BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-448D23.T7 (MSMg01no448_d23.b1) | MSMg01-448D23.TJ (MSMg01no448_d23.g1) |
ACC | AG536507 | AG536508 |
length | 718 | 790 |
length of high quality (start - end) | 466 (74 - 539) | 398 (79 - 476) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no448_d23.b1 PHD_FILE: MSMg01no448_d23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:17:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no448_d23.g1 PHD_FILE: MSMg01no448_d23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:17:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | AACGATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCGAGAATCCG
CGGAATTCTTGACTTTTACCAGCTAGGGGGGGTTGAAAAGGAATGGCTGA
GGAGGAAAAGACACTGCTTTGGAGCCTGATGACCTGAGTTTGACCCCTGC
AACCCAGGAAGTGGAAGGAGAGAACAGGGTCTGAAAGAGGTCTGACAACT
TAACTTCCCCCTCCAATAAACGTTAAGGTTTGGTTTTGTTTCTTTCCTTT
TCTAAAGAATTGAGTGTAAAAATGCTTAAGGACAAAAGGGTCACTAGGAG
AATTTGTGAAGGACCACAGTGCCCTCTTGTGGAAAAAGCATGCATTGCAT
GATATGTCATTTTAGAGTTTTGCTTCACTGTGAATAAGTGCCAGAGAGAC
TTCCTTCCATGGGCTTATTTTAATACATTTTCGTTAGGGTTGACTAGAAT
TCTAATTAAATCCGAGAATGCAGGAATGTCACTAATTGGCATCTAGATTC
GCTACTGTTGGCAATTTTCCTATGGAAATCCTACTTTGGGAATTGAGGAG
ACCTCCTTACTGATCTCTTGGAGGATCCCTTCTGCTAACTAGCTCTTTTA
TTAGCTATGTTTATAGGCACATACCAGCTGGACTATGGAAGAATTTTCCA
GCGTGTTCAGTACCCTGTTGTTTCCTCACGAGGGTCTTTTGCGTTTGTCC
ATTCTTTTACTGAAGCAC
| NCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGGGATACAAAGATAAGAAAT
CTAGTGTAACTTCTTGTATTAAATAGAATATTATATATGAATCAATATTA
TGGGCATTATATATGCAGATTTATGACGGACTCATGTACTTACAGAGGTT
GAGAAGCACTGTGATAGGCCAACCCTCTGCAAGCTCCCCTGAAGGCTGTG
AGGTTCCAGTCCTAGCCCAAAGTTCTGAGAACTTGCATGGAGAGTACTAG
TGTGTTAAGTCCTGGTCCAAGTCTGAAGGCCTGGTTCAGTCCAAATGAGT
TTCCTGCATTTAGATACTTAGTCACTAATTGGTGGCCCTGTTTGGGTAGG
TTTAAAAGATGTGGCCTTGCTAGAGGAAATGTCATTAAGGACAGGATCTG
AGATTTCAAAAGCCACATATCACTCCCAGTGTTCTCACTTGTACGTATAG
TTCCAGATGGAAGCTCTTAACTTGCTGCTTTCAGCCCCCTTGCCTGCTTT
GCATGCTTTCCCCTCAGGATTTTTCCCTTTGTGGCCGGAACAGCCCCTAA
TGGGACACCCGCCCTCCTTGGTAACCTGCCCACCCTCATTCCCAACCCTG
TTTCCCCTGTTCCCCCCCTCTTTCGTCTCCTCTTTCTCTCGTCAGGATAG
GCCGTTCTTTTCCCTTACTTAATAACCCCGCTCTTTTTTCCCTATTCTTC
CCTCCCGTTCATTCTCGTTGCCGCCTTTTCTCCCACCCCC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 10 9 9 9 10 13 8 8 8 12 12 23 25 33 28 28 29 31 30 33 33 33 39 39 39 43 27 22 11 10 10 25 21 22 9 9 9 9 9 7 7 8 8 9 9 10 15 12
15 12 22 23 31 31 33 33 42 37 37 24 19 19 9 10 9 10 9 14 12 14 14 18 23 24 30 32 34 47 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 50 47 47 47 47 47 57 50 68 68
54 54 54 57 68 68 68 68 68 53 50 48 48 43 50 57 68 44 41 30 17 17 19 32 38 57 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54
48 57 50 57 57 48 57 57 51 51 51 57 57 57 54 57 57 57 57 57 54 57 50 52 52 52 43 44 23 23 23 41 41 44 50 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 43 42 32 32 32 43 43 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 50 50 47 57 48 48 48 54 47 57 43 43 43 57 44 44 47 57 44 48 48 48
57 57 57 57 57 54 57 59 59 59 57 57 57 57 48 47 48 39 32 23 15 11 11 12 12 20 18 30 23 41 41 32 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 57 57
57 48 48 48 59 48 59 46 46 46 43 27 25 12 11 11 19 21 36 37 59 59 59 48 48 43 43 37 43 43 47 47 57 48 43 43 43 43 47 39 37 37 35 35 43 42 42 42 42 48
48 54 59 59 68 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 43 43 44 46 46 54 59 59 59 47 43 43 43 42 42 35 42 42 35 42 43 32 32 39 35 35 42 47
57 59 59 54 54 47 59 57 54 54 42 44 42 42 35 42 27 32 24 19 13 19 19 28 36 36 37 33 33 25 25 25 44 44 44 32 28 20 20 20 24 24 28 32 30 39 39 43 42 35
25 29 26 30 32 33 30 26 29 19 19 30 20 19 28 21 26 19 28 28 30 21 21 15 15 18 19 32 34 37 35 36 36 39 35 25 24 14 13 13 22 24 25 20 30 19 21 13 13 11
13 18 12 14 11 11 14 16 23 47 37 37 39 41 41 33 32 29 29 22 22 22 22 22 25 25 22 25 32 37 37 22 22 15 15 14 17 17 16 15 13 11 11 11 17 15 22 19 19 25
21 23 11 11 9 15 13 21 22 17 13 11 9 9 10 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 14 13 13 10 11 10 16 11 11 17 10 9 9 8 8 8 8 10 10 17 13
10 10 10 10 10 10 10 8 10 10 12 10 8 11 10 10 11 15 17 21 28 29 24 19 16 13 10 9 9 11 12 12 8 10 8 9 9 12 16 19 15 15 23 10 12 10 10 8 8 9
11 12 12 19 14 11 14 14 10 11 13 11 8 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 16 17 31 31 31 29 37 37 37 37 37 31 28 28 37 31 28 30 23 13 9 9 10 10 10 15 16 19 19 33 32 41 37 47 47
44 38 42 42 42 43 43 59 57 57 50 43 28 19 12 19 16 22 22 28 28 34 26 41 41 41 41 43 50 50 51 51 50 47 50 50 50 54 53 51 50 50 50 42 48 43 41 42 42 50
50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62
62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 52 57 57 57 52
59 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 43 35 35 43 43 52 57 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
57 59 59 57 57 48 57 57 57 59 59 54 46 57 57 57 57 57 57 43 43 57 57 57 48 57 48 57 57 57 57 57 57 48 48 47 54 54 57 54 57 59 59 57 57 57 48 48 48 48
48 48 42 39 42 47 57 57 59 59 59 47 47 47 39 37 37 39 43 37 34 28 28 32 34 37 32 37 41 41 39 39 36 31 32 31 19 18 24 22 32 30 28 28 33 37 37 37 43 43
31 22 16 20 20 26 20 28 28 30 30 32 26 17 24 14 14 14 26 26 32 30 22 15 10 10 10 19 17 22 12 12 12 26 28 20 20 20 30 30 14 10 8 8 8 11 11 17 22 12
9 9 9 9 10 10 11 12 9 10 11 13 13 11 11 12 18 23 12 14 22 23 30 28 26 20 13 11 11 13 18 10 8 8 8 8 8 18 11 9 9 8 8 8 8 11 13 10 13 17
10 8 8 8 8 10 10 13 13 16 24 15 15 15 12 13 8 10 6 6 10 11 9 10 10 10 15 10 8 6 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 11 8 8 10 8 8
6 6 7 6 8 6 8 9 9 10 10 10 10 12 12 10 12 13 10 10 10 10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 10 8 6 6 6 6 8 8 10 11 11 11 11 12 12 10 12 9 9
9 17 21 19 24 12 10 9 9 9 9 10 10 8 8 9 9 9 8 10 9 9 10 10 8 8 9 9 9 9 11 11 11 10 10 12 11 14 11 11 11 11 11 10 8 8 8 10 8 8
8 8 6 7 8 10 8 8 12 13 9 8 8 8 8 10 8 10 13 10 11 11 11 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 10 15 16 10 10 8 8 8 8 11 11 11 11 8 8 8 13
10 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 10 10 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 15 13 10 10 9 8 10 10 8 6 6 8 8 10 7 |