BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-454D14.T7 (MSMg01no454_d14.b1) | MSMg01-454D14.TJ (MSMg01no454_d14.g1) |
ACC | AG541051 | AG541052 |
length | 774 | 1,456 |
length of high quality (start - end) | 531 (74 - 604) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_d14.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_d14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_d14.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_d14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:25:21 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAAATCCGCGGA
ATTCTCCAANATTACTTCATATCTTGGCAAGCCATAACCATAGATTGGGC
AAATTTTGCAAATATTCTAACTTGCATTTCAACCTTATGTCACTTGTTAA
CTTGATGTTGTTCCTGGATGTATGTTCATTCTCCTTCACATTTCATGTGT
CTTTCTTACTTTGTCTGCTTTTTTATTCTTTTGTCTCTACCTACACACAT
AGCCAAATAATTGATCTGTCTATCCCTTATCTACCATCTAACCACAGGCT
TTAGATTTTTATTGACCTTTTAACTTGGGGAACAAGGTTACATAGCATCA
TTTGATGTATCTAAGGATCTCCTCCTCAGGGGCAACCATATCTTGGCAGG
GGGTGGGAAACAGTATTTATCATTTGAATACATTGCAGCATCTGAGCAAC
CCTCTACATTTATTGCCTTAGATTTAGGGGGAGAAACTGTTTTGATTTAG
TTAAACATGTTCTTTGAGCTTTTTCCTTGTATATTTCTCCTTATTCCATG
AAAAATTATATGTTATGAAAATATCATGATGTCCCAAATTGTTTCTTTGC
TTTGNTATGTTTAACTTTATTCATTTTTAGTGAATAAANTCTCTTTATCT
TGTCTTCATGAACAGATATCCTCTGGTCTTTTTTAACCCATTTGAAACAA
TCCTCTGAGCCTTTTTGTTTGACTTTGGGGAATCTGACATTACGAATTAT
TTTCATTGAATTTTTCTTTCAGGA
| ACACACTCACAATAACCAACAGAGGGACAGACNGTGCAGCGCGTCTTCCT
CCAGAGACGGGAGCGNAGTGTTAACANAGCAAGTACTTTTCCCCAGGAGC
ATTCGTCTGTGTAAACCATCATATTCTTATATTTTTAGCGCGAGGCGCGT
GTACGTGATGTCTCTCAGTGCGACACGACACCGTCCTCTTTNAGTCGTCA
CTATACCACCGCGCCGCGAACAAATATAACGAGTATATATAAGGAAGAGC
AGAGCGCAAGTGATGCAAGTACGCACGCGACGTATGCACAGATTTCGCCG
TACTTGATATATATATATTTGTGCGACCAATAATACAGNTTCGGCTACTT
ATATTCAGCAAGCGAGTGCTGTAAGACAGATACAGTGTGCTAGAAATGAA
GTGCGGGGTGCGGAGAGAGAGGGCGCGAGTGAGAGATGAAGACATATATA
TCTCGACACCGACGTGCGCTGAGANAGGTTAGCACGCCCATACCCATCCT
CTGTATCAACTCAGCACCGACGGCGCTTNTATGTTCATATCAAGACGAGC
GTCCGACGCGGATCGGAGCATGAGTGTCTATCGTGACAGTAANTACTGCC
GTAATAACGTCNGATGCGTACAGTGACAGGCGGTCGGCATGATGACAGAT
ATCGCACGCGACGGTAATNAGTCCCGCCGCGGAGATACGCGTCTGAGCGA
TGTGTGCGTGACGAGTATTATTATAGTAGTCTCGCCTGCCTCGCCTGTCG
ACGAGCGACGATATAGCGCTATATAGATACGATACCGCGCCGTGTAGGGA
AAGATGNTAGAGAGAAAATCNGTTCTNGTATCGATTGCGAGATAGGAGAG
GGATGAGAGATGCGAGATGTCGNCGACAGCTACAGTAACAACAGAAGCAG
TACTTATGACAGTAGAACTGCTATACGCTGCGTCGCGTTTTATTATATCN
GCGACGCAAGAGAAGTAGAGTATGCAGCGCATGTGANGAGGAACGAGTTA
TGACATATAGTGTCATGTGNCGTCATCAGTCACGAGTTATGTTATTTATC
GCAGCGCGGCGCTGAAGACACGTAGTATTGACGCATTGTGATGAGTGTAT
ATCTGCGTCCNGTGCTGACGTGCGGTGGTACTATGCTCCCGCTTGGAGCG
CGTCACTGTCCGATCGACATCGANCANCTCTCATGATCTGCCGTTATACG
CGCGGCGCGGGCCATTTATTATATATCGCAGCGCGTGGCGCGCTCGTGAG
TGCTGTACTCGCGAGATGGTAGTACACTATCTGACAATCGCGCGCGCGCG
CTCGCGCATGTGTACTATATAACAATGCTGCTACGTACTACCTGCGACGA
TATCTGAGCGTCAGTAGGAAGCTGCGACTTAAAATCGTATATACGCGCCN
CGCCCGCGCACTAGATAAGATATAGCTCGGCATGTGTAGATTAGAGCATT
CATAGN
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 6 7 10 18 30 28 37 37 37 30 32 41 44 37 37 37 37 37 44 47 48 30 28 28 24 21 19 27 9 9 9 13 9 9 9 7 9 9 9 10 15 12 23 18 30 30
31 31 33 33 37 22 19 8 3 0 3 8 8 8 9 9 10 11 12 10 10 10 13 15 25 23 39 41 50 50 53 53 53 53 53 53 53 57 57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 46 57 48 48 48 57 57 48 48 57 48 48 57 57 51 51 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 51 51 51 51 51 68 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 43 37 36
23 23 23 37 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 34 30 10 8 8 8 8 8 15 11 11 12 18 29 28 59 59 50 50 50 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 57 59 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 59 59 52 52 52 57 57 68
68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 44 44 27 44 44 48 59 68 68 68 59 59 48 48 54 57 57 57 57 54 57 57 59 57 57 54 54 38 44 23 23
44 36 44 57 57 54 54 57 54 54 54 54 54 54 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 57 48 42 40 39 39 30 37 34 46 46 57 48 48 48 48 48 48 48 46 40 59 39 37 37 40
35 37 37 32 29 29 29 37 41 41 59 46 46 43 47 43 41 37 37 43 41 41 41 41 41 40 37 37 24 24 20 32 29 29 23 18 18 20 17 22 28 22 19 32 31 31 31 43 37 41
41 27 27 3 0 3 18 18 11 12 12 23 23 25 30 30 28 28 22 19 22 24 24 22 20 18 19 15 9 9 9 10 10 7 6 6 8 3 0 3 12 12 14 18 18 30 28 28 28 15
11 9 9 12 19 18 17 17 18 23 21 11 11 9 11 9 9 9 13 10 14 19 15 12 9 8 8 8 8 8 16 23 15 12 11 12 12 16 16 16 18 19 19 23 14 13 10 8 8 8
8 9 9 11 11 11 11 11 11 9 9 9 9 13 21 14 15 8 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 9 9 9 10 10 11 12 14
10 9 8 8 8 8 9 13 12 11 12 12 17 13 11 11 11 9 9 10 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 8 10 12 10 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 7 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7
7 10 12 12 6 6 6 6 6 8 8 8 9 11 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 8 3 0 3 6 6 10 6 6 8 8 10 10 10 13 19 15 11 11 11 8 8 8 8 6 6
7 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 8 9 10 10 9 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 9 12 17 12 9 9 10 10 13 10 9 7 7 8 8 8 8 8 6
6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 7 8 8 6 6 6 6 8 10 11 6 6 7 6 8 8 9 10 10 7 7 6 6 3 0 3 6 8 8 10 8 8 10
10 11 10 12 15 12 12 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 8 8 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6
6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 9 9
11 10 10 10 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 11 10 10 10 10 10 12 10 10 6 6 6 6 10 11 11 10 8 8 8 8 3 0 3 6 6 8 6 6 8 6 6 8 8
10 16 11 11 11 11 12 13 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 12 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6
6 8 10 10 14 12 14 9 6 6 6 7 7 12 8 11 8 9 9 9 10 10 9 8 6 6 6 6 7 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 9
9 9 7 7 6 6 6 6 8 8 6 6 7 7 11 8 8 8 9 10 8 7 6 3 0 3 6 8 6 9 9 9 8 10 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13
13 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 9 9 3 0 3 10 8 8 8 6 6 6 6 11 10 10 10 10 10 9 9 9 10 8 8
8 10 10 7 7 8 8 12 13 12 12 6 6 6 6 8 8 10 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 8 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 10 6 11 12 11 11 10 10 11 11 11 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 9 8 9 9 9 8 8 12 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 9 11 11 11 10 10 10 10 10 10 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6
6 8 6 10 10 11 8 8 8 8 8 11 11 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 9 6 6 7 7 8 6 10 11 11 17 11 11 8 7 7 7 7 7 9
9 11 10 8 8 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 6 10 6 6 8 6 6 6 6 8 10 10 10 11 11 11 9 6 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 6 6 9 7 7 7 6 6 3 0 3 6 6 6 3 0 3 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 12 6 9
10 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 10 8 7 7 8 9 9 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6
8 6 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 10 8 3 0
3 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6
10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 6 6 6 8 8 3 0 3 6 8 8 10 12 13 13 12 12 12 10 10 9 9 10 11 8 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 8 8
8 8 8 11 10 15 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 6 6 10 15 15 10 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 10 10 8 8 8 12 8 8 6 6 10
6 6 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 10 10 9 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8
8 7 7 7 8 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 3 0 3 3 0 3 9 9 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 11 10 11 8 8 8 11
10 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 8 9 15 13 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
10 8 8 8 8 7 9 9 10 10 11 11 11 11 11 10 10 9 6 6 6 6 6 10 10 8 10 10 10 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 12 11 11 9 6 6 6
6 6 6 9 9 9 7 8 8 8 9 10 12 19 11 10 10 10 10 10 11 15 6 6 6 8 6 6 10 10 8 8 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 10
10 12 8 8 6 6 6 6 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 7 6 6 6 7 7 3 0
3 6 6 7 7 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 10 11 11 11 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8
8 8 8 11 3 0 |