BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-397O17.T7 (MSMg01no397_o17.b1) | MSMg01-397O17.TJ (MSMg01no397_o17.g1) |
ACC | AG498145 | AG498146 |
length | 1,232 | 802 |
length of high quality (start - end) | --- | 308 (155 - 462) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_o17.b1 PHD_FILE: MSMg01no397_o17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:10:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no397_o17.g1 PHD_FILE: MSMg01no397_o17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:10:30 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTCCTCTTGTTCTTAACACCCTGAATCACGTCTTCCTATCCAAAAAAAGT
CGCCCACACAACCCGATATTCTCAACCCCCATGGAATCACTCTCCACTCT
TGTCTTTCGCCCGGCCCGCCCGAGGCAGTTCTGTGCCCACTATGCCTTCC
GTACCTTCTACCCTACTACCACTGATTTATTTCTACATTATTCTTTGCGC
TCCGACTCCCAACGCTTAACCTTTATGTCCGATTATTGTCGATTATTCTC
TCCTCTCCCAGCAAGTACGTCCCCCTATATTTTCTGTGGTTTGTGGTAGA
TAGAGTATCTAACTATCACTTTCAGCCGCCGGTTGCTCCCCCACTCTACC
GGTTAATGCGCTTCTTGCGTCTGCGCGCGAATTCGGTACGCGAGATGTTC
AACCTCCATAACCCGACTAGTCGTAGCGTTTTATCTCGATGTATCACCTC
GCTTCACCTCGGCTATCTCATTTACCACTCCTCATTCCACCTCCCCATTC
TTACCCTGGTTTGTGTGCTTCTCTGCCTATATTCCACCACACTCACGACA
TTTCATCAGTAGGCGTGGCAGGAGCATCATCGAAGTCGCGACGTATCCCA
TCTCCCACACTGCTGATACCGCCACAGCGTCAACTCTTTCTTATCTATGC
GTATCGGCCCATTCGGGTACGGCTATCTATCATACTCTATGCATCTGCAT
CGCCCGGCGGCGTATCGTTCTCGTATCGCGCTGTGAACTCGCGCGGGTCA
CGTATCGCCTAACCACGATACTCTACGTCCGCACGCCCTCACGCACGTCC
GCTCGATCGCTGCTATCATTCTACCGCCGAGCGGCTGCGCTCTCTCGCTC
GCTCAGAGGTGCACGTGGCGCGCCGACGACACATTTCTGTCTCTGATTCT
GCCATGTTACGTTTCACCGCGTTCGCACCCTAATATGTACCACCCCGACT
CTTCTACCTCCCCGTCTCCTTCACGGCTGTGTACACTACAGTCGCCGCGC
TGGACCTTATTTACGATCTCTAGCATCCATACGCCGCCGACTCTATATCA
CGCGACGAACATTGCGATTGCGACGCCAGACGCATGCCGAGCTACCATGT
CTGAGTCGCGAACCTATTACTAGATCTCTATTCCACCGCCGCGAGGTTAT
CCTGCCCTCATCCTTCGCTTGCGGCCATTACTACTAACACTCTAGTCTCA
NCTNGCATCGATCGAATCTCTCTACTATAACG
| GGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXTCTCGCCAATTCCTAACTAGCCCTTGCTTCGTATGCTAGCTGGA
GTGAATTTCTAGAGAAACAGAAGCAATGAGATGCAGGAGGCAGGGGCTAA
GAAATCCTATATCATCTAACCACCTGAAATTTTAAGATGAAGAAAGCCAA
CTAAGTAAATTCCAATGACAGCATGAAGGCCTGAAATCTGGGACCTTCGT
CTATGCATATTCTAATAAGTATCAGAGCCAGCATCATGCTTACATACCCA
AAATCACAGAGCAAATCCTTTATTGTTGATGCTTTTTATAATGTCCAGTC
CCCGAGCAGATCATGTAGTACCCCCTCACACTGAGCAGGGTGATTTTCTT
TAGTTATCTGATATTAAAAATCAAAAACAGTGACTAGAATCAACTCACAG
ATAAATCCAGAAATTATGTTTAACTAAACACTTGTGTACCCAGCAACGTA
GAACCACATGTGTCAGCAATAGCTGGTTTCATATTCCTGGCATCCGTGCT
GGGCCCCTGAGTTTGAAGCTGGGAGGGAGCCCCTCCCCAAGAAAATTTCT
GAAAATACTAAAATTGTACCTCAACCTCCCCTCCTTATCTTCTGTGGTTT
TCCCCCTTCTCTAAATTCGACCTTATGGCCACACCCCCCCGCTTCGGTTT
GCCCCCTTTTCTCAACCATACTGCTAAACCTAGTGTTTTAATTCCTTTCC
TCCCCCCCCTTACTCTTTGTCTCAACCCCCCTCCTCATTCTATGATTCTC
TC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 6 6 8 8 6 6 10 10 13 8 8 11 10 8 19 8 6 8 8 8 6 8 8 8 10 10 10 12 11 10 9 9 9 9 8 10 10 8 8
8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 14 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 8
6 6 10 10 15 16 13 11 11 12 11 8 8 8 8 10 7 11 11 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 13 10 10 10 10 7 8 6 6 8 6 7 10 10 14 9 9 9 9
9 10 8 8 11 12 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 11 15 15 19 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 7 7 7 10
11 9 8 8 6 6 8 8 10 13 18 14 13 9 8 8 6 7 7 7 8 8 10 8 6 6 6 6 10 8 8 8 10 11 9 9 9 8 8 8 10 8 10 8 8 11 11 8 8 10
9 10 10 10 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 13 8 8 6 6 6 6 8 13 8 8 8 8 8 8 8 10 9 6 8 8 8 6 6 8 8 10
8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 7 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 11 10
10 10 10 10 12 10 10 10 8 9 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 10 12 10 13 6 6 6 7 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8
8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 11 10 9 9 9 9 9 16 8 8 6 6 7 7 11 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 10 10 10 10 15 13 13 8 10 7
6 8 8 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6 9 10 13 10 10 10 13 10 12 12 9 9 9 10 9 8 8 7 7 11 10 9 9 6 6 7
7 10 10 6 6 8 8 10 10 9 10 10 10 10 8 8 10 10 7 6 8 8 8 8 10 8 10 11 9 9 12 9 9 12 10 10 10 8 8 8 10 10 10 10 12 12 12 9 9 9
9 10 16 16 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 12 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 15 10 8 12 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 6
6 6 6 8 6 10 10 13 10 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 17 10 10 10 8 8 9 8 10 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 6
8 8 8 8 10 9 9 9 16 11 11 11 10 9 9 9 9 9 10 17 12 13 12 10 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 10 11 11 9 10 10 9 9 8 15 15 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 11 10 10 15 19 10 10 8 7 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 9 10 10 12 10 8 8 8
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 10 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 13 10 15 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 10 10 13 7 8
8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 10 11 12 10 8 8 8 9 10 10 8 8 11 11 8 8 8 8 8 10 10 8 7 9 10 10
12 12 11 8 7 7 7 8 8 11 12 13 12 13 12 12 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 8 10 8 8 8 8 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 11 11 8 8 8 6 8 6 7 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 9 9 9 9 9 10 12 8 8 8 10 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 13 15 10 10 8 6 6 6
6 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 7 8 8 6 6 6 7 8 6 6 8 8 10 10 10 8
7 7 7 7 7 7 6 6 6 6 6 8 8 15 11 8 8 8 8 10 6 6 6 6 7 10 10 8 8 10 8 8 6 7 7 6 8 6 7 10 10 7 9 9 7 6 6 6 6 8
10 8 8 6 6 8 6 10 10 11 12 9 12 10 10 12 13 15 10 10 9 9 9 6 8 6 7 10 10 8 8 8 6 6 10 8 10 10 10 13 10 11 9 6 6 6 6 8 8 3
0 3 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 8 6 8 7 7 10 8 8 10 11 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 8 8 23 28 39 37 43 43 43 43 44 44 41 41 44 59 44 44 29 27 9 9 6 6 6 6 6 6 9 18 18 27 32 34 34 48 48 36 36 36 50 50 50 59 59 59 59 59
59 33 31 28 13 12 8 8 6 8 6 6 7 10 22 22 30 33 30 30 15 12 10 10 10 10 11 11 22 26 32 43 40 28 28 13 13 13 28 28 28 20 18 20 34 18 20 15 18 12
12 11 18 21 20 19 23 27 29 35 39 37 39 30 30 28 28 23 23 10 10 9 9 9 20 10 11 12 10 10 14 32 24 32 27 19 15 12 12 12 32 18 24 24 19 16 16 15 19 12
12 10 21 10 10 9 22 38 50 50 25 24 11 11 11 24 24 24 27 20 32 20 23 32 44 44 28 28 13 18 18 38 38 44 32 32 32 43 38 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 27 35 35 38 41 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 47 43 35 35 44 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 54 57 59
59 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 57 59 59 68 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 57 48 42 39 39 47 57 57 57 57 57
48 44 43 30 28 28 28 39 37 44 37 37 32 30 30 26 28 31 33 47 42 35 35 35 59 34 32 24 24 20 28 24 34 34 33 28 28 37 37 48 48 43 34 31 32 23 23 28 32 33
47 37 37 31 34 34 34 20 20 23 15 14 19 19 20 19 30 23 23 22 18 15 17 18 18 18 37 27 24 16 16 20 22 9 9 9 16 16 18 23 13 11 10 15 10 10 10 15 15 12
19 15 21 21 19 19 12 12 13 15 13 10 12 12 11 12 11 11 11 21 18 13 12 13 11 10 9 9 11 12 14 14 14 14 14 18 17 11 9 8 8 9 10 12 9 6 6 6 8 8
8 8 10 11 17 13 16 13 21 16 21 19 19 19 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 12 9 9 9 9 15 8 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8
8 13 12 12 9 8 6 6 6 8 8 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 11 19 22 31 14 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 13
12 13 11 17 16 15 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 24 12 13 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9
8 8 10 8 8 8 10 10 15 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 10 10 10 13 10 10 9 10 9 9 8 8 6 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 13 9 6 8 8 10 10
10 8 8 10 9 9 10 11 12 13 11 10 9 10 8 8 13 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 10 12 12 16 15 10 10 13 10 10 10 12 6 6 8 8 9 8 8 9 9 9 9
9 9 |