTTGAATTCATTACTTCTTCTATAAT
TATCAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAC
AGAGAGACAGAGAGAGAGACAGAGACAGAGACAGAAACAGAGTCAGAGAG
AGAGAGAGACAGAGACAGAGAGGCAGAGAGAGACNAAGAGAGTCCATTGT
ATGTTGTTGCTTGTACATAAATGTGCTTATAGATGGCCACCTGGGATTGG
TAACCAAGCAAGTGTCCCAAGAAAAAAAACTGATTCTCCTCTCAGCAGCC
ATTGATTATGTGTAGCTTTTTAGTAAGGAGAGAGGCTTTGTGAGAATTCC
TGTTTTCACTGCCAAGGCAATATTTTTGATCCAAATCATGAACCATAGGG
GCCATGAAAAGCTTATTCCCCGGGAAAGTAATAATACCCCTTTTTTCCCC
GAAACTTGAGCAAGCCTTGAAACAAACCATTCTCCAAACAAAATGGGGGG
GACCCCCTTTTTTACTTGGGCCAACCCCTTTGTGGGAGCCTCTCATAGGT
TGACGGAAAAGAGAAACCTCCCCTTGTTCTCCCGCGCTCCTTTATGTCCC
ACCACCTTTGGAGACCCTTCCTTCTTGATCCTCTCTTTCACAGACAATTA
TAAATCTACTCCCGTCTGATGTGAGATATACAAATAAAAAATTTACATTC
CCTCCACCCTCCTTGTTTGTACCAAGA
|
| quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 8 9 10 9 9 9 9 9 3 0 0 0 0 0 3 8 8 8 8 10 8 9 12 10 8 8 8 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 19 28 35 28 24 28
24 24 22 28 37 37 37 37 37 37 32 32 23 29 37 29 30 24 25 28 28 31 31 33 39 50 47 47 29 21 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9 7 7 8 8 8 8 10 10 17 27
41 37 39 44 44 47 53 53 57 53 53 35 35 35 31 41 37 50 47 37 25 23 11 9 9 9 9 9 9 9 12 25 30 30 28 22 24 17 15 15 24 27 39 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 57 50 53 54 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 57 68 68 68 68 54 57 57 57 57 57 44 37 37 37 43 44 54 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 68 59 59 48 48 44 59 42 42 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 37 44 44 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 59 59 59 59 59 59 57 59 68
68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 45 45 45 59
59 52 52 52 52 52 45 62 62 68 68 62 62 62 62 52 52 62 52 52 62 62 62 45 45 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52
52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 45 45 45 44 43 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 43 43 39 39 43 57 57 68 57 59 57 42 42 39 27 27 18 18 26 43 44
43 57 43 38 28 20 20 38 34 34 29 33 33 38 38 39 38 29 27 27 33 43 43 43 43 43 43 44 38 35 33 33 27 27 27 43 43 33 33 33 32 32 32 32 16 30 28 38 18 20
20 44 43 43 43 43 46 44 48 50 44 32 20 20 16 16 14 28 28 33 42 41 32 28 23 23 23 36 32 35 41 42 42 43 59 59 36 36 25 30 30 39 39 32 32 20 20 20 34 34
23 23 20 30 27 35 32 44 36 35 35 35 59 59 59 42 32 24 20 20 25 32 28 32 30 39 40 43 39 39 35 32 32 23 23 23 34 34 37 35 31 32 30 30 30 28 28 14 14 14
31 33 36 28 28 20 18 18 15 15 18 30 22 28 28 39 32 35 35 32 32 23 28 20 28 28 30 32 28 37 20 20 20 24 23 30 30 47 37 30 32 28 28 23 32 28 24 13 12 12
21 25 34 31 31 31 30 30 17 17 17 30 30 32 25 25 28 34 37 40 43 43 48 47 43 46 46 46 43 43 43 43 43 43 43 43 39 33 28 25 25 34 34 43 43 39 41 35 35 35
39 39 43 32 32 24 24 20 20 18 32 24 30 28 37 36 33 33 35 39 39 37 34 32 28 28 20 20 15 28 14 17 17 30 30 35 30 30 28 28 28 37 37 39 39 28 28 24 23 23
24 12 11 11 11 20 22 34 34 28 28 23 28 19 25 23 32 32 31 31 32 31 40 37 34 28 22 30 28 28 28 28 28 28 18 18 12 12 12 18 11 13 13 22 26 37 33 32 31 31
31 24 24 18 19 19 24 28 30 22 28 34 31 26 26 32 30 27 19 23 28 20 22 24 24 33 23 21 11 11 11 15 15 20 23 19 20 16 15 15 15 20 19 17 27 19 28 25 22 14
16 3 0 3 12 15 19 21 26 18 12 12 11 11 11 12 12 24 22 25 20 28 19 14 14 11 11 11 13 17 13 11 11 11 14 14 11 15 10 10 11 12 16 17 15 10 8 8 8 8
8 10 10 10 15 11 11 12 11 13 9 9 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 9 11 10 12 13 10 9 9 9 9 9 9 9 9 16 9 9 9 12
12 14 15 15 22 24 18 11 11 10 10 10 9 12 9 9 9 10 8 9 10 10 13 13 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 10 8 8 9 8 8 6 7 9 9 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 9 10 19 14 9 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 9 12 12 11 10 9 10 9 9 9 17 16 12
12 11 11 11 11 12 11 10 11 10 15 10 11 10 9 9 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 19 10 10 10 12 9 7 7 7 7 8 8 12 14 8 8 8 9 10
9 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 10 13 10 9 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 7 8 7 8 7 8
8 9 10 10 12 21 11 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9 9 8 8 8 9 9 9 9 14 16 13 13 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 10 10 10 10 10 10 9
9 9 11 6 7 6 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 15 10 10 11 13 11 15 11 8 8 7 7 7 7 7 8 8 8 8 10
14 10 10 8 8 10 9 9 9 9 6 7 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 18 18 12 12 11 8 8 10 10 9 9 8 6 9 9 9 9 9 10 10 10 10
10 10 10 10 9 12 9 11 8 8 9 9 9 9 8 8 10 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 9 9 9 9 16 11 3 0 3 0 0 3 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 | Open.Hide. 0 3 9 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 10 15 8 8 9 8 10 10 16 19 20 25 25 28 31 29 22
19 12 12 19 24 28 35 37 37 37 37 36 35 36 36 36 36 36 50 50 50 50 47 37 27 27 9 9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13 13 19 25 30 36 35 50 50
50 50 50 53 53 42 42 53 53 53 53 50 59 50 50 59 25 23 12 11 11 11 11 11 12 22 26 37 28 30 30 32 37 39 37 32 34 44 57 59 53 43 43 47 43 43 50 53 47 47
47 47 47 43 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 51 47 48 57 57 57 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 57 68 68 68 57 59 59 57 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68
62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 44 39 39 14 13 13 27 27 39 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 68
62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 45 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 59 59 59 57 57 52 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68
68 68 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 44 44 35 35 35 44 42 54 57 57 59 59 59 57 36 36 25 36 36 48 43 47 47 48 54 54 54 54 42 42 35
35 35 42 42 42 40 37 28 28 29 43 43 48 48 48 50 48 43 43 36 36 43 44 37 39 30 30 30 37 37 39 30 35 35 34 27 31 35 30 39 34 25 21 11 11 19 23 34 48 48
47 50 47 47 47 47 43 34 31 23 23 32 34 30 25 17 17 25 30 39 39 59 39 35 35 37 33 36 36 37 37 23 23 3 0 3 21 21 33 37 39 39 37 31 26 29 28 30 30 37
32 47 39 43 43 41 37 37 43 41 39 27 20 10 11 12 18 16 24 23 20 25 19 25 28 27 21 24 10 10 9 9 9 15 16 25 18 14 14 14 18 20 20 30 21 20 14 14 12 16
21 19 23 14 14 11 13 19 18 32 28 25 20 22 22 15 16 19 19 20 25 20 30 35 37 37 19 11 9 12 12 15 26 30 22 25 22 19 19 21 16 16 13 11 9 10 12 13 11 11
24 25 16 15 13 10 10 12 16 12 12 10 14 12 12 12 19 26 30 21 19 11 11 11 17 17 12 12 11 11 11 13 11 13 12 14 14 23 24 12 12 12 11 11 10 11 11 17 17 19
28 28 19 19 21 16 11 11 11 18 9 10 9 10 9 11 13 13 13 9 11 11 13 26 27 37 37 20 13 11 8 8 8 11 9 10 9 6 8 6 6 6 6 10 10 10 8 8 8 9
11 13 9 8 10 11 9 14 10 16 17 20 15 23 10 9 9 9 11 14 13 8 8 8 10 13 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 14 11 11 14 18 19 20 12 10 10 9 7 7 10
10 11 12 11 8 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 8 8 8 8 8 12 9 9 11 10 8 8 8 10 13 15 11 10 10 11 8 12 10 11 14 23 23 30 21 17
11 11 11 13 14 15 15 15 15 21 13 8 8 8 8 8 9 11 11 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 7 6 10 10 8 11 8 8 8 8 10 10 11 11 10 10 10 12 12 12 10
10 8 10 9 9 10 9 8 11 6 6 6 8 8 12 7 7 6 6 9 15 17 11 9 8 8 8 8 8 10 6 10 7 9 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 9 9 10 10
11 11 11 11 8 8 8 8 7 7 7 7 7 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 11 11 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8
8 8 17 15 13 12 8 8 9 10 15 19 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 11 11 16 8 8 8 8 8 11 6 6 6 8 8 9
9 9 9 10 10 11 18 11 9 11 8 8 8 8 9 8 10 6 7 8 6 6 8 8 8 6 6 |