BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-441F10.T7 (MSMg01no441_f10.b1) | MSMg01-441F10.TJ (MSMg01no441_f10.g1) |
ACC | AG531244 | AG531245 |
length | 1,111 | 762 |
length of high quality (start - end) | --- | 500 (79 - 578) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no441_f10.b1 PHD_FILE: MSMg01no441_f10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:08:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no441_f10.g1 PHD_FILE: MSMg01no441_f10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:08:05 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GATTTATACAACATTGGGGGTCGTCAAAAACAGACTACCTTTTTCCCAAA
GCAGGATTCTGCGGTAATTCTAATTATTTCCATAAAATAATCCTCAATAA
TATATATCCAATTACATGGAAAATGTTCATATTATTATGGTACGATCTTG
CACCTAACATTTCTTCCCATAACGCGCCGATGTTTATTTATCCACGCAAA
GGAACTCCACATCAAAAGTGCATATCAGTGCACCTGCAGGTCCCTCCGGT
GTTGTCCCATTTAAAATTCATAGCTTAACGCCCCCTGCACCTATCAACTG
AATATTCGACACACTTATTGCCCCCCAGTTTNCTCTATTTATCATTCCAA
GTATTTCCCCTGGTTATATAATATCTCCTGGTGGACAATGAAGCCTATAT
CCAATATGACAAATTAATTATNATAAGAACAGACGGCGCCAGCCAACCTC
ATCAAATAACTCAATTTCTATTTAATAGTGCTATAATTACTTACCCAGAT
AATCGAGTTGATACTTCGTCCAACTCATAGCCCCCCCTCTTGTATTTCAT
CCTCCATTATAAATACCTACTTGTATGCCCGAATATAATTTTGATATCCA
CTATTCCTCCTTCGATTCCGGTCCCCTACTATCCTCGCTATCCCTCGCCG
CCGCTATTTTATCATACCGCACTTACTCATTATTATATCCTATCATCACT
CTCTTCCACATATCCTGCATACTCGCCTCATCCACTTATGATATTATCAC
CTCTATTATATCCTCTACATAGGAACTACCACATATCATGCACCATTACT
CCGATATATAATCATACAACTCCCTCTGTACCCCACAATAAACACGCTGT
GTGTGTTTATATATATTATATCTGCACGCGCGTTATATATTATACCCTCT
GTTATATACCTCGACCGGAACGTATTATATCTGTATTTTATATTCGCCCA
CTTATATAACATATAATCCACCTTTATATTTATTCTATTATCTCCCTCCA
TTCGTCTTATACTCGGCTCTACCTATCTCGCGGTATACTCTCTGCGAGAT
GGGACGTCCCGCACTATTCCACGCCCCACGTTCTTTTTGTTACGNACACT
TACTACATTAT
| NCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCCAGTGGAAGGCCACACAT
TGAAGACATGTGGGCAACTCATAATGGACTTAATGGGTTTAAAAACCAAA
AGAAAACACAAAGTTGGGTAGATAGGGTAGCTTGGATAAATCTGTGGAGA
GTTGGAGAAGGTGGCAGATATGAACAAGACAAACTGTAAAAACTCTTAAC
TAATAAAATTAATTAGAAATATTTATTGAAGTATGTAGATATATTTATAT
TCATTTATGCCTTAAACATTTTTTTATATTAAGTATAATTTGAGGTTATT
TTAGTCAGCTTTATAGTAGCATGCTCTTAAAAGTGAAAGTGCTTTGATTC
TTCATACTTAGGAATTTGTTTGATAAATATGAAGTATATTCTTCCTTCTT
CTGTGGGATATGTGGGTAGAACTGAGCATTGTGAAAAGGAATTGATTGAA
ATTCCCAACATTAAAAACTTGAAGCAAAATTGATATGATCTACAATTATG
TGTACAGCTATTATTGAATTATGTTTACATTGGGCACAAGCAGAATACAT
TTTACTGAGTTATCCTTTATTGAGTTTATGCAACATCCTAATTATCTGTT
TGCTCCCTTTGGCACAACAATCTATGTGAATAACTTCCCCCCTTGTGATA
CATAATGTATATTTGCGAACACCAATCTCATTATGGCCCTTAATAATCTT
CCTTTTCCTGCA
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 6 8 6 9 7 7 6 6 6 7 8 13 12 11 11 11 11 8 8 6 6 8 10 11 21 17 8 8 9 9 10 12 10 6 6 6 6 6 8 10 8 9 8 10 12 7 6
6 6 6 10 18 13 8 8 6 7 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 6 8 6 8 8 6 7 6 6 6 6 9 11 11 8 12 6 6 6 7 10 12 14 14 12 10 10 9 9
9 9 9 10 8 9 9 8 8 10 6 6 10 11 11 10 9 9 9 9 14 15 12 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 10 9 10 13 15 9 9 10 13
9 9 8 8 8 10 9 9 10 15 15 12 7 7 7 7 12 12 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 7 7 13 13 34 12 12 9 9 12 12 12 6 6 8 8 8 8 12
11 7 7 8 8 8 8 8 6 8 6 6 12 13 28 18 15 12 9 8 8 8 6 8 9 6 10 6 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8
8 10 6 6 10 8 8 8 8 11 10 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 8 10 12 8 8 8 6 8 8 9 8 10 6 6 6 6 7 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 6 10 10 7 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 3 0 3 11 8 8 8 10 10 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 18 23 20 25 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 13 15 12 8 8 8 8
8 8 9 10 13 12 11 13 13 16 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 6 8 6 7 9 7 8 8 10
10 10 10 10 11 8 9 6 8 8 6 6 10 6 7 8 6 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 15 12 12 10 6 6 6
6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 6 6 7 6 6 6 7 8 6 6 8 8 15 21 18 9 9 12 10 10 8 10 8 8 9 9 12 10 10 12
13 16 18 13 13 10 9 9 10 8 6 8 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 12 13 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 12 10 11 6 6 6 8 12 8 8 8 8
8 8 8 9 11 11 12 12 12 9 12 12 6 6 8 8 10 10 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 7 9 9 8 8 8 8 8 8 12 15 15 9 9 10 10 10 12 8 8 8
8 8 8 8 8 13 11 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8
8 8 8 8 8 12 9 10 10 10 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 10 6 8 6 6 8 10 12 9 7 8 8 9 9 11 6 8 7 6 8 8 8 13 8 7 7 7 7 8 8
7 7 7 12 8 10 10 15 15 14 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 15 10 10 10 10 9 9 8 8 11 9 10 10 10
10 10 11 9 9 10 17 21 15 10 8 8 7 6 8 8 9 9 9 9 10 10 12 10 10 7 6 6 8 8 12 18 17 9 10 15 15 8 6 6 10 7 7 8 6 7 7 7 8 8
8 6 8 6 9 10 12 12 12 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 8 13 15 10 10 9 10 10 8 8 8 10 11 13 14 16 10 8
8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 11 10 10 6 7 6 6 6 6 6 7 8 8 10 10 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 12 12 8 8 8 11 11 8 8 8 15 7 6
6 8 8 8 8 8 8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9 9 10 10 6 7 6 6 8 8 8 7 7 8 6 6 6 6 10 10 15 13 10 10 8 9 10 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 11 8 8 8 8 8 8 15 14 11 9 9 9 9 9 9 9 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 8 6 6 6
6 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 10 8 8 6 6 6 6 8 10 12 21 10 8 6 6 10 8 8 3 0 3 11 10 8 11
7 6 6 6 8 10 7 7 8 7 7 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 7 7 8 9 10 11 9 3 0 3 17 11 3 0 3 18 18 29 37 17 17 11 7 6 6 6 6 6 9 9 9 9 10 16 19 22 27 30
35 31 30 28 33 33 33 34 23 17 9 7 7 7 7 7 7 9 9 17 17 13 8 10 11 19 23 23 47 47 30 28 28 28 25 28 47 39 39 32 32 32 30 24 25 30 30 30 33 33
33 50 50 48 36 48 41 37 37 37 41 59 39 39 32 28 24 35 37 36 36 37 36 33 33 37 37 44 48 57 47 42 42 43 43 43 43 47 47 47 57 57 57 57 57 42 39 39 48 39
48 48 57 54 48 57 48 47 47 48 48 57 54 54 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 47 47 47 47 59 59 57 57 59 47 57 57 68 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 48 50 50
57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 54 57 57 50 59 57 54 54 57 57 57 57 57 59 59 57 59 44
44 31 36 28 23 23 23 28 44 44 57 54 42 44 37 37 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 48 48 48 54 54 54 59 57 57 54 57 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 37 36 28 33 23 19 10 8 8 8 15 21 36 25 30 23 31 30 59 59 59 59 59 59 59 59 48 57 57 48 59 59 48 48 59 59 59
57 57 57 43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 48 46 40 36 25 26 36 40 42 54 59 54 57 57 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 59 57 57 68 57 57 57
57 57 48 48 57 57 59 59 59 59 48 48 50 50 50 50 50 41 43 43 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 48 48 59 57 57 57 48 48 54 46 42 39 35 35 59 47 48 54 59 48 40 40 28 28 29 40 43 43 43 46 43 46 46 48 48 59 36 29 28 28 28 28 39 37 37 37 34 34
39 43 37 32 32 20 20 20 24 32 34 43 43 43 36 36 37 37 37 37 41 41 34 30 18 14 12 15 19 22 22 30 30 37 37 37 37 47 46 41 34 34 28 28 28 34 34 37 39 33
29 28 30 30 28 28 28 32 23 34 34 37 32 29 28 30 25 28 33 34 34 28 25 25 22 25 11 11 10 12 12 20 19 10 12 11 11 8 8 12 11 10 8 8 8 8 8 15 15 19
23 20 21 14 14 16 24 19 13 15 13 11 13 12 22 25 26 14 14 14 14 11 8 11 10 8 8 13 18 15 9 9 9 9 12 8 7 6 6 8 10 8 8 8 8 8 16 24 16 14
18 10 10 10 8 8 10 9 9 12 9 8 8 8 11 7 6 6 6 6 6 11 11 11 9 9 9 8 9 8 10 10 10 9 8 11 11 12 15 16 14 18 15 10 8 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 11 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 13 10 8 8 8 12 8 8 8 8 10 12 10 10 8 9 9 12
19 24 26 21 13 13 10 8 8 8 8 8 |