BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-371B22.T7 (MSMg01no371_b22.b1) | MSMg01-371B22.TJ (MSMg01no371_b22.g1) |
ACC | AG477705 | AG477706 |
length | 803 | 877 |
length of high quality (start - end) | 269 (77 - 345) | 49 (84 - 132) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no371_b22.b1 PHD_FILE: MSMg01no371_b22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:09:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no371_b22.g1 PHD_FILE: MSMg01no371_b22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:09:24 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTTAAAAACCTCTTACCAGCTTC
TCAGATGTAGTCTTTGTGTCTTTGTCCTTTTTACATGTGTTTTGTTTTGT
TTGTTTGTTTGTTTTTTTTTGCTTTATCATGATATTTATTTTTAATTAAA
TCACCCCCTTCCTTTTCTTACTTCTACTCCTCCCATGCCTAACATCCCCA
TCCCAGCACAGGGCAGTTCAGTCCCATCCCCATAGCCTCACTGCGTGTCC
TCATAGGATGGCATGTAGGTCCCCAGGTTACTGCTTGCTCTGAGATGCCT
TCGTGCATTTGCCGATTTGTAAGACCACTTTGCCTTTGCCTGCATAATGT
GCTCCTTTCAGTCATTGTTCACCCCTGCACACTCAACATCCTCCCCTGCC
CTCTACTATCATGGCAACAACTTCCTCACCATTCCTACAATCATTCTCTT
CTACTACCAACATCCCTCCTTCTTCCCCCCTTCACCCCCTCAACCTTACC
CTCCAATTTCCCTCCTCCTAACCATCACTCTCAATCCCTCAAAACTTTTA
CCCCCAATCACATATCATCATCTCCCTTCATATCCCTCACTCCACCCCAT
ACATGCTCATTCTCTCACTTTTTCTCCTTAACTCTACCCCCCAATCCTAT
TAAAACACCTATCCAACCCACCCCTCTTCATCTCCCCTCCTCTACTATTC
CCCTACATCACTTCCCCCTCACCTCAACCCTCAACACCTTATCACCCTTC
AAA
| NNCCCCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTACAGGATC
CGCCGGAATTCAAAACCATNTGTACGCTATTCAGTGAGTAGTAGGCAAGT
ATATTATAAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCNCCNCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCTTTCCT
CCCCCCCCCCCCNCCCTTTNCCCTTTCCTTCCTCCTCCCCCTCCTCCCCC
CCCNCCCCCCCCCTCCCTCCCNCCTCTCCTCCCCCCCCTCTTCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCTTCCCCTCCCCTCCTCCCCTCTCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCCCCTTCCCTCCT
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCTCCCCCCCCACCCCCCC
CCCTCCCCCATTCTCCTTCCCTCCCCCTCTACTCCCCACACCCCCCCCTC
CTCCCCCCCACCCCCCCACCCCCCCCTTTCCACACCTCCTCTCTCCCCCA
CTCCCTTCCCCTCCTCCCCCCCCCTCCCCATCCCCTCCCTCCACCTTTCC
CCCCCCTCCCACTCACCTACCTCCCCCCCCCCCCCTTCCCCCATATCCCC
CCCTCCCCCCTCCCCCCCCTCCTCCCTCCCTCCCTCCCATAACTCCCCCC
TCTCACCCCNCCCCTACCCCCCCACCCCCCTCTCCTCCCACCCCTTCCCT
CCCCCTCCCCACTCCCCACCCACCTCCCTCCCTCCCTCCACCTCCCCCAT
CCCCCATCTATTCCCCTCTCCCTATCCTTCCCTCCCCTTTCCCTTCCCCA
CCTCTCCTTCTTCCCTCCACCTACCCG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 6 6 10 10 9 6 6 7 8 6 6 9 22 21 31 39 37 37 37 37 39 31 31 39 37 36 43 41 39 39 27 32 28 16 16 11 17 16 30 23 34 43 57 57 21 21
15 23 26 36 37 46 50 50 42 41 39 19 17 9 9 9 19 23 14 3 0 3 8 9 21 43 59 59 50 47 47 44 44 44 41 39 39 39 39 44 44 32 30 24 22 25 30 43 44 30
30 24 22 25 30 39 47 47 50 50 50 50 53 53 57 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 51 68 50 50 50 50 59 54 54 54 54 48 48 48 48 48 47 47 48
46 48 48 57 57 57 57 57 47 50 50 50 50 57 57 57 57 57 54 48 48 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 50 57 57 57 57 50 57 52
52 57 57 57 68 57 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 50 50 57 57 43 43 47 59 43 43 35 35 47 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 59 48 43 40 40 40 42 42 37 37 39
39 48 36 44 36 29 29 28 32 20 32 31 43 40 28 28 15 15 11 15 15 12 12 12 23 23 14 18 28 31 36 36 28 28 25 28 28 28 28 30 22 22 11 12 12 11 11 12 19 23
26 12 12 11 11 11 19 11 8 8 8 8 10 10 10 12 13 16 18 24 21 22 11 11 15 18 25 15 12 11 10 10 12 12 13 16 25 24 24 19 12 11 11 16 16 18 14 10 10 10
13 15 18 18 17 13 8 8 8 8 8 8 10 15 19 10 10 9 9 9 9 10 8 13 14 10 8 8 8 11 8 8 8 9 12 17 11 9 8 8 8 8 8 11 11 12 20 17 23 24
21 15 12 12 11 11 11 9 9 9 9 9 10 10 9 9 9 8 8 6 7 7 7 10 11 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10
9 12 19 21 15 10 10 10 10 8 8 8 8 12 10 7 6 8 8 8 8 8 10 11 13 13 21 22 19 12 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 13 13 19
12 10 10 10 14 12 8 8 11 10 10 10 10 12 12 9 9 9 11 9 9 12 10 10 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 12 12 15 13 14 11 9 10 9 9
11 12 13 13 13 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 9 10 10 10 9 9 7 11 6 6 8 12 10 11 10 15 10 10 9 9 9 9 12 12 8 11 9 9 10
10 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 6 8 8 10 8 10 10 11 15 17 12 10 10 10 10 9 8 8 8 8 10 8 9 9 11 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6
8 10 9 7 7 10 13 15 18 11 11 9 9 9 9 9 6 8 7 6 8 8 10 9 9 8 8 10 8 8 8 8 10 15 12 13 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 10 9 9 8 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 8 10 8 8
8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 7 8 10 11 9 9 10 21 19 18 17 12 12 9 9 11 15 12 12 11 10 9 9 9 10 10 7 7 7 15 23 28 14 22 12 11 9 9 13 10 8 8 7 8 8
8 10 10 9 9 9 14 9 13 24 22 22 24 29 23 24 15 8 3 0 3 8 8 22 20 23 20 28 30 21 17 9 9 9 13 23 37 47 59 59 59 59 59 33 33 21 30 28 23 23
34 34 43 43 40 40 25 28 18 28 28 37 32 29 29 32 37 37 39 37 37 30 30 30 30 30 30 30 28 26 15 13 13 13 24 24 25 15 12 12 10 10 10 17 10 11 22 25 30 28
20 19 14 9 9 9 9 8 9 13 12 3 0 3 3 0 3 6 6 8 8 6 6 7 6 9 9 9 9 9 7 10 9 10 13 3 0 3 9 9 10 9 9 10 19 21 8 8 8 8
8 10 10 18 23 29 19 15 6 6 6 3 0 3 7 6 6 8 3 0 3 7 6 6 8 11 15 12 12 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 10 8 11 10
12 12 3 0 3 14 6 6 6 6 8 11 9 19 8 8 7 8 8 12 3 0 3 9 9 9 9 8 8 8 8 17 19 19 8 8 7 10 10 8 8 6 6 8 15 14 12 13 13 8
8 10 10 10 13 10 17 16 10 9 12 9 9 9 9 9 17 12 11 11 11 15 8 8 6 6 8 10 10 14 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 15 23 29 30 22 23 10 10 10
10 8 19 10 8 6 6 13 15 27 15 13 8 8 8 13 9 14 19 19 19 18 13 10 6 6 6 6 8 17 15 15 6 6 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 9
9 11 11 15 15 12 12 10 8 10 8 14 19 21 19 15 10 9 10 8 12 15 9 6 7 6 7 11 8 6 6 8 8 9 9 10 13 18 21 17 23 10 10 10 15 15 11 11 12 13
13 12 10 6 7 6 7 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 9 11 11 9 9 8 15 8 8 8 7 6 8 6 7 11 13 8 8 8 6 6 13 15 20 19 19 19 10 10 10
11 9 9 11 12 15 7 7 6 6 6 7 9 16 12 12 7 7 7 9 15 18 27 17 13 7 7 8 8 10 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 18 17 9 9
10 12 10 12 10 18 16 19 23 23 14 9 8 8 8 8 8 10 14 17 19 17 17 11 11 11 10 13 8 8 8 8 10 10 14 16 13 26 23 13 13 9 8 6 8 8 8 8 10 18
15 18 14 14 17 11 15 12 18 10 10 9 9 8 8 8 10 6 7 8 8 8 9 15 19 29 30 37 25 24 18 18 13 12 10 9 8 8 10 9 8 7 9 7 7 7 10 11 14 12
12 12 15 19 19 24 20 15 17 8 8 8 8 19 29 30 18 21 11 8 11 9 9 14 22 16 15 9 11 12 10 8 8 7 6 12 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 12 21 19 10
8 6 6 6 6 8 9 17 3 0 3 13 11 10 8 6 6 11 11 25 17 13 8 8 8 9 8 10 8 6 6 6 6 8 10 8 8 9 8 11 10 10 8 6 6 6 6 15 15 12
8 9 10 9 9 7 7 10 10 8 8 8 8 8 13 17 8 8 8 9 8 9 10 9 9 11 12 12 12 11 19 10 10 10 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8
8 8 6 6 6 6 12 14 20 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 6 6 8 8 8 8 8 6 6 7 7 10 18 13 13 10 13 11 11 8 13 8 8 8 10 15 10 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 11 23 16 13 10 8 12 8 9 9 14 9 9 |