BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-333L12.T7 (MSMg01no333_l12.b1) | MSMg01-333L12.TJ (MSMg01no333_l12.g1) |
ACC | AG449397 | AG449398 |
length | 719 | 715 |
length of high quality (start - end) | 584 (71 - 654) | 539 (74 - 612) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no333_l12.b1 PHD_FILE: MSMg01no333_l12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:20:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no333_l12.g1 PHD_FILE: MSMg01no333_l12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:20:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCGTAGCTGCGCGGAA
TTCTTTGTTTTTTCTGAACCCCATTTTTAATAGGGCTATTTGATTTGGAG
TCCATCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATAAGTCCCCTATCTGA
TTTAGGATTGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCATTTTGTCT
TATTAACAGTGTCTTTTGCCTACAGAAGCTTTGCAATTTTATGAGGTCCC
ATTTGTCGATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTAGTGTTCTGTTCAGG
AATTTTTCCCCTGTGGAGGGCAACTCTTATAAAGGAAAATATTTCATTGG
GGCTGGCTTACAGTTTCAGAAGCTTAGTCCATTATCATCATGGTGGTAAA
CATGGAAGCATCCAGGCACACATGGCACAGTTGGAGCTGAGAGTTCTACA
TCTTGAACTGCAAACACAATTGAGAGACTATGTTACACTGAGTATAAAGA
GTAGAGGAGACCGCAAAGCCCACCACCACAGTGACGCACTTCCTCCAGCA
AGTCCACACCTCATAATAGTGCCACTCTCTATGAGTTCAGCATTCAAATA
CAGGAGTCTGTAAGGGCTGTACCTAATCAAACCACCACACAGACTAACAC
AGATACAGAAGCCTACCTTTGAGAGCTCATGTCAAAACTTTTTGCNAGTT
GCGGCAGGGGTGCACTTAC
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTTGGAAACATTTCACTGCAGCCTCC
ATCCACATCCCTCAACACAACAGCACATGGACTCAGCACAGAGACAAGTA
GGGTCAGCAAAATGGCTTAACTAGAAATCTACAAGGCACTTACCAGGAAC
AACAGCAACCACAAACCCACCATGAAAGTTGTGACTGATCAACTCAAGAA
ACTACAGCAGGGCATGGTCACAAAAACAAAGGTAATGGAGTAATACTGGA
CAAAGTATAGTTTAGATTTTTTAGGGTTGGAATAAGCCTTCCTGTTATTT
CTGGAGTGGAGCCAGGAAGCCAGGCAGTAGCCATTCTGGGGTTAATATAT
ATAGGAGCTCACACAAGCCACCAATAGTCTCAGCTCCCATCACCCCCTGC
TTCAGGACATTGCAGGTCAAGAATTATAATTATTTGGACAGAACCGTACA
TCAGCCATTTGTTCAGTTTGTTCAGTAAAAGCAGTTTGTTGATGCACTCA
ACAGAACCAGATGAAATTACAGACTACAATCTGAACCTATAATGCATGCG
TTAGCATATTTCCCCCAGAAATGAAATGATACCACAATCGTCTGTTAAAG
ATTTGAAGATGATTTGTTTCAGTCCAAGTTTTTGTGACAAGCTATGTAAA
AATATGTATCTGAAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 10 10 25 39 37 37 37 32 29 31 37 23 23 25 28 28 28 48 48 28 28 28 25 23 21 27 9 7 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 11 17 16 25 26 29
31 33 33 59 47 47 44 27 27 11 11 11 11 9 10 9 9 11 13 13 19 24 29 37 37 50 59 53 53 53 53 53 53 57 59 57 50 53 53 53 50 50 50 53 53 53 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 43 36 19 19 40 42 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 25 25 24
38 21 51 59 48 42 46 46 46 48 57 68 68 68 50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 38 38 14 18 16 41 41 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 52 43 43 38 28 23 23 27 32 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 37 37 37 39 39 43 48 47 47 47 59 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 53 53 50 59 59 59 41 31 24 12 12 11 12 12 12 12 12 12 10 9 9 19 21 41 59 53 59 57 57 57 57 59 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 43 43
43 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 57 59 59 54 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 59 57 57 57 48 57 48 43 34 34 23 23 23 41
34 39 32 30 30 39 39 48 48 48 48 41 41 40 41 41 41 41 41 41 44 39 39 39 42 42 41 48 37 37 36 39 39 39 30 27 15 15 15 27 30 57 57 57 57 48 48 48 57 59
59 57 59 59 48 59 59 50 50 42 41 37 32 24 22 18 23 26 25 31 24 22 25 32 37 44 47 59 59 46 46 39 39 36 35 31 36 35 36 36 39 39 39 39 30 25 25 31 32 37
36 27 25 26 39 30 30 13 19 14 19 17 24 34 41 39 40 37 37 37 32 29 29 39 32 31 35 39 39 41 41 36 31 35 31 34 39 39 41 39 40 41 39 39 37 28 28 32 32 30
30 30 23 18 9 9 9 18 16 17 11 11 12 20 22 29 26 21 17 15 18 15 19 24 34 28 31 28 17 13 11 11 10 13 15 30 31 39 19 19 15 11 10 8 3 0 3 9 7 15
9 9 9 14 15 19 18 13 11 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 10 11 11 11 11 23 17 21 11 8 10 8 22 22 37 48 43 30 28 28 25 36 25 25 13 17 13 9 9 9 6 7 6 6 6 6 8 11 12 15 15 6 3 0 3 8 8
25 25 22 21 12 12 26 23 13 9 9 9 11 11 18 13 15 10 11 9 12 10 12 24 34 32 46 46 48 48 39 48 47 39 39 39 39 36 43 34 34 31 31 25 25 43 59 50 50 42
42 42 42 42 42 41 42 43 43 57 50 50 50 50 47 48 42 42 47 48 47 46 46 39 39 39 57 42 47 57 57 50 50 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 59 59
47 47 47 57 57 68 68 68 59 50 50 50 50 50 50 59 59 59 59 68 59 57 57 59 50 50 50 50 50 50 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57
68 57 57 57 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 44 44 27 32 32 43 44 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 50 50 43 37 37 43 59 44 44 43 43 52 50 57 57 57 57
57 57 50 43 43 43 50 50 57 57 57 44 44 29 29 29 44 44 57 44 32 27 15 14 14 14 14 32 32 43 59 59 59 59 59 59 59 48 57 57 59 47 47 39 43 44 57 68 57 54
59 59 57 57 57 59 43 43 32 32 32 37 28 28 28 37 32 36 36 59 47 48 48 48 32 32 15 15 13 30 28 37 37 46 46 47 30 21 9 8 8 8 8 11 18 34 41 41 41 43
46 46 48 59 57 57 48 48 43 34 22 16 11 12 15 26 26 35 26 19 23 12 11 11 12 20 25 30 43 43 47 48 48 48 57 57 48 48 48 57 48 48 48 57 59 59 57 57 48 48
48 44 48 48 48 48 48 41 40 41 47 59 43 41 31 31 35 39 39 32 30 20 19 30 28 34 34 41 41 50 50 50 50 47 47 23 23 9 11 11 21 21 37 34 34 34 43 43 39 39
32 34 28 30 39 41 27 30 18 19 11 24 29 37 37 30 31 25 32 26 26 26 20 19 10 10 9 9 9 10 16 22 34 37 39 23 19 10 10 10 23 27 24 24 18 24 28 37 35 31
31 37 59 41 37 32 28 23 14 14 14 26 26 25 34 34 31 25 30 22 24 24 33 37 37 43 36 39 36 59 43 39 18 11 8 8 8 14 19 20 30 33 37 37 37 30 30 30 37 30
26 26 32 37 32 36 36 37 27 23 15 11 11 12 22 13 19 18 18 14 15 15 23 25 26 27 26 21 12 9 8 8 8 8 13 13 11 6 6 6 6 8 16 12 12 12 12 14 15 19
19 24 22 27 30 31 25 31 37 39 35 39 39 28 28 12 8 8 6 6 6 6 8 10 13 21 33 18 17 16 16 15 17 12 12 12 19 15 18 16 21 23 28 17 17 10 10 10 14 13
21 21 28 21 24 12 10 8 6 7 9 8 10 3 0 |