| Query= MSMg01no437_h21.g1 MSMg01no437_h21.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no437_h21.g1 PHD_FILE: MSMg01no437_h21.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 19:02:54 2005
(419 letters)
>mm_chr1_68961172_68961990
Length = 819
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Identities = 419/423 (99%), Gaps = 4/423 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ctattcagatctggaatcagtggtaacacatatatacatgaatacaaacatatataaatg 60
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Sbjct: 797 ctattcagatctggaatcagtggtaacacatatatacatgaatacaaacatatataaatg 738
Query: 61 catacatatatacatacacacacacatatatacatacacacacacacatacacacacaca 120
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Sbjct: 737 catacatatatacatacacacacacatatatacatacacacacacacatacacacacaca 678
Query: 121 tatatatatac----atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataca 176
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Sbjct: 677 tatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatataca 618
Query: 177 gatttgtgcaataaatatattgctcttaactttgaaactgaatgaaccctgctaatacag 236
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Sbjct: 617 gatttgtgcaataaatatattgctcttaactttgaaactgaatgaaccctgctaatacag 558
Query: 237 ctcattgatgctttacagaaaatggtatggctagagtaatggctaacaggacctgagaga 296
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Sbjct: 557 ctcattgatgctttacagaaaatggtatggctagagtaatggctaacaggacctgagaga 498
Query: 297 ggcattctaacccattgcttgtttaccttgaaactcagccttaggaaagaagccagaagc 356
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Sbjct: 497 ggcattctaacccattgcttgtttaccttgaaactcagccttaggaaagaagccagaagc 438
Query: 357 ataacacttaagctcacatttatatgcaacatatgagctcctgtcttcttaagcataaac 416
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Sbjct: 437 ataacacttaagctcacatttatatgcaacatatgagctcctgtcttcttaagcataaac 378
Query: 417 tga 419
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Sbjct: 377 tga 375
Score = 91.6 bits (47), Expect = 9e-23
Identities = 53/55 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 120 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 174
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Sbjct: 621 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatata 675
Score = 91.6 bits (47), Expect = 9e-23
Identities = 53/55 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 120 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 174
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Sbjct: 623 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatata 677
Score = 89.7 bits (46), Expect = 3e-22
Identities = 52/54 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 121 tatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 174
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Sbjct: 620 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatata 673
Score = 89.7 bits (46), Expect = 3e-22
Identities = 52/54 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 120 atatatatatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 173
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Sbjct: 625 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatat 678
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 118
Number of extensions: 35
Number of successful extensions: 35
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 21
Number of HSP's successfully gapped: 11
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Effective length of query: 410
Effective length of database: 810
Effective search space: 332100
Effective search space used: 332100
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
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